MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 chromosome

Total Repeats: 2553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008740	TCACT	2	10	1566	1575	20 %	40 %	0 %	40 %	120552945
2	NC_008740	ACCAC	2	10	1823	1832	40 %	0 %	0 %	60 %	120552945
3	NC_008740	CCTTC	2	10	3357	3366	0 %	40 %	0 %	60 %	120552947
4	NC_008740	GGGCT	2	10	5645	5654	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008740	CTTTT	2	10	8229	8238	0 %	80 %	0 %	20 %	120552950
6	NC_008740	TTCTT	2	10	8533	8542	0 %	80 %	0 %	20 %	120552950
7	NC_008740	CGGGC	2	10	10873	10882	0 %	0 %	60 %	40 %	120552952
8	NC_008740	AGGCC	2	10	11974	11983	20 %	0 %	40 %	40 %	120552952
9	NC_008740	TGGCC	2	10	12830	12839	0 %	20 %	40 %	40 %	120552953
10	NC_008740	ACGAA	2	10	13876	13885	60 %	0 %	20 %	20 %	120552953
11	NC_008740	CTGTC	2	10	15127	15136	0 %	40 %	20 %	40 %	120552954
12	NC_008740	GCACC	2	10	15299	15308	20 %	0 %	20 %	60 %	120552954
13	NC_008740	GGGCA	2	10	15366	15375	20 %	0 %	60 %	20 %	120552954
14	NC_008740	ACCGC	2	10	15580	15589	20 %	0 %	20 %	60 %	120552954
15	NC_008740	GCGCG	2	10	18220	18229	0 %	0 %	60 %	40 %	120552955
16	NC_008740	CCGCA	2	10	18362	18371	20 %	0 %	20 %	60 %	120552955
17	NC_008740	GGCTG	2	10	18607	18616	0 %	20 %	60 %	20 %	120552955
18	NC_008740	TGGGT	2	10	21318	21327	0 %	40 %	60 %	0 %	120552956
19	NC_008740	CGGAA	2	10	21704	21713	40 %	0 %	40 %	20 %	120552956
20	NC_008740	CCTTG	2	10	23280	23289	0 %	40 %	20 %	40 %	120552956
21	NC_008740	CGGCG	2	10	23724	23733	0 %	0 %	60 %	40 %	120552956
22	NC_008740	TGAGC	2	10	25785	25794	20 %	20 %	40 %	20 %	120552958
23	NC_008740	CTGCA	2	10	26266	26275	20 %	20 %	20 %	40 %	120552958
24	NC_008740	TTCCC	2	10	27055	27064	0 %	40 %	0 %	60 %	120552959
25	NC_008740	CAGCG	2	10	27993	28002	20 %	0 %	40 %	40 %	120552959
26	NC_008740	GGCGT	2	10	29249	29258	0 %	20 %	60 %	20 %	120552960
27	NC_008740	GTTTG	2	10	30742	30751	0 %	60 %	40 %	0 %	120552962
28	NC_008740	GCTGT	2	10	30865	30874	0 %	40 %	40 %	20 %	120552962
29	NC_008740	CGGTC	2	10	32983	32992	0 %	20 %	40 %	40 %	120552962
30	NC_008740	CACGG	2	10	33759	33768	20 %	0 %	40 %	40 %	120552963
31	NC_008740	GGCCC	2	10	34639	34648	0 %	0 %	40 %	60 %	120552964
32	NC_008740	TTCGC	2	10	36643	36652	0 %	40 %	20 %	40 %	120552967
33	NC_008740	TTGCT	2	10	40885	40894	0 %	60 %	20 %	20 %	120552971
34	NC_008740	ATTGC	2	10	41573	41582	20 %	40 %	20 %	20 %	120552971
35	NC_008740	CGGAT	2	10	41961	41970	20 %	20 %	40 %	20 %	120552971
36	NC_008740	CTTCA	2	10	43803	43812	20 %	40 %	0 %	40 %	120552972
37	NC_008740	GATGG	2	10	45060	45069	20 %	20 %	60 %	0 %	120552973
38	NC_008740	TTTGG	2	10	50523	50532	0 %	60 %	40 %	0 %	120552977
