MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 59550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009051	GCC	2	6	231998	232003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178202
5502	NC_009051	CGC	3	9	232009	232017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178202
5503	NC_009051	TCC	2	6	232053	232058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178202
5504	NC_009051	CGC	2	6	232099	232104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178202
5505	NC_009051	CTC	4	12	232112	232123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178202
5506	NC_009051	TCG	2	6	232143	232148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178202
5507	NC_009051	GCC	2	6	232161	232166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178202
5508	NC_009051	TCG	2	6	232191	232196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178202
5509	NC_009051	TGGGGA	2	12	232203	232214	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	126178202
5510	NC_009051	GCT	2	6	232243	232248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178202
5511	NC_009051	GAC	2	6	232255	232260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178202
5512	NC_009051	CGC	2	6	232267	232272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178202
5513	NC_009051	TGC	2	6	232290	232295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178202
5514	NC_009051	TCT	2	6	232314	232319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178202
5515	NC_009051	ACC	2	6	232331	232336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178202
5516	NC_009051	CAT	2	6	232339	232344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178202
5517	NC_009051	CTA	2	6	232363	232368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178202
5518	NC_009051	TGG	2	6	232386	232391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178202
5519	NC_009051	ATG	2	6	232394	232399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178202
5520	NC_009051	GAT	2	6	232411	232416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178202
5521	NC_009051	TCA	2	6	232452	232457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178202
5522	NC_009051	CGA	2	6	232464	232469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178202
5523	NC_009051	TC	3	6	232537	232542	0 %	50 %	0 %	50 %	126178202
5524	NC_009051	TCC	2	6	232554	232559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178202
5525	NC_009051	TCT	2	6	232660	232665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_009051	AGC	2	6	232803	232808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5527	NC_009051	CTC	2	6	232883	232888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178203
5528	NC_009051	CGA	2	6	232903	232908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5529	NC_009051	CGG	2	6	232974	232979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178203
5530	NC_009051	AGC	2	6	233064	233069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5531	NC_009051	CTG	2	6	233075	233080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5532	NC_009051	GGA	2	6	233086	233091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178203
5533	NC_009051	GAG	2	6	233138	233143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178203
5534	NC_009051	CCG	2	6	233149	233154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178203
5535	NC_009051	TCT	2	6	233176	233181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178203
5536	NC_009051	GAA	2	6	233212	233217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178203
5537	NC_009051	TC	3	6	233221	233226	0 %	50 %	0 %	50 %	126178203
5538	NC_009051	TCGA	2	8	233258	233265	25 %	25 %	25 %	25 %	126178203
5539	NC_009051	TCT	2	6	233289	233294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178203
5540	NC_009051	TTC	2	6	233345	233350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178203
5541	NC_009051	CGA	2	6	233379	233384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5542	NC_009051	CG	3	6	233443	233448	0 %	0 %	50 %	50 %	126178203
5543	NC_009051	GAA	2	6	233534	233539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178203
5544	NC_009051	GCC	2	6	233548	233553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178203
5545	NC_009051	TGC	2	6	233580	233585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5546	NC_009051	GAAACG	2	12	233617	233628	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126178203
5547	NC_009051	CGG	2	6	233716	233721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178203
5548	NC_009051	CGA	2	6	233736	233741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5549	NC_009051	ATC	2	6	233780	233785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178203
5550	NC_009051	CGA	2	6	233839	233844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5551	NC_009051	CGG	2	6	233878	233883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178203
5552	NC_009051	GTG	2	6	233930	233935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178203
5553	NC_009051	AAG	2	6	233936	233941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178203
5554	NC_009051	TCA	2	6	233970	233975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178203
5555	NC_009051	GCG	2	6	234023	234028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178203
5556	NC_009051	CTC	2	6	234043	234048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178203
5557	NC_009051	GAG	2	6	234089	234094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178203
