MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008147	GC	3	6	312	317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008147	GC	3	6	1181	1186	0 %	0 %	50 %	50 %	108802375
3	NC_008147	CA	3	6	1401	1406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008147	CG	4	8	1831	1838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008147	CG	5	10	2005	2014	0 %	0 %	50 %	50 %	108802377
6	NC_008147	GA	3	6	2461	2466	50 %	0 %	50 %	0 %	108802378
7	NC_008147	CG	3	6	2710	2715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008147	GT	3	6	2736	2741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008147	GC	3	6	3381	3386	0 %	0 %	50 %	50 %	108802380
10	NC_008147	AC	3	6	3711	3716	50 %	0 %	0 %	50 %	108802380
11	NC_008147	GT	3	6	3920	3925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008147	CA	3	6	4371	4376	50 %	0 %	0 %	50 %	108802381
13	NC_008147	AC	3	6	5790	5795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008147	GC	3	6	5976	5981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008147	GC	3	6	8418	8423	0 %	0 %	50 %	50 %	108802385
16	NC_008147	GC	3	6	8804	8809	0 %	0 %	50 %	50 %	108802385
17	NC_008147	GC	3	6	8925	8930	0 %	0 %	50 %	50 %	108802385
18	NC_008147	GT	3	6	9554	9559	0 %	50 %	50 %	0 %	108802386
19	NC_008147	GT	3	6	10529	10534	0 %	50 %	50 %	0 %	108802388
20	NC_008147	AC	3	6	10599	10604	50 %	0 %	0 %	50 %	108802388
21	NC_008147	GC	3	6	11083	11088	0 %	0 %	50 %	50 %	108802388
22	NC_008147	CA	3	6	11541	11546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008147	GT	3	6	11631	11636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008147	AC	3	6	14447	14452	50 %	0 %	0 %	50 %	108802392
25	NC_008147	CG	3	6	15269	15274	0 %	0 %	50 %	50 %	108802393
26	NC_008147	GC	3	6	15551	15556	0 %	0 %	50 %	50 %	108802393
27	NC_008147	GC	3	6	15907	15912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008147	GT	3	6	17446	17451	0 %	50 %	50 %	0 %	108802396
29	NC_008147	GC	3	6	19698	19703	0 %	0 %	50 %	50 %	108802398
30	NC_008147	GT	4	8	20441	20448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008147	GC	3	6	20464	20469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008147	CG	3	6	21383	21388	0 %	0 %	50 %	50 %	108802400
33	NC_008147	GC	3	6	21437	21442	0 %	0 %	50 %	50 %	108802400
34	NC_008147	GC	3	6	22617	22622	0 %	0 %	50 %	50 %	108802401
35	NC_008147	CA	3	6	23750	23755	50 %	0 %	0 %	50 %	108802403
36	NC_008147	TG	3	6	23951	23956	0 %	50 %	50 %	0 %	108802403
37	NC_008147	AC	3	6	24142	24147	50 %	0 %	0 %	50 %	108802403
38	NC_008147	CG	3	6	24459	24464	0 %	0 %	50 %	50 %	108802403
39	NC_008147	GA	3	6	24683	24688	50 %	0 %	50 %	0 %	108802403
40	NC_008147	CG	3	6	24804	24809	0 %	0 %	50 %	50 %	108802403
41	NC_008147	GC	3	6	24897	24902	0 %	0 %	50 %	50 %	108802403
42	NC_008147	TC	3	6	24960	24965	0 %	50 %	0 %	50 %	108802403
43	NC_008147	CG	3	6	25351	25356	0 %	0 %	50 %	50 %	108802404
44	NC_008147	CG	3	6	25704	25709	0 %	0 %	50 %	50 %	108802404
45	NC_008147	GC	3	6	26647	26652	0 %	0 %	50 %	50 %	108802405
46	NC_008147	CG	3	6	27094	27099	0 %	0 %	50 %	50 %	108802405
47	NC_008147	AG	3	6	27320	27325	50 %	0 %	50 %	0 %	108802405
