MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 59550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009051	CCG	2	6	41196	41201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177995
1002	NC_009051	CGG	2	6	41209	41214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177995
1003	NC_009051	ATA	2	6	41238	41243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126177995
1004	NC_009051	CCGGAT	2	12	41278	41289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_009051	TCG	2	6	41306	41311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_009051	CCGCGC	2	12	41369	41380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_009051	A	6	6	41407	41412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009051	GAC	2	6	41426	41431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1009	NC_009051	GCG	2	6	41440	41445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1010	NC_009051	CGA	2	6	41536	41541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1011	NC_009051	CCG	2	6	41542	41547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177996
1012	NC_009051	GCC	2	6	41570	41575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177996
1013	NC_009051	CTT	2	6	41597	41602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126177996
1014	NC_009051	GAG	2	6	41645	41650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177996
1015	NC_009051	CGA	2	6	41671	41676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1016	NC_009051	GCC	2	6	41681	41686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177996
1017	NC_009051	GCG	2	6	41727	41732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1018	NC_009051	ATC	2	6	41754	41759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177996
1019	NC_009051	AGG	2	6	41794	41799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177996
1020	NC_009051	GGC	2	6	41851	41856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1021	NC_009051	GCC	2	6	41880	41885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177996
1022	NC_009051	CAT	2	6	41897	41902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177996
1023	NC_009051	AGA	2	6	41914	41919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177996
1024	NC_009051	GGAAG	2	10	41920	41929	40 %	0 %	60 %	0 %	126177996
1025	NC_009051	GGC	2	6	42008	42013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1026	NC_009051	GGC	2	6	42068	42073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1027	NC_009051	GGT	2	6	42074	42079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177996
1028	NC_009051	TGG	2	6	42129	42134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177996
1029	NC_009051	CCG	2	6	42150	42155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177996
1030	NC_009051	CGG	2	6	42223	42228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1031	NC_009051	GAT	2	6	42284	42289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177996
1032	NC_009051	TGA	2	6	42334	42339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177996
1033	NC_009051	TGG	2	6	42340	42345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177996
1034	NC_009051	AGG	2	6	42400	42405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177996
1035	NC_009051	CGA	2	6	42442	42447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1036	NC_009051	AGA	2	6	42466	42471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177996
1037	NC_009051	GAG	2	6	42491	42496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177996
1038	NC_009051	GGC	2	6	42518	42523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1039	NC_009051	ATC	2	6	42534	42539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177996
1040	NC_009051	GCG	2	6	42540	42545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1041	NC_009051	TTG	2	6	42555	42560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126177996
1042	NC_009051	GCT	2	6	42578	42583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1043	NC_009051	GAT	2	6	42617	42622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177996
1044	NC_009051	CGA	2	6	42628	42633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1045	NC_009051	CAG	2	6	42650	42655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1046	NC_009051	GAG	2	6	42659	42664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177996
1047	NC_009051	GAT	2	6	42734	42739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177996
1048	NC_009051	GTC	2	6	42836	42841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1049	NC_009051	CGA	2	6	42868	42873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177996
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1051	NC_009051	AG	3	6	42928	42933	50 %	0 %	50 %	0 %	126177996
1052	NC_009051	TGA	2	6	43009	43014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177996
1053	NC_009051	AGCCCG	2	12	43041	43052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126177996
1054	NC_009051	CGAA	2	8	43084	43091	50 %	0 %	25 %	25 %	126177996
1055	NC_009051	GCG	2	6	43122	43127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1056	NC_009051	TCG	2	6	43129	43134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1057	NC_009051	GAC	2	6	43247	43252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177996
1058	NC_009051	CTGT	2	8	43289	43296	0 %	50 %	25 %	25 %	126177996
1059	NC_009051	GGC	2	6	43325	43330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177996
1060	NC_009051	TCT	2	6	43336	43341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126177996
1061	NC_009051	TC	3	6	43447	43452	0 %	50 %	0 %	50 %	126177996