39	NC_008740	CTCCG	2	10	50719	50728	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_008740	TTGGC	2	10	51532	51541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008740	GTGCG	2	10	52705	52714	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008740	CAGGC	2	10	53122	53131	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_008740	AGGTC	2	10	54336	54345	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008740	CAAAG	2	10	55627	55636	60 %	0 %	20 %	20 %	120552979
45	NC_008740	CAATC	2	10	55654	55663	40 %	20 %	0 %	40 %	120552979
46	NC_008740	CCTTG	2	10	56625	56634	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008740	CCCTG	2	10	56674	56683	0 %	20 %	20 %	60 %	120552980
48	NC_008740	GGCGG	2	10	56850	56859	0 %	0 %	80 %	20 %	120552980
49	NC_008740	ACGGT	2	10	59906	59915	20 %	20 %	40 %	20 %	120552981
50	NC_008740	CGGGT	2	10	60002	60011	0 %	20 %	60 %	20 %	120552981
51	NC_008740	GGCCG	2	10	60040	60049	0 %	0 %	60 %	40 %	120552981
52	NC_008740	CCCAG	2	10	60872	60881	20 %	0 %	20 %	60 %	120552982
53	NC_008740	GCTGG	2	10	61086	61095	0 %	20 %	60 %	20 %	120552982
54	NC_008740	GCCAG	2	10	63661	63670	20 %	0 %	40 %	40 %	120552984
55	NC_008740	GTAAC	2	10	63859	63868	40 %	20 %	20 %	20 %	120552984
56	NC_008740	TCCGG	2	10	63903	63912	0 %	20 %	40 %	40 %	120552984
57	NC_008740	GGCCA	2	10	65510	65519	20 %	0 %	40 %	40 %	120552986
58	NC_008740	GGCCG	2	10	67170	67179	0 %	0 %	60 %	40 %	120552988
59	NC_008740	GCACC	2	10	69422	69431	20 %	0 %	20 %	60 %	120552990
60	NC_008740	AGCCG	2	10	70741	70750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008740	CGCAG	2	10	72408	72417	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_008740	CGGAC	2	10	72508	72517	20 %	0 %	40 %	40 %	120552994
63	NC_008740	GCTGG	2	10	79515	79524	0 %	20 %	60 %	20 %	120553001
64	NC_008740	CTTAT	2	10	82948	82957	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008740	CTTCG	2	10	85517	85526	0 %	40 %	20 %	40 %	120553006
66	NC_008740	GCCGG	2	10	86733	86742	0 %	0 %	60 %	40 %	120553008
67	NC_008740	CCGCG	2	10	87820	87829	0 %	0 %	40 %	60 %	120553010
68	NC_008740	TCAGG	2	10	88502	88511	20 %	20 %	40 %	20 %	120553011
69	NC_008740	CTGGC	2	10	89249	89258	0 %	20 %	40 %	40 %	120553012
70	NC_008740	GGTCT	2	10	92324	92333	0 %	40 %	40 %	20 %	120553015
71	NC_008740	CTGGC	2	10	92800	92809	0 %	20 %	40 %	40 %	120553015
72	NC_008740	CTGTT	2	10	93499	93508	0 %	60 %	20 %	20 %	120553016
73	NC_008740	GGCCG	2	10	94107	94116	0 %	0 %	60 %	40 %	120553016
74	NC_008740	GGGCC	2	10	96268	96277	0 %	0 %	60 %	40 %	120553017
75	NC_008740	CCAGT	2	10	99327	99336	20 %	20 %	20 %	40 %	120553021
76	NC_008740	CGGGC	2	10	99817	99826	0 %	0 %	60 %	40 %	120553021
77	NC_008740	CATAA	2	10	102948	102957	60 %	20 %	0 %	20 %	120553024
78	NC_008740	GGGCT	2	10	103581	103590	0 %	20 %	60 %	20 %	120553024
79	NC_008740	TGCCA	2	10	104250	104259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008740	CGGTG	2	10	105818	105827	0 %	20 %	60 %	20 %	120553026
