MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 8923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007796	GTTT	2	8	185	192	0 %	75 %	25 %	0 %	88601323
2	NC_007796	TATC	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007796	GCCC	2	8	725	732	0 %	0 %	25 %	75 %	88601324
4	NC_007796	TCAA	2	8	830	837	50 %	25 %	0 %	25 %	88601324
5	NC_007796	TCCT	2	8	1779	1786	0 %	50 %	0 %	50 %	88601325
6	NC_007796	ATTC	2	8	1854	1861	25 %	50 %	0 %	25 %	88601325
7	NC_007796	TAAA	2	8	1917	1924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007796	GAGG	2	8	2337	2344	25 %	0 %	75 %	0 %	88601326
9	NC_007796	CCTT	2	8	2909	2916	0 %	50 %	0 %	50 %	88601326
10	NC_007796	CCAT	2	8	3044	3051	25 %	25 %	0 %	50 %	88601326
11	NC_007796	GAAA	2	8	3893	3900	75 %	0 %	25 %	0 %	88601326
12	NC_007796	TGAT	2	8	4856	4863	25 %	50 %	25 %	0 %	88601326
13	NC_007796	ACGG	2	8	4918	4925	25 %	0 %	50 %	25 %	88601326
14	NC_007796	CTTT	2	8	5031	5038	0 %	75 %	0 %	25 %	88601326
15	NC_007796	CTGC	2	8	5302	5309	0 %	25 %	25 %	50 %	88601327
16	NC_007796	TAAA	2	8	6295	6302	75 %	25 %	0 %	0 %	88601327
17	NC_007796	GGAC	2	8	7063	7070	25 %	0 %	50 %	25 %	88601327
18	NC_007796	AAAG	2	8	7137	7144	75 %	0 %	25 %	0 %	88601327
19	NC_007796	TGTC	2	8	7189	7196	0 %	50 %	25 %	25 %	88601327
20	NC_007796	GCAG	2	8	7454	7461	25 %	0 %	50 %	25 %	88601327
21	NC_007796	GGAT	2	8	7766	7773	25 %	25 %	50 %	0 %	88601327
22	NC_007796	AGAA	2	8	8024	8031	75 %	0 %	25 %	0 %	88601327
23	NC_007796	GTTC	2	8	8267	8274	0 %	50 %	25 %	25 %	88601327
24	NC_007796	CATG	2	8	8753	8760	25 %	25 %	25 %	25 %	88601327
25	NC_007796	AGGA	2	8	8818	8825	50 %	0 %	50 %	0 %	88601327
26	NC_007796	GAGG	2	8	9093	9100	25 %	0 %	75 %	0 %	88601327
27	NC_007796	TCTT	2	8	9199	9206	0 %	75 %	0 %	25 %	88601327
28	NC_007796	CAGA	2	8	9343	9350	50 %	0 %	25 %	25 %	88601327
29	NC_007796	TCCA	2	8	9762	9769	25 %	25 %	0 %	50 %	88601328
30	NC_007796	ATCT	2	8	9797	9804	25 %	50 %	0 %	25 %	88601328
31	NC_007796	TCTG	2	8	9934	9941	0 %	50 %	25 %	25 %	88601328
32	NC_007796	GCAT	2	8	10038	10045	25 %	25 %	25 %	25 %	88601328
33	NC_007796	GGAA	2	8	10992	10999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007796	CTTC	2	8	11256	11263	0 %	50 %	0 %	50 %	88601329
35	NC_007796	CATC	2	8	12254	12261	25 %	25 %	0 %	50 %	88601330
36	NC_007796	TGAT	2	8	12265	12272	25 %	50 %	25 %	0 %	88601330
37	NC_007796	AATT	2	8	14032	14039	50 %	50 %	0 %	0 %	88601331
38	NC_007796	CATC	2	8	14361	14368	25 %	25 %	0 %	50 %	88601331
39	NC_007796	AAAG	2	8	14469	14476	75 %	0 %	25 %	0 %	88601331
40	NC_007796	GTTT	2	8	14591	14598	0 %	75 %	25 %	0 %	88601331
41	NC_007796	GATC	2	8	15013	15020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007796	TTCA	2	8	15480	15487	25 %	50 %	0 %	25 %	88601332
43	NC_007796	TTGC	2	8	15931	15938	0 %	50 %	25 %	25 %	88601332
44	NC_007796	CTTA	2	8	16248	16255	25 %	50 %	0 %	25 %	88601332
45	NC_007796	TTGC	2	8	16477	16484	0 %	50 %	25 %	25 %	88601332
46	NC_007796	ATGG	2	8	17010	17017	25 %	25 %	50 %	0 %	88601332
47	NC_007796	GAAT	2	8	17745	17752	50 %	25 %	25 %	0 %	88601333
48	NC_007796	TACA	2	8	17815	17822	50 %	25 %	0 %	25 %	88601333
49	NC_007796	TGAA	2	8	18203	18210	50 %	25 %	25 %	0 %	88601333
