MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 59550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009051	CCGGTC	2	12	165897	165908	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126178134
4002	NC_009051	CG	3	6	165929	165934	0 %	0 %	50 %	50 %	126178134
4003	NC_009051	C	6	6	165947	165952	0 %	0 %	0 %	100 %	126178134
4004	NC_009051	GGC	2	6	165953	165958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
4005	NC_009051	GGA	2	6	165959	165964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178134
4006	NC_009051	CCGG	2	8	165982	165989	0 %	0 %	50 %	50 %	126178134
4007	NC_009051	TCC	3	9	166015	166023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178134
4008	NC_009051	GGA	2	6	166043	166048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178134
4009	NC_009051	GTC	2	6	166071	166076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178134
4010	NC_009051	CGGC	2	8	166092	166099	0 %	0 %	50 %	50 %	126178134
4011	NC_009051	CG	4	8	166112	166119	0 %	0 %	50 %	50 %	126178134
4012	NC_009051	GTC	2	6	166176	166181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178134
4013	NC_009051	TCC	2	6	166210	166215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178134
4014	NC_009051	GGT	2	6	166274	166279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178134
4015	NC_009051	GAC	2	6	166280	166285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178134
4016	NC_009051	CGG	2	6	166303	166308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
4017	NC_009051	CGG	2	6	166354	166359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
4018	NC_009051	GGGGA	2	10	166368	166377	20 %	0 %	80 %	0 %	126178134
4019	NC_009051	G	6	6	166396	166401	0 %	0 %	100 %	0 %	126178134
4020	NC_009051	GAG	2	6	166449	166454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178134
4021	NC_009051	TGA	2	6	166530	166535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178134
4022	NC_009051	CGG	2	6	166570	166575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178135
4023	NC_009051	GTT	2	6	166586	166591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178135
4024	NC_009051	TGA	2	6	166593	166598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178135
4025	NC_009051	CAT	2	6	166621	166626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178135
4026	NC_009051	GCG	2	6	166727	166732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178135
4027	NC_009051	GCC	2	6	166739	166744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178135
4028	NC_009051	TGA	2	6	166756	166761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178135
4029	NC_009051	CTT	2	6	166768	166773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178135
4030	NC_009051	TGC	2	6	166801	166806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178135
4031	NC_009051	TAC	2	6	167018	167023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178135
4032	NC_009051	GA	3	6	167026	167031	50 %	0 %	50 %	0 %	126178135
4033	NC_009051	AGA	2	6	167086	167091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178135
4034	NC_009051	A	6	6	167124	167129	100 %	0 %	0 %	0 %	126178135
4035	NC_009051	AG	3	6	167170	167175	50 %	0 %	50 %	0 %	126178135
4036	NC_009051	GTTG	2	8	167176	167183	0 %	50 %	50 %	0 %	126178135
4037	NC_009051	CGG	2	6	167188	167193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178135
4038	NC_009051	GCTG	2	8	167229	167236	0 %	25 %	50 %	25 %	126178135
4039	NC_009051	CGA	2	6	167284	167289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178135
4040	NC_009051	GTT	2	6	167390	167395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178135
4041	NC_009051	CTG	2	6	167626	167631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_009051	GTA	2	6	167725	167730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_009051	CAC	2	6	167788	167793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_009051	TCC	2	6	167879	167884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178136
4045	NC_009051	TGA	2	6	167889	167894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178136
4046	NC_009051	A	6	6	167971	167976	100 %	0 %	0 %	0 %	126178136
4047	NC_009051	GAT	2	6	168006	168011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178136
4048	NC_009051	GGA	2	6	168036	168041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178136
4049	NC_009051	TTC	2	6	168070	168075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178136
4050	NC_009051	GAA	2	6	168084	168089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178136
4051	NC_009051	TCA	2	6	168098	168103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178136
4052	NC_009051	CCG	2	6	168109	168114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178136
4053	NC_009051	TTC	2	6	168157	168162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178136
4054	NC_009051	ATA	2	6	168276	168281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126178136
4055	NC_009051	TGA	2	6	168288	168293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_009051	CGG	2	6	168312	168317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178137
4057	NC_009051	CGT	2	6	168525	168530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178137
4058	NC_009051	TCGA	2	8	168562	168569	25 %	25 %	25 %	25 %	126178137
4059	NC_009051	TGC	2	6	168614	168619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178137
4060	NC_009051	GCG	2	6	168625	168630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178137
4061	NC_009051	CGAC	2	8	168665	168672	25 %	0 %	25 %	50 %	126178137
4062	NC_009051	GGC	2	6	168753	168758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178137
4063	NC_009051	CG	3	6	168771	168776	0 %	0 %	50 %	50 %	126178137
4064	NC_009051	CCT	2	6	168882	168887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178137
4065	NC_009051	GAA	2	6	168894	168899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178137
4066	NC_009051	ACA	2	6	169007	169012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178137
4067	NC_009051	CGG	2	6	169014	169019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178137
4068	NC_009051	TCC	2	6	169058	169063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178137
4069	NC_009051	CTCG	2	8	169131	169138	0 %	25 %	25 %	50 %	126178137
4070	NC_009051	CTC	2	6	169140	169145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178137
4071	NC_009051	GTG	3	9	169230	169238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178137
4072	NC_009051	CGA	2	6	169343	169348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178138
4073	NC_009051	TC	4	8	169376	169383	0 %	50 %	0 %	50 %	126178138
4074	NC_009051	GTC	2	6	169392	169397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178138
4075	NC_009051	CGC	2	6	169400	169405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178138
4076	NC_009051	AT	3	6	169562	169567	50 %	50 %	0 %	0 %	126178138
4077	NC_009051	CTC	2	6	169614	169619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178138
