MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 179918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008596	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008596	TGCC	2	8	33	40	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008596	CGG	2	6	49	54	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008596	GC	3	6	80	85	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008596	TC	3	6	108	113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008596	CGA	2	6	124	129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008596	CGG	2	6	140	145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008596	TCA	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008596	CA	3	6	164	169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008596	AC	3	6	184	189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008596	AGA	2	6	275	280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008596	GA	3	6	313	318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008596	CGAT	2	8	345	352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008596	CGG	2	6	396	401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008596	CTG	2	6	451	456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008596	CGA	3	9	503	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
17	NC_008596	GGCTG	2	10	513	522	0 %	20 %	60 %	20 %	118468117
18	NC_008596	CGT	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
19	NC_008596	CCA	2	6	602	607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118468117
20	NC_008596	CTG	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
21	NC_008596	CCG	2	6	716	721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
22	NC_008596	GCT	2	6	744	749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
23	NC_008596	GC	4	8	830	837	0 %	0 %	50 %	50 %	118468117
24	NC_008596	CTGC	2	8	877	884	0 %	25 %	25 %	50 %	118468117
25	NC_008596	GAG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118468117
26	NC_008596	GGTGGC	2	12	942	953	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	118468117
27	NC_008596	CGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
28	NC_008596	GTG	2	6	1018	1023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118468117
29	NC_008596	CGC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
30	NC_008596	GACC	2	8	1032	1039	25 %	0 %	25 %	50 %	118468117
31	NC_008596	CAC	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118468117
32	NC_008596	GCC	2	6	1132	1137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
33	NC_008596	ACGG	2	8	1147	1154	25 %	0 %	50 %	25 %	118468117
34	NC_008596	GTCG	2	8	1188	1195	0 %	25 %	50 %	25 %	118468117
35	NC_008596	GCA	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
36	NC_008596	GCT	2	6	1281	1286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
37	NC_008596	CCG	2	6	1289	1294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
38	NC_008596	CGA	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
39	NC_008596	CGA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
40	NC_008596	CAC	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118468117
41	NC_008596	CGGC	2	8	1588	1595	0 %	0 %	50 %	50 %	118468117
42	NC_008596	GAT	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118468117
43	NC_008596	GGT	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118468117
44	NC_008596	GCC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
45	NC_008596	CTG	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
46	NC_008596	GAG	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118471954
47	NC_008596	CGTGT	2	10	1874	1883	0 %	40 %	40 %	20 %	118471954
48	NC_008596	CGG	2	6	1969	1974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118471954
49	NC_008596	CGCA	2	8	2001	2008	25 %	0 %	25 %	50 %	118471954
50	NC_008596	TTG	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118471954
51	NC_008596	GT	3	6	2049	2054	0 %	50 %	50 %	0 %	118471954
52	NC_008596	CGG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118471954
53	NC_008596	CGG	2	6	2098	2103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118471954
54	NC_008596	GAC	3	9	2108	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118471954
55	NC_008596	CCG	2	6	2153	2158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118471954
56	NC_008596	GGTG	2	8	2194	2201	0 %	25 %	75 %	0 %	118471954
57	NC_008596	CTG	2	6	2276	2281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118471954
58	NC_008596	TCA	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118471954
59	NC_008596	GTG	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118471954
60	NC_008596	GAG	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118471954
61	NC_008596	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118471954
62	NC_008596	TCGATC	2	12	2673	2684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118467917
63	NC_008596	TTG	2	6	2739	2744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118467917
64	NC_008596	CGC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118467917
65	NC_008596	CG	3	6	2822	2827	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
66	NC_008596	TCG	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
67	NC_008596	CAA	2	6	2899	2904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118467917
68	NC_008596	TGC	2	6	2955	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
69	NC_008596	GC	3	6	2959	2964	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
70	NC_008596	GTT	2	6	2968	2973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118467917
71	NC_008596	TC	3	6	2986	2991	0 %	50 %	0 %	50 %	118467917
72	NC_008596	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
73	NC_008596	GC	3	6	3073	3078	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
74	NC_008596	GGT	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467917
75	NC_008596	CGC	2	6	3193	3198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118467917
76	NC_008596	CGGCG	2	10	3202	3211	0 %	0 %	60 %	40 %	118467917
77	NC_008596	CG	3	6	3222	3227	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
