MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 59550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009051	TGG	2	6	145572	145577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178109
3502	NC_009051	AGT	2	6	145623	145628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178109
3503	NC_009051	CGG	2	6	145655	145660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178109
3504	NC_009051	TTC	2	6	145690	145695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178109
3505	NC_009051	TCG	2	6	145815	145820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178109
3506	NC_009051	CGA	2	6	145836	145841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178109
3507	NC_009051	CGGAGC	2	12	145874	145885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126178109
3508	NC_009051	TTC	2	6	145892	145897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178109
3509	NC_009051	CGG	2	6	146069	146074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178109
3510	NC_009051	GC	3	6	146163	146168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_009051	CTG	2	6	146215	146220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_009051	A	6	6	146303	146308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009051	GCC	2	6	146382	146387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_009051	TCC	2	6	146419	146424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178110
3515	NC_009051	AAG	2	6	146442	146447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178110
3516	NC_009051	CCG	2	6	146509	146514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178110
3517	NC_009051	GGT	2	6	146562	146567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178110
3518	NC_009051	GAA	2	6	146571	146576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178110
3519	NC_009051	CGC	2	6	146595	146600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178110
3520	NC_009051	GGC	2	6	146654	146659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178110
3521	NC_009051	GTA	2	6	146676	146681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178110
3522	NC_009051	TTC	2	6	146686	146691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178110
3523	NC_009051	GC	3	6	146703	146708	0 %	0 %	50 %	50 %	126178110
3524	NC_009051	CCG	2	6	146747	146752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178110
3525	NC_009051	TCT	2	6	146807	146812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178110
3526	NC_009051	TCT	2	6	146912	146917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178110
3527	NC_009051	AGC	2	6	146962	146967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178110
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3529	NC_009051	GCC	2	6	147027	147032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178111
3530	NC_009051	CAA	2	6	147052	147057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178111
3531	NC_009051	TCG	2	6	147120	147125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178111
3532	NC_009051	CGA	2	6	147169	147174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178111
3533	NC_009051	AAG	2	6	147180	147185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178111
3534	NC_009051	CGG	2	6	147235	147240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178111
3535	NC_009051	CGG	2	6	147278	147283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178111
3536	NC_009051	GAC	2	6	147284	147289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178111
3537	NC_009051	GGA	2	6	147298	147303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178111
3538	NC_009051	GCGAG	2	10	147382	147391	20 %	0 %	60 %	20 %	126178111
3539	NC_009051	GAT	2	6	147392	147397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178111
3540	NC_009051	CGA	2	6	147409	147414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178111
3541	NC_009051	CGA	3	9	147511	147519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178111
3542	NC_009051	TCT	2	6	147520	147525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178111
3543	NC_009051	CGC	2	6	147551	147556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178111
3544	NC_009051	GAG	2	6	147569	147574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178111
3545	NC_009051	CGG	2	6	147594	147599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178111
3546	NC_009051	AT	3	6	147633	147638	50 %	50 %	0 %	0 %	126178111
3547	NC_009051	TGT	2	6	147643	147648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_009051	CGG	2	6	147651	147656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_009051	A	6	6	147661	147666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_009051	ATC	2	6	147735	147740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178112
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3552	NC_009051	C	6	6	147794	147799	0 %	0 %	0 %	100 %	126178112
3553	NC_009051	GAG	3	9	147803	147811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178112
3554	NC_009051	CGG	2	6	147823	147828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178112
3555	NC_009051	GAC	2	6	147845	147850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178112
3556	NC_009051	CTT	2	6	147851	147856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178112
3557	NC_009051	GAC	2	6	147866	147871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178112
3558	NC_009051	CCCG	2	8	147878	147885	0 %	0 %	25 %	75 %	126178112
3559	NC_009051	GAGC	2	8	147890	147897	25 %	0 %	50 %	25 %	126178112
3560	NC_009051	GAC	2	6	147902	147907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178112
3561	NC_009051	CCG	2	6	147919	147924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178112
3562	NC_009051	TGA	2	6	147928	147933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178112
3563	NC_009051	AGA	2	6	147934	147939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178112
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3565	NC_009051	GCGA	2	8	148011	148018	25 %	0 %	50 %	25 %	126178112
