MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methylibium petroleiphilum PM1 chromosome

Total Repeats: 3134

< Previous1234567Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008825	GATCGT	2	12	3888357	3888368	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	124268860
3002	NC_008825	CGAGCT	2	12	3889600	3889611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268861
3003	NC_008825	CGGCGC	2	12	3890058	3890069	0 %	0 %	50 %	50 %	124268862
3004	NC_008825	GGCCTG	2	12	3890729	3890740	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268863
3005	NC_008825	CTGGTG	2	12	3890954	3890965	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	124268863
3006	NC_008825	GGCGCA	2	12	3891541	3891552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	124268864
3007	NC_008825	GCGGGC	2	12	3892215	3892226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124268865
3008	NC_008825	TGCACC	2	12	3896813	3896824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	124268870
3009	NC_008825	GCCTCG	2	12	3898830	3898841	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268872
3010	NC_008825	GCCGGC	2	12	3901279	3901290	0 %	0 %	50 %	50 %	124268874
3011	NC_008825	GGCATG	2	12	3902527	3902538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124268874
3012	NC_008825	GCCGGC	2	12	3903966	3903977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_008825	AGCACC	2	12	3904264	3904275	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124268876
3014	NC_008825	GCGCTG	2	12	3904311	3904322	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268876
3015	NC_008825	GCGCCC	2	12	3904388	3904399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124268876
3016	NC_008825	GCCCGA	2	12	3905559	3905570	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268876
3017	NC_008825	GCCCAG	2	12	3905900	3905911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268877
3018	NC_008825	GCACCA	2	12	3905965	3905976	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124268877
3019	NC_008825	CCTCGT	2	12	3912175	3912186	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	124268884
3020	NC_008825	CTGCCG	2	12	3913278	3913289	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268886
3021	NC_008825	CAGCTC	2	12	3914904	3914915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	124268889
3022	NC_008825	CCAGCA	2	12	3915899	3915910	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124268889
3023	NC_008825	CCGGAC	2	12	3917596	3917607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268890
3024	NC_008825	CTACGT	2	12	3920267	3920278	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	124268893
3025	NC_008825	GCGAGG	2	12	3923156	3923167	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	124268894
3026	NC_008825	GGCAAG	2	12	3923599	3923610	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	124268894
3027	NC_008825	ACCGCC	2	12	3925978	3925989	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_008825	ACCGCG	2	12	3926063	3926074	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268898
3029	NC_008825	CGCGCT	2	12	3926101	3926112	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268898
3030	NC_008825	GCTGGC	2	12	3926641	3926652	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268898
3031	NC_008825	GGCGGT	2	12	3927762	3927773	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	124268899
3032	NC_008825	GTCCTC	2	12	3927810	3927821	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	124268899
3033	NC_008825	CGGTGG	2	12	3927934	3927945	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	124268900
3034	NC_008825	GGCTCG	2	12	3927949	3927960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268900
3035	NC_008825	TGACCG	2	12	3930210	3930221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268902
3036	NC_008825	CGCCTT	2	12	3930853	3930864	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	124268903
3037	NC_008825	CCGCAC	2	12	3931615	3931626	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_008825	ACGTCG	2	12	3931880	3931891	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268905
3039	NC_008825	GCCGAC	2	12	3932487	3932498	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268905
3040	NC_008825	GCCTCC	2	12	3932740	3932751	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	124268905
3041	NC_008825	GTGCAG	2	12	3933190	3933201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124268905
3042	NC_008825	CGTCGC	2	12	3934093	3934104	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268906
3043	NC_008825	CGGTCG	2	12	3934822	3934833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268906
3044	NC_008825	GTCAGC	2	12	3935678	3935689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268907
3045	NC_008825	CCGGGG	2	12	3935717	3935728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124268907
3046	NC_008825	CCAGCA	2	12	3935736	3935747	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124268907
3047	NC_008825	AAGGCG	2	12	3937192	3937203	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	124268908
3048	NC_008825	TCACCT	2	12	3939017	3939028	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	124268908
3049	NC_008825	TGGTCG	2	12	3939806	3939817	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	124268909
3050	NC_008825	TCGCCG	2	12	3940736	3940747	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268910
3051	NC_008825	CGTCGA	2	12	3940986	3940997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268910
3052	NC_008825	CCGCTC	2	12	3941613	3941624	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	124268911
3053	NC_008825	GGCAGG	2	12	3942529	3942540	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	124268911
3054	NC_008825	TTGACC	2	12	3942719	3942730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	124268912
3055	NC_008825	ACGGGA	2	12	3943399	3943410	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	124268912
3056	NC_008825	ACCACG	2	12	3944136	3944147	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124268914
3057	NC_008825	GCTACG	2	12	3945966	3945977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268915
3058	NC_008825	CGCGAC	2	12	3946627	3946638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268915
3059	NC_008825	CGGCTT	2	12	3947429	3947440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124268916
3060	NC_008825	GCATCG	2	12	3947956	3947967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268916
3061	NC_008825	GGTGCA	2	12	3949216	3949227	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124268917
3062	NC_008825	GCGGCA	2	12	3952049	3952060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	124268920
3063	NC_008825	CGTGGC	2	12	3952061	3952072	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268920
3064	NC_008825	TGCGCG	2	12	3952916	3952927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268921
3065	NC_008825	AGCGCG	2	12	3953285	3953296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	124268921
3066	NC_008825	CGTCGC	2	12	3954846	3954857	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268922