81	NC_008740	GCCGA	2	10	108858	108867	20 %	0 %	40 %	40 %	120553028
82	NC_008740	GGGCT	2	10	109827	109836	0 %	20 %	60 %	20 %	120553029
83	NC_008740	GCTTT	2	10	110121	110130	0 %	60 %	20 %	20 %	120553029
84	NC_008740	GTGGG	2	10	111806	111815	0 %	20 %	80 %	0 %	120553031
85	NC_008740	AGGCC	2	10	117432	117441	20 %	0 %	40 %	40 %	120553034
86	NC_008740	GGAAC	2	10	117535	117544	40 %	0 %	40 %	20 %	120553034
87	NC_008740	CGGTG	2	10	117946	117955	0 %	20 %	60 %	20 %	120553034
88	NC_008740	CCAGG	2	10	120086	120095	20 %	0 %	40 %	40 %	120553036
89	NC_008740	CCAGG	2	10	120700	120709	20 %	0 %	40 %	40 %	120553037
90	NC_008740	GAATG	2	10	120820	120829	40 %	20 %	40 %	0 %	120553037
91	NC_008740	ATCGT	2	10	122230	122239	20 %	40 %	20 %	20 %	120553039
92	NC_008740	TGGCG	2	10	123179	123188	0 %	20 %	60 %	20 %	120553039
93	NC_008740	TCGGG	2	10	123493	123502	0 %	20 %	60 %	20 %	120553040
94	NC_008740	CCCGG	2	10	124537	124546	0 %	0 %	40 %	60 %	120553040
95	NC_008740	ATGGA	2	10	127147	127156	40 %	20 %	40 %	0 %	120553043
96	NC_008740	CCTGG	2	10	127419	127428	0 %	20 %	40 %	40 %	120553043
97	NC_008740	CCGGG	2	10	133421	133430	0 %	0 %	60 %	40 %	120553050
98	NC_008740	AAGCA	2	10	133665	133674	60 %	0 %	20 %	20 %	120553050
99	NC_008740	CGGGC	2	10	135686	135695	0 %	0 %	60 %	40 %	120553052
100	NC_008740	CGCGG	2	10	135859	135868	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_008740	CCCGG	2	10	136576	136585	0 %	0 %	40 %	60 %	120553053
102	NC_008740	GCCAG	2	10	136623	136632	20 %	0 %	40 %	40 %	120553053
103	NC_008740	CGTGG	2	10	136764	136773	0 %	20 %	60 %	20 %	120553053
104	NC_008740	TGCCC	2	10	136783	136792	0 %	20 %	20 %	60 %	120553053
105	NC_008740	TCTTT	2	10	138789	138798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008740	CTGGC	2	10	139579	139588	0 %	20 %	40 %	40 %	120553055
107	NC_008740	GCGTG	2	10	146388	146397	0 %	20 %	60 %	20 %	120553062
108	NC_008740	GTCCA	2	10	147736	147745	20 %	20 %	20 %	40 %	120553064
109	NC_008740	CCAGT	2	10	147906	147915	20 %	20 %	20 %	40 %	120553064
110	NC_008740	GGCCA	2	10	149219	149228	20 %	0 %	40 %	40 %	120553065
111	NC_008740	TCGTT	2	10	151576	151585	0 %	60 %	20 %	20 %	120553067
112	NC_008740	CATGA	2	10	152736	152745	40 %	20 %	20 %	20 %	120553068
113	NC_008740	GCCTG	2	10	153615	153624	0 %	20 %	40 %	40 %	120553069
114	NC_008740	GACTG	2	10	155109	155118	20 %	20 %	40 %	20 %	120553070
115	NC_008740	CGGTG	2	10	162348	162357	0 %	20 %	60 %	20 %	120553078
116	NC_008740	GTGGC	2	10	163134	163143	0 %	20 %	60 %	20 %	120553078
117	NC_008740	GCTGA	2	10	164490	164499	20 %	20 %	40 %	20 %	120553079
118	NC_008740	GGGCC	2	10	165470	165479	0 %	0 %	60 %	40 %	120553079
119	NC_008740	TCCAA	2	10	167914	167923	40 %	20 %	0 %	40 %	120553081
