MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome

Total Repeats: 5762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007681	GTAA	2	8	110	117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007681	TTAT	2	8	345	352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007681	TATT	2	8	381	388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007681	TATT	2	8	431	438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007681	TTAT	2	8	565	572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007681	ATTA	2	8	632	639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007681	ATTT	2	8	1112	1119	25 %	75 %	0 %	0 %	84488832
8	NC_007681	AAAG	2	8	1363	1370	75 %	0 %	25 %	0 %	84488832
9	NC_007681	ACTT	2	8	1630	1637	25 %	50 %	0 %	25 %	84488832
10	NC_007681	TCTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	0 %	25 %	84488833
11	NC_007681	ATCA	2	8	2067	2074	50 %	25 %	0 %	25 %	84488833
12	NC_007681	TACT	2	8	2177	2184	25 %	50 %	0 %	25 %	84488833
13	NC_007681	ATTT	2	8	2528	2535	25 %	75 %	0 %	0 %	84488834
14	NC_007681	TGCT	2	8	2581	2588	0 %	50 %	25 %	25 %	84488834
15	NC_007681	TCTT	2	8	2743	2750	0 %	75 %	0 %	25 %	84488834
16	NC_007681	TATT	2	8	4233	4240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007681	TAAT	2	8	4254	4261	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
18	NC_007681	ATAA	2	8	4428	4435	75 %	25 %	0 %	0 %	84488836
19	NC_007681	TTCT	2	8	5726	5733	0 %	75 %	0 %	25 %	84488836
20	NC_007681	AGAA	2	8	6251	6258	75 %	0 %	25 %	0 %	84488836
21	NC_007681	TTTC	2	8	6358	6365	0 %	75 %	0 %	25 %	84488836
22	NC_007681	AATG	2	8	6461	6468	50 %	25 %	25 %	0 %	84488836
23	NC_007681	AAAT	2	8	7045	7052	75 %	25 %	0 %	0 %	84488836
24	NC_007681	ATAA	2	8	7213	7220	75 %	25 %	0 %	0 %	84488837
25	NC_007681	CTAA	2	8	7317	7324	50 %	25 %	0 %	25 %	84488837
26	NC_007681	ATTT	2	8	7451	7458	25 %	75 %	0 %	0 %	84488837
27	NC_007681	TTTG	2	8	7681	7688	0 %	75 %	25 %	0 %	84488838
28	NC_007681	TATC	2	8	8417	8424	25 %	50 %	0 %	25 %	84488838
29	NC_007681	TTGT	2	8	9380	9387	0 %	75 %	25 %	0 %	84488838
30	NC_007681	CTTC	2	8	9679	9686	0 %	50 %	0 %	50 %	84488838
31	NC_007681	TAAA	2	8	9856	9863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007681	ATTA	2	8	10149	10156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007681	GATG	2	8	11441	11448	25 %	25 %	50 %	0 %	84488840
34	NC_007681	ATTA	2	8	12102	12109	50 %	50 %	0 %	0 %	84488840
35	NC_007681	ATAA	2	8	12523	12530	75 %	25 %	0 %	0 %	84488840
36	NC_007681	TAAT	2	8	12843	12850	50 %	50 %	0 %	0 %	84488841
37	NC_007681	ATTT	2	8	13155	13162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007681	CATT	2	8	13294	13301	25 %	50 %	0 %	25 %	84488842
39	NC_007681	ATCT	2	8	13484	13491	25 %	50 %	0 %	25 %	84488842
40	NC_007681	ATTT	2	8	14352	14359	25 %	75 %	0 %	0 %	84488843
41	NC_007681	AGTA	2	8	14658	14665	50 %	25 %	25 %	0 %	84488843
42	NC_007681	ACTA	2	8	14932	14939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007681	ATAA	2	8	17555	17562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007681	TTTA	2	8	17616	17623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007681	CCAT	2	8	17711	17718	25 %	25 %	0 %	50 %	84488846
46	NC_007681	CTTT	2	8	18072	18079	0 %	75 %	0 %	25 %	84488846
47	NC_007681	TATT	2	8	18352	18359	25 %	75 %	0 %	0 %	84488846
