MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. KMS chromosome

Total Repeats: 156112

< Previous12...301302303304305306307308309310311312313Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
156001	NC_008705	AGG	2	6	5733108	5733113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119871513
156002	NC_008705	AGC	2	6	5733167	5733172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871513
156003	NC_008705	TCG	2	6	5733186	5733191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871513
156004	NC_008705	CA	3	6	5733226	5733231	50 %	0 %	0 %	50 %	119871513
156005	NC_008705	CCA	2	6	5733234	5733239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119871513
156006	NC_008705	TCG	2	6	5733246	5733251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871513
156007	NC_008705	ACG	2	6	5733252	5733257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871513
156008	NC_008705	CGGC	2	8	5733264	5733271	0 %	0 %	50 %	50 %	119871513
156009	NC_008705	CTG	2	6	5733317	5733322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871513
156010	NC_008705	AAC	2	6	5733336	5733341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119871513
156011	NC_008705	GCC	2	6	5733344	5733349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871513
156012	NC_008705	TCG	2	6	5733351	5733356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871513
156013	NC_008705	GCCGGG	2	12	5733438	5733449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119871513
156014	NC_008705	CGA	2	6	5733478	5733483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871513
156015	NC_008705	CGC	3	9	5733498	5733506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871513
156016	NC_008705	CCG	2	6	5733507	5733512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871513
156017	NC_008705	GCC	3	9	5733549	5733557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871513
156018	NC_008705	GC	3	6	5733571	5733576	0 %	0 %	50 %	50 %	119871513
156019	NC_008705	ATC	3	9	5733732	5733740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119871514
156020	NC_008705	CCGGC	2	10	5733745	5733754	0 %	0 %	40 %	60 %	119871514
156021	NC_008705	GCC	2	6	5733765	5733770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871514
156022	NC_008705	CGC	2	6	5733776	5733781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871514
156023	NC_008705	GC	4	8	5733780	5733787	0 %	0 %	50 %	50 %	119871514
156024	NC_008705	CGG	2	6	5733824	5733829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119871514
156025	NC_008705	GCGCT	2	10	5733921	5733930	0 %	20 %	40 %	40 %	119871514
156026	NC_008705	GGA	2	6	5733950	5733955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119871514
156027	NC_008705	CGA	2	6	5733959	5733964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871514
156028	NC_008705	CGA	2	6	5734004	5734009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871514
156029	NC_008705	GCC	2	6	5734047	5734052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871514
156030	NC_008705	GCT	2	6	5734085	5734090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871514
156031	NC_008705	CTT	3	9	5734127	5734135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119871514
156032	NC_008705	CGG	3	9	5734160	5734168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119871514
156033	NC_008705	GGA	2	6	5734181	5734186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119871514
156034	NC_008705	CG	3	6	5734208	5734213	0 %	0 %	50 %	50 %	119871514
156035	NC_008705	CCG	2	6	5734232	5734237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871514
156036	NC_008705	GAG	2	6	5734239	5734244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119871514
156037	NC_008705	CAT	2	6	5734259	5734264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119871514
156038	NC_008705	CCGCGC	2	12	5734271	5734282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871514
156039	NC_008705	GAG	2	6	5734380	5734385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119871514
156040	NC_008705	GT	3	6	5734405	5734410	0 %	50 %	50 %	0 %	119871514
156041	NC_008705	TCG	2	6	5734411	5734416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871514
156042	NC_008705	CGTG	2	8	5734445	5734452	0 %	25 %	50 %	25 %	119871514
156043	NC_008705	GTCGAC	2	12	5734458	5734469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119871514
156044	NC_008705	CAC	2	6	5734499	5734504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119871514
156045	NC_008705	CCG	2	6	5734573	5734578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871514
156046	NC_008705	GTT	2	6	5734588	5734593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119871514
156047	NC_008705	GCC	2	6	5734596	5734601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871514
156048	NC_008705	GCTG	2	8	5734615	5734622	0 %	25 %	50 %	25 %	119871514
156049	NC_008705	AC	3	6	5734682	5734687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
156050	NC_008705	GAG	2	6	5734697	5734702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156051	NC_008705	CA	3	6	5734703	5734708	50 %	0 %	0 %	50 %	119871515
156052	NC_008705	CACCGT	2	12	5734722	5734733	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119871515
156053	NC_008705	CGA	2	6	5734737	5734742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871515
156054	NC_008705	CAG	2	6	5734767	5734772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871515
156055	NC_008705	GAG	2	6	5734840	5734845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119871515
