MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium ulcerans Agy99 chromosome

Total Repeats: 103517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008611	CGC	2	6	27	32	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
2	NC_008611	CGT	2	6	45	50	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
3	NC_008611	CTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
4	NC_008611	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615920
5	NC_008611	ACA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118615920
6	NC_008611	CGC	2	6	305	310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
7	NC_008611	CCG	2	6	311	316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
8	NC_008611	GAT	2	6	319	324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615920
9	NC_008611	GCC	2	6	337	342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
10	NC_008611	AAG	2	6	386	391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615920
11	NC_008611	CGA	2	6	396	401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615920
12	NC_008611	AAG	2	6	460	465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615920
13	NC_008611	CCG	2	6	516	521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
14	NC_008611	CTG	2	6	658	663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
15	NC_008611	CGC	2	6	666	671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
16	NC_008611	GTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615920
17	NC_008611	TCA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118615920
18	NC_008611	TGA	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615920
19	NC_008611	TCG	2	6	815	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
20	NC_008611	AAG	2	6	845	850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615920
21	NC_008611	TTC	2	6	865	870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118615920
22	NC_008611	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
23	NC_008611	AAG	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615920
24	NC_008611	CGA	2	6	1071	1076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615920
25	NC_008611	CAG	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615920
26	NC_008611	TGC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
27	NC_008611	CCA	2	6	1250	1255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615920
28	NC_008611	CAC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615920
29	NC_008611	ACG	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008611	TTA	2	6	1785	1790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008611	GAT	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008611	GAA	2	6	1824	1829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008611	GTC	2	6	1886	1891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008611	CGG	2	6	2010	2015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008611	CCA	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615921
36	NC_008611	GTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615921
37	NC_008611	CGA	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615921
38	NC_008611	CCG	2	6	2280	2285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615921
39	NC_008611	CGA	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615921
40	NC_008611	CCG	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615921
41	NC_008611	TGA	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615921
42	NC_008611	GGC	2	6	2605	2610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615921
43	NC_008611	GGC	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615921
44	NC_008611	GGC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615921
45	NC_008611	CTG	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615921
46	NC_008611	GCA	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615921
47	NC_008611	TGG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615921
48	NC_008611	GAA	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615921
49	NC_008611	CAC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615921
50	NC_008611	CGG	2	6	3225	3230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615921
51	NC_008611	TCG	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
52	NC_008611	CGA	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
53	NC_008611	CGC	2	6	3561	3566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615922
54	NC_008611	GCA	2	6	3608	3613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
55	NC_008611	TGT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615922
56	NC_008611	CGG	2	6	3686	3691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
57	NC_008611	TCG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
58	NC_008611	TGC	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
59	NC_008611	GGC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
60	NC_008611	GCT	2	6	3951	3956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
61	NC_008611	GCG	2	6	3976	3981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
62	NC_008611	CGA	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
63	NC_008611	CGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615922
64	NC_008611	GAA	2	6	4051	4056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615922
65	NC_008611	GTT	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615922
66	NC_008611	GGC	2	6	4065	4070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
67	NC_008611	GAC	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
68	NC_008611	GGC	2	6	4221	4226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
69	NC_008611	GCT	2	6	4233	4238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
70	NC_008611	CGA	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
71	NC_008611	GCC	2	6	4297	4302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615922
72	NC_008611	CGG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
73	NC_008611	CGG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
74	NC_008611	GCA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615923
75	NC_008611	GCG	2	6	4529	4534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615923
76	NC_008611	CGC	2	6	4595	4600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615923
77	NC_008611	CGC	2	6	4609	4614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615923
78	NC_008611	GGT	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615923
79	NC_008611	CGC	2	6	4898	4903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615923
80	NC_008611	GTG	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615923
81	NC_008611	CGT	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615923
82	NC_008611	GGA	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008611	CTG	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008611	GAG	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118615924
85	NC_008611	AGA	3	9	5283	5291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
86	NC_008611	CAC	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615924
87	NC_008611	GTC	2	6	5417	5422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
88	NC_008611	GCT	2	6	5476	5481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
89	NC_008611	CGT	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
90	NC_008611	CGG	2	6	5587	5592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
91	NC_008611	CGG	2	6	5599	5604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
92	NC_008611	GTG	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615924
93	NC_008611	GGT	2	6	5656	5661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615924
94	NC_008611	AAG	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
95	NC_008611	ACC	2	6	5822	5827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615924
