MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanococcoides burtonii DSM 6242

Total Repeats: 921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007955	AGACCG	2	12	1684	1695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772084
2	NC_007955	AGGTAA	2	12	1934	1945	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91772084
3	NC_007955	TCAAGG	2	12	4439	4450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772089
4	NC_007955	CGATCA	2	12	5359	5370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772091
5	NC_007955	GAGCAA	2	12	9528	9539	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	91772101
6	NC_007955	TTTTAA	2	12	15349	15360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91772109
7	NC_007955	CACTTT	2	12	23064	23075	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	91772115
8	NC_007955	CTGCTT	2	12	33438	33449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	91772127
9	NC_007955	GTGCAA	2	12	36744	36755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772129
10	NC_007955	AGAAAC	2	12	41621	41632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	91772135
11	NC_007955	ACTCGA	2	12	43782	43793	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772138
12	NC_007955	GGTAAT	2	12	46259	46270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772139
13	NC_007955	TAGTGT	2	12	47959	47970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	91772140
14	NC_007955	GAAACT	2	12	52685	52696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91772143
15	NC_007955	CTCTTT	2	12	53497	53508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772144
16	NC_007955	GGTTTA	2	12	56738	56749	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	91772147
17	NC_007955	CTATTG	2	12	57046	57057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91772147
18	NC_007955	TGGTTT	2	12	57155	57166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772147
19	NC_007955	TACAAG	2	12	57531	57542	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91772147
20	NC_007955	CTTCTG	2	12	58157	58168	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	91772147
21	NC_007955	CTGCAA	2	12	58960	58971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772148
22	NC_007955	ATATGA	2	12	59618	59629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91772148
23	NC_007955	CAAAAT	2	12	75034	75045	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	91772161
24	NC_007955	TGGAAT	2	12	75163	75174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772161
25	NC_007955	CATTCA	2	12	75339	75350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772161
26	NC_007955	TCCCCA	2	12	76352	76363	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	91772162
27	NC_007955	AGGATT	2	12	78016	78027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007955	ACCACT	2	12	80973	80984	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	91772169
29	NC_007955	AAGGAA	2	12	83835	83846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772172
30	NC_007955	CACTTC	2	12	85081	85092	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	91772172
31	NC_007955	ATGGAT	2	12	85652	85663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772173
32	NC_007955	ATCTTT	2	12	86896	86907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007955	TATTAA	2	12	87160	87171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007955	GGATGC	2	12	88032	88043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	91772174
35	NC_007955	TCATCC	2	12	92421	92432	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	91772180
36	NC_007955	TACTTT	2	12	92666	92677	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91772180
37	NC_007955	CTTTTG	2	12	93579	93590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91772181
38	NC_007955	TACTGC	2	12	95715	95726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772184
39	NC_007955	ATAAAA	2	12	98504	98515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007955	CTGATT	2	12	100248	100259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91772191
41	NC_007955	CCTGCT	2	12	101288	101299	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	91772193
42	NC_007955	TTTCCT	2	12	103377	103388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772195
43	NC_007955	TGCAGT	2	12	104395	104406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772197
44	NC_007955	ATGATC	2	12	105328	105339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772197
45	NC_007955	TCACCT	2	12	110704	110715	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007955	TATTCA	2	12	118290	118301	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91772208
47	NC_007955	GTATCG	2	12	118850	118861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772210
48	NC_007955	TTGACA	2	12	123970	123981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772216
49	NC_007955	ATTGTT	2	12	129637	129648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91772224
50	NC_007955	TTGGTG	2	12	130184	130195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007955	CATACT	2	12	130616	130627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007955	CTGTTT	2	12	134531	134542	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91772225
53	NC_007955	AGAACG	2	12	136687	136698	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	91772227
54	NC_007955	TTTTTG	2	12	142088	142099	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	91772232
55	NC_007955	TGGAAT	2	12	153314	153325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772242
56	NC_007955	TCCATG	2	12	160836	160847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772248
57	NC_007955	CTTTAT	2	12	161028	161039	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91772248
58	NC_007955	AGTTCC	2	12	163845	163856	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	91772250
59	NC_007955	TACTGA	2	12	177278	177289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772261
60	NC_007955	AGGTAT	2	12	181418	181429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772267
61	NC_007955	GATGAG	2	12	182201	182212	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	91772267
62	NC_007955	TGAATG	2	12	186699	186710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772275
63	NC_007955	TTATGC	2	12	187420	187431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91772276
64	NC_007955	TTCTTT	2	12	189470	189481	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	91772279
65	NC_007955	TTGCGC	2	12	190068	190079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772280
66	NC_007955	TTGGTG	2	12	190404	190415	0 %	50 %	50 %	0 %	91772280
