MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU01

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008738	AG	3	6	48	53	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008738	AG	3	6	525	530	50 %	0 %	50 %	0 %	120536824
3	NC_008738	AG	3	6	789	794	50 %	0 %	50 %	0 %	120536824
4	NC_008738	GC	4	8	2427	2434	0 %	0 %	50 %	50 %	120536824
5	NC_008738	AG	3	6	2642	2647	50 %	0 %	50 %	0 %	120536824
6	NC_008738	GC	3	6	2956	2961	0 %	0 %	50 %	50 %	120536824
7	NC_008738	AC	3	6	3851	3856	50 %	0 %	0 %	50 %	120536825
8	NC_008738	AT	3	6	4619	4624	50 %	50 %	0 %	0 %	120536826
9	NC_008738	CA	3	6	4765	4770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008738	GA	3	6	4815	4820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008738	GA	3	6	5262	5267	50 %	0 %	50 %	0 %	120536827
12	NC_008738	CG	3	6	5567	5572	0 %	0 %	50 %	50 %	120536828
13	NC_008738	CT	3	6	5657	5662	0 %	50 %	0 %	50 %	120536828
14	NC_008738	AC	3	6	6307	6312	50 %	0 %	0 %	50 %	120536829
15	NC_008738	GA	3	6	6499	6504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008738	AT	3	6	7353	7358	50 %	50 %	0 %	0 %	120536830
17	NC_008738	CT	3	6	7375	7380	0 %	50 %	0 %	50 %	120536830
18	NC_008738	CG	3	6	7512	7517	0 %	0 %	50 %	50 %	120536831
19	NC_008738	TG	3	6	8627	8632	0 %	50 %	50 %	0 %	120536831
20	NC_008738	AG	3	6	8737	8742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008738	GA	3	6	9325	9330	50 %	0 %	50 %	0 %	120536832
22	NC_008738	AT	3	6	9984	9989	50 %	50 %	0 %	0 %	120536832
23	NC_008738	CA	3	6	10228	10233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008738	TG	3	6	10537	10542	0 %	50 %	50 %	0 %	120536833
25	NC_008738	TA	3	6	11141	11146	50 %	50 %	0 %	0 %	120536833
26	NC_008738	CT	3	6	11306	11311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008738	GC	3	6	11497	11502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008738	AG	3	6	12945	12950	50 %	0 %	50 %	0 %	120536835
29	NC_008738	AT	3	6	13563	13568	50 %	50 %	0 %	0 %	120536835
30	NC_008738	GA	3	6	13828	13833	50 %	0 %	50 %	0 %	120536835
31	NC_008738	GC	3	6	13901	13906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008738	TC	3	6	14045	14050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008738	AG	3	6	14160	14165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008738	AG	3	6	14713	14718	50 %	0 %	50 %	0 %	120536836
35	NC_008738	GC	3	6	15477	15482	0 %	0 %	50 %	50 %	120536837
36	NC_008738	AC	4	8	17802	17809	50 %	0 %	0 %	50 %	120536838
37	NC_008738	CA	3	6	18212	18217	50 %	0 %	0 %	50 %	120536839
38	NC_008738	GA	3	6	18821	18826	50 %	0 %	50 %	0 %	120536840
39	NC_008738	GC	3	6	19261	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	120536841
40	NC_008738	GA	3	6	20017	20022	50 %	0 %	50 %	0 %	120536842
41	NC_008738	AG	3	6	20105	20110	50 %	0 %	50 %	0 %	120536842
42	NC_008738	CG	3	6	20622	20627	0 %	0 %	50 %	50 %	120536843
43	NC_008738	CG	4	8	21957	21964	0 %	0 %	50 %	50 %	120536843
44	NC_008738	GC	3	6	27842	27847	0 %	0 %	50 %	50 %	120536849
45	NC_008738	GC	3	6	29160	29165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008738	GC	3	6	31748	31753	0 %	0 %	50 %	50 %	120536853
47	NC_008738	GC	3	6	33065	33070	0 %	0 %	50 %	50 %	120536855
