MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 59550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009051	CGA	2	6	213048	213053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178187
5003	NC_009051	GAC	2	6	213088	213093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178187
5004	NC_009051	TCG	2	6	213108	213113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178187
5005	NC_009051	GCGA	2	8	213119	213126	25 %	0 %	50 %	25 %	126178187
5006	NC_009051	GATG	2	8	213138	213145	25 %	25 %	50 %	0 %	126178187
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5008	NC_009051	GGC	2	6	213229	213234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178187
5009	NC_009051	CGG	2	6	213271	213276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178187
5010	NC_009051	GTC	2	6	213349	213354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178187
5011	NC_009051	GTC	2	6	213376	213381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178187
5012	NC_009051	CACC	2	8	213393	213400	25 %	0 %	0 %	75 %	126178187
5013	NC_009051	GA	3	6	213434	213439	50 %	0 %	50 %	0 %	126178187
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5015	NC_009051	TCG	2	6	213512	213517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178187
5016	NC_009051	CGC	2	6	213580	213585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178187
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5018	NC_009051	C	6	6	213600	213605	0 %	0 %	0 %	100 %	126178187
5019	NC_009051	GCCC	2	8	213606	213613	0 %	0 %	25 %	75 %	126178187
5020	NC_009051	GAG	2	6	213616	213621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178187
5021	NC_009051	CGA	2	6	213639	213644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178187
5022	NC_009051	CGC	2	6	213651	213656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178187
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5034	NC_009051	GCCGC	2	10	214057	214066	0 %	0 %	40 %	60 %	126178187
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5122	NC_009051	TCT	2	6	217981	217986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178190
5123	NC_009051	GGT	2	6	217997	218002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178190
5124	NC_009051	TTC	2	6	218010	218015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178190
5125	NC_009051	CG	4	8	218042	218049	0 %	0 %	50 %	50 %	126178190
5126	NC_009051	CCT	2	6	218104	218109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178190
5127	NC_009051	CCT	2	6	218149	218154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178190
5128	NC_009051	GAG	2	6	218223	218228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178190
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5130	NC_009051	TTC	2	6	218277	218282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178190
5131	NC_009051	CGA	2	6	218314	218319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178190
5132	NC_009051	GAT	2	6	218417	218422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178190
5133	NC_009051	GCC	2	6	218534	218539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178190
5134	NC_009051	TCT	2	6	218608	218613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178190
5135	NC_009051	CGG	2	6	218656	218661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178190
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5138	NC_009051	TTC	2	6	218747	218752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178190
5139	NC_009051	TCA	2	6	218764	218769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178190
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5142	NC_009051	TTG	2	6	218934	218939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178190
5143	NC_009051	GAT	2	6	218948	218953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178190
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5147	NC_009051	GCG	2	6	219015	219020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178190
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5151	NC_009051	TCG	2	6	219102	219107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178190
5152	NC_009051	CGA	2	6	219160	219165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178190
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5154	NC_009051	CTG	2	6	219293	219298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178190
5155	NC_009051	CGATGG	2	12	219346	219357	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126178190
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5160	NC_009051	TGG	2	6	219498	219503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178190
5161	NC_009051	GAT	2	6	219506	219511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178190
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5171	NC_009051	GTA	2	6	219785	219790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178190
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5182	NC_009051	CGT	2	6	220111	220116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178190
5183	NC_009051	CG	3	6	220128	220133	0 %	0 %	50 %	50 %	126178190
5184	NC_009051	AGC	2	6	220152	220157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178190
5185	NC_009051	GAT	2	6	220226	220231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178190
5186	NC_009051	A	7	7	220282	220288	100 %	0 %	0 %	0 %	126178190
5187	NC_009051	GAC	2	6	220326	220331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5188	NC_009051	AAT	2	6	220360	220365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5189	NC_009051	TCTGG	2	10	220434	220443	0 %	40 %	40 %	20 %	126178191