50	NC_007796	CTGA	2	8	18301	18308	25 %	25 %	25 %	25 %	88601333
51	NC_007796	CTGA	2	8	18508	18515	25 %	25 %	25 %	25 %	88601333
52	NC_007796	CATC	2	8	18584	18591	25 %	25 %	0 %	50 %	88601333
53	NC_007796	ATTG	2	8	18837	18844	25 %	50 %	25 %	0 %	88601333
54	NC_007796	AGGG	2	8	19057	19064	25 %	0 %	75 %	0 %	88601333
55	NC_007796	AGGG	2	8	19402	19409	25 %	0 %	75 %	0 %	88601333
56	NC_007796	AGGG	2	8	19774	19781	25 %	0 %	75 %	0 %	88601333
57	NC_007796	GGAA	2	8	21099	21106	50 %	0 %	50 %	0 %	88601334
58	NC_007796	GCCA	2	8	21770	21777	25 %	0 %	25 %	50 %	88601334
59	NC_007796	AACA	2	8	22081	22088	75 %	0 %	0 %	25 %	88601334
60	NC_007796	ATTA	2	8	22911	22918	50 %	50 %	0 %	0 %	88601335
61	NC_007796	CCTG	2	8	23176	23183	0 %	25 %	25 %	50 %	88601335
62	NC_007796	TCAT	2	8	23413	23420	25 %	50 %	0 %	25 %	88601335
63	NC_007796	GCCT	2	8	23812	23819	0 %	25 %	25 %	50 %	88601335
64	NC_007796	ATGA	2	8	23922	23929	50 %	25 %	25 %	0 %	88601335
65	NC_007796	ATCC	2	8	24837	24844	25 %	25 %	0 %	50 %	88601335
66	NC_007796	AATT	2	8	25018	25025	50 %	50 %	0 %	0 %	88601336
67	NC_007796	CTTC	2	8	25338	25345	0 %	50 %	0 %	50 %	88601336
68	NC_007796	TGAT	2	8	25806	25813	25 %	50 %	25 %	0 %	88601336
69	NC_007796	CATT	2	8	25972	25979	25 %	50 %	0 %	25 %	88601336
70	NC_007796	TGCC	2	8	28109	28116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007796	ATCG	2	8	28173	28180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007796	ATCA	2	8	28251	28258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007796	CGGT	2	8	28742	28749	0 %	25 %	50 %	25 %	88601337
74	NC_007796	TTGG	2	8	28825	28832	0 %	50 %	50 %	0 %	88601337
75	NC_007796	CCTG	2	8	30268	30275	0 %	25 %	25 %	50 %	88601337
76	NC_007796	GTAA	2	8	30512	30519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007796	GAAT	2	8	30750	30757	50 %	25 %	25 %	0 %	88601338
78	NC_007796	TTCC	2	8	30838	30845	0 %	50 %	0 %	50 %	88601338
79	NC_007796	CCGC	2	8	31094	31101	0 %	0 %	25 %	75 %	88601339
80	NC_007796	TGAC	2	8	31823	31830	25 %	25 %	25 %	25 %	88601340
81	NC_007796	ACAT	2	8	33185	33192	50 %	25 %	0 %	25 %	88601341
82	NC_007796	TGGC	2	8	33340	33347	0 %	25 %	50 %	25 %	88601342
83	NC_007796	GACC	2	8	33911	33918	25 %	0 %	25 %	50 %	88601342
84	NC_007796	ATCC	2	8	34104	34111	25 %	25 %	0 %	50 %	88601342
85	NC_007796	GGTT	2	8	34496	34503	0 %	50 %	50 %	0 %	88601342
86	NC_007796	ACAG	2	8	34691	34698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007796	CTGA	2	8	34822	34829	25 %	25 %	25 %	25 %	88601343
88	NC_007796	CCGC	2	8	35072	35079	0 %	0 %	25 %	75 %	88601343
89	NC_007796	ACTG	2	8	35393	35400	25 %	25 %	25 %	25 %	88601344
90	NC_007796	GCAG	2	8	35536	35543	25 %	0 %	50 %	25 %	88601344
91	NC_007796	AAAG	2	8	35696	35703	75 %	0 %	25 %	0 %	88601344
92	NC_007796	AGAA	2	8	35803	35810	75 %	0 %	25 %	0 %	88601344
93	NC_007796	CTTC	2	8	36933	36940	0 %	50 %	0 %	50 %	88601344
94	NC_007796	AAAG	2	8	37148	37155	75 %	0 %	25 %	0 %	88601344
95	NC_007796	ATGA	2	8	38157	38164	50 %	25 %	25 %	0 %	88601344