48	NC_008147	CG	3	6	28880	28885	0 %	0 %	50 %	50 %	108802407
49	NC_008147	GC	3	6	29242	29247	0 %	0 %	50 %	50 %	108802408
50	NC_008147	AG	3	6	29288	29293	50 %	0 %	50 %	0 %	108802408
51	NC_008147	GC	3	6	29454	29459	0 %	0 %	50 %	50 %	108802408
52	NC_008147	CT	3	6	30241	30246	0 %	50 %	0 %	50 %	108802410
53	NC_008147	AC	3	6	31346	31351	50 %	0 %	0 %	50 %	108802410
54	NC_008147	GT	3	6	32825	32830	0 %	50 %	50 %	0 %	108802412
55	NC_008147	GC	3	6	33372	33377	0 %	0 %	50 %	50 %	108802413
56	NC_008147	CG	4	8	33994	34001	0 %	0 %	50 %	50 %	108802414
57	NC_008147	CG	3	6	34502	34507	0 %	0 %	50 %	50 %	108802414
58	NC_008147	AG	3	6	35444	35449	50 %	0 %	50 %	0 %	108802415
59	NC_008147	CG	3	6	36522	36527	0 %	0 %	50 %	50 %	108802416
60	NC_008147	GC	3	6	37139	37144	0 %	0 %	50 %	50 %	108802416
61	NC_008147	CG	3	6	37394	37399	0 %	0 %	50 %	50 %	108802417
62	NC_008147	CG	4	8	37630	37637	0 %	0 %	50 %	50 %	108802417
63	NC_008147	CG	3	6	37744	37749	0 %	0 %	50 %	50 %	108802417
64	NC_008147	AC	4	8	38649	38656	50 %	0 %	0 %	50 %	108802418
65	NC_008147	GC	3	6	38696	38701	0 %	0 %	50 %	50 %	108802418
66	NC_008147	CG	3	6	38903	38908	0 %	0 %	50 %	50 %	108802418
67	NC_008147	GA	3	6	39046	39051	50 %	0 %	50 %	0 %	108802418
68	NC_008147	CG	3	6	39081	39086	0 %	0 %	50 %	50 %	108802418
69	NC_008147	GC	3	6	39415	39420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008147	GC	3	6	39771	39776	0 %	0 %	50 %	50 %	108802419
71	NC_008147	GC	3	6	40052	40057	0 %	0 %	50 %	50 %	108802419
72	NC_008147	CG	3	6	41363	41368	0 %	0 %	50 %	50 %	108802420
73	NC_008147	GC	4	8	41465	41472	0 %	0 %	50 %	50 %	108802421
74	NC_008147	GC	3	6	42305	42310	0 %	0 %	50 %	50 %	108802421
75	NC_008147	CG	5	10	42428	42437	0 %	0 %	50 %	50 %	108802421
76	NC_008147	TG	3	6	42854	42859	0 %	50 %	50 %	0 %	108802422
77	NC_008147	GC	3	6	43008	43013	0 %	0 %	50 %	50 %	108802423
78	NC_008147	CG	3	6	43365	43370	0 %	0 %	50 %	50 %	108802424
79	NC_008147	CG	3	6	43688	43693	0 %	0 %	50 %	50 %	108802424
80	NC_008147	GC	3	6	43816	43821	0 %	0 %	50 %	50 %	108802424
81	NC_008147	GC	3	6	43946	43951	0 %	0 %	50 %	50 %	108802424
82	NC_008147	CG	3	6	44218	44223	0 %	0 %	50 %	50 %	108802425
83	NC_008147	GC	3	6	44435	44440	0 %	0 %	50 %	50 %	108802425
84	NC_008147	CG	3	6	45216	45221	0 %	0 %	50 %	50 %	108802426
85	NC_008147	AC	3	6	45526	45531	50 %	0 %	0 %	50 %	108802426
86	NC_008147	CG	3	6	46224	46229	0 %	0 %	50 %	50 %	108802427
87	NC_008147	CG	3	6	46352	46357	0 %	0 %	50 %	50 %	108802427
88	NC_008147	GC	3	6	46374	46379	0 %	0 %	50 %	50 %	108802427
89	NC_008147	CA	3	6	46438	46443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008147	CA	3	6	46527	46532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008147	GC	3	6	47131	47136	0 %	0 %	50 %	50 %	108802429
92	NC_008147	GC	3	6	47583	47588	0 %	0 %	50 %	50 %	108802429
93	NC_008147	GC	3	6	47924	47929	0 %	0 %	50 %	50 %	108802429
94	NC_008147	GC	3	6	48101	48106	0 %	0 %	50 %	50 %	108802429
95	NC_008147	GC	3	6	48683	48688	0 %	0 %	50 %	50 %	108802430
96	NC_008147	GC	3	6	48798	48803	0 %	0 %	50 %	50 %	108802430
97	NC_008147	GC	3	6	48813	48818	0 %	0 %	50 %	50 %	108802430
