MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS02

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008704	CCGTC	2	10	2329	2338	0 %	20 %	20 %	60 %	119855179
2	NC_008704	CCCAG	2	10	2511	2520	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_008704	ACCGC	2	10	7049	7058	20 %	0 %	20 %	60 %	119855183
4	NC_008704	CAGCG	2	10	7998	8007	20 %	0 %	40 %	40 %	119855183
5	NC_008704	CGCGA	2	10	8186	8195	20 %	0 %	40 %	40 %	119855184
6	NC_008704	CCCGC	2	10	9459	9468	0 %	0 %	20 %	80 %	119855184
7	NC_008704	CGTCA	2	10	10413	10422	20 %	20 %	20 %	40 %	119855185
8	NC_008704	ACACC	2	10	10877	10886	40 %	0 %	0 %	60 %	119855185
9	NC_008704	GCACC	2	10	11471	11480	20 %	0 %	20 %	60 %	119855186
10	NC_008704	ACCCC	2	10	12221	12230	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_008704	GTGGG	2	10	12720	12729	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008704	TGGCC	2	10	13433	13442	0 %	20 %	40 %	40 %	119855187
13	NC_008704	CGGCC	2	10	13969	13978	0 %	0 %	40 %	60 %	119855187
14	NC_008704	GCCGC	2	10	14619	14628	0 %	0 %	40 %	60 %	119855188
15	NC_008704	CACGC	2	10	14811	14820	20 %	0 %	20 %	60 %	119855188
16	NC_008704	GCGCC	2	10	15178	15187	0 %	0 %	40 %	60 %	119855188
17	NC_008704	GCCGC	2	10	15664	15673	0 %	0 %	40 %	60 %	119855189
18	NC_008704	GACCG	2	10	15741	15750	20 %	0 %	40 %	40 %	119855189
19	NC_008704	GGCGC	2	10	15751	15760	0 %	0 %	60 %	40 %	119855189
20	NC_008704	TCGGT	2	10	15944	15953	0 %	40 %	40 %	20 %	119855189
21	NC_008704	CGGCG	2	10	15994	16003	0 %	0 %	60 %	40 %	119855189
22	NC_008704	CGGCG	2	10	17319	17328	0 %	0 %	60 %	40 %	119855190
23	NC_008704	TCACA	2	10	17930	17939	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008704	CCCGC	2	10	18001	18010	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_008704	CACCC	2	10	18030	18039	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
26	NC_008704	GGGTG	2	10	18902	18911	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008704	CGATC	2	10	19499	19508	20 %	20 %	20 %	40 %	119855193
28	NC_008704	CCGTC	2	10	21145	21154	0 %	20 %	20 %	60 %	119855195
29	NC_008704	CTGGC	2	10	23720	23729	0 %	20 %	40 %	40 %	119855198
30	NC_008704	CGCTG	2	10	23966	23975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008704	GCACG	2	10	28367	28376	20 %	0 %	40 %	40 %	119855204
32	NC_008704	CGAGG	2	10	29118	29127	20 %	0 %	60 %	20 %	119855205
33	NC_008704	CGCGC	2	10	29705	29714	0 %	0 %	40 %	60 %	119855206
34	NC_008704	TGAAT	2	10	30729	30738	40 %	40 %	20 %	0 %	119855207
35	NC_008704	AGTGC	2	10	31119	31128	20 %	20 %	40 %	20 %	119855207
36	NC_008704	TGGGG	2	10	31165	31174	0 %	20 %	80 %	0 %	119855207
37	NC_008704	GCCGG	2	10	31664	31673	0 %	0 %	60 %	40 %	119855207
38	NC_008704	CGAGT	2	10	31950	31959	20 %	20 %	40 %	20 %	119855207
39	NC_008704	CGACA	2	10	32746	32755	40 %	0 %	20 %	40 %	119855207
40	NC_008704	GTCGC	2	10	33526	33535	0 %	20 %	40 %	40 %	119855208
41	NC_008704	CATCG	2	10	33857	33866	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008704	CGCAC	2	10	34052	34061	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_008704	ACCCC	2	10	37019	37028	20 %	0 %	0 %	80 %	119855213