156056	NC_008705	GC	3	6	5734865	5734870	0 %	0 %	50 %	50 %	119871515
156057	NC_008705	TCGACG	2	12	5734886	5734897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119871515
156058	NC_008705	ACC	2	6	5734906	5734911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119871515
156059	NC_008705	GTC	2	6	5734927	5734932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871515
156060	NC_008705	CGA	2	6	5734940	5734945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871515
156061	NC_008705	TCG	2	6	5734982	5734987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871515
156062	NC_008705	CTG	2	6	5735008	5735013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871515
156063	NC_008705	CTG	2	6	5735253	5735258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156064	NC_008705	CGA	3	9	5735267	5735275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156065	NC_008705	CAC	2	6	5735279	5735284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119871516
156066	NC_008705	GTC	2	6	5735295	5735300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156067	NC_008705	CGA	2	6	5735312	5735317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156068	NC_008705	CAG	2	6	5735346	5735351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156069	NC_008705	TCG	2	6	5735377	5735382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156070	NC_008705	ACGT	2	8	5735432	5735439	25 %	25 %	25 %	25 %	119871516
156071	NC_008705	CGA	2	6	5735471	5735476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156072	NC_008705	GC	3	6	5735493	5735498	0 %	0 %	50 %	50 %	119871516
156073	NC_008705	CTGGT	2	10	5735521	5735530	0 %	40 %	40 %	20 %	119871516
156074	NC_008705	CCT	2	6	5735569	5735574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119871516
156075	NC_008705	CGG	2	6	5735660	5735665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119871516
156076	NC_008705	CGC	2	6	5735668	5735673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871516
156077	NC_008705	GAG	3	9	5735685	5735693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119871516
156078	NC_008705	CCG	2	6	5735699	5735704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871516
156079	NC_008705	TCA	2	6	5735734	5735739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119871516
156080	NC_008705	CGG	2	6	5735753	5735758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119871516
156081	NC_008705	TCA	2	6	5735773	5735778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119871516
156082	NC_008705	CCCG	2	8	5735881	5735888	0 %	0 %	25 %	75 %	119871516
156083	NC_008705	CGC	2	6	5735918	5735923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871516
156084	NC_008705	TGA	2	6	5735950	5735955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119871516
156085	NC_008705	CTGCG	2	10	5735961	5735970	0 %	20 %	40 %	40 %	119871516
156086	NC_008705	GCGTC	2	10	5735998	5736007	0 %	20 %	40 %	40 %	119871516
156087	NC_008705	CCA	2	6	5736040	5736045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119871516
156088	NC_008705	GTC	2	6	5736081	5736086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156089	NC_008705	CTG	2	6	5736135	5736140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156090	NC_008705	CGC	2	6	5736254	5736259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119871516
156091	NC_008705	CTG	2	6	5736324	5736329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871516
156092	NC_008705	GGCC	2	8	5736353	5736360	0 %	0 %	50 %	50 %	119871516
156093	NC_008705	GCCC	2	8	5736405	5736412	0 %	0 %	25 %	75 %	119871517
156094	NC_008705	GCT	2	6	5736419	5736424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871517
156095	NC_008705	TCCA	2	8	5736476	5736483	25 %	25 %	0 %	50 %	119871517
156096	NC_008705	GCG	2	6	5736527	5736532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119871517
156097	NC_008705	GAC	2	6	5736534	5736539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871517
156098	NC_008705	ACC	2	6	5736613	5736618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119871517
156099	NC_008705	CGG	2	6	5736659	5736664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119871517
156100	NC_008705	CGA	2	6	5736722	5736727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871517
156101	NC_008705	CAG	2	6	5736735	5736740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119871517
156102	NC_008705	GGT	2	6	5736756	5736761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119871517
156103	NC_008705	CGT	2	6	5736786	5736791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871517
156104	NC_008705	CCGGT	2	10	5736815	5736824	0 %	20 %	40 %	40 %	119871517
156105	NC_008705	CCGC	2	8	5736848	5736855	0 %	0 %	25 %	75 %	119871517
156106	NC_008705	CA	3	6	5736879	5736884	50 %	0 %	0 %	50 %	119871517
156107	NC_008705	TCC	2	6	5736889	5736894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119871517
156108	NC_008705	CGG	2	6	5736911	5736916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119871517
156109	NC_008705	TCG	2	6	5736919	5736924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871517
156110	NC_008705	CTTC	2	8	5736998	5737005	0 %	50 %	0 %	50 %	119871517
156111	NC_008705	AGA	2	6	5737064	5737069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119871517
156112	NC_008705	GCT	2	6	5737094	5737099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119871517

< Previous12...301302303304305306307308309310311312313Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.