98	NC_008147	CG	3	6	50566	50571	0 %	0 %	50 %	50 %	108802431
99	NC_008147	GC	3	6	50602	50607	0 %	0 %	50 %	50 %	108802431
100	NC_008147	GC	3	6	50722	50727	0 %	0 %	50 %	50 %	108802432
101	NC_008147	CG	3	6	50904	50909	0 %	0 %	50 %	50 %	108802432
102	NC_008147	GC	3	6	51432	51437	0 %	0 %	50 %	50 %	108802433
103	NC_008147	AC	3	6	51965	51970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008147	GC	3	6	52028	52033	0 %	0 %	50 %	50 %	108802434
105	NC_008147	GC	3	6	52305	52310	0 %	0 %	50 %	50 %	108802434
106	NC_008147	GC	3	6	53052	53057	0 %	0 %	50 %	50 %	108802435
107	NC_008147	TC	3	6	53363	53368	0 %	50 %	0 %	50 %	108802436
108	NC_008147	GC	3	6	53449	53454	0 %	0 %	50 %	50 %	108802436
109	NC_008147	GC	3	6	54042	54047	0 %	0 %	50 %	50 %	108802437
110	NC_008147	GC	4	8	54608	54615	0 %	0 %	50 %	50 %	108802438
111	NC_008147	CG	3	6	55445	55450	0 %	0 %	50 %	50 %	108802440
112	NC_008147	CG	3	6	56319	56324	0 %	0 %	50 %	50 %	108802441
113	NC_008147	GC	3	6	56646	56651	0 %	0 %	50 %	50 %	108802441
114	NC_008147	GC	3	6	57403	57408	0 %	0 %	50 %	50 %	108802442
115	NC_008147	GC	4	8	57595	57602	0 %	0 %	50 %	50 %	108802442
116	NC_008147	TG	3	6	58264	58269	0 %	50 %	50 %	0 %	108802444
117	NC_008147	CA	3	6	59154	59159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008147	CG	3	6	59181	59186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008147	GC	3	6	59443	59448	0 %	0 %	50 %	50 %	108802445
120	NC_008147	GC	3	6	59870	59875	0 %	0 %	50 %	50 %	108802447
121	NC_008147	CA	3	6	60535	60540	50 %	0 %	0 %	50 %	108802448
122	NC_008147	CG	3	6	60752	60757	0 %	0 %	50 %	50 %	108802448
123	NC_008147	TC	3	6	60880	60885	0 %	50 %	0 %	50 %	108802448
124	NC_008147	GC	3	6	60964	60969	0 %	0 %	50 %	50 %	108802448
125	NC_008147	AC	3	6	61081	61086	50 %	0 %	0 %	50 %	108802448
126	NC_008147	GC	3	6	61701	61706	0 %	0 %	50 %	50 %	108802448
127	NC_008147	CG	3	6	62081	62086	0 %	0 %	50 %	50 %	108802448
128	NC_008147	CG	3	6	63192	63197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008147	CG	3	6	63699	63704	0 %	0 %	50 %	50 %	108802450
130	NC_008147	GC	3	6	64181	64186	0 %	0 %	50 %	50 %	108802451
131	NC_008147	GC	3	6	64457	64462	0 %	0 %	50 %	50 %	108802451
132	NC_008147	GC	3	6	64758	64763	0 %	0 %	50 %	50 %	108802451
133	NC_008147	CG	3	6	66546	66551	0 %	0 %	50 %	50 %	108802451
134	NC_008147	GC	3	6	67153	67158	0 %	0 %	50 %	50 %	108802452
135	NC_008147	GC	4	8	67376	67383	0 %	0 %	50 %	50 %	108802452
136	NC_008147	CA	3	6	67967	67972	50 %	0 %	0 %	50 %	108802452
137	NC_008147	GC	3	6	68130	68135	0 %	0 %	50 %	50 %	108802452
138	NC_008147	CG	3	6	68284	68289	0 %	0 %	50 %	50 %	108802452
139	NC_008147	GC	4	8	68331	68338	0 %	0 %	50 %	50 %	108802452
140	NC_008147	CG	3	6	68394	68399	0 %	0 %	50 %	50 %	108802452
141	NC_008147	GC	3	6	68425	68430	0 %	0 %	50 %	50 %	108802452
142	NC_008147	GC	3	6	69052	69057	0 %	0 %	50 %	50 %	108802452
143	NC_008147	CG	5	10	70320	70329	0 %	0 %	50 %	50 %	108802453
144	NC_008147	CA	3	6	70363	70368	50 %	0 %	0 %	50 %	108802453
145	NC_008147	GC	3	6	70372	70377	0 %	0 %	50 %	50 %	108802453
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.