44	NC_008704	CCACA	2	10	38020	38029	40 %	0 %	0 %	60 %	119855214
45	NC_008704	TCGAC	2	10	38649	38658	20 %	20 %	20 %	40 %	119855214
46	NC_008704	GCCCG	2	10	38849	38858	0 %	0 %	40 %	60 %	119855215
47	NC_008704	ATCGA	2	10	41697	41706	40 %	20 %	20 %	20 %	119855218
48	NC_008704	TGATC	2	10	42160	42169	20 %	40 %	20 %	20 %	119855219
49	NC_008704	GCACA	2	10	44214	44223	40 %	0 %	20 %	40 %	119855221
50	NC_008704	CCGGC	2	10	46540	46549	0 %	0 %	40 %	60 %	119855224
51	NC_008704	TTCGC	2	10	53798	53807	0 %	40 %	20 %	40 %	119855231
52	NC_008704	ATTTG	2	10	55632	55641	20 %	60 %	20 %	0 %	119855233
53	NC_008704	GAACT	2	10	57169	57178	40 %	20 %	20 %	20 %	119855235
54	NC_008704	CGGAC	2	10	59633	59642	20 %	0 %	40 %	40 %	119855238
55	NC_008704	CCGCT	2	10	60240	60249	0 %	20 %	20 %	60 %	119855238
56	NC_008704	GGACC	2	10	60536	60545	20 %	0 %	40 %	40 %	119855238
57	NC_008704	TCGGG	2	10	61720	61729	0 %	20 %	60 %	20 %	119855239
58	NC_008704	TTCAA	2	10	63645	63654	40 %	40 %	0 %	20 %	119855241
59	NC_008704	ATCGC	2	10	65638	65647	20 %	20 %	20 %	40 %	119855243
60	NC_008704	AGCGC	2	10	67518	67527	20 %	0 %	40 %	40 %	119855246
61	NC_008704	GCCCA	2	10	68219	68228	20 %	0 %	20 %	60 %	119855246
62	NC_008704	GTGGC	2	10	69915	69924	0 %	20 %	60 %	20 %	119855249
63	NC_008704	ACTCA	2	10	71206	71215	40 %	20 %	0 %	40 %	119855251
64	NC_008704	CTGGG	2	10	71973	71982	0 %	20 %	60 %	20 %	119855252
65	NC_008704	AGCGG	2	10	72303	72312	20 %	0 %	60 %	20 %	119855252
66	NC_008704	CTGCC	2	10	76821	76830	0 %	20 %	20 %	60 %	119855258
67	NC_008704	CCTCA	2	10	79738	79747	20 %	20 %	0 %	60 %	119855262
68	NC_008704	CGAAG	2	10	81973	81982	40 %	0 %	40 %	20 %	119855266
69	NC_008704	GACGC	2	10	82297	82306	20 %	0 %	40 %	40 %	119855267
70	NC_008704	AGCCC	2	10	82840	82849	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_008704	GCAGC	2	10	84039	84048	20 %	0 %	40 %	40 %	119855269
72	NC_008704	CCGGC	2	10	84618	84627	0 %	0 %	40 %	60 %	119855270
73	NC_008704	ACCGC	2	10	86276	86285	20 %	0 %	20 %	60 %	119855273
74	NC_008704	TCGCA	2	10	87881	87890	20 %	20 %	20 %	40 %	119855274
75	NC_008704	CGGAT	2	10	88768	88777	20 %	20 %	40 %	20 %	119855275
76	NC_008704	GACGC	2	10	89622	89631	20 %	0 %	40 %	40 %	119855276
77	NC_008704	CGCGG	2	10	90451	90460	0 %	0 %	60 %	40 %	119855277
78	NC_008704	CGGCG	2	10	90769	90778	0 %	0 %	60 %	40 %	119855277
79	NC_008704	TTGAG	2	10	92907	92916	20 %	40 %	40 %	0 %	119855278
80	NC_008704	GAAGG	2	10	95186	95195	40 %	0 %	60 %	0 %	119855278
81	NC_008704	TCGCG	2	10	95419	95428	0 %	20 %	40 %	40 %	119855278
82	NC_008704	CACCG	2	10	96371	96380	20 %	0 %	20 %	60 %	119855279
83	NC_008704	CGATC	2	10	97548	97557	20 %	20 %	20 %	40 %	119855279
84	NC_008704	GCGAA	2	10	98765	98774	40 %	0 %	40 %	20 %	119855279
85	NC_008704	GCGCC	2	10	99433	99442	0 %	0 %	40 %	60 %	119855280
86	NC_008704	CGCGC	2	10	100332	100341	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_008704	CCTGC	2	10	101119	101128	0 %	20 %	20 %	60 %	119855284
88	NC_008704	TTCCC	2	10	101242	101251	0 %	40 %	0 %	60 %	119855284
