MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2 chromosome

Total Repeats: 82920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008769	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635884
2	NC_008769	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635884
3	NC_008769	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
4	NC_008769	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
5	NC_008769	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635884
6	NC_008769	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
7	NC_008769	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
8	NC_008769	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
9	NC_008769	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
10	NC_008769	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
11	NC_008769	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
12	NC_008769	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121635884
13	NC_008769	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
14	NC_008769	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635884
15	NC_008769	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
16	NC_008769	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121635884
17	NC_008769	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121635884
18	NC_008769	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
19	NC_008769	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635884
20	NC_008769	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
21	NC_008769	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
22	NC_008769	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635884
23	NC_008769	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
24	NC_008769	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635884
25	NC_008769	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008769	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008769	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008769	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008769	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008769	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008769	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008769	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008769	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008769	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008769	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635885
36	NC_008769	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635885
37	NC_008769	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635885
38	NC_008769	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635885
39	NC_008769	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635885
40	NC_008769	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121635885
41	NC_008769	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635885
42	NC_008769	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635885
43	NC_008769	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635885
44	NC_008769	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635885
45	NC_008769	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635885
46	NC_008769	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635885
47	NC_008769	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635885
48	NC_008769	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121635885
49	NC_008769	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635885
50	NC_008769	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121635885
51	NC_008769	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635885
52	NC_008769	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635885
53	NC_008769	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635886
54	NC_008769	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
55	NC_008769	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
56	NC_008769	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
57	NC_008769	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121635886
58	NC_008769	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121635886
59	NC_008769	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635886
60	NC_008769	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
61	NC_008769	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121635886
62	NC_008769	GTG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
63	NC_008769	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
64	NC_008769	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635886
65	NC_008769	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
66	NC_008769	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
67	NC_008769	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
68	NC_008769	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
69	NC_008769	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
70	NC_008769	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
71	NC_008769	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635886
72	NC_008769	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
73	NC_008769	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
74	NC_008769	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635886
75	NC_008769	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635886
76	NC_008769	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
77	NC_008769	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635887
78	NC_008769	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635887
79	NC_008769	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635887
80	NC_008769	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635887
81	NC_008769	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635887
82	NC_008769	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635887
83	NC_008769	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635887
84	NC_008769	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008769	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635888
86	NC_008769	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
87	NC_008769	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635888
88	NC_008769	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121635888
89	NC_008769	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635888
90	NC_008769	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
91	NC_008769	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
92	NC_008769	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635888
93	NC_008769	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
94	NC_008769	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
95	NC_008769	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635888
96	NC_008769	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
97	NC_008769	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
98	NC_008769	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635888
99	NC_008769	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121635888
100	NC_008769	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
101	NC_008769	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635888
102	NC_008769	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
103	NC_008769	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
104	NC_008769	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635888
105	NC_008769	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
106	NC_008769	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635888
107	NC_008769	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121635888
108	NC_008769	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121635888
109	NC_008769	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
110	NC_008769	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635888
111	NC_008769	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635888
112	NC_008769	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635888
113	NC_008769	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635888
114	NC_008769	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635888
115	NC_008769	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121635888
116	NC_008769	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635888
117	NC_008769	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
118	NC_008769	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635888
119	NC_008769	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635888
120	NC_008769	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635889
121	NC_008769	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
122	NC_008769	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
123	NC_008769	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635889
124	NC_008769	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635889
125	NC_008769	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635889
126	NC_008769	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635889
127	NC_008769	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
128	NC_008769	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
129	NC_008769	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635889
130	NC_008769	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635889
131	NC_008769	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635889
132	NC_008769	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
133	NC_008769	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
134	NC_008769	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635889
135	NC_008769	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635889
136	NC_008769	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635889
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143	NC_008769	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635889
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154	NC_008769	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
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174	NC_008769	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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254	NC_008769	GAA	2	6	14787	14792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635895
255	NC_008769	ACT	2	6	14869	14874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121635895
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461	NC_008769	CCA	2	6	26229	26234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635905
462	NC_008769	CCG	2	6	26275	26280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635905
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497	NC_008769	GCT	2	6	28631	28636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635909
498	NC_008769	CAC	2	6	28652	28657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635909
499	NC_008769	CCA	2	6	28796	28801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635909
500	NC_008769	GTT	2	6	28848	28853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635909

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