MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS01

Total Repeats: 7581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_008703	TCGG	2	8	299157	299164	0 %	25 %	50 %	25 %	119855169
7502	NC_008703	AGC	2	6	299191	299196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855169
7503	NC_008703	CGC	2	6	299198	299203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855169
7504	NC_008703	CGC	3	9	299226	299234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855169
7505	NC_008703	GCG	3	9	299238	299246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855169
7506	NC_008703	CGC	3	9	299288	299296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855169
7507	NC_008703	TGT	2	6	299315	299320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119855169
7508	NC_008703	CCG	2	6	299368	299373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855169
7509	NC_008703	GC	3	6	299411	299416	0 %	0 %	50 %	50 %	119855169
7510	NC_008703	GCC	2	6	299519	299524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855170
7511	NC_008703	CGG	2	6	299527	299532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855170
7512	NC_008703	ACG	2	6	299571	299576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7513	NC_008703	CCG	2	6	299630	299635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855170
7514	NC_008703	TGGC	2	8	299657	299664	0 %	25 %	50 %	25 %	119855170
7515	NC_008703	CGG	2	6	299670	299675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855170
7516	NC_008703	CAG	2	6	299691	299696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7517	NC_008703	GTC	2	6	299701	299706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7518	NC_008703	GAC	2	6	299714	299719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7519	NC_008703	TGG	2	6	299730	299735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855170
7520	NC_008703	GTT	2	6	299878	299883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119855170
7521	NC_008703	CGG	2	6	299892	299897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855170
7522	NC_008703	GGGCTG	2	12	299999	300010	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119855170
7523	NC_008703	CGC	2	6	300072	300077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855170
7524	NC_008703	CCT	2	6	300093	300098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119855170
7525	NC_008703	GTC	2	6	300118	300123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7526	NC_008703	GAG	2	6	300266	300271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119855170
7527	NC_008703	GGA	2	6	300277	300282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119855170
7528	NC_008703	CCA	2	6	300291	300296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855170
7529	NC_008703	CTG	2	6	300302	300307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7530	NC_008703	CGC	2	6	300328	300333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855170
7531	NC_008703	CGA	2	6	300424	300429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7532	NC_008703	GCC	2	6	300506	300511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855170
7533	NC_008703	AGC	2	6	300522	300527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7534	NC_008703	GCG	2	6	300557	300562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855170
7535	NC_008703	GCT	2	6	300586	300591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7536	NC_008703	CGT	2	6	300630	300635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7537	NC_008703	ACC	2	6	300650	300655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855170
7538	NC_008703	TCGACG	2	12	300689	300700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7539	NC_008703	CG	3	6	300760	300765	0 %	0 %	50 %	50 %	119855170
7540	NC_008703	GCT	2	6	300766	300771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7541	NC_008703	CGA	2	6	300835	300840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7542	NC_008703	CCA	2	6	300859	300864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119855170
7543	NC_008703	CAG	2	6	300865	300870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7544	NC_008703	CGG	2	6	300871	300876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855170
7545	NC_008703	CGG	2	6	300903	300908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855170
7546	NC_008703	GAC	2	6	300918	300923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855170
7547	NC_008703	GAT	2	6	300936	300941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119855171
7548	NC_008703	CA	3	6	301033	301038	50 %	0 %	0 %	50 %	119855171
7549	NC_008703	CGC	3	9	301063	301071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855171
7550	NC_008703	GCC	2	6	301099	301104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855171
7551	NC_008703	GCC	2	6	301117	301122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855171
7552	NC_008703	CTT	2	6	301179	301184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119855171
7553	NC_008703	CGCGG	2	10	301216	301225	0 %	0 %	60 %	40 %	119855171
7554	NC_008703	CTG	2	6	301318	301323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_008703	CAG	2	6	301325	301330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_008703	CG	3	6	301366	301371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7557	NC_008703	TGA	2	6	301448	301453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119855172
7558	NC_008703	GCG	2	6	301457	301462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855172
7559	NC_008703	CGCC	2	8	301472	301479	0 %	0 %	25 %	75 %	119855172
7560	NC_008703	GGT	2	6	301486	301491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855172
7561	NC_008703	GCG	2	6	301502	301507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119855172
7562	NC_008703	AGC	2	6	301516	301521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855172
7563	NC_008703	GCC	2	6	301525	301530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855172
7564	NC_008703	GCA	2	6	301549	301554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119855172
7565	NC_008703	GCC	2	6	301560	301565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855172
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7567	NC_008703	CCG	2	6	301596	301601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119855172
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7569	NC_008703	TGG	4	12	301645	301656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855172
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7571	NC_008703	GCT	2	6	301758	301763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119855172
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7573	NC_008703	TGG	3	9	301837	301845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855172
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7579	NC_008703	GGT	2	6	302027	302032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119855172
7580	NC_008703	CCCG	2	8	302038	302045	0 %	0 %	25 %	75 %	119855172
7581	NC_008703	GCC	2	6	302084	302089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.