120	NC_008740	GCCCG	2	10	172252	172261	0 %	0 %	40 %	60 %	120553085
121	NC_008740	AACGG	2	10	176083	176092	40 %	0 %	40 %	20 %	120553088
122	NC_008740	GGGTT	2	10	176294	176303	0 %	40 %	60 %	0 %	120553088
123	NC_008740	TGCAG	2	10	178299	178308	20 %	20 %	40 %	20 %	120553090
124	NC_008740	CCGAT	2	10	180474	180483	20 %	20 %	20 %	40 %	120553092
125	NC_008740	GCTTG	2	10	182753	182762	0 %	40 %	40 %	20 %	120553093
126	NC_008740	ATTCG	2	10	185125	185134	20 %	40 %	20 %	20 %	120553098
127	NC_008740	CCATG	2	10	200922	200931	20 %	20 %	20 %	40 %	120553111
128	NC_008740	AGGCA	2	10	201413	201422	40 %	0 %	40 %	20 %	120553111
129	NC_008740	CCCAA	2	10	204000	204009	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_008740	CCATG	2	10	208975	208984	20 %	20 %	20 %	40 %	120553116
131	NC_008740	GCCAG	2	10	212233	212242	20 %	0 %	40 %	40 %	120553119
132	NC_008740	CCGGG	2	10	212560	212569	0 %	0 %	60 %	40 %	120553119
133	NC_008740	GGTTT	2	10	213737	213746	0 %	60 %	40 %	0 %	120553120
134	NC_008740	TGGCC	2	10	217847	217856	0 %	20 %	40 %	40 %	120553122
135	NC_008740	GGCAA	2	10	219960	219969	40 %	0 %	40 %	20 %	120553124
136	NC_008740	GTGCG	2	10	220698	220707	0 %	20 %	60 %	20 %	120553125
137	NC_008740	CTGCT	2	10	223204	223213	0 %	40 %	20 %	40 %	120553128
138	NC_008740	GATTC	2	10	225805	225814	20 %	40 %	20 %	20 %	120553130
139	NC_008740	AGCCA	2	10	226676	226685	40 %	0 %	20 %	40 %	120553130
140	NC_008740	AGCCA	2	10	230819	230828	40 %	0 %	20 %	40 %	120553134
141	NC_008740	GCAGA	2	10	237627	237636	40 %	0 %	40 %	20 %	120553139
142	NC_008740	GGATC	2	10	238184	238193	20 %	20 %	40 %	20 %	120553139
143	NC_008740	CATGC	2	10	243084	243093	20 %	20 %	20 %	40 %	120553148
144	NC_008740	TGGCA	2	10	248630	248639	20 %	20 %	40 %	20 %	120553152
145	NC_008740	CCGGC	2	10	248731	248740	0 %	0 %	40 %	60 %	120553152
146	NC_008740	TTAAA	2	10	249956	249965	60 %	40 %	0 %	0 %	120553153
147	NC_008740	TTTCC	2	10	254919	254928	0 %	60 %	0 %	40 %	120553160
148	NC_008740	ACAGC	2	10	255204	255213	40 %	0 %	20 %	40 %	120553160
149	NC_008740	CCATG	2	10	262189	262198	20 %	20 %	20 %	40 %	120553168
150	NC_008740	TTTGC	2	10	262497	262506	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008740	TAACG	2	10	267350	267359	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_008740	TTTTC	2	10	272200	272209	0 %	80 %	0 %	20 %	120553172
153	NC_008740	TCTCG	2	10	276390	276399	0 %	40 %	20 %	40 %	120553176
154	NC_008740	TTCCA	2	10	277340	277349	20 %	40 %	0 %	40 %	120553176
155	NC_008740	CCAAT	2	10	278274	278283	40 %	20 %	0 %	40 %	120553177
156	NC_008740	TGGTC	2	10	280146	280155	0 %	40 %	40 %	20 %	120553179
157	NC_008740	GCCCG	2	10	282342	282351	0 %	0 %	40 %	60 %	120553184
158	NC_008740	GCGCG	2	10	282758	282767	0 %	0 %	60 %	40 %	120553184
159	NC_008740	GTCCG	2	10	285400	285409	0 %	20 %	40 %	40 %	120553187
