MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 59550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009051	CGGC	2	8	103015	103022	0 %	0 %	50 %	50 %	126178063
2502	NC_009051	CTC	2	6	103070	103075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178063
2503	NC_009051	TC	3	6	103222	103227	0 %	50 %	0 %	50 %	126178063
2504	NC_009051	GCGGG	2	10	103264	103273	0 %	0 %	80 %	20 %	126178063
2505	NC_009051	TGC	2	6	103320	103325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178063
2506	NC_009051	TCC	2	6	103350	103355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178063
2507	NC_009051	CGG	2	6	103365	103370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178063
2508	NC_009051	CCGG	2	8	103377	103384	0 %	0 %	50 %	50 %	126178063
2509	NC_009051	GTG	3	9	103424	103432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178063
2510	NC_009051	CCG	3	9	103443	103451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178063
2511	NC_009051	GAC	2	6	103462	103467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178063
2512	NC_009051	TCA	2	6	103491	103496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178063
2513	NC_009051	ACT	2	6	103509	103514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178063
2514	NC_009051	CGGG	2	8	103531	103538	0 %	0 %	75 %	25 %	126178063
2515	NC_009051	GCTC	2	8	103545	103552	0 %	25 %	25 %	50 %	126178063
2516	NC_009051	GGGCG	2	10	103570	103579	0 %	0 %	80 %	20 %	126178063
2517	NC_009051	CGG	2	6	103592	103597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178063
2518	NC_009051	GCCG	2	8	103637	103644	0 %	0 %	50 %	50 %	126178063
2519	NC_009051	CGC	2	6	103693	103698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178063
2520	NC_009051	GGC	2	6	103705	103710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178063
2521	NC_009051	TCG	2	6	103719	103724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178063
2522	NC_009051	CCG	2	6	103875	103880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178063
2523	NC_009051	CGGG	2	8	103947	103954	0 %	0 %	75 %	25 %	126178063
2524	NC_009051	ACG	2	6	103974	103979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178063
2525	NC_009051	GCCG	2	8	103991	103998	0 %	0 %	50 %	50 %	126178063
2526	NC_009051	GGA	2	6	104014	104019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178063
2527	NC_009051	TCGACC	2	12	104022	104033	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126178063
2528	NC_009051	CGCGGT	2	12	104041	104052	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126178063
2529	NC_009051	GCG	2	6	104069	104074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178063
2530	NC_009051	GAG	2	6	104075	104080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178063
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2532	NC_009051	CGG	2	6	104122	104127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178063
2533	NC_009051	GCG	2	6	104141	104146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178063
2534	NC_009051	TCCGGG	2	12	104181	104192	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126178063
2535	NC_009051	GGCT	2	8	104234	104241	0 %	25 %	50 %	25 %	126178063
2536	NC_009051	AGG	2	6	104250	104255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178063
2537	NC_009051	CGTG	2	8	104264	104271	0 %	25 %	50 %	25 %	126178063
2538	NC_009051	TCCC	2	8	104322	104329	0 %	25 %	0 %	75 %	126178064
2539	NC_009051	GAG	2	6	104397	104402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178064
2540	NC_009051	G	7	7	104438	104444	0 %	0 %	100 %	0 %	126178064
2541	NC_009051	CCTCCC	2	12	104522	104533	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	126178064
2542	NC_009051	ATC	2	6	104640	104645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178064
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2545	NC_009051	GGGA	2	8	104740	104747	25 %	0 %	75 %	0 %	126178064
2546	NC_009051	GGA	2	6	104750	104755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178064
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2551	NC_009051	TCGC	2	8	105006	105013	0 %	25 %	25 %	50 %	126178064
2552	NC_009051	CGT	3	9	105026	105034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178064
2553	NC_009051	CGACGG	2	12	105038	105049	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126178064
2554	NC_009051	TCC	2	6	105070	105075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178064
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2557	NC_009051	GTC	2	6	105111	105116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178064
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2564	NC_009051	CGG	2	6	105343	105348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178064
2565	NC_009051	AGCGG	2	10	105411	105420	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2568	NC_009051	AGA	2	6	105485	105490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_009051	TTG	2	6	105516	105521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2571	NC_009051	TCCA	2	8	105634	105641	25 %	25 %	0 %	50 %	126178065
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2573	NC_009051	CT	3	6	105663	105668	0 %	50 %	0 %	50 %	126178065
2574	NC_009051	TCT	2	6	105688	105693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178065
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2581	NC_009051	CGGC	2	8	106005	106012	0 %	0 %	50 %	50 %	126178066
2582	NC_009051	TCG	2	6	106056	106061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178066
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2585	NC_009051	CGGCA	2	10	106131	106140	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2586	NC_009051	TCCC	2	8	106167	106174	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2587	NC_009051	GCC	2	6	106175	106180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2595	NC_009051	CCCTC	2	10	106316	106325	0 %	20 %	0 %	80 %	126178067
2596	NC_009051	CCCG	2	8	106354	106361	0 %	0 %	25 %	75 %	126178067
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2604	NC_009051	GTCCTC	2	12	106591	106602	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126178067
2605	NC_009051	CTC	3	9	106600	106608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178067
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2617	NC_009051	AGG	2	6	106996	107001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_009051	TTG	2	6	107020	107025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178068
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2992	NC_009051	TGGG	2	8	122621	122628	0 %	25 %	75 %	0 %	126178085
2993	NC_009051	TCG	2	6	122698	122703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178085
2994	NC_009051	AC	3	6	122712	122717	50 %	0 %	0 %	50 %	126178085
2995	NC_009051	T	6	6	122729	122734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_009051	ATG	2	6	122741	122746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178086
2997	NC_009051	CGC	2	6	122791	122796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178086
2998	NC_009051	TGA	2	6	122814	122819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178086
2999	NC_009051	TCG	2	6	122847	122852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178086
3000	NC_009051	ATC	2	6	122855	122860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178086

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