MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 2804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007796	ACCAG	2	10	663	672	40 %	0 %	20 %	40 %	88601324
2	NC_007796	ATCCT	2	10	4031	4040	20 %	40 %	0 %	40 %	88601326
3	NC_007796	AGATC	2	10	4983	4992	40 %	20 %	20 %	20 %	88601326
4	NC_007796	CAGGG	2	10	6384	6393	20 %	0 %	60 %	20 %	88601327
5	NC_007796	AGATG	2	10	6581	6590	40 %	20 %	40 %	0 %	88601327
6	NC_007796	CGGGA	2	10	7203	7212	20 %	0 %	60 %	20 %	88601327
7	NC_007796	GACAT	2	10	8716	8725	40 %	20 %	20 %	20 %	88601327
8	NC_007796	TGGAA	2	10	9251	9260	40 %	20 %	40 %	0 %	88601327
9	NC_007796	AGAAT	2	10	9478	9487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007796	TCCGG	2	10	10410	10419	0 %	20 %	40 %	40 %	88601328
11	NC_007796	AAATC	2	10	13741	13750	60 %	20 %	0 %	20 %	88601331
12	NC_007796	TTTCT	2	10	15522	15531	0 %	80 %	0 %	20 %	88601332
13	NC_007796	GCAGG	2	10	17571	17580	20 %	0 %	60 %	20 %	88601333
14	NC_007796	GAGAT	2	10	20415	20424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007796	GGTTC	2	10	20737	20746	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007796	CTGAC	2	10	21299	21308	20 %	20 %	20 %	40 %	88601334
17	NC_007796	TCATC	2	10	22871	22880	20 %	40 %	0 %	40 %	88601335
18	NC_007796	GTCTG	2	10	23662	23671	0 %	40 %	40 %	20 %	88601335
19	NC_007796	TGATC	2	10	24098	24107	20 %	40 %	20 %	20 %	88601335
20	NC_007796	GAATT	2	10	24767	24776	40 %	40 %	20 %	0 %	88601335
21	NC_007796	AGCTC	2	10	25869	25878	20 %	20 %	20 %	40 %	88601336
22	NC_007796	CTGCC	2	10	27845	27854	0 %	20 %	20 %	60 %	88601336
23	NC_007796	TGTGG	2	10	29014	29023	0 %	40 %	60 %	0 %	88601337
24	NC_007796	TGGAT	2	10	30231	30240	20 %	40 %	40 %	0 %	88601337
25	NC_007796	GTGAT	2	10	30531	30540	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007796	AATGC	2	10	30644	30653	40 %	20 %	20 %	20 %	88601338
27	NC_007796	GAAAT	2	10	30731	30740	60 %	20 %	20 %	0 %	88601338
28	NC_007796	CAGGG	2	10	32446	32455	20 %	0 %	60 %	20 %	88601340
29	NC_007796	TTTCA	2	10	33435	33444	20 %	60 %	0 %	20 %	88601342
30	NC_007796	GAAGA	2	10	36549	36558	60 %	0 %	40 %	0 %	88601344
31	NC_007796	TCCAG	2	10	38931	38940	20 %	20 %	20 %	40 %	88601345
32	NC_007796	GGACA	2	10	40992	41001	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007796	GGAAT	2	10	41334	41343	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007796	TCGTA	2	10	42190	42199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007796	AATCC	2	10	42965	42974	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007796	ATGGC	2	10	52030	52039	20 %	20 %	40 %	20 %	88601353
37	NC_007796	CTCTG	2	10	53896	53905	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007796	GATCT	2	10	54120	54129	20 %	40 %	20 %	20 %	88601356
39	NC_007796	CAGAA	2	10	57072	57081	60 %	0 %	20 %	20 %	88601358
40	NC_007796	TGGAG	2	10	57238	57247	20 %	20 %	60 %	0 %	88601358
41	NC_007796	TTCAG	2	10	57331	57340	20 %	40 %	20 %	20 %	88601358
42	NC_007796	CGGAT	2	10	58261	58270	20 %	20 %	40 %	20 %	88601359
43	NC_007796	TCTTT	2	10	58698	58707	0 %	80 %	0 %	20 %	88601360
44	NC_007796	ATCAG	2	10	60581	60590	40 %	20 %	20 %	20 %	88601362
45	NC_007796	TAAAG	2	10	61895	61904	60 %	20 %	20 %	0 %	88601364
46	NC_007796	CAGGC	2	10	63756	63765	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007796	GATAT	2	10	64022	64031	40 %	40 %	20 %	0 %	88601366
48	NC_007796	TCCAA	2	10	64348	64357	40 %	20 %	0 %	40 %	88601366
49	NC_007796	TGGTA	2	10	66455	66464	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007796	ACCCA	2	10	68497	68506	40 %	0 %	0 %	60 %	88601369