3067	NC_008825	CGCGCA	2	12	3955278	3955289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268922
3068	NC_008825	AGCCGC	2	12	3958300	3958311	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268923
3069	NC_008825	GGCCTC	2	12	3959951	3959962	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268924
3070	NC_008825	TGCCGT	2	12	3962463	3962474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124268926
3071	NC_008825	AGCGCC	2	12	3966473	3966484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268930
3072	NC_008825	GTGCAG	2	12	3968263	3968274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124268931
3073	NC_008825	TGAGGT	2	12	3969380	3969391	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	124268932
3074	NC_008825	GGCCTG	2	12	3977717	3977728	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268941
3075	NC_008825	ATCGCG	2	12	3977890	3977901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268942
3076	NC_008825	CGCAGC	2	12	3979073	3979084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268943
3077	NC_008825	AACGAG	2	12	3980045	3980056	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	124268944
3078	NC_008825	GCCCGG	2	12	3980787	3980798	0 %	0 %	50 %	50 %	124268945
3079	NC_008825	TGCGCC	2	12	3981241	3981252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268945
3080	NC_008825	CCGCGA	2	12	3981973	3981984	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268946
3081	NC_008825	GCCGGC	2	12	3983091	3983102	0 %	0 %	50 %	50 %	124268947
3082	NC_008825	GATCGC	2	12	3983126	3983137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268947
3083	NC_008825	GTCGCG	2	12	3983483	3983494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_008825	TCGGTC	2	12	3984301	3984312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124268949
3085	NC_008825	CGCTCG	2	12	3984562	3984573	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268949
3086	NC_008825	GTCGGC	2	12	3988038	3988049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268953
3087	NC_008825	GCCGGC	2	12	3993220	3993231	0 %	0 %	50 %	50 %	124268958
3088	NC_008825	CTCGCC	2	12	3997764	3997775	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	124268962
3089	NC_008825	CGGTGT	2	12	3998533	3998544	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	124268963
3090	NC_008825	TCCTGG	2	12	3998553	3998564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124268963
3091	NC_008825	CTCGGT	2	12	3998714	3998725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124268963
3092	NC_008825	TGCGCG	2	12	4001234	4001245	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268964
3093	NC_008825	CGAGGC	3	18	4001351	4001368	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	124268964
3094	NC_008825	CGAGGT	2	12	4002870	4002881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124268967
3095	NC_008825	GTTGCT	2	12	4004691	4004702	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	124268970
3096	NC_008825	GGCCGC	2	12	4005147	4005158	0 %	0 %	50 %	50 %	124268971
3097	NC_008825	ACAGCC	2	12	4006430	4006441	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124268971
3098	NC_008825	GCCACC	2	12	4007142	4007153	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	124268972
3099	NC_008825	CAGCAC	2	12	4007722	4007733	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124268974
3100	NC_008825	ACGCGC	2	12	4010328	4010339	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268975
3101	NC_008825	TCTCGA	2	12	4010518	4010529	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	124268975
3102	NC_008825	GATGCC	2	12	4010824	4010835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268976
3103	NC_008825	CCGCTC	2	12	4011712	4011723	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	124268977
3104	NC_008825	GCGCTG	2	12	4011799	4011810	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268977
3105	NC_008825	GCCGAT	2	12	4012453	4012464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268977
3106	NC_008825	CGAGCT	2	12	4012515	4012526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268977
3107	NC_008825	AAGCCG	2	12	4013042	4013053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124268977
3108	NC_008825	CGAGCG	3	18	4013148	4013165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	124268977
3109	NC_008825	GAACAG	2	12	4017608	4017619	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	124268983
3110	NC_008825	CCAGCG	2	12	4017730	4017741	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268983
3111	NC_008825	GGGCCT	2	12	4019318	4019329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268985
3112	NC_008825	GCATCG	2	12	4020169	4020180	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268985
3113	NC_008825	TGCCCG	2	12	4021025	4021036	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268986
3114	NC_008825	CAGGCC	2	12	4021081	4021092	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	124268986
3115	NC_008825	TCCGCC	2	12	4021422	4021433	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	124268986
3116	NC_008825	TGCGGA	2	12	4022227	4022238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124268987
3117	NC_008825	GCGCTG	2	12	4023976	4023987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268988
3118	NC_008825	GCTTCG	2	12	4024478	4024489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124268989
3119	NC_008825	GCCCGG	2	12	4025918	4025929	0 %	0 %	50 %	50 %	124268991
3120	NC_008825	CGTCGA	2	12	4026906	4026917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124268992
3121	NC_008825	TGCCCA	2	12	4027823	4027834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	124268993
3122	NC_008825	CGCGGC	2	12	4027844	4027855	0 %	0 %	50 %	50 %	124268993
3123	NC_008825	GCGCCT	2	12	4027931	4027942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	124268993
3124	NC_008825	CGCTGG	2	12	4028273	4028284	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124268994
3125	NC_008825	CTCGAC	2	12	4029478	4029489	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	124268994
3126	NC_008825	TGCAGG	2	12	4029992	4030003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124268994
3127	NC_008825	CAGCAC	2	12	4034791	4034802	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	124269001
3128	NC_008825	CGTGCG	2	12	4035775	4035786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	124269003
3129	NC_008825	CGACTA	2	12	4038345	4038356	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	124269006
3130	NC_008825	CGGTAG	2	12	4039631	4039642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	124269007
3131	NC_008825	GCCGCG	2	12	4040278	4040289	0 %	0 %	50 %	50 %	124269008
3132	NC_008825	TCGCGA	2	12	4041317	4041328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124269008
3133	NC_008825	TCACGG	2	12	4042847	4042858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124269009
3134	NC_008825	CGGCGC	2	12	4042995	4043006	0 %	0 %	50 %	50 %	124269009

< Previous1234567Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.