4078	NC_009051	ATC	2	6	169659	169664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178138
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4080	NC_009051	TCG	2	6	169702	169707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178138
4081	NC_009051	TGC	2	6	169714	169719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178138
4082	NC_009051	TC	3	6	169721	169726	0 %	50 %	0 %	50 %	126178138
4083	NC_009051	GTG	2	6	169749	169754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178138
4084	NC_009051	ACGA	2	8	169845	169852	50 %	0 %	25 %	25 %	126178138
4085	NC_009051	ATC	2	6	169887	169892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178138
4086	NC_009051	CCT	2	6	170110	170115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178139
4087	NC_009051	GAT	2	6	170134	170139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178139
4088	NC_009051	GAG	2	6	170177	170182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178139
4089	NC_009051	CCGG	2	8	170196	170203	0 %	0 %	50 %	50 %	126178139
4090	NC_009051	GCT	2	6	170227	170232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178139
4091	NC_009051	GGCTCG	2	12	170234	170245	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126178139
4092	NC_009051	AGG	2	6	170277	170282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178139
4093	NC_009051	G	7	7	170287	170293	0 %	0 %	100 %	0 %	126178139
4094	NC_009051	GGAC	2	8	170331	170338	25 %	0 %	50 %	25 %	126178139
4095	NC_009051	GTT	2	6	170348	170353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178139
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4097	NC_009051	GAC	2	6	170375	170380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178139
4098	NC_009051	GGA	2	6	170386	170391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178139
4099	NC_009051	TCT	2	6	170421	170426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178139
4100	NC_009051	AGG	2	6	170430	170435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178139
4101	NC_009051	TCGA	2	8	170489	170496	25 %	25 %	25 %	25 %	126178139
4102	NC_009051	ATC	2	6	170570	170575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178139
4103	NC_009051	CCGG	2	8	170592	170599	0 %	0 %	50 %	50 %	126178139
4104	NC_009051	AAC	2	6	170624	170629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178139
4105	NC_009051	GAGG	2	8	170783	170790	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_009051	GAT	2	6	170792	170797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178140
4107	NC_009051	CGT	3	9	170801	170809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178140
4108	NC_009051	CCTCT	2	10	170846	170855	0 %	40 %	0 %	60 %	126178140
4109	NC_009051	GAG	2	6	170934	170939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178140
4110	NC_009051	CGG	2	6	170990	170995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178140
4111	NC_009051	GCC	2	6	171015	171020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178140
4112	NC_009051	G	6	6	171022	171027	0 %	0 %	100 %	0 %	126178140
4113	NC_009051	AAC	2	6	171045	171050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178140
4114	NC_009051	CGC	2	6	171125	171130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178140
4115	NC_009051	GCG	2	6	171187	171192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178140
4116	NC_009051	GCGCCG	2	12	171265	171276	0 %	0 %	50 %	50 %	126178140
4117	NC_009051	CGG	2	6	171285	171290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178140
4118	NC_009051	CGA	2	6	171299	171304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178140
4119	NC_009051	CTT	2	6	171326	171331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178140
4120	NC_009051	GGA	2	6	171341	171346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178140
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4122	NC_009051	CGG	2	6	171433	171438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178140
4123	NC_009051	CTA	2	6	171461	171466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178140
4124	NC_009051	CGT	2	6	171479	171484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178140
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4243	NC_009051	CGA	2	6	177749	177754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178144
4244	NC_009051	AT	3	6	177755	177760	50 %	50 %	0 %	0 %	126178144
4245	NC_009051	ATT	2	6	177781	177786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126178144
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4247	NC_009051	CTC	2	6	177795	177800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178144
4248	NC_009051	TCAG	2	8	177802	177809	25 %	25 %	25 %	25 %	126178144
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4262	NC_009051	TAC	2	6	178495	178500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4272	NC_009051	TCGA	2	8	179052	179059	25 %	25 %	25 %	25 %	126178145
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4276	NC_009051	TA	3	6	179555	179560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4282	NC_009051	TC	3	6	179981	179986	0 %	50 %	0 %	50 %	126178148
4283	NC_009051	ACC	2	6	179998	180003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4339	NC_009051	TAG	2	6	182799	182804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4341	NC_009051	GCG	2	6	182966	182971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4361	NC_009051	TTAT	2	8	184002	184009	25 %	75 %	0 %	0 %	126178150
4362	NC_009051	T	6	6	184147	184152	0 %	100 %	0 %	0 %	126178151
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4365	NC_009051	AAATA	2	10	184280	184289	80 %	20 %	0 %	0 %	126178151
4366	NC_009051	ATATGT	2	12	184342	184353	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126178151
4367	NC_009051	T	7	7	184389	184395	0 %	100 %	0 %	0 %	126178152
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4370	NC_009051	CAT	2	6	184583	184588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178152
4371	NC_009051	AGT	2	6	184614	184619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178152
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4491	NC_009051	GTC	2	6	190429	190434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4492	NC_009051	TCT	2	6	190494	190499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178158
4493	NC_009051	CCA	2	6	190512	190517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178158
4494	NC_009051	GACC	2	8	190549	190556	25 %	0 %	25 %	50 %	126178158
4495	NC_009051	GGA	2	6	190557	190562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178158
4496	NC_009051	AGC	2	6	190623	190628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4497	NC_009051	C	6	6	190630	190635	0 %	0 %	0 %	100 %	126178158
4498	NC_009051	CGG	2	6	190647	190652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
4499	NC_009051	GCG	2	6	190662	190667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
4500	NC_009051	ATCC	2	8	190678	190685	25 %	25 %	0 %	50 %	126178158

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