MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS02

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008704	ACCGTG	2	12	1759	1770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855178
2	NC_008704	CCGCGG	2	12	5630	5641	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
3	NC_008704	CCCACA	2	12	7613	7624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855183
4	NC_008704	CGCCTC	2	12	8558	8569	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119855184
5	NC_008704	CGCCTC	2	12	10578	10589	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119855185
6	NC_008704	ACACCG	2	12	11123	11134	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119855186
7	NC_008704	GCCACG	2	12	11521	11532	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855186
8	NC_008704	CACCGT	2	12	11994	12005	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119855186
9	NC_008704	TCACCG	2	12	14262	14273	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008704	CCGGGT	2	12	14860	14871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855188
11	NC_008704	CCCGGT	2	12	15115	15126	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855188
12	NC_008704	TCACCG	2	12	16269	16280	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119855189
13	NC_008704	TCGGCG	2	12	16446	16457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855189
14	NC_008704	CAGCCG	2	12	16727	16738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855189
15	NC_008704	CGGCGA	2	12	19971	19982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119855194
16	NC_008704	CGTCGG	2	12	21975	21986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855196
17	NC_008704	GCGATC	2	12	22824	22835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855197
18	NC_008704	TGCACC	2	12	23332	23343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119855198
19	NC_008704	TCGACA	2	12	24463	24474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119855200
20	NC_008704	ACCGCG	2	12	25200	25211	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855200
21	NC_008704	ACGAAC	2	12	27311	27322	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119855202
22	NC_008704	GCCGCA	2	12	27843	27854	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855203
23	NC_008704	CGGCCT	2	12	29980	29991	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855206
24	NC_008704	GGCCAC	2	12	30364	30375	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855207
25	NC_008704	GCGGCA	2	12	32445	32456	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119855207
26	NC_008704	TGGTCT	2	12	34556	34567	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008704	GCAAAG	2	12	40697	40708	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008704	TCGTGT	2	12	46727	46738	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119855224
29	NC_008704	ATCGAC	2	12	56211	56222	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119855233
30	NC_008704	GAAGTG	2	12	56380	56391	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008704	ACGCCG	2	12	61524	61535	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855239
32	NC_008704	CCTGAC	2	12	62091	62102	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119855240
33	NC_008704	CCCCGA	2	12	62665	62676	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855241
34	NC_008704	CGGCTT	2	12	69577	69588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855249
35	NC_008704	CGGCGC	2	12	70791	70802	0 %	0 %	50 %	50 %	119855250
36	NC_008704	CCAGAC	2	12	70878	70889	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119855250
37	NC_008704	GCCACC	2	12	71872	71883	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008704	GCGGTT	2	12	72560	72571	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008704	GCCAGC	2	12	76756	76767	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855258
40	NC_008704	CACCGC	2	12	77576	77587	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855259
41	NC_008704	GGCCCG	2	12	77630	77641	0 %	0 %	50 %	50 %	119855259
42	NC_008704	GGGCGC	2	12	78803	78814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855260
43	NC_008704	TCAGCG	2	12	82362	82373	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855267
44	NC_008704	GGCCGC	2	12	82570	82581	0 %	0 %	50 %	50 %	119855267
45	NC_008704	AGCCTG	2	12	83546	83557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855268
46	NC_008704	TCAGGT	2	12	84253	84264	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119855270
47	NC_008704	CGACCC	2	12	84460	84471	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855270
48	NC_008704	CGCCGG	2	12	86331	86342	0 %	0 %	50 %	50 %	119855273
49	NC_008704	CCGACA	2	12	87256	87267	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119855274
50	NC_008704	GGTCGT	2	12	89368	89379	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119855276
51	NC_008704	GTCGAC	2	12	91264	91275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855277
52	NC_008704	CGGCGT	2	12	91290	91301	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855277
53	NC_008704	GCCGCG	2	12	91363	91374	0 %	0 %	50 %	50 %	119855277
54	NC_008704	GTTGCC	2	12	94412	94423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855278
55	NC_008704	TGGTCT	2	12	94942	94953	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119855278
56	NC_008704	GTCGAT	2	12	97592	97603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119855279
57	NC_008704	TGCCGG	2	12	98451	98462	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855279
58	NC_008704	ATGCCG	2	12	100778	100789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855284
59	NC_008704	CCGGCG	2	12	102364	102375	0 %	0 %	50 %	50 %	119855285
60	NC_008704	CTGGAC	2	12	103118	103129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855285
61	NC_008704	CCGTCG	2	12	105127	105138	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855290