1062	NC_009051	TCC	2	6	43458	43463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_009051	CGG	2	6	43526	43531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009051	CGA	3	9	43577	43585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177997
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1071	NC_009051	GAC	2	6	44016	44021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177997
1072	NC_009051	GCG	2	6	44038	44043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177997
1073	NC_009051	GTTC	2	8	44123	44130	0 %	50 %	25 %	25 %	126177997
1074	NC_009051	GATCCC	2	12	44145	44156	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126177997
1075	NC_009051	CGA	2	6	44159	44164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177997
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1081	NC_009051	TCG	2	6	44401	44406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177997
1082	NC_009051	TCCGC	2	10	44414	44423	0 %	20 %	20 %	60 %	126177997
1083	NC_009051	GTC	2	6	44436	44441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177997
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1086	NC_009051	CGA	2	6	44492	44497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177997
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1088	NC_009051	CCA	2	6	44531	44536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177997
1089	NC_009051	GAT	2	6	44541	44546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177997
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1091	NC_009051	ATC	2	6	44623	44628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177997
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1094	NC_009051	CGTCC	2	10	44748	44757	0 %	20 %	20 %	60 %	126177997
1095	NC_009051	CGG	2	6	44807	44812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177997
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1099	NC_009051	G	6	6	45058	45063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009051	CAC	2	6	45094	45099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_009051	ACC	2	6	45165	45170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177998
1102	NC_009051	GCA	2	6	45183	45188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177998
1103	NC_009051	CCGC	2	8	45218	45225	0 %	0 %	25 %	75 %	126177998
1104	NC_009051	CCT	2	6	45245	45250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177998
1105	NC_009051	GTC	2	6	45255	45260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177998
1106	NC_009051	G	6	6	45269	45274	0 %	0 %	100 %	0 %	126177998
1107	NC_009051	CTT	2	6	45282	45287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126177998
1108	NC_009051	TCG	2	6	45295	45300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177998
1109	NC_009051	CGG	2	6	45313	45318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177998
1110	NC_009051	TCG	3	9	45376	45384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177998
1111	NC_009051	TCG	2	6	45441	45446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177998
1112	NC_009051	ATC	2	6	45507	45512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177998
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1114	NC_009051	TGG	2	6	45547	45552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177998
1115	NC_009051	TAC	2	6	45570	45575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177998
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1119	NC_009051	TCG	2	6	45703	45708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177998
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1122	NC_009051	GC	3	6	45798	45803	0 %	0 %	50 %	50 %	126177998
1123	NC_009051	A	6	6	45804	45809	100 %	0 %	0 %	0 %	126177998
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1125	NC_009051	TTA	2	6	45842	45847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_009051	CGG	2	6	50613	50618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178004
1253	NC_009051	ACGA	2	8	50675	50682	50 %	0 %	25 %	25 %	126178004
1254	NC_009051	C	6	6	50795	50800	0 %	0 %	0 %	100 %	126178005
1255	NC_009051	C	8	8	50833	50840	0 %	0 %	0 %	100 %	126178005
1256	NC_009051	CGC	3	9	50842	50850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178005
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1260	NC_009051	CGG	2	6	51052	51057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178005
1261	NC_009051	CGG	2	6	51134	51139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178005
1262	NC_009051	GCG	2	6	51149	51154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178005
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1264	NC_009051	GCG	2	6	51231	51236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178005
1265	NC_009051	GTT	2	6	51287	51292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178005
1266	NC_009051	CGGGG	2	10	51296	51305	0 %	0 %	80 %	20 %	126178005
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1272	NC_009051	GCCG	2	8	51446	51453	0 %	0 %	50 %	50 %	126178005
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1275	NC_009051	GAT	2	6	51580	51585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178005
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1297	NC_009051	CCCGG	2	10	52551	52560	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1302	NC_009051	GGT	2	6	53013	53018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1374	NC_009051	GA	3	6	56684	56689	50 %	0 %	50 %	0 %	126178012
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1376	NC_009051	TTG	2	6	56699	56704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178012
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