96	NC_008611	CAA	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118615924
97	NC_008611	CGA	2	6	5905	5910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
98	NC_008611	GTC	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
99	NC_008611	GAC	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
100	NC_008611	GTC	2	6	5942	5947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
101	NC_008611	CCG	2	6	5955	5960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
102	NC_008611	GCC	2	6	5987	5992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
103	NC_008611	CGC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
104	NC_008611	CGG	2	6	6040	6045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
105	NC_008611	CAG	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
106	NC_008611	TCG	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
107	NC_008611	GAA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
108	NC_008611	GGT	2	6	6256	6261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615924
109	NC_008611	AAG	2	6	6281	6286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
110	NC_008611	GAC	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
111	NC_008611	AGC	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
112	NC_008611	CGC	2	6	6532	6537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
113	NC_008611	GCG	2	6	6559	6564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
114	NC_008611	TGG	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615924
115	NC_008611	CCG	2	6	6663	6668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
116	NC_008611	ATC	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118615924
117	NC_008611	ATC	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118615924
118	NC_008611	ACG	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
119	NC_008611	GTT	3	9	6904	6912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615924
120	NC_008611	TGT	2	6	6918	6923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615924
121	NC_008611	GCC	2	6	6973	6978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
122	NC_008611	CCT	2	6	7045	7050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118615924
123	NC_008611	AAG	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
124	NC_008611	CAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118615924
125	NC_008611	TGC	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
126	NC_008611	CGA	2	6	7192	7197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
127	NC_008611	GCG	2	6	7199	7204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
128	NC_008611	GCC	2	6	7205	7210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
129	NC_008611	CGC	2	6	7253	7258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
130	NC_008611	TGC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615925
131	NC_008611	TGG	2	6	7369	7374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615925
132	NC_008611	CAG	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615925
133	NC_008611	TCG	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615925
134	NC_008611	CCG	2	6	7504	7509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615925
135	NC_008611	ACC	2	6	7599	7604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615925
136	NC_008611	GCC	2	6	7721	7726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615925
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141	NC_008611	CGC	2	6	7917	7922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615925
142	NC_008611	ACG	2	6	7971	7976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615925
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152	NC_008611	CTA	2	6	8437	8442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118615925
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154	NC_008611	CGA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615925
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157	NC_008611	GCC	2	6	8678	8683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615925
158	NC_008611	TCG	2	6	8700	8705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615925
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250	NC_008611	GCC	2	6	13529	13534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
251	NC_008611	CCA	2	6	13604	13609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_008611	GCG	2	6	13935	13940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615930
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257	NC_008611	GTG	2	6	14153	14158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615930
258	NC_008611	CGA	2	6	14169	14174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615930
259	NC_008611	CGT	2	6	14348	14353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615931
260	NC_008611	GAT	2	6	14415	14420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615931
261	NC_008611	GCA	2	6	14438	14443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615931
262	NC_008611	GAC	2	6	14583	14588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615931
263	NC_008611	GCG	2	6	14596	14601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615931
264	NC_008611	CCG	2	6	14642	14647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615931
265	NC_008611	TGC	2	6	14668	14673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615931
266	NC_008611	CAA	2	6	14852	14857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118615932
267	NC_008611	AAC	2	6	15003	15008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118615932
268	NC_008611	CGA	2	6	15010	15015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615932
269	NC_008611	TTC	2	6	15084	15089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118615932
270	NC_008611	CAA	2	6	15131	15136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_008611	GCA	2	6	15173	15178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_008611	GGC	2	6	15235	15240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_008611	CTG	3	9	15304	15312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615933
274	NC_008611	GCC	2	6	15313	15318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615933
275	NC_008611	CGG	2	6	15333	15338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615933
276	NC_008611	CCG	2	6	15348	15353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615933
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279	NC_008611	ACC	2	6	15455	15460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615933
280	NC_008611	TGC	2	6	15491	15496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615933
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287	NC_008611	CAT	2	6	15786	15791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118615933
288	NC_008611	GCG	2	6	15823	15828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615933
289	NC_008611	GGC	2	6	15834	15839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615933
290	NC_008611	TGG	2	6	15845	15850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615933
291	NC_008611	GTC	2	6	16034	16039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615934
292	NC_008611	ACG	2	6	16116	16121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615934
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379	NC_008611	CAG	2	6	21516	21521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615938
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381	NC_008611	CCG	2	6	21529	21534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615938
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500	NC_008611	GTG	2	6	27700	27705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615942

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