96	NC_007796	TCTG	2	8	39761	39768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007796	CGAA	2	8	39993	40000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007796	GGCT	2	8	40205	40212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007796	CGAG	2	8	40846	40853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007796	AGGA	2	8	40927	40934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007796	ATGC	2	8	41933	41940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007796	TGCC	2	8	43355	43362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007796	GGTT	2	8	43762	43769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007796	TAGG	2	8	43832	43839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007796	TGGG	2	8	43845	43852	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007796	CTAT	2	8	44215	44222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007796	GTTT	2	8	44987	44994	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007796	GAAA	2	8	45347	45354	75 %	0 %	25 %	0 %	88601346
109	NC_007796	TGGC	2	8	45581	45588	0 %	25 %	50 %	25 %	88601346
110	NC_007796	CTTC	2	8	45645	45652	0 %	50 %	0 %	50 %	88601346
111	NC_007796	CCCG	2	8	45750	45757	0 %	0 %	25 %	75 %	88601346
112	NC_007796	GCTT	2	8	45998	46005	0 %	50 %	25 %	25 %	88601347
113	NC_007796	ATAA	2	8	46062	46069	75 %	25 %	0 %	0 %	88601347
114	NC_007796	ATTC	2	8	46070	46077	25 %	50 %	0 %	25 %	88601347
115	NC_007796	CCCG	2	8	46394	46401	0 %	0 %	25 %	75 %	88601347
116	NC_007796	ACAG	2	8	47479	47486	50 %	0 %	25 %	25 %	88601349
117	NC_007796	TTCA	2	8	48152	48159	25 %	50 %	0 %	25 %	88601350
118	NC_007796	AATC	2	8	48292	48299	50 %	25 %	0 %	25 %	88601350
119	NC_007796	ACTG	2	8	48492	48499	25 %	25 %	25 %	25 %	88601350
120	NC_007796	CCTG	2	8	48588	48595	0 %	25 %	25 %	50 %	88601350
121	NC_007796	CATT	2	8	48924	48931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007796	GCAA	2	8	49185	49192	50 %	0 %	25 %	25 %	88601351
123	NC_007796	GGTA	2	8	49215	49222	25 %	25 %	50 %	0 %	88601351
124	NC_007796	ATGA	2	8	49699	49706	50 %	25 %	25 %	0 %	88601351
125	NC_007796	GGAA	2	8	49778	49785	50 %	0 %	50 %	0 %	88601351
126	NC_007796	TGCT	2	8	50076	50083	0 %	50 %	25 %	25 %	88601352
127	NC_007796	TCAC	3	12	51921	51932	25 %	25 %	0 %	50 %	88601353
128	NC_007796	ACCT	2	8	52084	52091	25 %	25 %	0 %	50 %	88601353
129	NC_007796	AAGA	2	8	52548	52555	75 %	0 %	25 %	0 %	88601353
130	NC_007796	ATGG	2	8	53550	53557	25 %	25 %	50 %	0 %	88601355
131	NC_007796	CAGG	2	8	53566	53573	25 %	0 %	50 %	25 %	88601355
132	NC_007796	TTCA	2	8	53642	53649	25 %	50 %	0 %	25 %	88601355
133	NC_007796	GCAG	2	8	53700	53707	25 %	0 %	50 %	25 %	88601355
134	NC_007796	CTCA	2	8	53931	53938	25 %	25 %	0 %	50 %	88601356
135	NC_007796	CTGA	2	8	54299	54306	25 %	25 %	25 %	25 %	88601356
136	NC_007796	ATGG	2	8	54606	54613	25 %	25 %	50 %	0 %	88601356
137	NC_007796	AAAC	2	8	54680	54687	75 %	0 %	0 %	25 %	88601357
138	NC_007796	GTAT	2	8	54898	54905	25 %	50 %	25 %	0 %	88601357
139	NC_007796	TATC	2	8	55294	55301	25 %	50 %	0 %	25 %	88601358
140	NC_007796	ATCG	2	8	55312	55319	25 %	25 %	25 %	25 %	88601358
141	NC_007796	GTCG	2	8	55418	55425	0 %	25 %	50 %	25 %	88601358
142	NC_007796	GTCA	2	8	55826	55833	25 %	25 %	25 %	25 %	88601358
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144	NC_007796	CAGA	2	8	55954	55961	50 %	0 %	25 %	25 %	88601358
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