MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocorpusculum labreanum Z chromosome

Total Repeats: 24891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008942	TGA	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008942	AAG	2	6	23	28	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008942	TTG	2	6	41	46	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008942	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008942	CAA	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008942	CAA	2	6	347	352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008942	TCA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008942	TTC	2	6	396	401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008942	ACA	2	6	409	414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008942	AGT	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008942	ATA	2	6	503	508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008942	ATC	2	6	1005	1010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
13	NC_008942	TAT	2	6	1109	1114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484830
14	NC_008942	CCG	2	6	1197	1202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484830
15	NC_008942	TCA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
16	NC_008942	CGT	2	6	1265	1270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484830
17	NC_008942	CTC	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484830
18	NC_008942	TCA	2	6	1546	1551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
19	NC_008942	CCG	2	6	1601	1606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484830
20	NC_008942	TCA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
21	NC_008942	ATC	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484830
22	NC_008942	GAC	2	6	1685	1690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484830
23	NC_008942	CAG	2	6	1855	1860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484831
24	NC_008942	TCC	2	6	1947	1952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484831
25	NC_008942	ACT	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484831
26	NC_008942	ATG	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484831
27	NC_008942	TCG	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484831
28	NC_008942	TTA	2	6	2289	2294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484831
29	NC_008942	ATC	2	6	2310	2315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008942	TTC	2	6	2373	2378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484832
31	NC_008942	AGC	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484832
32	NC_008942	ATC	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484832
33	NC_008942	GAC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484832
34	NC_008942	CGT	2	6	2642	2647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484832
35	NC_008942	GTT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484832
36	NC_008942	ATC	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484832
37	NC_008942	ATC	3	9	2886	2894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484832
38	NC_008942	TCT	2	6	2903	2908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484832
39	NC_008942	CGG	2	6	2962	2967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484832
40	NC_008942	GGC	2	6	3040	3045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484832
41	NC_008942	CCA	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124484832
42	NC_008942	TGA	2	6	3106	3111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484832
43	NC_008942	TGC	2	6	3137	3142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484832
44	NC_008942	GAG	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124484832
45	NC_008942	AGA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484832
46	NC_008942	CGA	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484832
47	NC_008942	AGC	2	6	3340	3345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484832
48	NC_008942	GCG	2	6	3382	3387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484832
49	NC_008942	TAA	2	6	3484	3489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008942	ATC	2	6	3589	3594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484833
51	NC_008942	GCG	2	6	3619	3624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484833
52	NC_008942	ATC	2	6	3645	3650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484833
53	NC_008942	AGG	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124484833
54	NC_008942	GAT	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484833
55	NC_008942	CAG	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484833
56	NC_008942	ATG	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484833
57	NC_008942	CAG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484833
58	NC_008942	ATC	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484833
59	NC_008942	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484833
60	NC_008942	GCA	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484833
61	NC_008942	TGG	2	6	4324	4329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124484833
62	NC_008942	GCC	2	6	4416	4421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484833
63	NC_008942	GAA	2	6	4597	4602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484833
64	NC_008942	GAT	2	6	4608	4613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484833
65	NC_008942	CCT	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484833
66	NC_008942	CAT	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484833
67	NC_008942	CCT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484833
68	NC_008942	TTC	2	6	4971	4976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008942	TAT	2	6	4995	5000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008942	CTC	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008942	GAA	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
72	NC_008942	AGA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
73	NC_008942	GTC	2	6	5244	5249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484834
74	NC_008942	CAA	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484834
75	NC_008942	AAC	2	6	5375	5380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484834
76	NC_008942	GCA	2	6	5385	5390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
77	NC_008942	TCT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484834
78	NC_008942	CGG	2	6	5513	5518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
79	NC_008942	CCT	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484834
80	NC_008942	CGG	3	9	5609	5617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
81	NC_008942	GAC	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
82	NC_008942	ATC	2	6	5787	5792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
83	NC_008942	GCA	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
84	NC_008942	GCA	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
85	NC_008942	TCC	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484834
86	NC_008942	GCA	2	6	5892	5897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
87	NC_008942	GCA	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
88	NC_008942	AGA	2	6	5944	5949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
89	NC_008942	TTG	3	9	5989	5997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484834
90	NC_008942	ATC	3	9	6000	6008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
91	NC_008942	CAT	2	6	6011	6016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
92	NC_008942	TTG	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484834
93	NC_008942	TAC	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
94	NC_008942	ATC	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
95	NC_008942	ATC	2	6	6282	6287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484834
96	NC_008942	GCA	2	6	6342	6347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
