MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanococcoides burtonii DSM 6242

Total Repeats: 1921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007955	TTGTC	2	10	309	318	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007955	TGATG	2	10	858	867	20 %	40 %	40 %	0 %	91772083
3	NC_007955	ATTGC	2	10	1446	1455	20 %	40 %	20 %	20 %	91772084
4	NC_007955	GACCT	2	10	1480	1489	20 %	20 %	20 %	40 %	91772084
5	NC_007955	GGATT	2	10	2388	2397	20 %	40 %	40 %	0 %	91772085
6	NC_007955	CCAAA	2	10	2747	2756	60 %	0 %	0 %	40 %	91772086
7	NC_007955	GGAAA	2	10	3335	3344	60 %	0 %	40 %	0 %	91772087
8	NC_007955	AGACG	2	10	5254	5263	40 %	0 %	40 %	20 %	91772091
9	NC_007955	ATTGG	2	10	5470	5479	20 %	40 %	40 %	0 %	91772092
10	NC_007955	AAAGG	2	10	6370	6379	60 %	0 %	40 %	0 %	91772094
11	NC_007955	CAGTA	2	10	12780	12789	40 %	20 %	20 %	20 %	91772106
12	NC_007955	ATTCA	2	10	13242	13251	40 %	40 %	0 %	20 %	91772106
13	NC_007955	ATTAA	2	10	16749	16758	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007955	GACTT	2	10	17064	17073	20 %	40 %	20 %	20 %	91772111
15	NC_007955	CTCTG	2	10	18771	18780	0 %	40 %	20 %	40 %	91772112
16	NC_007955	TTGCT	2	10	19426	19435	0 %	60 %	20 %	20 %	91772113
17	NC_007955	GTGAT	2	10	20330	20339	20 %	40 %	40 %	0 %	91772114
18	NC_007955	ACAAT	2	10	20595	20604	60 %	20 %	0 %	20 %	91772114
19	NC_007955	ATGAT	2	10	23678	23687	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007955	TATGG	2	10	23846	23855	20 %	40 %	40 %	0 %	91772117
21	NC_007955	CGCAC	2	10	25822	25831	20 %	0 %	20 %	60 %	91772119
22	NC_007955	AGGCA	2	10	25835	25844	40 %	0 %	40 %	20 %	91772119
23	NC_007955	TTCTG	2	10	26583	26592	0 %	60 %	20 %	20 %	91772121
24	NC_007955	AGATC	2	10	29444	29453	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007955	CCTTT	2	10	30131	30140	0 %	60 %	0 %	40 %	91772124
26	NC_007955	ATGTC	2	10	31728	31737	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007955	TGTTC	2	10	31755	31764	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007955	TCTTT	2	10	33486	33495	0 %	80 %	0 %	20 %	91772127
29	NC_007955	CCCAA	2	10	36192	36201	40 %	0 %	0 %	60 %	91772129
30	NC_007955	TACGA	2	10	36679	36688	40 %	20 %	20 %	20 %	91772129
31	NC_007955	ATCTT	2	10	37930	37939	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007955	AACCA	2	10	38715	38724	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007955	TTCCT	2	10	39886	39895	0 %	60 %	0 %	40 %	91772133
34	NC_007955	TTGTG	2	10	39946	39955	0 %	60 %	40 %	0 %	91772133
35	NC_007955	CATTT	2	10	40676	40685	20 %	60 %	0 %	20 %	91772134
36	NC_007955	TCTGA	2	10	41682	41691	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007955	TCTCT	2	10	44401	44410	0 %	60 %	0 %	40 %	91772138
38	NC_007955	TGTTT	2	10	44935	44944	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007955	ATCTG	2	10	47644	47653	20 %	40 %	20 %	20 %	91772140
40	NC_007955	CACTG	2	10	50322	50331	20 %	20 %	20 %	40 %	91772142
41	NC_007955	TGCAT	2	10	51586	51595	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007955	GTAGT	2	10	52336	52345	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007955	TGGTG	2	10	52511	52520	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007955	ATTGT	2	10	52635	52644	20 %	60 %	20 %	0 %	91772143
45	NC_007955	ATATC	2	10	52896	52905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007955	ATTTT	2	10	52909	52918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007955	CTGAA	2	10	53749	53758	40 %	20 %	20 %	20 %	91772144
48	NC_007955	ATTCC	2	10	54836	54845	20 %	40 %	0 %	40 %	91772146
49	NC_007955	GCTCA	2	10	54871	54880	20 %	20 %	20 %	40 %	91772146
50	NC_007955	CTCTT	2	10	57201	57210	0 %	60 %	0 %	40 %	91772147
51	NC_007955	TTTTC	2	10	58112	58121	0 %	80 %	0 %	20 %	91772147
52	NC_007955	TTTAA	2	10	58384	58393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007955	TAAAT	2	10	58778	58787	60 %	40 %	0 %	0 %	91772148
54	NC_007955	ATATA	2	10	60539	60548	60 %	40 %	0 %	0 %	91772149
55	NC_007955	AACAT	2	10	60940	60949	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007955	AAAAG	2	10	62256	62265	80 %	0 %	20 %	0 %	91772151
57	NC_007955	GAAGC	2	10	63965	63974	40 %	0 %	40 %	20 %	91772153
58	NC_007955	TTCTT	2	10	64251	64260	0 %	80 %	0 %	20 %	91772153