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5195	NC_009051	GA	3	6	220636	220641	50 %	0 %	50 %	0 %	126178191
5196	NC_009051	GGTC	2	8	220658	220665	0 %	25 %	50 %	25 %	126178191
5197	NC_009051	CGA	2	6	220703	220708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178191
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5200	NC_009051	ATG	2	6	220786	220791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178191
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5203	NC_009051	CCT	2	6	220883	220888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178191
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5209	NC_009051	TGC	2	6	220996	221001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178191
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5215	NC_009051	C	6	6	221129	221134	0 %	0 %	0 %	100 %	126178191
5216	NC_009051	GGGTG	2	10	221168	221177	0 %	20 %	80 %	0 %	126178191
5217	NC_009051	GAT	2	6	221181	221186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178191
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5219	NC_009051	CCA	2	6	221321	221326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178191
5220	NC_009051	CGA	2	6	221330	221335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178191
5221	NC_009051	GT	3	6	221397	221402	0 %	50 %	50 %	0 %	126178191
5222	NC_009051	ATC	2	6	221411	221416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5223	NC_009051	G	6	6	221456	221461	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5224	NC_009051	TGACGG	2	12	221508	221519	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126178192
5225	NC_009051	CCG	2	6	221603	221608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178192
5226	NC_009051	GGT	2	6	221614	221619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178192
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5228	NC_009051	CGA	2	6	221677	221682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178192
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5230	NC_009051	C	6	6	221755	221760	0 %	0 %	0 %	100 %	126178192
5231	NC_009051	TCC	2	6	221765	221770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178192
5232	NC_009051	GTC	2	6	221792	221797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178192
5233	NC_009051	CCG	2	6	221891	221896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178192
5234	NC_009051	GAC	2	6	221920	221925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178192
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5236	NC_009051	GGT	2	6	221974	221979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178192
5237	NC_009051	CCG	2	6	222069	222074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178192
5238	NC_009051	TCC	2	6	222086	222091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178192
5239	NC_009051	ACG	2	6	222134	222139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178192
5240	NC_009051	TC	3	6	222280	222285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5241	NC_009051	TTG	2	6	222318	222323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_009051	GGA	2	6	222336	222341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_009051	ACGC	2	8	222374	222381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5244	NC_009051	GAA	2	6	222390	222395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5366	NC_009051	G	6	6	227962	227967	0 %	0 %	100 %	0 %	126178197
5367	NC_009051	CGGCA	2	10	227998	228007	20 %	0 %	40 %	40 %	126178197
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5371	NC_009051	GCA	2	6	228145	228150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178198
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5401	NC_009051	TA	3	6	229063	229068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_009051	CCG	2	6	229085	229090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5474	NC_009051	G	6	6	231060	231065	0 %	0 %	100 %	0 %	126178201
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5478	NC_009051	AG	3	6	231220	231225	50 %	0 %	50 %	0 %	126178202
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5485	NC_009051	TCC	2	6	231516	231521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178202
5486	NC_009051	GCG	2	6	231549	231554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178202
5487	NC_009051	CACC	2	8	231586	231593	25 %	0 %	0 %	75 %	126178202
5488	NC_009051	CCCG	2	8	231598	231605	0 %	0 %	25 %	75 %	126178202
5489	NC_009051	GCGA	2	8	231606	231613	25 %	0 %	50 %	25 %	126178202
5490	NC_009051	ACG	2	6	231635	231640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178202
5491	NC_009051	CTCG	2	8	231658	231665	0 %	25 %	25 %	50 %	126178202
5492	NC_009051	CTC	2	6	231731	231736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178202
5493	NC_009051	TCCTC	2	10	231822	231831	0 %	40 %	0 %	60 %	126178202
5494	NC_009051	GCCTG	2	10	231858	231867	0 %	20 %	40 %	40 %	126178202
5495	NC_009051	ACC	2	6	231872	231877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178202
5496	NC_009051	CTC	2	6	231893	231898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178202
5497	NC_009051	GCG	2	6	231899	231904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178202
5498	NC_009051	TCT	2	6	231924	231929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178202
5499	NC_009051	GCC	2	6	231945	231950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178202
5500	NC_009051	GAA	2	6	231982	231987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178202

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