78	NC_008596	TCG	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
79	NC_008596	GCA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
80	NC_008596	GC	3	6	3395	3400	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
81	NC_008596	GTG	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467917
82	NC_008596	TG	3	6	3427	3432	0 %	50 %	50 %	0 %	118467917
83	NC_008596	TCG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
84	NC_008596	CGA	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
85	NC_008596	GCCA	2	8	3497	3504	25 %	0 %	25 %	50 %	118467917
86	NC_008596	TGT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118467917
87	NC_008596	TGC	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
88	NC_008596	CGA	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
89	NC_008596	GGC	2	6	3624	3629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118467917
90	NC_008596	GC	4	8	3628	3635	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
91	NC_008596	GGA	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118467917
92	NC_008596	CG	3	6	3712	3717	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
93	NC_008596	GAC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
94	NC_008596	TGG	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467917
95	NC_008596	CGA	3	9	3789	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470893
96	NC_008596	GAG	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118470893
97	NC_008596	ATC	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470893
98	NC_008596	GAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118470893
99	NC_008596	CGCGG	2	10	3892	3901	0 %	0 %	60 %	40 %	118470893
100	NC_008596	CGGCCG	2	12	3924	3935	0 %	0 %	50 %	50 %	118470893
101	NC_008596	CGGCC	2	10	3939	3948	0 %	0 %	40 %	60 %	118470893
102	NC_008596	ACT	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470893
103	NC_008596	GGT	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470893
104	NC_008596	CTG	2	6	4225	4230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470893
105	NC_008596	CGC	2	6	4239	4244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470893
106	NC_008596	GGT	2	6	4245	4250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470893
107	NC_008596	GTG	2	6	4261	4266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470893
108	NC_008596	TCG	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470893
109	NC_008596	CGT	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470893
110	NC_008596	GCC	2	6	4394	4399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008596	GAC	2	6	4528	4533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008596	AGA	2	6	4601	4606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118470567
113	NC_008596	CAC	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470567
114	NC_008596	CGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
115	NC_008596	CG	3	6	4778	4783	0 %	0 %	50 %	50 %	118470567
116	NC_008596	CGA	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
117	NC_008596	CCA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470567
118	NC_008596	GTC	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
119	NC_008596	GGT	2	6	4942	4947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
120	NC_008596	TAC	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470567
121	NC_008596	CAC	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470567
122	NC_008596	CGAC	2	8	5135	5142	25 %	0 %	25 %	50 %	118470567
123	NC_008596	CG	3	6	5160	5165	0 %	0 %	50 %	50 %	118470567
124	NC_008596	CAA	2	6	5190	5195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118470567
125	NC_008596	CGA	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
126	NC_008596	GGT	2	6	5241	5246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
127	NC_008596	CGA	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
128	NC_008596	CGT	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
129	NC_008596	CCG	2	6	5267	5272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470567
130	NC_008596	CGA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
131	NC_008596	GCC	2	6	5299	5304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470567
132	NC_008596	TGGTC	2	10	5355	5364	0 %	40 %	40 %	20 %	118470567
133	NC_008596	CAG	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
134	NC_008596	CAT	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470567
135	NC_008596	GGT	2	6	5527	5532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
136	NC_008596	GAG	2	6	5539	5544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118470567
137	NC_008596	GCG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118470567
138	NC_008596	GTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
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253	NC_008596	CAC	2	6	9606	9611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470742
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261	NC_008596	CGG	2	6	9879	9884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118470742
262	NC_008596	TCG	2	6	9971	9976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470742
263	NC_008596	GCT	2	6	10049	10054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_008596	TCC	2	6	10132	10137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_008596	ACG	2	6	10145	10150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_008596	TGT	2	6	10204	10209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118473279
267	NC_008596	GGC	2	6	10210	10215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118473279
268	NC_008596	GGTTA	2	10	10390	10399	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
269	NC_008596	TG	3	6	10408	10413	0 %	50 %	50 %	0 %	118470556
270	NC_008596	CGTC	2	8	10427	10434	0 %	25 %	25 %	50 %	118470556
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382	NC_008596	GGAA	2	8	15274	15281	50 %	0 %	50 %	0 %	118469728
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395	NC_008596	CG	3	6	15806	15811	0 %	0 %	50 %	50 %	118472346