89	NC_008704	ACCCC	2	10	101859	101868	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
90	NC_008704	CGTCG	2	10	102824	102833	0 %	20 %	40 %	40 %	119855285
91	NC_008704	GGTGT	2	10	105987	105996	0 %	40 %	60 %	0 %	119855292
92	NC_008704	GGGGT	2	10	106990	106999	0 %	20 %	80 %	0 %	119855292
93	NC_008704	TCGAC	2	10	107798	107807	20 %	20 %	20 %	40 %	119855293
94	NC_008704	CCGCC	2	10	108183	108192	0 %	0 %	20 %	80 %	119855293
95	NC_008704	GTCGA	2	10	109809	109818	20 %	20 %	40 %	20 %	119855297
96	NC_008704	TGACT	2	10	112573	112582	20 %	40 %	20 %	20 %	119855300
97	NC_008704	CGCGA	2	10	116567	116576	20 %	0 %	40 %	40 %	119855306
98	NC_008704	CGTCG	2	10	117317	117326	0 %	20 %	40 %	40 %	119855307
99	NC_008704	CAGCT	2	10	117969	117978	20 %	20 %	20 %	40 %	119855308
100	NC_008704	GCGCC	2	10	117989	117998	0 %	0 %	40 %	60 %	119855308
101	NC_008704	CCGCG	2	10	118628	118637	0 %	0 %	40 %	60 %	119855309
102	NC_008704	CGCGG	2	10	122459	122468	0 %	0 %	60 %	40 %	119855311
103	NC_008704	GTGTG	2	10	123408	123417	0 %	40 %	60 %	0 %	119855314
104	NC_008704	GCGCC	2	10	124300	124309	0 %	0 %	40 %	60 %	119855314
105	NC_008704	GTGCT	2	10	125310	125319	0 %	40 %	40 %	20 %	119855315
106	NC_008704	GCTGC	2	10	125836	125845	0 %	20 %	40 %	40 %	119855316
107	NC_008704	CGGGC	2	10	127632	127641	0 %	0 %	60 %	40 %	119855318
108	NC_008704	GCGCC	2	10	129547	129556	0 %	0 %	40 %	60 %	119855321
109	NC_008704	GCACG	2	10	130446	130455	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_008704	GTCTT	2	10	131469	131478	0 %	60 %	20 %	20 %	119855323
111	NC_008704	CGTTG	2	10	131917	131926	0 %	40 %	40 %	20 %	119855323
112	NC_008704	CGGCG	2	10	132431	132440	0 %	0 %	60 %	40 %	119855323
113	NC_008704	CGCAG	2	10	135806	135815	20 %	0 %	40 %	40 %	119855328
114	NC_008704	ACGCG	2	10	137241	137250	20 %	0 %	40 %	40 %	119855329
115	NC_008704	GCCGG	2	10	140618	140627	0 %	0 %	60 %	40 %	119855331
116	NC_008704	GCTGG	2	10	144115	144124	0 %	20 %	60 %	20 %	119855335
117	NC_008704	GTCGT	2	10	144398	144407	0 %	40 %	40 %	20 %	119855335
118	NC_008704	GCCGC	2	10	145615	145624	0 %	0 %	40 %	60 %	119855335
119	NC_008704	TGGTG	2	10	150803	150812	0 %	40 %	60 %	0 %	119855341
120	NC_008704	CTGGA	2	10	151692	151701	20 %	20 %	40 %	20 %	119855342
121	NC_008704	TCCGC	2	10	153006	153015	0 %	20 %	20 %	60 %	119855343
122	NC_008704	CCACC	2	10	154038	154047	20 %	0 %	0 %	80 %	119855344
123	NC_008704	GCCGC	2	10	155096	155105	0 %	0 %	40 %	60 %	119855345
124	NC_008704	CACGC	2	10	155670	155679	20 %	0 %	20 %	60 %	119855345
125	NC_008704	CGCGG	2	10	159230	159239	0 %	0 %	60 %	40 %	119855346
126	NC_008704	GGCCA	2	10	159840	159849	20 %	0 %	40 %	40 %	119855346
127	NC_008704	CTGGG	2	10	160332	160341	0 %	20 %	60 %	20 %	119855346
128	NC_008704	GCTCG	2	10	160637	160646	0 %	20 %	40 %	40 %	119855346
129	NC_008704	CTCAC	2	10	163098	163107	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_008704	CAGCG	2	10	163962	163971	20 %	0 %	40 %	40 %	119855351
131	NC_008704	ACCAC	2	10	163984	163993	40 %	0 %	0 %	60 %	119855351
132	NC_008704	CGGCG	2	10	165573	165582	0 %	0 %	60 %	40 %	119855352
