MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2 chromosome

Total Repeats: 108976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008769	CCT	2	6	250797	250802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121636101
6002	NC_008769	GCA	2	6	250836	250841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636101
6003	NC_008769	CGA	2	6	250845	250850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636101
6004	NC_008769	CG	3	6	250868	250873	0 %	0 %	50 %	50 %	121636101
6005	NC_008769	CGG	2	6	250886	250891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636101
6006	NC_008769	CGG	2	6	250900	250905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636101
6007	NC_008769	CGG	2	6	250941	250946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636101
6008	NC_008769	GCC	2	6	250975	250980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636101
6009	NC_008769	TCA	2	6	251037	251042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121636101
6010	NC_008769	ATG	2	6	251081	251086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121636101
6011	NC_008769	CCGG	2	8	251122	251129	0 %	0 %	50 %	50 %	121636101
6012	NC_008769	CCG	2	6	251157	251162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636101
6013	NC_008769	GCG	2	6	251177	251182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636101
6014	NC_008769	CAG	2	6	251221	251226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636101
6015	NC_008769	GCC	2	6	251371	251376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636101
6016	NC_008769	CCT	2	6	251391	251396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121636101
6017	NC_008769	GA	3	6	251423	251428	50 %	0 %	50 %	0 %	121636101
6018	NC_008769	ACG	3	9	251451	251459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636101
6019	NC_008769	TCG	2	6	251489	251494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636101
6020	NC_008769	TCG	2	6	251603	251608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636101
6021	NC_008769	CGC	2	6	251652	251657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_008769	ATG	2	6	251706	251711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_008769	CAG	2	6	251774	251779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636102
6024	NC_008769	GCA	2	6	251793	251798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636102
6025	NC_008769	GCGTC	2	10	251823	251832	0 %	20 %	40 %	40 %	121636102
6026	NC_008769	CG	3	6	251853	251858	0 %	0 %	50 %	50 %	121636102
6027	NC_008769	CGGT	2	8	251926	251933	0 %	25 %	50 %	25 %	121636102
6028	NC_008769	CTG	2	6	251944	251949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636102
6029	NC_008769	CCGTG	2	10	251976	251985	0 %	20 %	40 %	40 %	121636102
6030	NC_008769	GCA	2	6	252031	252036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636102
6031	NC_008769	CG	3	6	252039	252044	0 %	0 %	50 %	50 %	121636102
6032	NC_008769	GTTC	2	8	252049	252056	0 %	50 %	25 %	25 %	121636102
6033	NC_008769	CGC	2	6	252062	252067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_008769	CAC	2	6	252089	252094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_008769	GGTGC	2	10	252100	252109	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6036	NC_008769	ACG	2	6	252218	252223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6037	NC_008769	CCG	2	6	252291	252296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636103
6038	NC_008769	GC	3	6	252312	252317	0 %	0 %	50 %	50 %	121636103
6039	NC_008769	GCCGC	2	10	252436	252445	0 %	0 %	40 %	60 %	121636103
6040	NC_008769	TGG	2	6	252453	252458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121636103
6041	NC_008769	GCC	2	6	252524	252529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636103
6042	NC_008769	CTG	2	6	252560	252565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6043	NC_008769	GCC	2	6	252601	252606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636103
6044	NC_008769	GC	3	6	252619	252624	0 %	0 %	50 %	50 %	121636103
6045	NC_008769	ACG	2	6	252626	252631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6046	NC_008769	GTC	2	6	252662	252667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6047	NC_008769	GGC	2	6	252708	252713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636103
6048	NC_008769	GGC	2	6	252715	252720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636103
6049	NC_008769	CGGCG	2	10	252733	252742	0 %	0 %	60 %	40 %	121636103
6050	NC_008769	GCC	2	6	252758	252763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636103
6051	NC_008769	TGC	2	6	252786	252791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6052	NC_008769	GC	3	6	252790	252795	0 %	0 %	50 %	50 %	121636103
6053	NC_008769	CAC	2	6	252830	252835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121636103
6054	NC_008769	GAT	2	6	252871	252876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121636103
6055	NC_008769	CCTACA	2	12	252900	252911	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	121636103
6056	NC_008769	GTG	2	6	252914	252919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121636103
6057	NC_008769	ATC	2	6	252920	252925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121636103
6058	NC_008769	CGT	2	6	252931	252936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6059	NC_008769	CTGGC	2	10	252956	252965	0 %	20 %	40 %	40 %	121636103
6060	NC_008769	CGC	2	6	252970	252975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636103
6061	NC_008769	TGG	2	6	253008	253013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121636103
6062	NC_008769	TCG	2	6	253050	253055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6063	NC_008769	CGG	2	6	253071	253076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636103
6064	NC_008769	CTG	2	6	253133	253138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6065	NC_008769	TGC	2	6	253191	253196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6066	NC_008769	CGG	2	6	253200	253205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636103
6067	NC_008769	GCG	3	9	253215	253223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636103
6068	NC_008769	CAT	2	6	253273	253278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121636103
6069	NC_008769	CTG	2	6	253289	253294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6070	NC_008769	GCT	2	6	253300	253305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636103
6071	NC_008769	GAT	2	6	253324	253329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121636103
6072	NC_008769	CGG	2	6	253341	253346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636103
6073	NC_008769	GTT	2	6	253363	253368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121636103
6074	NC_008769	CAG	2	6	253432	253437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_008769	GAA	2	6	253478	253483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_008769	CGC	2	6	253547	253552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636104
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6078	NC_008769	GCC	2	6	253703	253708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636104
6079	NC_008769	ACCCG	2	10	253709	253718	20 %	0 %	20 %	60 %	121636104