59	NC_007955	TATTT	2	10	64569	64578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007955	CATAC	2	10	65703	65712	40 %	20 %	0 %	40 %	91772154
61	NC_007955	GAAAA	2	10	66232	66241	80 %	0 %	20 %	0 %	91772155
62	NC_007955	GATAT	2	10	67617	67626	40 %	40 %	20 %	0 %	91772157
63	NC_007955	ATAGA	2	10	67867	67876	60 %	20 %	20 %	0 %	91772157
64	NC_007955	AGTGT	2	10	69408	69417	20 %	40 %	40 %	0 %	91772159
65	NC_007955	ACCGG	2	10	69522	69531	20 %	0 %	40 %	40 %	91772159
66	NC_007955	ATAAC	2	10	71360	71369	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007955	AACAT	2	10	71679	71688	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007955	TGATA	2	10	73285	73294	40 %	40 %	20 %	0 %	91772161
69	NC_007955	AAATG	2	10	73996	74005	60 %	20 %	20 %	0 %	91772161
70	NC_007955	TGTAT	2	10	75403	75412	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007955	TTCCC	2	10	76573	76582	0 %	40 %	0 %	60 %	91772163
72	NC_007955	GCTCA	2	10	78663	78672	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007955	ATGTG	2	10	78722	78731	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007955	TCACA	2	10	78897	78906	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_007955	GAACA	2	10	79161	79170	60 %	0 %	20 %	20 %	91772165
76	NC_007955	ATAGT	2	10	79552	79561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007955	TACTT	2	10	79977	79986	20 %	60 %	0 %	20 %	91772167
78	NC_007955	TGAGA	2	10	82403	82412	40 %	20 %	40 %	0 %	91772171
79	NC_007955	AGGAA	2	10	83495	83504	60 %	0 %	40 %	0 %	91772172
80	NC_007955	AAGGT	2	10	84432	84441	40 %	20 %	40 %	0 %	91772172
81	NC_007955	CATGA	2	10	84804	84813	40 %	20 %	20 %	20 %	91772172
82	NC_007955	GAAGG	2	10	84849	84858	40 %	0 %	60 %	0 %	91772172
83	NC_007955	TAAAA	2	10	87068	87077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007955	AGAAA	2	10	87978	87987	80 %	0 %	20 %	0 %	91772174
85	NC_007955	GTACT	2	10	93879	93888	20 %	40 %	20 %	20 %	91772181
86	NC_007955	TATGA	2	10	95371	95380	40 %	40 %	20 %	0 %	91772184
87	NC_007955	TCAAC	2	10	98401	98410	40 %	20 %	0 %	40 %	91772186
88	NC_007955	TGATT	2	10	100320	100329	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007955	TGATC	2	10	101862	101871	20 %	40 %	20 %	20 %	91772194
90	NC_007955	TGTAA	2	10	102617	102626	40 %	40 %	20 %	0 %	91772195
91	NC_007955	CAGGA	2	10	103811	103820	40 %	0 %	40 %	20 %	91772196
92	NC_007955	CGGAA	2	10	104383	104392	40 %	0 %	40 %	20 %	91772197
93	NC_007955	ATATT	2	10	112147	112156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007955	ATCAA	2	10	112876	112885	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007955	CATAT	2	10	113864	113873	40 %	40 %	0 %	20 %	91772205
96	NC_007955	GCCAT	2	10	115125	115134	20 %	20 %	20 %	40 %	91772206
97	NC_007955	CAGAA	2	10	115856	115865	60 %	0 %	20 %	20 %	91772207
98	NC_007955	CAATG	2	10	116255	116264	40 %	20 %	20 %	20 %	91772207
99	NC_007955	TGCTG	2	10	116822	116831	0 %	40 %	40 %	20 %	91772207
100	NC_007955	CCTTG	2	10	117539	117548	0 %	40 %	20 %	40 %	91772207
101	NC_007955	TGGTT	2	10	118112	118121	0 %	60 %	40 %	0 %	91772208
102	NC_007955	AGCAT	2	10	119885	119894	40 %	20 %	20 %	20 %	91772210
103	NC_007955	CAAAG	2	10	121726	121735	60 %	0 %	20 %	20 %	91772214
104	NC_007955	AGATA	2	10	124280	124289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007955	ACCCC	2	10	124375	124384	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
106	NC_007955	TGAAC	2	10	124878	124887	40 %	20 %	20 %	20 %	91772217
107	NC_007955	CATTT	2	10	125033	125042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007955	AGATT	2	10	127131	127140	40 %	40 %	20 %	0 %	91772220
109	NC_007955	TCCAA	2	10	127375	127384	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007955	GTTAC	2	10	127614	127623	20 %	40 %	20 %	20 %	91772221
111	NC_007955	ATATT	2	10	129995	130004	40 %	60 %	0 %	0 %	91772224
112	NC_007955	TGGAT	2	10	130417	130426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007955	AATTT	2	10	133787	133796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007955	TTCTT	2	10	133950	133959	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007955	TTCTA	2	10	135850	135859	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007955	TCCTT	2	10	137317	137326	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_007955	CATGG	2	10	138948	138957	20 %	20 %	40 %	20 %	91772230
