MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 chromosome

Total Repeats: 81583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
81501	NC_008740	GTT	2	6	4322369	4322374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120556797
81502	NC_008740	GCG	2	6	4322401	4322406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120556797
81503	NC_008740	GGT	2	6	4322423	4322428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556797
81504	NC_008740	TTC	2	6	4322445	4322450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120556797
81505	NC_008740	TGA	2	6	4322494	4322499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120556797
81506	NC_008740	GCA	2	6	4322521	4322526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556797
81507	NC_008740	TGT	2	6	4322602	4322607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120556797
81508	NC_008740	GGA	2	6	4322610	4322615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120556797
81509	NC_008740	GGGC	2	8	4322653	4322660	0 %	0 %	75 %	25 %	120556797
81510	NC_008740	TCCT	2	8	4322668	4322675	0 %	50 %	0 %	50 %	120556797
81511	NC_008740	ATT	2	6	4322678	4322683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120556797
81512	NC_008740	CTG	2	6	4322698	4322703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556797
81513	NC_008740	GCA	2	6	4322831	4322836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556798
81514	NC_008740	GGT	2	6	4322898	4322903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556798
81515	NC_008740	TGC	2	6	4322967	4322972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556798
81516	NC_008740	CAGA	2	8	4323029	4323036	50 %	0 %	25 %	25 %	120556798
81517	NC_008740	TCACCG	2	12	4323053	4323064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	120556798
81518	NC_008740	GGT	3	9	4323126	4323134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556798
81519	NC_008740	CCA	2	6	4323140	4323145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120556798
81520	NC_008740	TTC	2	6	4323174	4323179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120556798
81521	NC_008740	CGG	2	6	4323233	4323238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120556798
81522	NC_008740	AAT	2	6	4323243	4323248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120556798
81523	NC_008740	CCCGC	2	10	4323332	4323341	0 %	0 %	20 %	80 %	120556798
81524	NC_008740	CAG	2	6	4323351	4323356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556798
81525	NC_008740	GCCG	2	8	4323377	4323384	0 %	0 %	50 %	50 %	120556798
81526	NC_008740	CTG	2	6	4323444	4323449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556798
81527	NC_008740	CAG	2	6	4323459	4323464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556798
81528	NC_008740	TCC	2	6	4323514	4323519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120556798
81529	NC_008740	CCA	2	6	4323569	4323574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120556798
81530	NC_008740	GCC	2	6	4323628	4323633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120556798
81531	NC_008740	ATCAG	2	10	4323652	4323661	40 %	20 %	20 %	20 %	120556798
81532	NC_008740	GCC	2	6	4323789	4323794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120556798
81533	NC_008740	TCA	2	6	4323865	4323870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120556798
81534	NC_008740	ATGGCC	2	12	4323952	4323963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120556798
81535	NC_008740	GGC	2	6	4324020	4324025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120556798
81536	NC_008740	GCTG	2	8	4324039	4324046	0 %	25 %	50 %	25 %	120556798
81537	NC_008740	GTCAG	2	10	4324099	4324108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81538	NC_008740	CTT	2	6	4324128	4324133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120556799
81539	NC_008740	CTG	2	6	4324173	4324178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556799
81540	NC_008740	TGT	2	6	4324193	4324198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120556799
81541	NC_008740	CCAG	2	8	4324202	4324209	25 %	0 %	25 %	50 %	120556799
81542	NC_008740	CCGG	2	8	4324222	4324229	0 %	0 %	50 %	50 %	120556799
81543	NC_008740	GAA	2	6	4324239	4324244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120556799
81544	NC_008740	GATT	2	8	4324499	4324506	25 %	50 %	25 %	0 %	120556799
81545	NC_008740	CAT	2	6	4324527	4324532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120556799
81546	NC_008740	ATC	2	6	4324554	4324559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120556799
81547	NC_008740	CG	3	6	4324599	4324604	0 %	0 %	50 %	50 %	120556799
81548	NC_008740	TGG	2	6	4324628	4324633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556799
81549	NC_008740	GAA	2	6	4324644	4324649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120556799
81550	NC_008740	CAG	2	6	4324671	4324676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556799
81551	NC_008740	GAT	2	6	4324677	4324682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120556799
81552	NC_008740	GACCA	2	10	4324701	4324710	40 %	0 %	20 %	40 %	120556799
81553	NC_008740	GAA	2	6	4324749	4324754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120556799
81554	NC_008740	CAGC	2	8	4324755	4324762	25 %	0 %	25 %	50 %	120556799
81555	NC_008740	CGT	2	6	4324872	4324877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556799
81556	NC_008740	GGT	2	6	4324920	4324925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120556799
81557	NC_008740	TGC	2	6	4324978	4324983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556799
81558	NC_008740	GCCA	3	12	4324990	4325001	25 %	0 %	25 %	50 %	120556799
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81565	NC_008740	CGC	2	6	4325636	4325641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120556799
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81567	NC_008740	CAGG	2	8	4325657	4325664	25 %	0 %	50 %	25 %	120556799
81568	NC_008740	CTG	2	6	4325692	4325697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556799
81569	NC_008740	CTGTT	2	10	4325724	4325733	0 %	60 %	20 %	20 %	120556799
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81571	NC_008740	GTCTG	2	10	4325835	4325844	0 %	40 %	40 %	20 %	120556800
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81574	NC_008740	TGGC	2	8	4326056	4326063	0 %	25 %	50 %	25 %	120556800
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81577	NC_008740	GGC	2	6	4326251	4326256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120556801
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81579	NC_008740	CTG	2	6	4326463	4326468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120556801
81580	NC_008740	AGGC	2	8	4326523	4326530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81581	NC_008740	CGA	2	6	4326571	4326576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120556802
81582	NC_008740	TCG	2	6	4326689	4326694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81583	NC_008740	ATGGTT	2	12	4326772	4326783	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.