133	NC_008704	AGCGC	2	10	165818	165827	20 %	0 %	40 %	40 %	119855352
134	NC_008704	CGGCG	2	10	166859	166868	0 %	0 %	60 %	40 %	119855353
135	NC_008704	CGGGG	2	10	167015	167024	0 %	0 %	80 %	20 %	119855353
136	NC_008704	CGCGG	2	10	167274	167283	0 %	0 %	60 %	40 %	119855353
137	NC_008704	GCCGC	2	10	167450	167459	0 %	0 %	40 %	60 %	119855353
138	NC_008704	CCGCT	2	10	168867	168876	0 %	20 %	20 %	60 %	119855354
139	NC_008704	TCGCT	2	10	170052	170061	0 %	40 %	20 %	40 %	119855355
140	NC_008704	CGGCG	2	10	172063	172072	0 %	0 %	60 %	40 %	119855357
141	NC_008704	CGGGG	2	10	172766	172775	0 %	0 %	80 %	20 %	119855357
142	NC_008704	CCGCC	2	10	173928	173937	0 %	0 %	20 %	80 %	119855358
143	NC_008704	CCGCG	2	10	174350	174359	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_008704	GTGGC	2	10	174716	174725	0 %	20 %	60 %	20 %	119855360
145	NC_008704	GCGGT	2	10	176129	176138	0 %	20 %	60 %	20 %	119855361
146	NC_008704	GCTCT	2	10	176729	176738	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_008704	CGGCG	2	10	176844	176853	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
148	NC_008704	ACCGA	2	10	178188	178197	40 %	0 %	20 %	40 %	119855363
149	NC_008704	AGCTG	2	10	178507	178516	20 %	20 %	40 %	20 %	119855363
150	NC_008704	CCAGG	2	10	179188	179197	20 %	0 %	40 %	40 %	119855363
151	NC_008704	GGCCG	2	10	179681	179690	0 %	0 %	60 %	40 %	119855363
152	NC_008704	CGCGA	2	10	180734	180743	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_008704	TGCGA	2	10	181774	181783	20 %	20 %	40 %	20 %	119855365
154	NC_008704	TCGTG	2	10	182649	182658	0 %	40 %	40 %	20 %	119855366
155	NC_008704	CCCTG	2	10	183732	183741	0 %	20 %	20 %	60 %	119855367
156	NC_008704	ACCCC	2	10	188700	188709	20 %	0 %	0 %	80 %	119855370
157	NC_008704	CCACA	2	10	189701	189710	40 %	0 %	0 %	60 %	119855371
158	NC_008704	GTCAC	2	10	195925	195934	20 %	20 %	20 %	40 %	119855379
159	NC_008704	CCGAC	2	10	199042	199051	20 %	0 %	20 %	60 %	119855384
160	NC_008704	GCCGC	2	10	199302	199311	0 %	0 %	40 %	60 %	119855384
161	NC_008704	GGCCG	2	10	200516	200525	0 %	0 %	60 %	40 %	119855384
162	NC_008704	ACCTC	2	10	201635	201644	20 %	20 %	0 %	60 %	119855385
163	NC_008704	CGGGC	2	10	202520	202529	0 %	0 %	60 %	40 %	119855386
164	NC_008704	GTCGA	2	10	202720	202729	20 %	20 %	40 %	20 %	119855387
165	NC_008704	GGTGT	2	10	203347	203356	0 %	40 %	60 %	0 %	119855387
166	NC_008704	GGGGT	2	10	204350	204359	0 %	20 %	80 %	0 %	119855388
167	NC_008704	TCGGT	2	10	204845	204854	0 %	40 %	40 %	20 %	119855389
168	NC_008704	CCCGG	2	10	206376	206385	0 %	0 %	40 %	60 %	119855390
169	NC_008704	CACGA	2	10	206569	206578	40 %	0 %	20 %	40 %	119855390
170	NC_008704	ATCGC	2	10	208630	208639	20 %	20 %	20 %	40 %	119855393
171	NC_008704	GCGCC	2	10	209604	209613	0 %	0 %	40 %	60 %	119855394
172	NC_008704	CGCTG	2	10	210667	210676	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
173	NC_008704	GCCCG	2	10	213401	213410	0 %	0 %	40 %	60 %	119855399
174	NC_008704	CGCTG	2	10	215153	215162	0 %	20 %	40 %	40 %	119855404
175	NC_008704	GGGGT	2	10	215303	215312	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.