67	NC_007955	ACGGAT	2	12	191556	191567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772281
68	NC_007955	TATGCA	2	12	196093	196104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772285
69	NC_007955	ACGTTG	2	12	197285	197296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772286
70	NC_007955	TATTAA	2	12	199489	199500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007955	GATGCT	2	12	202987	202998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	91772293
72	NC_007955	ATGTTG	2	12	206706	206717	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	91772298
73	NC_007955	GATTTT	2	12	206820	206831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	91772299
74	NC_007955	AATGAA	2	12	216758	216769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007955	AACCAT	2	12	218183	218194	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	91772310
76	NC_007955	CAATTT	3	18	222999	223016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91772313
77	NC_007955	ACATAT	2	12	232995	233006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007955	GTCAAG	2	12	234980	234991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772323
79	NC_007955	GAAGGA	2	12	235521	235532	50 %	0 %	50 %	0 %	91772324
80	NC_007955	CATGTT	2	12	236837	236848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	91772325
81	NC_007955	ATAGAG	2	12	238181	238192	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91772327
82	NC_007955	ATTTAT	2	12	240364	240375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007955	GAGATC	2	12	244835	244846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772331
84	NC_007955	GAATTT	2	12	250451	250462	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007955	ATATTC	2	12	253818	253829	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007955	CCAAGA	2	12	257959	257970	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	91772343
87	NC_007955	TTACTT	2	12	258966	258977	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91772344
88	NC_007955	CCCCAG	2	12	261108	261119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	91772346
89	NC_007955	TCCTAT	2	12	268386	268397	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	91772354
90	NC_007955	GGAAAA	2	12	268899	268910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007955	GTGGCT	2	12	269980	269991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	91772355
92	NC_007955	TGTTGA	2	12	270204	270215	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007955	ATTTTA	2	12	271537	271548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007955	GAAATA	2	12	272625	272636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91772358
95	NC_007955	ACAGTT	2	12	272697	272708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772358
96	NC_007955	CTGCAA	2	12	273301	273312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772358
97	NC_007955	AACACA	2	12	278368	278379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772365
98	NC_007955	CAATAT	2	12	279545	279556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91772366
99	NC_007955	ACATCG	2	12	280156	280167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772366
100	NC_007955	CTCTTT	2	12	281490	281501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772367
101	NC_007955	TTATCT	2	12	283937	283948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	91772370
102	NC_007955	GTGCCT	2	12	284829	284840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772371
103	NC_007955	ATACTT	2	12	286152	286163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91772372
104	NC_007955	TTTGTT	2	12	286567	286578	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	91772372
105	NC_007955	TTTGAA	2	12	288841	288852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007955	TAACAT	2	12	290197	290208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	91772374
107	NC_007955	TGAAGA	2	12	290495	290506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91772374
108	NC_007955	TCCCCA	2	12	291009	291020	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	91772374
109	NC_007955	TAAATT	2	12	291211	291222	50 %	50 %	0 %	0 %	91772374
110	NC_007955	AGAATT	2	12	291890	291901	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91772374
111	NC_007955	CACAAC	2	12	292327	292338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007955	TTTTTG	2	12	293741	293752	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	91772375
113	NC_007955	CGGCTG	2	12	295072	295083	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	91772376
114	NC_007955	GCAGAG	2	12	296008	296019	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	91772376
115	NC_007955	AGTTCA	2	12	301331	301342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772379
116	NC_007955	TTTTTG	2	12	304282	304293	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007955	CTTTTG	2	12	314970	314981	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91772388
118	NC_007955	AGGAAC	2	12	315428	315439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	91772388
119	NC_007955	ACAAAG	2	12	321113	321124	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	91772394
120	NC_007955	GTCCAT	2	12	322182	322193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007955	AAAGAT	2	12	327304	327315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	91772399
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161	NC_007955	ATCGTA	2	12	451324	451335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	91772500
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231	NC_007955	AATTAT	2	12	649700	649711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_007955	AAAAAG	2	12	653050	653061	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	91772663
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237	NC_007955	AATATA	2	12	663787	663798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
238	NC_007955	TTTTTG	2	12	668048	668059	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	91772677
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469	NC_007955	TCCATA	2	12	1306967	1306978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91773197
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471	NC_007955	TTAACT	2	12	1309638	1309649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	91773199
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498	NC_007955	TGTTCT	2	12	1371304	1371315	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	91773259
499	NC_007955	CACATT	2	12	1371887	1371898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91773259
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