MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C5 plasmid pMMC501

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009136	TAT	2	6	261	266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009136	ATT	2	6	339	344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009136	AAT	2	6	346	351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009136	TAT	2	6	355	360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009136	ATT	3	9	457	465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009136	CTT	2	6	499	504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046899
7	NC_009136	GGT	2	6	710	715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134046899
8	NC_009136	AAT	2	6	733	738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046899
9	NC_009136	AAC	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134046899
10	NC_009136	ACC	2	6	786	791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_009136	ATT	2	6	798	803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
12	NC_009136	TAA	2	6	905	910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046900
13	NC_009136	TTA	2	6	919	924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
14	NC_009136	TTA	2	6	1045	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
15	NC_009136	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046900
16	NC_009136	TTC	2	6	1142	1147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046900
17	NC_009136	TCT	2	6	1318	1323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046900
18	NC_009136	TTA	2	6	1356	1361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
19	NC_009136	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
20	NC_009136	TTG	2	6	1543	1548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134046900
21	NC_009136	ATT	2	6	1572	1577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
22	NC_009136	TCT	2	6	1578	1583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046900
23	NC_009136	TAT	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
24	NC_009136	ATG	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134046900
25	NC_009136	ATT	2	6	1694	1699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
26	NC_009136	TAA	2	6	1738	1743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046900
27	NC_009136	TAT	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
28	NC_009136	TAT	2	6	1880	1885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
29	NC_009136	TTA	2	6	1999	2004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
30	NC_009136	TTC	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046900
31	NC_009136	TCA	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134046900
32	NC_009136	AAT	2	6	2166	2171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046900
33	NC_009136	ATA	2	6	2257	2262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046900
34	NC_009136	TAA	2	6	2300	2305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046900
35	NC_009136	ATT	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
36	NC_009136	TAA	2	6	2513	2518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046900
37	NC_009136	TAA	2	6	2554	2559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046900
38	NC_009136	TAT	2	6	2576	2581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
39	NC_009136	CGG	2	6	2692	2697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134046900
40	NC_009136	CTT	2	6	2701	2706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046900
41	NC_009136	ATC	2	6	2775	2780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134046900
42	NC_009136	TTC	2	6	2804	2809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046900
43	NC_009136	TTC	2	6	2990	2995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046900
44	NC_009136	TTA	2	6	3033	3038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
45	NC_009136	ATT	2	6	3075	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046900
46	NC_009136	CAT	2	6	3130	3135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134046900
47	NC_009136	GTT	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134046900
48	NC_009136	TAA	2	6	3228	3233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046900
49	NC_009136	ATA	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046900
50	NC_009136	GAT	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134046900
51	NC_009136	GTG	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134046900
52	NC_009136	TGT	2	6	3393	3398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134046900
53	NC_009136	TTG	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009136	TAA	2	6	3481	3486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009136	ACT	2	6	3545	3550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134046901
56	NC_009136	TCT	3	9	3552	3560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046901
57	NC_009136	ATT	2	6	3576	3581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046901
58	NC_009136	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134046901
59	NC_009136	AAT	2	6	3644	3649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046901
60	NC_009136	TCC	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134046901
61	NC_009136	TCT	2	6	3657	3662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134046901
62	NC_009136	TAT	2	6	3682	3687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046901
63	NC_009136	TGT	2	6	3810	3815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134046901
64	NC_009136	TGC	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134046902
65	NC_009136	AAC	2	6	4091	4096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134046902
66	NC_009136	ATG	2	6	4116	4121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134046902
67	NC_009136	GAA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046902
68	NC_009136	ATT	2	6	4161	4166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046902
69	NC_009136	AGA	4	12	4647	4658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046903
70	NC_009136	ATT	2	6	4663	4668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046903
71	NC_009136	ATA	2	6	4757	4762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046904
72	NC_009136	TAT	2	6	4787	4792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046904
73	NC_009136	TTA	2	6	4906	4911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046904
74	NC_009136	AGA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046904
75	NC_009136	TTG	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134046904
76	NC_009136	TAA	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046904
77	NC_009136	AAT	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046905
78	NC_009136	ATA	2	6	5130	5135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046905
79	NC_009136	AAT	2	6	5183	5188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046905
80	NC_009136	GTA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134046905
81	NC_009136	ACA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134046905
82	NC_009136	ATA	2	6	5547	5552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046905
83	NC_009136	GAA	2	6	5620	5625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046905
84	NC_009136	ATA	2	6	5733	5738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046905
85	NC_009136	AAT	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046905
86	NC_009136	ATT	2	6	5839	5844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046905
87	NC_009136	GTA	2	6	5847	5852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134046905
88	NC_009136	GAA	2	6	5885	5890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046905
89	NC_009136	ACT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134046905
90	NC_009136	ACC	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009136	AAG	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009136	TTA	2	6	6199	6204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009136	ATA	2	6	6317	6322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046906
94	NC_009136	GAA	2	6	6551	6556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046906
95	NC_009136	TTG	2	6	6713	6718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009136	ATA	2	6	6800	6805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009136	AGA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009136	ATT	2	6	7221	7226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009136	AAT	2	6	7238	7243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009136	AAG	2	6	7302	7307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046907
101	NC_009136	AAT	2	6	7324	7329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046907
102	NC_009136	ATA	2	6	7377	7382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046907
103	NC_009136	ATT	2	6	7420	7425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046907
104	NC_009136	TGA	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134046907
105	NC_009136	TTA	2	6	7448	7453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046907
106	NC_009136	AGA	2	6	7500	7505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046907
107	NC_009136	TAA	2	6	7516	7521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134046907
108	NC_009136	AAG	2	6	7581	7586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046907
109	NC_009136	AGA	2	6	7651	7656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046907
110	NC_009136	AGA	2	6	7683	7688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046907
111	NC_009136	AGA	2	6	7697	7702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046907
112	NC_009136	TAT	2	6	7800	7805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046907
113	NC_009136	TTA	2	6	7808	7813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046907
114	NC_009136	AGG	2	6	7858	7863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134046907
115	NC_009136	AAG	2	6	7926	7931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046907
116	NC_009136	AAG	2	6	7934	7939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134046907
117	NC_009136	TAT	2	6	7943	7948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134046907
118	NC_009136	AAG	2	6	8017	8022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009136	AGA	2	6	8040	8045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009136	ATT	2	6	8088	8093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009136	CAC	2	6	8108	8113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009136	AGA	2	6	8133	8138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009136	ATA	2	6	8269	8274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.