MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 59550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59501	NC_009051	AAG	2	6	2476312	2476317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126180439
59502	NC_009051	TCA	2	6	2476331	2476336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126180439
59503	NC_009051	CCG	2	6	2476365	2476370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126180439
59504	NC_009051	CAA	2	6	2476377	2476382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126180439
59505	NC_009051	TCGA	2	8	2476393	2476400	25 %	25 %	25 %	25 %	126180439
59506	NC_009051	CGC	2	6	2476455	2476460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126180439
59507	NC_009051	AGC	2	6	2476472	2476477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180439
59508	NC_009051	GAG	2	6	2476513	2476518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180439
59509	NC_009051	TGAA	2	8	2476543	2476550	50 %	25 %	25 %	0 %	126180439
59510	NC_009051	GGA	2	6	2476635	2476640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180440
59511	NC_009051	CGA	2	6	2476645	2476650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180440
59512	NC_009051	CAT	2	6	2476663	2476668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126180440
59513	NC_009051	GACGG	2	10	2476690	2476699	20 %	0 %	60 %	20 %	126180440
59514	NC_009051	GGC	2	6	2476711	2476716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180440
59515	NC_009051	TGCC	2	8	2476726	2476733	0 %	25 %	25 %	50 %	126180440
59516	NC_009051	CGG	2	6	2476744	2476749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180440
59517	NC_009051	CTC	2	6	2476784	2476789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126180440
59518	NC_009051	CGC	2	6	2476792	2476797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126180440
59519	NC_009051	TCG	2	6	2476823	2476828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180440
59520	NC_009051	AGGG	2	8	2476935	2476942	25 %	0 %	75 %	0 %	126180440
59521	NC_009051	GAG	2	6	2476943	2476948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180440
59522	NC_009051	CTT	2	6	2476970	2476975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126180440
59523	NC_009051	GAG	2	6	2477000	2477005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180440
59524	NC_009051	GAG	2	6	2477021	2477026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180440
59525	NC_009051	CTC	2	6	2477060	2477065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126180440
59526	NC_009051	CGA	2	6	2477084	2477089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59527	NC_009051	T	8	8	2477091	2477098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59528	NC_009051	TTG	2	6	2477127	2477132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59529	NC_009051	GAT	3	9	2477207	2477215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126180441
59530	NC_009051	GCG	2	6	2477223	2477228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180441
59531	NC_009051	TCG	2	6	2477242	2477247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180441
59532	NC_009051	AGA	2	6	2477260	2477265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126180441
59533	NC_009051	CGA	2	6	2477278	2477283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126180441
59534	NC_009051	T	6	6	2477371	2477376	0 %	100 %	0 %	0 %	126180441
59535	NC_009051	CGT	2	6	2477407	2477412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180441
59536	NC_009051	CG	3	6	2477468	2477473	0 %	0 %	50 %	50 %	126180441
59537	NC_009051	TCG	2	6	2477499	2477504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180441
59538	NC_009051	CGG	2	6	2477539	2477544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126180441
59539	NC_009051	AGG	2	6	2477547	2477552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126180441
59540	NC_009051	TGA	2	6	2477608	2477613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126180441
59541	NC_009051	GCT	2	6	2477645	2477650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126180441
59542	NC_009051	TTC	2	6	2477660	2477665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59543	NC_009051	CGC	2	6	2477760	2477765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59544	NC_009051	GGA	2	6	2477777	2477782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59545	NC_009051	G	6	6	2477790	2477795	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59546	NC_009051	CT	3	6	2477960	2477965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59547	NC_009051	CGG	2	6	2477968	2477973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59548	NC_009051	ATCG	3	12	2477974	2477985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59549	NC_009051	CCCTG	2	10	2478025	2478034	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59550	NC_009051	CT	3	6	2478080	2478085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.