MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 59550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009051	TGGA	2	8	252837	252844	25 %	25 %	50 %	0 %	126178226
6002	NC_009051	GGC	2	6	252872	252877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178226
6003	NC_009051	CCG	2	6	252891	252896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178226
6004	NC_009051	ATG	2	6	252903	252908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178226
6005	NC_009051	ACG	2	6	252921	252926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178226
6006	NC_009051	CGGC	2	8	252930	252937	0 %	0 %	50 %	50 %	126178226
6007	NC_009051	CCT	2	6	252967	252972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178226
6008	NC_009051	GGT	2	6	252997	253002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178226
6009	NC_009051	CCG	2	6	253014	253019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178226
6010	NC_009051	CCG	2	6	253021	253026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178226
6011	NC_009051	CGAAG	2	10	253034	253043	40 %	0 %	40 %	20 %	126178226
6012	NC_009051	C	6	6	253106	253111	0 %	0 %	0 %	100 %	126178226
6013	NC_009051	TTC	2	6	253134	253139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178226
6014	NC_009051	GAC	2	6	253184	253189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178226
6015	NC_009051	GCCG	2	8	253205	253212	0 %	0 %	50 %	50 %	126178226
6016	NC_009051	ACC	2	6	253296	253301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178226
6017	NC_009051	TTC	2	6	253308	253313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178226
6018	NC_009051	CGG	2	6	253321	253326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178226
6019	NC_009051	ATCG	2	8	253328	253335	25 %	25 %	25 %	25 %	126178226
6020	NC_009051	TGC	2	6	253372	253377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178226
6021	NC_009051	TCG	2	6	253392	253397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178226
6022	NC_009051	ATT	2	6	253521	253526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126178226
6023	NC_009051	TA	3	6	253575	253580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_009051	GCA	2	6	253590	253595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_009051	CGA	2	6	253608	253613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178227
6026	NC_009051	CAA	2	6	253626	253631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178227
6027	NC_009051	CGAC	2	8	253656	253663	25 %	0 %	25 %	50 %	126178227
6028	NC_009051	GGA	2	6	253669	253674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178227
6029	NC_009051	TCG	2	6	253709	253714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178227
6030	NC_009051	TGA	3	9	253809	253817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178227
6031	NC_009051	CTC	2	6	253868	253873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178227
6032	NC_009051	ACA	2	6	253920	253925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178227
6033	NC_009051	CAT	2	6	253933	253938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178227
6034	NC_009051	GCCG	2	8	253952	253959	0 %	0 %	50 %	50 %	126178227
6035	NC_009051	GAA	2	6	253999	254004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178227
6036	NC_009051	CTC	2	6	254033	254038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178227
6037	NC_009051	ATC	2	6	254039	254044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178227
6038	NC_009051	ATC	2	6	254048	254053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178227
6039	NC_009051	ATC	2	6	254063	254068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178227
6040	NC_009051	CAT	2	6	254089	254094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178227
6041	NC_009051	CGC	3	9	254095	254103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178227
6042	NC_009051	GAG	2	6	254141	254146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178227
6043	NC_009051	GCG	2	6	254265	254270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178227
6044	NC_009051	G	7	7	254327	254333	0 %	0 %	100 %	0 %	126178227
6045	NC_009051	CGA	2	6	254344	254349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178227
6046	NC_009051	C	6	6	254364	254369	0 %	0 %	0 %	100 %	126178227
6047	NC_009051	CAG	2	6	254375	254380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178227
6048	NC_009051	CTG	2	6	254384	254389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178227
6049	NC_009051	AGG	2	6	254400	254405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178227
6050	NC_009051	AGCG	2	8	254429	254436	25 %	0 %	50 %	25 %	126178227
6051	NC_009051	GCG	2	6	254442	254447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178227
6052	NC_009051	TGA	2	6	254484	254489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178227
6053	NC_009051	GGCA	2	8	254494	254501	25 %	0 %	50 %	25 %	126178227
6054	NC_009051	GCTACG	2	12	254553	254564	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126178227
6055	NC_009051	GGA	2	6	254587	254592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178227
6056	NC_009051	GAA	2	6	254608	254613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178227