62	NC_008704	CGACAT	2	12	108273	108284	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119855293
63	NC_008704	ACCGCG	2	12	109105	109116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855295
64	NC_008704	CATATG	2	12	111447	111458	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119855300
65	NC_008704	CGCGGT	2	12	111744	111755	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855300
66	NC_008704	ATTCGC	2	12	112557	112568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119855300
67	NC_008704	CCACCG	2	12	112720	112731	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855300
68	NC_008704	GCCTTC	2	12	113230	113241	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119855300
69	NC_008704	CGGTGG	2	12	114232	114243	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119855301
70	NC_008704	GTGACG	2	12	114661	114672	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119855302
71	NC_008704	CAAGGC	2	12	115274	115285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855303
72	NC_008704	GCGGTG	2	12	118615	118626	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119855309
73	NC_008704	CGACGC	2	12	122885	122896	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855312
74	NC_008704	CGGCGA	2	12	123863	123874	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119855314
75	NC_008704	CGCGGC	2	12	124229	124240	0 %	0 %	50 %	50 %	119855314
76	NC_008704	GCGCCG	2	12	124533	124544	0 %	0 %	50 %	50 %	119855314
77	NC_008704	CGTCGA	2	12	127297	127308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855317
78	NC_008704	TGCCGG	2	12	127670	127681	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855318
79	NC_008704	GGTCGT	2	12	128722	128733	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119855321
80	NC_008704	CCGGGC	2	12	128781	128792	0 %	0 %	50 %	50 %	119855321
81	NC_008704	TCGCCG	2	12	136928	136939	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855329
82	NC_008704	CGGGCC	2	12	141057	141068	0 %	0 %	50 %	50 %	119855332
83	NC_008704	CACGTG	2	12	141925	141936	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855332
84	NC_008704	GCCCCG	2	12	143308	143319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855334
85	NC_008704	CGAAGA	2	12	145657	145668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119855335
86	NC_008704	GGCCGC	2	12	146328	146339	0 %	0 %	50 %	50 %	119855336
87	NC_008704	GTCAAC	2	12	146869	146880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119855338
88	NC_008704	GACGCC	2	12	147529	147540	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855338
89	NC_008704	CGACCC	2	12	147966	147977	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855339
90	NC_008704	ACCGCC	3	18	148078	148095	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855339
91	NC_008704	CCACGC	2	12	149276	149287	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855339
92	NC_008704	TGGACC	2	12	149353	149364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855339
93	NC_008704	AGGCCA	2	12	150844	150855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855341
94	NC_008704	TGGGAC	2	12	150981	150992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119855341
95	NC_008704	TCGACA	2	12	151137	151148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119855342
96	NC_008704	CACCGC	2	12	154809	154820	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119855344
97	NC_008704	GGGCGC	2	12	156308	156319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855345
98	NC_008704	CAGCGG	2	12	162519	162530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119855348
99	NC_008704	GACGCC	2	12	162625	162636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119855348
100	NC_008704	GTCACC	2	12	165978	165989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119855352
101	NC_008704	CCGCGG	2	12	166672	166683	0 %	0 %	50 %	50 %	119855353
102	NC_008704	ATCCGC	2	12	166797	166808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119855353
103	NC_008704	GTCGAC	2	12	168583	168594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855354
104	NC_008704	CAGCGA	2	12	172526	172537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855357
105	NC_008704	CCGCGG	2	12	172585	172596	0 %	0 %	50 %	50 %	119855357
106	NC_008704	GTCGAA	2	12	179621	179632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119855363
107	NC_008704	GCTGCC	2	12	180058	180069	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855363
108	NC_008704	TGACAA	2	12	183103	183114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119855366
109	NC_008704	CCGCGG	2	12	183678	183689	0 %	0 %	50 %	50 %	119855367
110	NC_008704	GCTTCG	2	12	188001	188012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008704	CTGGGC	2	12	193255	193266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855377
112	NC_008704	TGGGCA	2	12	193962	193973	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119855377
113	NC_008704	TCCTCG	2	12	195585	195596	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119855379
114	NC_008704	TCGGCC	2	12	196083	196094	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119855380
115	NC_008704	TGCACA	2	12	197227	197238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008704	TGCAGG	2	12	199092	199103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119855384
117	NC_008704	GTCGGC	2	12	205578	205589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119855390
118	NC_008704	GTCGAT	2	12	206196	206207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119855390
119	NC_008704	CGGCGC	2	12	206411	206422	0 %	0 %	50 %	50 %	119855390
120	NC_008704	CCGGCG	2	12	209466	209477	0 %	0 %	50 %	50 %	119855394
121	NC_008704	CGCCGG	2	12	209562	209573	0 %	0 %	50 %	50 %	119855394
122	NC_008704	GACCTC	2	12	212468	212479	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119855398
123	NC_008704	AGGGGA	2	12	215425	215436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.