48	NC_007681	TACT	2	8	18746	18753	25 %	50 %	0 %	25 %	84488847
49	NC_007681	TTAT	2	8	18847	18854	25 %	75 %	0 %	0 %	84488847
50	NC_007681	ATTT	2	8	19460	19467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007681	ATTT	2	8	19480	19487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007681	TATT	2	8	19592	19599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007681	TTTA	2	8	19771	19778	25 %	75 %	0 %	0 %	84488848
54	NC_007681	GATA	2	8	20015	20022	50 %	25 %	25 %	0 %	84488848
55	NC_007681	AATC	2	8	20195	20202	50 %	25 %	0 %	25 %	84488848
56	NC_007681	ACCA	2	8	20302	20309	50 %	0 %	0 %	50 %	84488848
57	NC_007681	AAAG	2	8	20327	20334	75 %	0 %	25 %	0 %	84488848
58	NC_007681	ATAC	2	8	20623	20630	50 %	25 %	0 %	25 %	84488848
59	NC_007681	AACA	2	8	20759	20766	75 %	0 %	0 %	25 %	84488848
60	NC_007681	AAAT	2	8	20892	20899	75 %	25 %	0 %	0 %	84488848
61	NC_007681	ATTT	2	8	21091	21098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007681	ATTA	2	8	21161	21168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007681	ATTA	2	8	21195	21202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007681	TAAA	2	8	21335	21342	75 %	25 %	0 %	0 %	84488849
65	NC_007681	ATTT	2	8	21548	21555	25 %	75 %	0 %	0 %	84488849
66	NC_007681	AGCT	2	8	21701	21708	25 %	25 %	25 %	25 %	84488849
67	NC_007681	AATT	2	8	21834	21841	50 %	50 %	0 %	0 %	84488849
68	NC_007681	ACAT	2	8	22285	22292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007681	ACAA	2	8	22380	22387	75 %	0 %	0 %	25 %	84488850
70	NC_007681	TACA	2	8	22979	22986	50 %	25 %	0 %	25 %	84488850
71	NC_007681	ATTA	2	8	23066	23073	50 %	50 %	0 %	0 %	84488850
72	NC_007681	TTCT	2	8	23190	23197	0 %	75 %	0 %	25 %	84488851
73	NC_007681	TAAA	2	8	24126	24133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007681	GCAA	2	8	24213	24220	50 %	0 %	25 %	25 %	84488852
75	NC_007681	TTAC	2	8	24430	24437	25 %	50 %	0 %	25 %	84488852
76	NC_007681	AACA	2	8	25792	25799	75 %	0 %	0 %	25 %	84488853
77	NC_007681	AAAC	2	8	25868	25875	75 %	0 %	0 %	25 %	84488853
78	NC_007681	CATA	2	8	26000	26007	50 %	25 %	0 %	25 %	84488853
79	NC_007681	TCAT	2	8	26331	26338	25 %	50 %	0 %	25 %	84488853
80	NC_007681	AAAT	2	8	27231	27238	75 %	25 %	0 %	0 %	84488854
81	NC_007681	ATTT	2	8	27595	27602	25 %	75 %	0 %	0 %	84488855
82	NC_007681	TGTT	2	8	28447	28454	0 %	75 %	25 %	0 %	84488856
83	NC_007681	ATCT	2	8	28587	28594	25 %	50 %	0 %	25 %	84488856
84	NC_007681	TTGT	2	8	28696	28703	0 %	75 %	25 %	0 %	84488856
85	NC_007681	ATAC	2	8	29281	29288	50 %	25 %	0 %	25 %	84488856
86	NC_007681	CATT	2	8	29477	29484	25 %	50 %	0 %	25 %	84488856
87	NC_007681	ATTA	2	8	29505	29512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007681	ATTT	2	8	29831	29838	25 %	75 %	0 %	0 %	84488858
89	NC_007681	TTAC	2	8	30866	30873	25 %	50 %	0 %	25 %	84488859
90	NC_007681	TGTT	2	8	30933	30940	0 %	75 %	25 %	0 %	84488859
91	NC_007681	TGTT	2	8	31032	31039	0 %	75 %	25 %	0 %	84488859
92	NC_007681	TGCA	2	8	31561	31568	25 %	25 %	25 %	25 %	84488859
93	NC_007681	CTAA	2	8	31586	31593	50 %	25 %	0 %	25 %	84488859
94	NC_007681	TTAA	2	8	31694	31701	50 %	50 %	0 %	0 %	84488859