97	NC_008942	CCA	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124484834
98	NC_008942	GCA	2	6	6498	6503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
99	NC_008942	CGG	2	6	6632	6637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
100	NC_008942	CAG	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
101	NC_008942	GCA	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
102	NC_008942	AGA	2	6	6694	6699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
103	NC_008942	TCG	2	6	6700	6705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484834
104	NC_008942	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484834
105	NC_008942	AGC	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
106	NC_008942	GAT	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484834
107	NC_008942	TCT	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484834
108	NC_008942	CGG	2	6	6884	6889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
109	NC_008942	TCC	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484834
110	NC_008942	AAG	2	6	6969	6974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484834
111	NC_008942	CGG	2	6	6995	7000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484834
112	NC_008942	AGC	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484834
113	NC_008942	TGT	2	6	7028	7033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484834
114	NC_008942	CTG	2	6	7140	7145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484834
115	NC_008942	TCA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008942	AGC	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008942	ATC	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484835
118	NC_008942	AGC	2	6	7260	7265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484835
119	NC_008942	CTT	2	6	7330	7335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484835
120	NC_008942	CCG	2	6	7353	7358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484835
121	NC_008942	CAT	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484835
122	NC_008942	CCT	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484835
123	NC_008942	CTG	2	6	7777	7782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484836
124	NC_008942	ATC	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484836
125	NC_008942	TGG	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008942	CAT	2	6	8336	8341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008942	CAT	2	6	8405	8410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484837
128	NC_008942	ATT	2	6	8498	8503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484837
129	NC_008942	CTG	2	6	8668	8673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484837
130	NC_008942	TCC	2	6	8686	8691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484837
131	NC_008942	TCA	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484837
132	NC_008942	CGG	2	6	8839	8844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484837
133	NC_008942	CTC	2	6	8857	8862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484837
134	NC_008942	TCA	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
135	NC_008942	GCT	3	9	9011	9019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484838
136	NC_008942	ATG	2	6	9074	9079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484838
137	NC_008942	GAC	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484838
138	NC_008942	GAT	2	6	9164	9169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484838
139	NC_008942	GGC	2	6	9203	9208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484838
140	NC_008942	ACA	2	6	9252	9257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484838
141	NC_008942	AGA	2	6	9298	9303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484838
142	NC_008942	CGC	2	6	9403	9408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484838
143	NC_008942	TCA	2	6	9544	9549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
144	NC_008942	AGA	2	6	9581	9586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484838
145	NC_008942	ACG	2	6	9795	9800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484838
146	NC_008942	ATC	2	6	9812	9817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
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148	NC_008942	CTC	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484838
149	NC_008942	TCA	2	6	10002	10007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
150	NC_008942	GCA	2	6	10034	10039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484838
151	NC_008942	CAG	2	6	10064	10069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484838
152	NC_008942	TCA	2	6	10095	10100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484838
153	NC_008942	TGC	2	6	10605	10610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484839
154	NC_008942	CTC	3	9	10737	10745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484839
155	NC_008942	ATT	2	6	10858	10863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484839
156	NC_008942	GTA	2	6	10941	10946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484839
157	NC_008942	ATA	2	6	10998	11003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124484839
158	NC_008942	GGT	2	6	11019	11024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124484839
159	NC_008942	ATT	2	6	11059	11064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484839
160	NC_008942	GTT	2	6	11144	11149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008942	TGA	2	6	11275	11280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484840
162	NC_008942	GCG	2	6	11425	11430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484840
163	NC_008942	CTG	2	6	11510	11515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484840
164	NC_008942	GAT	2	6	11549	11554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484840
165	NC_008942	TCT	2	6	11577	11582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484840
166	NC_008942	GCA	2	6	11593	11598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484840
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169	NC_008942	GTC	2	6	11868	11873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484840
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171	NC_008942	TCT	2	6	12194	12199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484841
172	NC_008942	CGA	2	6	12215	12220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484841
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190	NC_008942	CTG	2	6	13454	13459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484842
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221	NC_008942	TTA	2	6	15984	15989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_008942	GTT	2	6	16139	16144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
223	NC_008942	AAG	2	6	16181	16186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_008942	TCT	2	6	18911	18916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484846
256	NC_008942	GCC	2	6	19019	19024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484846
257	NC_008942	GCG	2	6	19031	19036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484846
258	NC_008942	TAT	3	9	19155	19163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_008942	CTG	2	6	19197	19202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_008942	AAT	2	6	19211	19216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_008942	CGA	2	6	19430	19435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484847
262	NC_008942	GCC	2	6	19453	19458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484847
263	NC_008942	CGC	2	6	19478	19483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484847
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279	NC_008942	GCG	2	6	20944	20949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484848
280	NC_008942	TCC	2	6	20976	20981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484848
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