5558	NC_009051	TCC	2	6	234119	234124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178203
5559	NC_009051	CGG	2	6	234156	234161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178203
5560	NC_009051	TCG	2	6	234165	234170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5561	NC_009051	CTA	2	6	234184	234189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178203
5562	NC_009051	GAA	2	6	234363	234368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_009051	CGGTG	2	10	234492	234501	0 %	20 %	60 %	20 %	126178204
5564	NC_009051	AAG	2	6	234519	234524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178204
5565	NC_009051	TCT	2	6	234564	234569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_009051	CT	3	6	234596	234601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_009051	GAG	2	6	234637	234642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_009051	G	6	6	234654	234659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_009051	GCCG	2	8	234667	234674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_009051	GGTGA	2	10	234791	234800	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_009051	GAT	2	6	234805	234810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178205
5572	NC_009051	CGGTG	2	10	234929	234938	0 %	20 %	60 %	20 %	126178205
5573	NC_009051	GAA	2	6	234943	234948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178205
5574	NC_009051	GCC	2	6	234978	234983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5575	NC_009051	C	6	6	234982	234987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5576	NC_009051	ACA	2	6	234988	234993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_009051	TCT	2	6	234996	235001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_009051	GT	4	8	235011	235018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_009051	TCG	2	6	235134	235139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178206
5580	NC_009051	GGC	2	6	235266	235271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178206
5581	NC_009051	TCG	2	6	235285	235290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_009051	TAC	2	6	235331	235336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178207
5583	NC_009051	CGA	2	6	235392	235397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5584	NC_009051	GGCG	2	8	235404	235411	0 %	0 %	75 %	25 %	126178207
5585	NC_009051	CGA	2	6	235434	235439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5586	NC_009051	ACG	2	6	235457	235462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5587	NC_009051	GCG	2	6	235520	235525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178207
5588	NC_009051	CTCGA	2	10	235526	235535	20 %	20 %	20 %	40 %	126178207
5589	NC_009051	CCT	2	6	235557	235562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178207
5590	NC_009051	CCGG	2	8	235563	235570	0 %	0 %	50 %	50 %	126178207
5591	NC_009051	GAC	2	6	235612	235617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5592	NC_009051	TCG	2	6	235635	235640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5593	NC_009051	GGC	2	6	235696	235701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178207
5594	NC_009051	TCG	2	6	235733	235738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5595	NC_009051	GTG	2	6	235813	235818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178207
5596	NC_009051	CGT	2	6	235834	235839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5597	NC_009051	GTC	2	6	235844	235849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5598	NC_009051	CCT	2	6	235870	235875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178207
5599	NC_009051	TCG	2	6	235916	235921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5600	NC_009051	CGC	2	6	235963	235968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178207
5601	NC_009051	GCT	3	9	235971	235979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5602	NC_009051	GTC	2	6	236000	236005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5603	NC_009051	AGG	2	6	236012	236017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178207
5604	NC_009051	GAG	2	6	236029	236034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178207
5605	NC_009051	GCGG	2	8	236065	236072	0 %	0 %	75 %	25 %	126178207
5606	NC_009051	GCT	2	6	236085	236090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5607	NC_009051	GAG	2	6	236254	236259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178207
5608	NC_009051	CGT	2	6	236328	236333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5609	NC_009051	CGG	2	6	236367	236372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178207
5610	NC_009051	C	6	6	236391	236396	0 %	0 %	0 %	100 %	126178208
5611	NC_009051	CCG	2	6	236399	236404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178208
5612	NC_009051	CGAG	2	8	236424	236431	25 %	0 %	50 %	25 %	126178208
5613	NC_009051	GCG	2	6	236462	236467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
5614	NC_009051	TGA	2	6	236595	236600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178208
5615	NC_009051	CGA	3	9	236769	236777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178208
5616	NC_009051	AGA	2	6	236847	236852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178208
5617	NC_009051	AGC	2	6	236855	236860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178208
5618	NC_009051	GCG	2	6	236877	236882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