51	NC_007796	TATGG	2	10	68631	68640	20 %	40 %	40 %	0 %	88601369
52	NC_007796	GGTCC	2	10	70148	70157	0 %	20 %	40 %	40 %	88601370
53	NC_007796	TCTCC	2	10	70542	70551	0 %	40 %	0 %	60 %	88601371
54	NC_007796	GATGA	2	10	71902	71911	40 %	20 %	40 %	0 %	88601371
55	NC_007796	ATGAC	2	10	72407	72416	40 %	20 %	20 %	20 %	88601371
56	NC_007796	TATGA	2	10	73021	73030	40 %	40 %	20 %	0 %	88601371
57	NC_007796	GGAAG	2	10	76090	76099	40 %	0 %	60 %	0 %	88601375
58	NC_007796	GTTCA	2	10	76475	76484	20 %	40 %	20 %	20 %	88601375
59	NC_007796	TTATT	2	10	76815	76824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007796	ATGAT	2	10	77016	77025	40 %	40 %	20 %	0 %	88601376
61	NC_007796	GGGCC	2	10	77968	77977	0 %	0 %	60 %	40 %	88601377
62	NC_007796	CAGTC	2	10	78715	78724	20 %	20 %	20 %	40 %	88601379
63	NC_007796	TCCAT	2	10	81706	81715	20 %	40 %	0 %	40 %	88601380
64	NC_007796	ATGCA	2	10	83003	83012	40 %	20 %	20 %	20 %	88601382
65	NC_007796	ACCAT	2	10	84278	84287	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007796	TATTG	2	10	84882	84891	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007796	ACTGA	2	10	85162	85171	40 %	20 %	20 %	20 %	88601385
68	NC_007796	GCATG	2	10	88887	88896	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_007796	ATCTC	2	10	89258	89267	20 %	40 %	0 %	40 %	88601389
70	NC_007796	TCCGG	2	10	89463	89472	0 %	20 %	40 %	40 %	88601389
71	NC_007796	GATTT	2	10	92708	92717	20 %	60 %	20 %	0 %	88601391
72	NC_007796	ATATA	2	10	93071	93080	60 %	40 %	0 %	0 %	88601391
73	NC_007796	GACCT	2	10	95277	95286	20 %	20 %	20 %	40 %	88601393
74	NC_007796	TATGA	2	10	96708	96717	40 %	40 %	20 %	0 %	88601394
75	NC_007796	GGGGA	2	10	99846	99855	20 %	0 %	80 %	0 %	88601398
76	NC_007796	TTCAA	2	10	100768	100777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007796	ACCGG	2	10	101377	101386	20 %	0 %	40 %	40 %	88601401
78	NC_007796	TGTCT	2	10	102464	102473	0 %	60 %	20 %	20 %	88601401
79	NC_007796	TTCAG	2	10	103515	103524	20 %	40 %	20 %	20 %	88601402
80	NC_007796	CTGAT	2	10	103909	103918	20 %	40 %	20 %	20 %	88601402
81	NC_007796	TCCCG	2	10	104260	104269	0 %	20 %	20 %	60 %	88601402
82	NC_007796	TCCTG	2	10	104932	104941	0 %	40 %	20 %	40 %	88601403
83	NC_007796	TATTT	2	10	108487	108496	20 %	80 %	0 %	0 %	88601406
84	NC_007796	CTTCC	2	10	110094	110103	0 %	40 %	0 %	60 %	88601408
85	NC_007796	GGCAG	2	10	110476	110485	20 %	0 %	60 %	20 %	88601409
86	NC_007796	TGACC	2	10	111429	111438	20 %	20 %	20 %	40 %	88601411
87	NC_007796	CACGA	2	10	111701	111710	40 %	0 %	20 %	40 %	88601411
88	NC_007796	GACAT	2	10	111752	111761	40 %	20 %	20 %	20 %	88601411
89	NC_007796	TCATT	2	10	112394	112403	20 %	60 %	0 %	20 %	88601412
90	NC_007796	GAGAA	2	10	115208	115217	60 %	0 %	40 %	0 %	88601415
91	NC_007796	GAGAA	2	10	118893	118902	60 %	0 %	40 %	0 %	88601419
92	NC_007796	GTGGA	2	10	122187	122196	20 %	20 %	60 %	0 %	88601423
93	NC_007796	GGACC	2	10	123721	123730	20 %	0 %	40 %	40 %	88601424
94	NC_007796	TCTGT	2	10	124224	124233	0 %	60 %	20 %	20 %	88601424
95	NC_007796	GAAGA	2	10	124691	124700	60 %	0 %	40 %	0 %	88601425
96	NC_007796	ATAAA	2	10	127059	127068	80 %	20 %	0 %	0 %	88601428
97	NC_007796	TGTCT	2	10	127607	127616	0 %	60 %	20 %	20 %	88601428
98	NC_007796	ATCTG	2	10	129076	129085	20 %	40 %	20 %	20 %	88601429
99	NC_007796	TCCCC	2	10	130530	130539	0 %	20 %	0 %	80 %	88601429
100	NC_007796	ACTGA	2	10	130637	130646	40 %	20 %	20 %	20 %	88601429
101	NC_007796	TGAAT	2	10	130757	130766	40 %	40 %	20 %	0 %	88601429