160	NC_008740	GGTCA	2	10	288253	288262	20 %	20 %	40 %	20 %	120553189
161	NC_008740	CGGTT	2	10	294786	294795	0 %	40 %	40 %	20 %	120553194
162	NC_008740	ACGTT	2	10	296254	296263	20 %	40 %	20 %	20 %	120553196
163	NC_008740	CAGGG	2	10	300567	300576	20 %	0 %	60 %	20 %	120553200
164	NC_008740	AAAGC	2	10	300740	300749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_008740	GTGCC	2	10	304357	304366	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
166	NC_008740	ACGCC	2	10	304775	304784	20 %	0 %	20 %	60 %	120553204
167	NC_008740	GTGCT	2	10	307312	307321	0 %	40 %	40 %	20 %	120553205
168	NC_008740	GTCTG	2	10	307357	307366	0 %	40 %	40 %	20 %	120553205
169	NC_008740	GTTTT	2	10	307678	307687	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008740	GGGCT	2	10	307936	307945	0 %	20 %	60 %	20 %	120553206
171	NC_008740	CGGTG	2	10	310091	310100	0 %	20 %	60 %	20 %	120553209
172	NC_008740	CACCG	2	10	311453	311462	20 %	0 %	20 %	60 %	120553209
173	NC_008740	GCTGG	2	10	312216	312225	0 %	20 %	60 %	20 %	120553210
174	NC_008740	GTGCG	2	10	314099	314108	0 %	20 %	60 %	20 %	120553213
175	NC_008740	GCGTG	2	10	314948	314957	0 %	20 %	60 %	20 %	120553213
176	NC_008740	GCCCG	2	10	319713	319722	0 %	0 %	40 %	60 %	120553217
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178	NC_008740	GGCGC	2	10	324296	324305	0 %	0 %	60 %	40 %	120553221
179	NC_008740	GGCCA	2	10	325988	325997	20 %	0 %	40 %	40 %	120553223
180	NC_008740	CCGTT	2	10	328773	328782	0 %	40 %	20 %	40 %	120553226
181	NC_008740	TAAAC	2	10	329554	329563	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_008740	GTCAA	2	10	331557	331566	40 %	20 %	20 %	20 %	120553228
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195	NC_008740	CTGAA	2	10	349160	349169	40 %	20 %	20 %	20 %	120553243
196	NC_008740	GATCA	2	10	351015	351024	40 %	20 %	20 %	20 %	120553244
197	NC_008740	GCGGT	2	10	352447	352456	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
198	NC_008740	GCTGT	2	10	352667	352676	0 %	40 %	40 %	20 %	120553245
199	NC_008740	GCTGG	2	10	354366	354375	0 %	20 %	60 %	20 %	120553245
200	NC_008740	TGATC	2	10	355076	355085	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
201	NC_008740	CAGCG	2	10	355693	355702	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
202	NC_008740	CCGGC	2	10	360269	360278	0 %	0 %	40 %	60 %	120553248
203	NC_008740	GTATG	2	10	362222	362231	20 %	40 %	40 %	0 %	120553249
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248	NC_008740	GAAAT	2	10	439030	439039	60 %	20 %	20 %	0 %	120553321
249	NC_008740	GTTCT	2	10	441331	441340	0 %	60 %	20 %	20 %	120553324
250	NC_008740	ATTGA	2	10	442054	442063	40 %	40 %	20 %	0 %	120553325
251	NC_008740	GGTAA	2	10	442228	442237	40 %	20 %	40 %	0 %	120553325