396	NC_008596	GTCGA	2	10	15831	15840	20 %	20 %	40 %	20 %	118472346
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423	NC_008596	CGC	2	6	16749	16754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118472346
424	NC_008596	TCG	2	6	16765	16770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472346
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427	NC_008596	CGCGG	2	10	16837	16846	0 %	0 %	60 %	40 %	118472346
428	NC_008596	CGA	2	6	16859	16864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118472346
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432	NC_008596	GGA	2	6	16956	16961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118472346
433	NC_008596	CAACGC	2	12	16962	16973	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118472346
434	NC_008596	GCT	2	6	16991	16996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472346
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437	NC_008596	CG	4	8	17092	17099	0 %	0 %	50 %	50 %	118472346
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441	NC_008596	TGC	2	6	17158	17163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472346
442	NC_008596	CA	3	6	17195	17200	50 %	0 %	0 %	50 %	118472346
443	NC_008596	GAT	2	6	17248	17253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118472346
444	NC_008596	CGA	2	6	17257	17262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118472884
445	NC_008596	CGG	2	6	17379	17384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118472884
446	NC_008596	GGT	2	6	17395	17400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118472884
447	NC_008596	ATCT	2	8	17405	17412	25 %	50 %	0 %	25 %	118472884
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450	NC_008596	ACCT	2	8	17528	17535	25 %	25 %	0 %	50 %	118472884
451	NC_008596	GC	3	6	17590	17595	0 %	0 %	50 %	50 %	118472884
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453	NC_008596	CTG	2	6	17642	17647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472884
454	NC_008596	GGTC	2	8	17653	17660	0 %	25 %	50 %	25 %	118472884
455	NC_008596	GTG	2	6	17672	17677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118472884
456	NC_008596	TTC	2	6	17720	17725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118472884
457	NC_008596	CGT	2	6	17731	17736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472884
458	NC_008596	GC	3	6	17784	17789	0 %	0 %	50 %	50 %	118472884
459	NC_008596	CGA	2	6	17854	17859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118472884
460	NC_008596	GATCGC	2	12	17863	17874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118472884
461	NC_008596	CG	3	6	17879	17884	0 %	0 %	50 %	50 %	118472884
462	NC_008596	GTCGA	2	10	17894	17903	20 %	20 %	40 %	20 %	118472884
463	NC_008596	GC	3	6	17981	17986	0 %	0 %	50 %	50 %	118472884
464	NC_008596	TTC	2	6	18011	18016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118472884
465	NC_008596	TGG	2	6	18024	18029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118472884
466	NC_008596	GCC	2	6	18062	18067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118472884
467	NC_008596	GTC	2	6	18074	18079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472884
468	NC_008596	CTG	2	6	18086	18091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472884
469	NC_008596	ACC	2	6	18107	18112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118472884
470	NC_008596	GTT	2	6	18151	18156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118472884
471	NC_008596	CGA	2	6	18187	18192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118472884
472	NC_008596	TCGGCA	2	12	18200	18211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118472884
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474	NC_008596	CCCGG	2	10	18251	18260	0 %	0 %	40 %	60 %	118472884
475	NC_008596	GGT	2	6	18346	18351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118472884
476	NC_008596	CCGG	2	8	18374	18381	0 %	0 %	50 %	50 %	118472884
477	NC_008596	CAC	2	6	18403	18408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118472884
478	NC_008596	GAC	2	6	18421	18426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118472884
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480	NC_008596	TCG	2	6	18438	18443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472884
481	NC_008596	GC	3	6	18473	18478	0 %	0 %	50 %	50 %	118472884
482	NC_008596	TCT	2	6	18552	18557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118472884
483	NC_008596	CGA	2	6	18571	18576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118472884
484	NC_008596	CGA	2	6	18607	18612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118472884
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487	NC_008596	CCG	2	6	18711	18716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118472884
488	NC_008596	GGT	2	6	18766	18771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118472884
489	NC_008596	CCG	2	6	18789	18794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118472884
490	NC_008596	CGC	2	6	18811	18816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118472884
491	NC_008596	GGA	2	6	18823	18828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118472884
492	NC_008596	CGC	2	6	18829	18834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118472884
493	NC_008596	GCC	2	6	18839	18844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118472884
494	NC_008596	TCG	2	6	18867	18872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472884
495	NC_008596	TCG	2	6	18933	18938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118472884
496	NC_008596	CGG	2	6	18970	18975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118472884
497	NC_008596	CG	3	6	18982	18987	0 %	0 %	50 %	50 %	118472884
498	NC_008596	GGA	2	6	19037	19042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
499	NC_008596	AAC	2	6	19097	19102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118470215
500	NC_008596	CGC	2	6	19144	19149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470215

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