102	NC_007796	TCAGT	2	10	131388	131397	20 %	40 %	20 %	20 %	88601431
103	NC_007796	TGCAG	2	10	137257	137266	20 %	20 %	40 %	20 %	88601434
104	NC_007796	ATGAT	2	10	138827	138836	40 %	40 %	20 %	0 %	88601435
105	NC_007796	CTACC	2	10	139786	139795	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_007796	TCCTG	2	10	143006	143015	0 %	40 %	20 %	40 %	88601439
107	NC_007796	TCCTT	2	10	143639	143648	0 %	60 %	0 %	40 %	88601439
108	NC_007796	AATGG	2	10	143722	143731	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007796	ATATC	2	10	143770	143779	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007796	GAGAA	2	10	144097	144106	60 %	0 %	40 %	0 %	88601440
111	NC_007796	ACAGC	2	10	144438	144447	40 %	0 %	20 %	40 %	88601440
112	NC_007796	GTTCA	2	10	145159	145168	20 %	40 %	20 %	20 %	88601442
113	NC_007796	CAGAA	2	10	145873	145882	60 %	0 %	20 %	20 %	88601443
114	NC_007796	GTGAT	2	10	146484	146493	20 %	40 %	40 %	0 %	88601443
115	NC_007796	GAGGG	2	10	147164	147173	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007796	GGACA	2	10	148141	148150	40 %	0 %	40 %	20 %	88601445
117	NC_007796	TGTCT	2	10	148546	148555	0 %	60 %	20 %	20 %	88601446
118	NC_007796	ATCTT	2	10	148565	148574	20 %	60 %	0 %	20 %	88601446
119	NC_007796	GATTC	2	10	150362	150371	20 %	40 %	20 %	20 %	88601447
120	NC_007796	AAATG	2	10	151608	151617	60 %	20 %	20 %	0 %	88601448
121	NC_007796	AGTTC	2	10	152188	152197	20 %	40 %	20 %	20 %	88601448
122	NC_007796	GTATT	2	10	152918	152927	20 %	60 %	20 %	0 %	88601448
123	NC_007796	TCGAT	2	10	153079	153088	20 %	40 %	20 %	20 %	88601448
124	NC_007796	TGATA	2	10	153445	153454	40 %	40 %	20 %	0 %	88601449
125	NC_007796	ATCTT	2	10	154610	154619	20 %	60 %	0 %	20 %	88601450
126	NC_007796	TCCCC	2	10	155009	155018	0 %	20 %	0 %	80 %	88601451
127	NC_007796	TCCTC	2	10	155215	155224	0 %	40 %	0 %	60 %	88601451
128	NC_007796	CAGAT	2	10	156323	156332	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007796	TTCAG	2	10	158604	158613	20 %	40 %	20 %	20 %	88601455
130	NC_007796	CTGAC	2	10	158619	158628	20 %	20 %	20 %	40 %	88601455
131	NC_007796	CCGGT	2	10	160086	160095	0 %	20 %	40 %	40 %	88601456
132	NC_007796	GATAA	2	10	162747	162756	60 %	20 %	20 %	0 %	88601459
133	NC_007796	GATCA	2	10	167922	167931	40 %	20 %	20 %	20 %	88601464
134	NC_007796	CCTTC	2	10	167996	168005	0 %	40 %	0 %	60 %	88601464
135	NC_007796	ACCGG	2	10	172535	172544	20 %	0 %	40 %	40 %	88601469
136	NC_007796	GGTTG	2	10	174361	174370	0 %	40 %	60 %	0 %	88601472
137	NC_007796	CCGTC	2	10	174450	174459	0 %	20 %	20 %	60 %	88601472
138	NC_007796	ACATC	2	10	176018	176027	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007796	TGCAG	2	10	176435	176444	20 %	20 %	40 %	20 %	88601475
140	NC_007796	TCATT	2	10	176644	176653	20 %	60 %	0 %	20 %	88601475
141	NC_007796	ATTAC	2	10	177245	177254	40 %	40 %	0 %	20 %	88601476
142	NC_007796	GAAGC	2	10	177452	177461	40 %	0 %	40 %	20 %	88601477
143	NC_007796	GAACG	2	10	179434	179443	40 %	0 %	40 %	20 %	88601477
144	NC_007796	TTACC	2	10	181656	181665	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_007796	TTGAA	2	10	181834	181843	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007796	TCTCC	2	10	182216	182225	0 %	40 %	0 %	60 %	88601481
147	NC_007796	GAAAT	2	10	184257	184266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007796	ATTAC	2	10	184291	184300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_007796	TTTCA	2	10	184762	184771	20 %	60 %	0 %	20 %	88601484
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152	NC_007796	TAAAA	2	10	187760	187769	80 %	20 %	0 %	0 %	88601487