252	NC_008740	CGGCG	2	10	443068	443077	0 %	0 %	60 %	40 %	120553326
253	NC_008740	GCCAG	2	10	444593	444602	20 %	0 %	40 %	40 %	120553327
254	NC_008740	ACAAA	2	10	447311	447320	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
255	NC_008740	GGGAA	2	10	447797	447806	40 %	0 %	60 %	0 %	120553330
256	NC_008740	GTCGG	2	10	449312	449321	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
257	NC_008740	CAAAG	2	10	450721	450730	60 %	0 %	20 %	20 %	120553333
258	NC_008740	ACGAA	2	10	452843	452852	60 %	0 %	20 %	20 %	120553335
259	NC_008740	TCATG	2	10	455458	455467	20 %	40 %	20 %	20 %	120553336
260	NC_008740	CTGAG	2	10	456663	456672	20 %	20 %	40 %	20 %	120553337
261	NC_008740	TGATC	2	10	458605	458614	20 %	40 %	20 %	20 %	120553340
262	NC_008740	GGTGG	2	10	463318	463327	0 %	20 %	80 %	0 %	120553346
263	NC_008740	GCTTC	2	10	464834	464843	0 %	40 %	20 %	40 %	120553347
264	NC_008740	AAGCC	2	10	465316	465325	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
265	NC_008740	CGGTG	2	10	466329	466338	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_008740	TGGAA	2	10	471649	471658	40 %	20 %	40 %	0 %	120553352
268	NC_008740	CAAGA	2	10	472281	472290	60 %	0 %	20 %	20 %	120553352
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370	NC_008740	CCGTC	2	10	667083	667092	0 %	20 %	20 %	60 %	120553519
371	NC_008740	CAAAG	2	10	669807	669816	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
372	NC_008740	CCTGG	2	10	670474	670483	0 %	20 %	40 %	40 %	120553522
373	NC_008740	TTGGC	2	10	670535	670544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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381	NC_008740	CGGAG	2	10	679259	679268	20 %	0 %	60 %	20 %	120553530
382	NC_008740	GGCAC	2	10	680219	680228	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
383	NC_008740	CGAAT	2	10	680256	680265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
384	NC_008740	GCAGC	2	10	685594	685603	20 %	0 %	40 %	40 %	120553537
385	NC_008740	CGCGC	2	10	685926	685935	0 %	0 %	40 %	60 %	120553537
386	NC_008740	ACTGA	2	10	687828	687837	40 %	20 %	20 %	20 %	120553538
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388	NC_008740	GATCA	2	10	689643	689652	40 %	20 %	20 %	20 %	120553540
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390	NC_008740	GATCA	2	10	691042	691051	40 %	20 %	20 %	20 %	120553541
391	NC_008740	ACCAG	2	10	691526	691535	40 %	0 %	20 %	40 %	120553541
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393	NC_008740	CCGCC	2	10	694684	694693	0 %	0 %	20 %	80 %	120553543
394	NC_008740	AGGGC	2	10	696343	696352	20 %	0 %	60 %	20 %	120553544
395	NC_008740	GAGTC	2	10	697162	697171	20 %	20 %	40 %	20 %	120553545
396	NC_008740	GCTTC	2	10	698345	698354	0 %	40 %	20 %	40 %	120553546
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