MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 59550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009051	GGC	2	6	19812	19817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177978
502	NC_009051	GAC	2	6	19920	19925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177978
503	NC_009051	GCCG	2	8	20001	20008	0 %	0 %	50 %	50 %	126177978
504	NC_009051	GCG	2	6	20016	20021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177978
505	NC_009051	GGC	2	6	20054	20059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177978
506	NC_009051	TCG	2	6	20064	20069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177978
507	NC_009051	GCC	2	6	20083	20088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177978
508	NC_009051	CTA	2	6	20099	20104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177978
509	NC_009051	CGC	2	6	20116	20121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177978
510	NC_009051	CGGC	2	8	20167	20174	0 %	0 %	50 %	50 %	126177978
511	NC_009051	CGC	2	6	20243	20248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177978
512	NC_009051	AT	3	6	20261	20266	50 %	50 %	0 %	0 %	126177978
513	NC_009051	GGA	2	6	20320	20325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177978
514	NC_009051	CT	3	6	20331	20336	0 %	50 %	0 %	50 %	126177978
515	NC_009051	CCG	2	6	20373	20378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177978
516	NC_009051	CT	3	6	20415	20420	0 %	50 %	0 %	50 %	126177978
517	NC_009051	CGG	2	6	20572	20577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177979
518	NC_009051	CCT	2	6	20641	20646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177979
519	NC_009051	TGA	2	6	20701	20706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177979
520	NC_009051	CGGCC	2	10	20713	20722	0 %	0 %	40 %	60 %	126177979
521	NC_009051	GCCT	2	8	20734	20741	0 %	25 %	25 %	50 %	126177979
522	NC_009051	GGC	2	6	20753	20758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177979
523	NC_009051	CGG	2	6	20821	20826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177979
524	NC_009051	TCG	2	6	20889	20894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177979
525	NC_009051	AGC	2	6	20901	20906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177979
526	NC_009051	ATC	2	6	20934	20939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177979
527	NC_009051	C	8	8	20953	20960	0 %	0 %	0 %	100 %	126177979
528	NC_009051	CCT	2	6	21016	21021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177979
529	NC_009051	AT	3	6	21064	21069	50 %	50 %	0 %	0 %	126177979
530	NC_009051	G	6	6	21070	21075	0 %	0 %	100 %	0 %	126177979
531	NC_009051	TGG	2	6	21123	21128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177979
532	NC_009051	CG	3	6	21153	21158	0 %	0 %	50 %	50 %	126177979
533	NC_009051	CGG	2	6	21186	21191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177979
534	NC_009051	TCC	2	6	21271	21276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177979
535	NC_009051	GAG	2	6	21278	21283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177979
536	NC_009051	GGAG	2	8	21304	21311	25 %	0 %	75 %	0 %	126177979
537	NC_009051	CGT	2	6	21343	21348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177979
538	NC_009051	GTT	2	6	21362	21367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126177979
539	NC_009051	GAA	2	6	21421	21426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
540	NC_009051	AAG	2	6	21513	21518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
541	NC_009051	CGA	2	6	21564	21569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177980
542	NC_009051	TCCT	2	8	21573	21580	0 %	50 %	0 %	50 %	126177980
543	NC_009051	GAC	2	6	21589	21594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177980
544	NC_009051	GAT	2	6	21610	21615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
545	NC_009051	TGA	2	6	21642	21647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
546	NC_009051	GAT	2	6	21658	21663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
547	NC_009051	CAC	2	6	21667	21672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177980
548	NC_009051	CCT	2	6	21708	21713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177980
549	NC_009051	GAG	2	6	21727	21732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
550	NC_009051	AG	3	6	21762	21767	50 %	0 %	50 %	0 %	126177980
551	NC_009051	CGG	2	6	21781	21786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177980
552	NC_009051	AG	3	6	21820	21825	50 %	0 %	50 %	0 %	126177980
553	NC_009051	AGA	2	6	21840	21845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
554	NC_009051	GAT	2	6	21922	21927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
555	NC_009051	C	6	6	21928	21933	0 %	0 %	0 %	100 %	126177980
556	NC_009051	GAGGAC	2	12	21934	21945	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126177980
557	NC_009051	CCGA	2	8	21970	21977	25 %	0 %	25 %	50 %	126177980
558	NC_009051	GAA	3	9	22009	22017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
559	NC_009051	GAG	2	6	22051	22056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
560	NC_009051	CGG	2	6	22086	22091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177980
561	NC_009051	TCC	2	6	22165	22170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177980
562	NC_009051	CGC	2	6	22183	22188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177980
563	NC_009051	GAC	2	6	22216	22221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177980
564	NC_009051	AGG	2	6	22254	22259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