3566	NC_009051	CGG	2	6	148036	148041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178112
3567	NC_009051	TTCGAG	2	12	148058	148069	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126178112
3568	NC_009051	CCA	2	6	148214	148219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178112
3569	NC_009051	GAT	2	6	148292	148297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178112
3570	NC_009051	GTT	2	6	148298	148303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178112
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3574	NC_009051	GAT	2	6	148439	148444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178112
3575	NC_009051	GAT	2	6	148478	148483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178112
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3581	NC_009051	G	6	6	148817	148822	0 %	0 %	100 %	0 %	126178112
3582	NC_009051	GGA	2	6	148828	148833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178112
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3586	NC_009051	GAA	3	9	149000	149008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178112
3587	NC_009051	GCG	2	6	149049	149054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178112
3588	NC_009051	AGG	2	6	149079	149084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178112
3589	NC_009051	GAA	2	6	149111	149116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178112
3590	NC_009051	GAT	2	6	149120	149125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178112
3591	NC_009051	CGG	2	6	149128	149133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178112
3592	NC_009051	AGA	2	6	149134	149139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178112
3593	NC_009051	CCTC	2	8	149149	149156	0 %	25 %	0 %	75 %	126178112
3594	NC_009051	TCCGC	2	10	149231	149240	0 %	20 %	20 %	60 %	126178113
3595	NC_009051	GA	3	6	149260	149265	50 %	0 %	50 %	0 %	126178113
3596	NC_009051	CGC	2	6	149268	149273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178113
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3599	NC_009051	GCG	2	6	149335	149340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178113
3600	NC_009051	GCT	2	6	149354	149359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178113
3601	NC_009051	TTC	2	6	149391	149396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178113
3602	NC_009051	CCG	2	6	149430	149435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178113
3603	NC_009051	TCC	2	6	149462	149467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178113
3604	NC_009051	GGA	2	6	149477	149482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178113
3605	NC_009051	GCGG	3	12	149522	149533	0 %	0 %	75 %	25 %	126178113
3606	NC_009051	TCG	2	6	149539	149544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178113
3607	NC_009051	GGTC	2	8	149546	149553	0 %	25 %	50 %	25 %	126178113
3608	NC_009051	CGT	2	6	149594	149599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178113
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3610	NC_009051	CCG	2	6	149700	149705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178113
3611	NC_009051	GAG	2	6	149739	149744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178113
3612	NC_009051	ACG	2	6	149797	149802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178113
3613	NC_009051	GAA	2	6	149862	149867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178113
3614	NC_009051	GTTC	2	8	149876	149883	0 %	50 %	25 %	25 %	126178113
3615	NC_009051	CT	3	6	149956	149961	0 %	50 %	0 %	50 %	126178113
3616	NC_009051	TCT	2	6	149984	149989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178113
3617	NC_009051	GCC	2	6	150024	150029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_009051	GGC	3	9	150107	150115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_009051	CGC	2	6	150135	150140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_009051	GGA	2	6	150144	150149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_009051	A	8	8	150175	150182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_009051	ATCG	2	8	150378	150385	25 %	25 %	25 %	25 %	126178114
3623	NC_009051	GTA	2	6	150401	150406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178114
3624	NC_009051	GTC	2	6	150431	150436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178114
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3649	NC_009051	TC	3	6	151352	151357	0 %	50 %	0 %	50 %	126178117
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3651	NC_009051	TCG	2	6	151464	151469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178117
3652	NC_009051	CTG	2	6	151470	151475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178117
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3654	NC_009051	GGCCCG	2	12	151516	151527	0 %	0 %	50 %	50 %	126178117
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3989	NC_009051	CGG	2	6	165582	165587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3990	NC_009051	CTC	2	6	165633	165638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178134
3991	NC_009051	TCC	2	6	165639	165644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178134
3992	NC_009051	CGT	2	6	165653	165658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178134
3993	NC_009051	GGC	2	6	165701	165706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3994	NC_009051	GCG	2	6	165713	165718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3995	NC_009051	TCG	2	6	165730	165735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178134
3996	NC_009051	ACT	2	6	165760	165765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178134
3997	NC_009051	GCG	2	6	165782	165787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3998	NC_009051	G	6	6	165787	165792	0 %	0 %	100 %	0 %	126178134
3999	NC_009051	GCC	2	6	165819	165824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178134
4000	NC_009051	ATC	2	6	165835	165840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178134

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