48	NC_008738	GC	3	6	33978	33983	0 %	0 %	50 %	50 %	120536856
49	NC_008738	TG	4	8	34445	34452	0 %	50 %	50 %	0 %	120536857
50	NC_008738	GT	3	6	35655	35660	0 %	50 %	50 %	0 %	120536858
51	NC_008738	GC	3	6	37179	37184	0 %	0 %	50 %	50 %	120536860
52	NC_008738	GC	3	6	38100	38105	0 %	0 %	50 %	50 %	120536861
53	NC_008738	CT	3	6	38718	38723	0 %	50 %	0 %	50 %	120536862
54	NC_008738	GA	3	6	39939	39944	50 %	0 %	50 %	0 %	120536863
55	NC_008738	GA	3	6	40148	40153	50 %	0 %	50 %	0 %	120536863
56	NC_008738	AG	3	6	40308	40313	50 %	0 %	50 %	0 %	120536863
57	NC_008738	CG	3	6	40707	40712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008738	GC	3	6	41031	41036	0 %	0 %	50 %	50 %	120536864
59	NC_008738	GA	4	8	41358	41365	50 %	0 %	50 %	0 %	120536864
60	NC_008738	AC	3	6	41455	41460	50 %	0 %	0 %	50 %	120536864
61	NC_008738	GC	3	6	45665	45670	0 %	0 %	50 %	50 %	120536866
62	NC_008738	TA	3	6	47231	47236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008738	TC	3	6	47611	47616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008738	GT	3	6	47920	47925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008738	AG	3	6	49869	49874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008738	AC	3	6	51107	51112	50 %	0 %	0 %	50 %	120536872
67	NC_008738	CG	3	6	52252	52257	0 %	0 %	50 %	50 %	120536873
68	NC_008738	CA	3	6	53197	53202	50 %	0 %	0 %	50 %	120536874
69	NC_008738	AG	3	6	53582	53587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008738	CG	3	6	53617	53622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008738	TG	3	6	54027	54032	0 %	50 %	50 %	0 %	120536875
72	NC_008738	AC	3	6	54511	54516	50 %	0 %	0 %	50 %	120536876
73	NC_008738	CG	3	6	54867	54872	0 %	0 %	50 %	50 %	120536876
74	NC_008738	GC	3	6	55549	55554	0 %	0 %	50 %	50 %	120536877
75	NC_008738	CA	3	6	55727	55732	50 %	0 %	0 %	50 %	120536877
76	NC_008738	AG	3	6	56843	56848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008738	CT	3	6	57356	57361	0 %	50 %	0 %	50 %	120536879
78	NC_008738	CT	3	6	57576	57581	0 %	50 %	0 %	50 %	120536880
79	NC_008738	TC	3	6	59282	59287	0 %	50 %	0 %	50 %	120536881
80	NC_008738	TG	3	6	59295	59300	0 %	50 %	50 %	0 %	120536881
81	NC_008738	CA	3	6	59908	59913	50 %	0 %	0 %	50 %	120536881
82	NC_008738	GC	3	6	60169	60174	0 %	0 %	50 %	50 %	120536882
83	NC_008738	AC	3	6	60271	60276	50 %	0 %	0 %	50 %	120536882
84	NC_008738	GC	3	6	61154	61159	0 %	0 %	50 %	50 %	120536883
85	NC_008738	CA	3	6	61549	61554	50 %	0 %	0 %	50 %	120536883
86	NC_008738	CG	3	6	63858	63863	0 %	0 %	50 %	50 %	120536884
87	NC_008738	CG	3	6	63972	63977	0 %	0 %	50 %	50 %	120536885
88	NC_008738	AC	3	6	65095	65100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008738	CA	3	6	67625	67630	50 %	0 %	0 %	50 %	120536887
90	NC_008738	CA	3	6	69450	69455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008738	GT	3	6	70682	70687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008738	GC	3	6	73015	73020	0 %	0 %	50 %	50 %	120536891
93	NC_008738	AG	3	6	73167	73172	50 %	0 %	50 %	0 %	120536891
94	NC_008738	AG	3	6	73294	73299	50 %	0 %	50 %	0 %	120536891
95	NC_008738	GC	3	6	73512	73517	0 %	0 %	50 %	50 %	120536891
96	NC_008738	CA	3	6	73701	73706	50 %	0 %	0 %	50 %	120536892
97	NC_008738	GC	3	6	75485	75490	0 %	0 %	50 %	50 %	120536892