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161	NC_007796	ATCAT	2	10	198234	198243	40 %	40 %	0 %	20 %	88601494
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166	NC_007796	ATATA	2	10	205356	205365	60 %	40 %	0 %	0 %	88601498
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169	NC_007796	TTATG	2	10	208205	208214	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_007796	GGAAA	2	10	218183	218192	60 %	0 %	40 %	0 %	88601507
173	NC_007796	AATCC	2	10	220528	220537	40 %	20 %	0 %	40 %	88601510
174	NC_007796	TGGTA	2	10	221203	221212	20 %	40 %	40 %	0 %	88601510
175	NC_007796	AGGAA	2	10	221507	221516	60 %	0 %	40 %	0 %	88601510
176	NC_007796	TTCTC	2	10	221852	221861	0 %	60 %	0 %	40 %	88601510
177	NC_007796	ATCAG	2	10	224389	224398	40 %	20 %	20 %	20 %	88601513
178	NC_007796	CTGAT	2	10	226869	226878	20 %	40 %	20 %	20 %	88601516
179	NC_007796	CTTCT	2	10	229742	229751	0 %	60 %	0 %	40 %	88601518
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182	NC_007796	CTTTA	2	10	236822	236831	20 %	60 %	0 %	20 %	88601524
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186	NC_007796	CCGGT	2	10	243695	243704	0 %	20 %	40 %	40 %	88601531
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194	NC_007796	TTCAT	2	10	252680	252689	20 %	60 %	0 %	20 %	88601539
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199	NC_007796	AGTGG	2	10	266791	266800	20 %	20 %	60 %	0 %	88601553
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201	NC_007796	AGTGA	2	10	268093	268102	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
202	NC_007796	TGTGG	2	10	268523	268532	0 %	40 %	60 %	0 %	88601555
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239	NC_007796	GCAAG	2	10	326128	326137	40 %	0 %	40 %	20 %	88601602
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249	NC_007796	ACCAA	2	10	336696	336705	60 %	0 %	0 %	40 %	88601609
250	NC_007796	ACCTG	2	10	337386	337395	20 %	20 %	20 %	40 %	88601610
251	NC_007796	TGGTA	2	10	338140	338149	20 %	40 %	40 %	0 %	88601611
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253	NC_007796	AGGGG	2	10	339534	339543	20 %	0 %	80 %	0 %	88601612
254	NC_007796	CAATA	2	10	339630	339639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
255	NC_007796	TTTTA	2	10	339998	340007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_007796	AGGTC	2	10	340725	340734	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_007796	AGGGG	2	10	341362	341371	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
258	NC_007796	TGATC	2	10	341782	341791	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
259	NC_007796	ACGTA	2	10	341884	341893	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
260	NC_007796	CATTT	2	10	342428	342437	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
261	NC_007796	TACAA	2	10	343510	343519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
262	NC_007796	ATCAC	2	10	343880	343889	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_007796	ACATC	2	10	344477	344486	40 %	20 %	0 %	40 %	88601616
264	NC_007796	CTTTC	2	10	344552	344561	0 %	60 %	0 %	40 %	88601617
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267	NC_007796	ACTTT	2	10	348633	348642	20 %	60 %	0 %	20 %	88601621
268	NC_007796	ACCGA	2	10	348918	348927	40 %	0 %	20 %	40 %	88601622
269	NC_007796	ATACA	2	10	349189	349198	60 %	20 %	0 %	20 %	88601622
270	NC_007796	ATTTT	2	10	349414	349423	20 %	80 %	0 %	0 %	88601623
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