5619	NC_009051	GAGC	2	8	236886	236893	25 %	0 %	50 %	25 %	126178208
5620	NC_009051	CGG	2	6	236967	236972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
5621	NC_009051	CGA	2	6	236973	236978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178208
5622	NC_009051	CGAG	2	8	237009	237016	25 %	0 %	50 %	25 %	126178208
5623	NC_009051	GCG	2	6	237072	237077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
5624	NC_009051	GAC	2	6	237100	237105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178208
5625	NC_009051	AAGA	2	8	237139	237146	75 %	0 %	25 %	0 %	126178208
5626	NC_009051	GGC	2	6	237175	237180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
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5629	NC_009051	GGA	2	6	237264	237269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178209
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5632	NC_009051	GAC	2	6	237387	237392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178209
5633	NC_009051	CGG	2	6	237491	237496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178209
5634	NC_009051	GATGAG	2	12	237513	237524	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126178209
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5659	NC_009051	C	7	7	238433	238439	0 %	0 %	0 %	100 %	126178210
5660	NC_009051	CCCT	2	8	238571	238578	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5661	NC_009051	TGGAC	2	10	238602	238611	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5662	NC_009051	ATT	2	6	238623	238628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5681	NC_009051	CCGA	2	8	239334	239341	25 %	0 %	25 %	50 %	126178212
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5688	NC_009051	GGCG	2	8	239584	239591	0 %	0 %	75 %	25 %	126178212
5689	NC_009051	TCGTC	2	10	239620	239629	0 %	40 %	20 %	40 %	126178212
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5709	NC_009051	GCCG	2	8	240530	240537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5710	NC_009051	CCG	2	6	240653	240658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178214
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5730	NC_009051	CCCTC	2	10	241367	241376	0 %	20 %	0 %	80 %	126178214
5731	NC_009051	GCT	2	6	241455	241460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178214
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5734	NC_009051	CTC	2	6	241607	241612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5735	NC_009051	TTC	2	6	241617	241622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5736	NC_009051	AGGGG	2	10	241834	241843	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5737	NC_009051	GCCCCC	2	12	241977	241988	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
5738	NC_009051	GAG	2	6	242001	242006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5739	NC_009051	TGGGG	2	10	242020	242029	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5740	NC_009051	AGGGG	2	10	242060	242069	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5741	NC_009051	G	7	7	242066	242072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5742	NC_009051	GAA	2	6	242083	242088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5743	NC_009051	TTC	2	6	242094	242099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5744	NC_009051	TTCGC	2	10	242105	242114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5745	NC_009051	C	6	6	242116	242121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5746	NC_009051	TTC	2	6	242128	242133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5747	NC_009051	GCTCC	2	10	242185	242194	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5748	NC_009051	TCGCAC	2	12	242204	242215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5749	NC_009051	TCGCT	2	10	242231	242240	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5750	NC_009051	CCA	2	6	242417	242422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5752	NC_009051	GT	4	8	242469	242476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5753	NC_009051	CAC	2	6	242510	242515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5754	NC_009051	A	6	6	242527	242532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5755	NC_009051	TCT	2	6	242564	242569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178215
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5988	NC_009051	TCGA	2	8	252251	252258	25 %	25 %	25 %	25 %	126178225
5989	NC_009051	CGGCG	2	10	252264	252273	0 %	0 %	60 %	40 %	126178225
5990	NC_009051	CCCG	2	8	252334	252341	0 %	0 %	25 %	75 %	126178225
5991	NC_009051	CCG	2	6	252356	252361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
5992	NC_009051	CGG	2	6	252411	252416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178225
5993	NC_009051	CCG	2	6	252442	252447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
5994	NC_009051	CCGG	2	8	252451	252458	0 %	0 %	50 %	50 %	126178225
5995	NC_009051	CGG	2	6	252534	252539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178225
5996	NC_009051	G	6	6	252549	252554	0 %	0 %	100 %	0 %	126178225
5997	NC_009051	GGA	2	6	252639	252644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178225
5998	NC_009051	CCT	2	6	252653	252658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178225
5999	NC_009051	GAC	2	6	252761	252766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178226
6000	NC_009051	CGC	2	6	252779	252784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178226

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