565	NC_009051	GGA	3	9	22260	22268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
566	NC_009051	GAC	2	6	22298	22303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177980
567	NC_009051	CCG	2	6	22307	22312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177980
568	NC_009051	GAT	2	6	22333	22338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177980
569	NC_009051	CAT	2	6	22366	22371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177980
570	NC_009051	GAA	2	6	22381	22386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
571	NC_009051	GAA	3	9	22393	22401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177980
572	NC_009051	GAG	2	6	22414	22419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177980
573	NC_009051	TTC	2	6	22514	22519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_009051	ACA	3	9	22641	22649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_009051	CGG	2	6	22661	22666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_009051	CCG	2	6	22670	22675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_009051	CCG	2	6	22737	22742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_009051	GGGC	2	8	22795	22802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
579	NC_009051	AT	3	6	22823	22828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009051	TTTA	2	8	22852	22859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009051	GAA	2	6	22931	22936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177981
582	NC_009051	GAA	2	6	23025	23030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177981
583	NC_009051	CTG	2	6	23032	23037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177981
584	NC_009051	ACA	2	6	23065	23070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126177981
585	NC_009051	TCA	2	6	23107	23112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177981
586	NC_009051	CTG	2	6	23114	23119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177981
587	NC_009051	GCG	2	6	23127	23132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177981
588	NC_009051	GTC	2	6	23166	23171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177981
589	NC_009051	GCA	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177981
590	NC_009051	CGT	2	6	23210	23215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177981
591	NC_009051	CAC	2	6	23228	23233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126177981
592	NC_009051	GGA	2	6	23267	23272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177981
593	NC_009051	TTA	2	6	23309	23314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126177981
594	NC_009051	AGC	2	6	23342	23347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177981
595	NC_009051	GAG	2	6	23439	23444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177981
596	NC_009051	CG	3	6	23483	23488	0 %	0 %	50 %	50 %	126177981
597	NC_009051	ATG	2	6	23544	23549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126177981
598	NC_009051	ACT	2	6	23731	23736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177981
599	NC_009051	CCGG	2	8	23742	23749	0 %	0 %	50 %	50 %	126177981
600	NC_009051	CGG	2	6	23785	23790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177981
601	NC_009051	TGG	2	6	23832	23837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177981
602	NC_009051	AAG	2	6	23934	23939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177981
603	NC_009051	CTACGA	2	12	23954	23965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126177981
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605	NC_009051	AG	3	6	23984	23989	50 %	0 %	50 %	0 %	126177981
606	NC_009051	TCC	2	6	23992	23997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177981
607	NC_009051	AGAC	2	8	24038	24045	50 %	0 %	25 %	25 %	126177982
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609	NC_009051	ACG	2	6	24195	24200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177982
610	NC_009051	AT	3	6	24265	24270	50 %	50 %	0 %	0 %	126177982
611	NC_009051	GT	3	6	24287	24292	0 %	50 %	50 %	0 %	126177982
612	NC_009051	GAA	2	6	24311	24316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126177982
613	NC_009051	CGC	2	6	24361	24366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126177982
614	NC_009051	CGT	2	6	24505	24510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177982
615	NC_009051	GAG	2	6	24711	24716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126177982
616	NC_009051	TCG	2	6	24723	24728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126177982
617	NC_009051	TCA	2	6	24753	24758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126177982
618	NC_009051	CCT	2	6	24769	24774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177982
619	NC_009051	GACG	2	8	24796	24803	25 %	0 %	50 %	25 %	126177982
620	NC_009051	TGG	2	6	24835	24840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126177982
621	NC_009051	TCT	2	6	24861	24866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126177982
622	NC_009051	C	6	6	25008	25013	0 %	0 %	0 %	100 %	126177982
623	NC_009051	CGA	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126177982
624	NC_009051	GGC	2	6	25061	25066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126177982
625	NC_009051	CTC	2	6	25090	25095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126177982
626	NC_009051	CGGGC	2	10	25114	25123	0 %	0 %	60 %	40 %	126177982
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628	NC_009051	GGAT	2	8	25199	25206	25 %	25 %	50 %	0 %	126177983
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