6057	NC_009051	TCC	2	6	254616	254621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178227
6058	NC_009051	AGG	2	6	254634	254639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178227
6059	NC_009051	ACG	2	6	254646	254651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178227
6060	NC_009051	GCC	2	6	254675	254680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178227
6061	NC_009051	GGGC	2	8	254755	254762	0 %	0 %	75 %	25 %	126178227
6062	NC_009051	GGCG	2	8	254773	254780	0 %	0 %	75 %	25 %	126178227
6063	NC_009051	CGC	2	6	254830	254835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178227
6064	NC_009051	CGA	2	6	254872	254877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178227
6065	NC_009051	CGT	2	6	254911	254916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178227
6066	NC_009051	ACGGT	2	10	255021	255030	20 %	20 %	40 %	20 %	126178227
6067	NC_009051	TCA	2	6	255090	255095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178227
6068	NC_009051	CGG	2	6	255157	255162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178227
6069	NC_009051	CGG	2	6	255198	255203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178227
6070	NC_009051	TCCG	2	8	255263	255270	0 %	25 %	25 %	50 %	126178227
6071	NC_009051	CGG	2	6	255289	255294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178227
6072	NC_009051	GGC	3	9	255313	255321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178227
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6075	NC_009051	CGA	2	6	255364	255369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178227
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6077	NC_009051	GGT	2	6	255406	255411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178227
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6079	NC_009051	TGA	2	6	255548	255553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178227
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6081	NC_009051	GGC	2	6	255760	255765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178228
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6084	NC_009051	GAAGA	2	10	255872	255881	60 %	0 %	40 %	0 %	126178228
6085	NC_009051	GCT	2	6	255886	255891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178228
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6087	NC_009051	GTCCG	2	10	256013	256022	0 %	20 %	40 %	40 %	126178228
6088	NC_009051	GTC	2	6	256031	256036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178228
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6091	NC_009051	CGAG	2	8	256251	256258	25 %	0 %	50 %	25 %	126178228
6092	NC_009051	TCG	2	6	256335	256340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178228
6093	NC_009051	TCCC	3	12	256345	256356	0 %	25 %	0 %	75 %	126178228
6094	NC_009051	ATC	2	6	256412	256417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178228
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6099	NC_009051	GC	3	6	256833	256838	0 %	0 %	50 %	50 %	126178228
6100	NC_009051	G	6	6	256868	256873	0 %	0 %	100 %	0 %	126178228
6101	NC_009051	GGGA	2	8	256916	256923	25 %	0 %	75 %	0 %	126178229
6102	NC_009051	TCT	2	6	256949	256954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178229
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6105	NC_009051	GGAA	2	8	257096	257103	50 %	0 %	50 %	0 %	126178229
6106	NC_009051	GTC	2	6	257129	257134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178229
6107	NC_009051	TCG	3	9	257213	257221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178229
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6111	NC_009051	CGGCG	2	10	257262	257271	0 %	0 %	60 %	40 %	126178229
6112	NC_009051	GCG	2	6	257342	257347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178229
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6122	NC_009051	CCT	2	6	257565	257570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178229
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6245	NC_009051	CAT	2	6	262472	262477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178235
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6351	NC_009051	GCC	2	6	267543	267548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178240
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6358	NC_009051	AG	4	8	267735	267742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6359	NC_009051	TGC	2	6	267806	267811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178241
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6361	NC_009051	GAC	2	6	267859	267864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178241
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6363	NC_009051	GTC	2	6	267919	267924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178241
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6487	NC_009051	GGC	2	6	272381	272386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178246
6488	NC_009051	GAG	2	6	272414	272419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178246
6489	NC_009051	CCT	2	6	272444	272449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178246
6490	NC_009051	ATG	2	6	272471	272476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178246
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