118	NC_007955	TTATT	2	10	139249	139258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007955	TGGCA	2	10	139874	139883	20 %	20 %	40 %	20 %	91772231
120	NC_007955	ATTCT	2	10	140153	140162	20 %	60 %	0 %	20 %	91772231
121	NC_007955	ATACA	2	10	142579	142588	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007955	AAGAT	2	10	143478	143487	60 %	20 %	20 %	0 %	91772233
123	NC_007955	ATGAA	2	10	143652	143661	60 %	20 %	20 %	0 %	91772233
124	NC_007955	AATTA	2	10	143717	143726	60 %	40 %	0 %	0 %	91772233
125	NC_007955	ATTAT	2	10	145134	145143	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007955	TTTGT	2	10	147580	147589	0 %	80 %	20 %	0 %	91772237
127	NC_007955	AAATA	2	10	147658	147667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007955	ATATC	2	10	147804	147813	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007955	ATAGA	2	10	147876	147885	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007955	GCTTC	2	10	148489	148498	0 %	40 %	20 %	40 %	91772238
131	NC_007955	ATAAA	2	10	150104	150113	80 %	20 %	0 %	0 %	91772240
132	NC_007955	CTTTT	2	10	150198	150207	0 %	80 %	0 %	20 %	91772240
133	NC_007955	CTTTG	2	10	151564	151573	0 %	60 %	20 %	20 %	91772241
134	NC_007955	TTCAA	2	10	152612	152621	40 %	40 %	0 %	20 %	91772241
135	NC_007955	TCTCC	2	10	154121	154130	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_007955	GAATC	2	10	155217	155226	40 %	20 %	20 %	20 %	91772243
137	NC_007955	TGCAA	2	10	156609	156618	40 %	20 %	20 %	20 %	91772244
138	NC_007955	GTTGC	2	10	157229	157238	0 %	40 %	40 %	20 %	91772244
139	NC_007955	ACTAC	2	10	157857	157866	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_007955	AAAGT	2	10	158600	158609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007955	TATCG	2	10	161064	161073	20 %	40 %	20 %	20 %	91772248
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242	NC_007955	ATGCG	2	10	287465	287474	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
243	NC_007955	ATATT	6	30	287540	287569	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_007955	TTGTG	2	10	289862	289871	0 %	60 %	40 %	0 %	91772374
245	NC_007955	ATTAA	2	10	292213	292222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_007955	TCCAA	2	10	299526	299535	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
251	NC_007955	ACAAA	2	10	300140	300149	80 %	0 %	0 %	20 %	91772378
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253	NC_007955	TATGT	2	10	302249	302258	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_007955	GGAAG	2	10	306664	306673	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
255	NC_007955	ATTCG	2	10	308660	308669	20 %	40 %	20 %	20 %	91772381
256	NC_007955	GGGAT	2	10	308944	308953	20 %	20 %	60 %	0 %	91772381
257	NC_007955	TTTCT	2	10	310321	310330	0 %	80 %	0 %	20 %	91772383
258	NC_007955	TGATC	2	10	312905	312914	20 %	40 %	20 %	20 %	91772386
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260	NC_007955	GGAAA	2	10	313365	313374	60 %	0 %	40 %	0 %	91772386
261	NC_007955	CTCAA	2	10	314778	314787	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
262	NC_007955	CTGTT	2	10	317054	317063	0 %	60 %	20 %	20 %	91772390
263	NC_007955	AAAGA	2	10	321826	321835	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_007955	GATTT	2	10	322109	322118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_007955	GTATC	2	10	324784	324793	20 %	40 %	20 %	20 %	91772397
266	NC_007955	ATTAT	5	25	325360	325384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_007955	ATTCA	2	10	326051	326060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_007955	TTAAT	2	10	330135	330144	40 %	60 %	0 %	0 %	91772404
270	NC_007955	CAATT	2	10	332743	332752	40 %	40 %	0 %	20 %	91772406
271	NC_007955	TATCG	2	10	332974	332983	20 %	40 %	20 %	20 %	91772406
272	NC_007955	ATGAA	2	10	334009	334018	60 %	20 %	20 %	0 %	91772406
273	NC_007955	ATTAA	2	10	334362	334371	60 %	40 %	0 %	0 %	91772407
274	NC_007955	AATTA	2	10	335781	335790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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