98	NC_008738	AC	3	6	76367	76372	50 %	0 %	0 %	50 %	120536892
99	NC_008738	GC	3	6	77037	77042	0 %	0 %	50 %	50 %	120536892
100	NC_008738	CA	3	6	77318	77323	50 %	0 %	0 %	50 %	120536892
101	NC_008738	CG	3	6	78195	78200	0 %	0 %	50 %	50 %	120536892
102	NC_008738	AG	3	6	78363	78368	50 %	0 %	50 %	0 %	120536892
103	NC_008738	AG	3	6	78418	78423	50 %	0 %	50 %	0 %	120536892
104	NC_008738	GT	3	6	78698	78703	0 %	50 %	50 %	0 %	120536892
105	NC_008738	CA	3	6	79266	79271	50 %	0 %	0 %	50 %	120536892
106	NC_008738	AG	3	6	80187	80192	50 %	0 %	50 %	0 %	120536893
107	NC_008738	CA	3	6	81115	81120	50 %	0 %	0 %	50 %	120536894
108	NC_008738	GC	3	6	82284	82289	0 %	0 %	50 %	50 %	120536894
109	NC_008738	AC	3	6	82332	82337	50 %	0 %	0 %	50 %	120536894
110	NC_008738	GC	3	6	82451	82456	0 %	0 %	50 %	50 %	120536894
111	NC_008738	AC	3	6	82596	82601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008738	AC	3	6	82883	82888	50 %	0 %	0 %	50 %	120536895
113	NC_008738	GC	3	6	83658	83663	0 %	0 %	50 %	50 %	120536895
114	NC_008738	GT	3	6	83968	83973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008738	TG	3	6	84153	84158	0 %	50 %	50 %	0 %	120536896
116	NC_008738	CG	3	6	84344	84349	0 %	0 %	50 %	50 %	120536896
117	NC_008738	GA	3	6	84485	84490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008738	AG	3	6	86278	86283	50 %	0 %	50 %	0 %	120536898
119	NC_008738	AC	3	6	86361	86366	50 %	0 %	0 %	50 %	120536898
120	NC_008738	GC	3	6	86517	86522	0 %	0 %	50 %	50 %	120536898
121	NC_008738	TG	3	6	87105	87110	0 %	50 %	50 %	0 %	120536899
122	NC_008738	AC	3	6	87769	87774	50 %	0 %	0 %	50 %	120536900
123	NC_008738	AT	3	6	88463	88468	50 %	50 %	0 %	0 %	120536900
124	NC_008738	CG	4	8	88909	88916	0 %	0 %	50 %	50 %	120536901
125	NC_008738	AG	3	6	89951	89956	50 %	0 %	50 %	0 %	120536901
126	NC_008738	GC	3	6	90000	90005	0 %	0 %	50 %	50 %	120536901
127	NC_008738	CT	3	6	90545	90550	0 %	50 %	0 %	50 %	120536902
128	NC_008738	GC	3	6	91295	91300	0 %	0 %	50 %	50 %	120536902
129	NC_008738	CT	3	6	93167	93172	0 %	50 %	0 %	50 %	120536905
130	NC_008738	CA	3	6	93837	93842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008738	GC	3	6	95016	95021	0 %	0 %	50 %	50 %	120536906
132	NC_008738	GC	3	6	96366	96371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008738	GT	3	6	97389	97394	0 %	50 %	50 %	0 %	120536908
134	NC_008738	GC	3	6	97427	97432	0 %	0 %	50 %	50 %	120536908
135	NC_008738	CA	3	6	98682	98687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008738	GC	3	6	99988	99993	0 %	0 %	50 %	50 %	120536910
137	NC_008738	CA	3	6	101970	101975	50 %	0 %	0 %	50 %	120536912
138	NC_008738	GC	3	6	103831	103836	0 %	0 %	50 %	50 %	120536914
139	NC_008738	GT	3	6	104554	104559	0 %	50 %	50 %	0 %	120536914
140	NC_008738	AG	4	8	105171	105178	50 %	0 %	50 %	0 %	120536914
141	NC_008738	GC	3	6	106366	106371	0 %	0 %	50 %	50 %	120536915
142	NC_008738	CA	3	6	106753	106758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008738	AC	3	6	108599	108604	50 %	0 %	0 %	50 %	120536918
144	NC_008738	TA	3	6	110987	110992	50 %	50 %	0 %	0 %	120536921
145	NC_008738	AG	3	6	111539	111544	50 %	0 %	50 %	0 %	120536921
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.