6080	NC_008769	GCC	2	6	253727	253732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636104
6081	NC_008769	GCC	3	9	253751	253759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636104
6082	NC_008769	CGC	2	6	253774	253779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636104
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6084	NC_008769	TTG	2	6	253846	253851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121636104
6085	NC_008769	CGC	2	6	253855	253860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636104
6086	NC_008769	GCC	2	6	253868	253873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636104
6087	NC_008769	TCA	2	6	253924	253929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121636104
6088	NC_008769	CCCG	2	8	253991	253998	0 %	0 %	25 %	75 %	121636104
6089	NC_008769	CGGC	2	8	254089	254096	0 %	0 %	50 %	50 %	121636104
6090	NC_008769	TGG	2	6	254128	254133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121636104
6091	NC_008769	CCG	2	6	254137	254142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636104
6092	NC_008769	ACG	2	6	254143	254148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636104
6093	NC_008769	CGT	2	6	254180	254185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636104
6094	NC_008769	CGG	2	6	254222	254227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636104
6095	NC_008769	CCA	2	6	254228	254233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121636104
6096	NC_008769	CTA	2	6	254249	254254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121636104
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6100	NC_008769	GTC	2	6	254499	254504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636104
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6102	NC_008769	ACA	2	6	254527	254532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121636104
6103	NC_008769	ACG	2	6	254536	254541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636104
6104	NC_008769	CG	3	6	254569	254574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_008769	AGC	2	6	254664	254669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636105
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6107	NC_008769	CAC	2	6	254687	254692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121636105
6108	NC_008769	GGC	2	6	254720	254725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636105
6109	NC_008769	CGCAG	2	10	254779	254788	20 %	0 %	40 %	40 %	121636105
6110	NC_008769	GC	3	6	254828	254833	0 %	0 %	50 %	50 %	121636105
6111	NC_008769	CGG	2	6	254875	254880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636105
6112	NC_008769	GGTCTT	2	12	254884	254895	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	121636105
6113	NC_008769	CGGG	2	8	254966	254973	0 %	0 %	75 %	25 %	121636105
6114	NC_008769	GCT	2	6	254974	254979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636105
6115	NC_008769	AGCC	2	8	254991	254998	25 %	0 %	25 %	50 %	121636105
6116	NC_008769	CTG	2	6	255022	255027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636105
6117	NC_008769	GC	3	6	255047	255052	0 %	0 %	50 %	50 %	121636105
6118	NC_008769	GAA	2	6	255143	255148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121636105
6119	NC_008769	CTC	2	6	255149	255154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121636105
6120	NC_008769	GCC	2	6	255228	255233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636105
6121	NC_008769	CG	3	6	255252	255257	0 %	0 %	50 %	50 %	121636105
6122	NC_008769	TTC	2	6	255309	255314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121636105
6123	NC_008769	GAG	2	6	255320	255325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121636105
6124	NC_008769	GCG	3	9	255345	255353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636105
6125	NC_008769	GCT	2	6	255373	255378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636105
6126	NC_008769	TCG	2	6	255387	255392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636105
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6151	NC_008769	CGG	2	6	256641	256646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6152	NC_008769	ACC	2	6	256735	256740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6185	NC_008769	CCGGG	2	10	257848	257857	0 %	0 %	60 %	40 %	121636106
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6469	NC_008769	CGAC	2	8	269056	269063	25 %	0 %	25 %	50 %	121636114
6470	NC_008769	GCCA	2	8	269076	269083	25 %	0 %	25 %	50 %	121636114
6471	NC_008769	ACC	2	6	269092	269097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121636114
6472	NC_008769	ACCAGC	2	12	269133	269144	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	121636114
6473	NC_008769	ACG	2	6	269148	269153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636114
6474	NC_008769	CACGC	2	10	269181	269190	20 %	0 %	20 %	60 %	121636114
6475	NC_008769	GCGAAC	2	12	269217	269228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636114
6476	NC_008769	GC	4	8	269273	269280	0 %	0 %	50 %	50 %	121636114
6477	NC_008769	TCGA	2	8	269421	269428	25 %	25 %	25 %	25 %	121636114
6478	NC_008769	GGC	3	9	269495	269503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636114
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6480	NC_008769	TCA	2	6	269518	269523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121636114
6481	NC_008769	CAA	2	6	269564	269569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121636114
6482	NC_008769	ACCAGC	2	12	269598	269609	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	121636114
6483	NC_008769	GTC	2	6	269630	269635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636114
6484	NC_008769	CCG	2	6	269661	269666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636114
6485	NC_008769	GTC	2	6	269789	269794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121636114
6486	NC_008769	ACG	2	6	269820	269825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636114
6487	NC_008769	GCG	2	6	269856	269861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121636114
6488	NC_008769	CCG	2	6	269892	269897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636114
6489	NC_008769	GC	3	6	269932	269937	0 %	0 %	50 %	50 %	121636114
6490	NC_008769	GGCCGC	2	12	269954	269965	0 %	0 %	50 %	50 %	121636114
6491	NC_008769	GCA	2	6	270004	270009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636114
6492	NC_008769	GCC	2	6	270042	270047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636114
6493	NC_008769	AGC	2	6	270054	270059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121636114
6494	NC_008769	GCC	2	6	270069	270074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636114
6495	NC_008769	CACC	2	8	270101	270108	25 %	0 %	0 %	75 %	121636114
6496	NC_008769	GCCG	2	8	270144	270151	0 %	0 %	50 %	50 %	121636114
6497	NC_008769	GCC	2	6	270183	270188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121636114
6498	NC_008769	ACCGCG	2	12	270246	270257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121636114
6499	NC_008769	ACA	2	6	270343	270348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121636114
6500	NC_008769	CGGC	2	8	270395	270402	0 %	0 %	50 %	50 %	121636114

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