95	NC_007681	ATTT	2	8	31743	31750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007681	CTTA	2	8	31836	31843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007681	TAAA	2	8	31875	31882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007681	GGTA	2	8	32037	32044	25 %	25 %	50 %	0 %	84488860
99	NC_007681	TAAA	2	8	32078	32085	75 %	25 %	0 %	0 %	84488860
100	NC_007681	AAAC	2	8	32321	32328	75 %	0 %	0 %	25 %	84488860
101	NC_007681	TAAA	2	8	33371	33378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007681	AACA	2	8	33654	33661	75 %	0 %	0 %	25 %	84488861
103	NC_007681	ATGT	2	8	34019	34026	25 %	50 %	25 %	0 %	84488861
104	NC_007681	ATCC	2	8	34879	34886	25 %	25 %	0 %	50 %	84488862
105	NC_007681	TAAA	2	8	35431	35438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007681	AAAT	2	8	35672	35679	75 %	25 %	0 %	0 %	84488863
107	NC_007681	TGAA	2	8	35689	35696	50 %	25 %	25 %	0 %	84488863
108	NC_007681	TTCA	2	8	35836	35843	25 %	50 %	0 %	25 %	84488863
109	NC_007681	ATGG	2	8	36375	36382	25 %	25 %	50 %	0 %	84488863
110	NC_007681	TGAT	2	8	36657	36664	25 %	50 %	25 %	0 %	84488864
111	NC_007681	ATAC	2	8	37008	37015	50 %	25 %	0 %	25 %	84488864
112	NC_007681	GTAT	2	8	37365	37372	25 %	50 %	25 %	0 %	84488864
113	NC_007681	GAAT	2	8	37485	37492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007681	TATT	2	8	38099	38106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007681	ATGA	2	8	38124	38131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007681	AAAT	2	8	38218	38225	75 %	25 %	0 %	0 %	84488866
117	NC_007681	AAGA	2	8	38237	38244	75 %	0 %	25 %	0 %	84488866
118	NC_007681	CAAG	2	8	38354	38361	50 %	0 %	25 %	25 %	84488866
119	NC_007681	ACAA	2	8	39065	39072	75 %	0 %	0 %	25 %	84488866
120	NC_007681	GAAA	2	8	39728	39735	75 %	0 %	25 %	0 %	84488866
121	NC_007681	ATAC	2	8	39828	39835	50 %	25 %	0 %	25 %	84488866
122	NC_007681	CAAT	2	8	39854	39861	50 %	25 %	0 %	25 %	84488866
123	NC_007681	TGTT	2	8	40416	40423	0 %	75 %	25 %	0 %	84488867
124	NC_007681	GGTA	2	8	40523	40530	25 %	25 %	50 %	0 %	84488867
125	NC_007681	GAAT	2	8	40729	40736	50 %	25 %	25 %	0 %	84488867
126	NC_007681	TATT	2	8	41003	41010	25 %	75 %	0 %	0 %	84488867
127	NC_007681	TTGG	2	8	41110	41117	0 %	50 %	50 %	0 %	84488867
128	NC_007681	ATTT	2	8	41366	41373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007681	TAAA	2	8	41463	41470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007681	TAAA	2	8	42108	42115	75 %	25 %	0 %	0 %	84488868
131	NC_007681	ATTA	2	8	42397	42404	50 %	50 %	0 %	0 %	84488869
132	NC_007681	TATT	2	8	42423	42430	25 %	75 %	0 %	0 %	84488869
133	NC_007681	CTTT	2	8	42509	42516	0 %	75 %	0 %	25 %	84488869
134	NC_007681	AAAT	2	8	42628	42635	75 %	25 %	0 %	0 %	84488869
135	NC_007681	TAAT	2	8	44306	44313	50 %	50 %	0 %	0 %	84488872
136	NC_007681	GATT	2	8	44438	44445	25 %	50 %	25 %	0 %	84488872
137	NC_007681	GAAA	2	8	44506	44513	75 %	0 %	25 %	0 %	84488872
138	NC_007681	ATGA	2	8	44659	44666	50 %	25 %	25 %	0 %	84488872
139	NC_007681	TTTA	2	8	45239	45246	25 %	75 %	0 %	0 %	84488873
140	NC_007681	CTGT	2	8	45259	45266	0 %	50 %	25 %	25 %	84488873
141	NC_007681	TAAA	2	8	45787	45794	75 %	25 %	0 %	0 %	84488873
142	NC_007681	TGTA	2	8	45892	45899	25 %	50 %	25 %	0 %	84488873
143	NC_007681	GTAA	2	8	46170	46177	50 %	25 %	25 %	0 %	84488873
144	NC_007681	TAAA	2	8	47167	47174	75 %	25 %	0 %	0 %	84488873
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