MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Moorella thermoacetica ATCC 39073 chromosome

Total Repeats: 1843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007644	CTGGC	2	10	471	480	0 %	20 %	40 %	40 %	83588876
2	NC_007644	CCCTG	2	10	518	527	0 %	20 %	20 %	60 %	83588876
3	NC_007644	CCTTC	2	10	1725	1734	0 %	40 %	0 %	60 %	83588876
4	NC_007644	CGGCC	2	10	3612	3621	0 %	0 %	40 %	60 %	83588879
5	NC_007644	GGGAA	2	10	4296	4305	40 %	0 %	60 %	0 %	83588879
6	NC_007644	GACCG	2	10	7752	7761	20 %	0 %	40 %	40 %	83588882
7	NC_007644	AAGAT	2	10	10814	10823	60 %	20 %	20 %	0 %	83588884
8	NC_007644	GCGTG	2	10	11987	11996	0 %	20 %	60 %	20 %	83588885
9	NC_007644	CGTAT	2	10	13565	13574	20 %	40 %	20 %	20 %	83588887
10	NC_007644	GGTTG	2	10	14120	14129	0 %	40 %	60 %	0 %	83588887
11	NC_007644	AAATA	2	10	14533	14542	80 %	20 %	0 %	0 %	83588887
12	NC_007644	GGTAT	2	10	14740	14749	20 %	40 %	40 %	0 %	83588888
13	NC_007644	CTTTC	2	10	17922	17931	0 %	60 %	0 %	40 %	83588892
14	NC_007644	TTTAT	2	10	18842	18851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007644	CGTAA	2	10	20102	20111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007644	AGTCA	2	10	20162	20171	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007644	GAAAA	2	10	20695	20704	80 %	0 %	20 %	0 %	83588894
18	NC_007644	CCGGC	2	10	23082	23091	0 %	0 %	40 %	60 %	83588895
19	NC_007644	CTCGA	2	10	27105	27114	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007644	AGTAT	2	10	27168	27177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007644	CCTGG	2	10	27492	27501	0 %	20 %	40 %	40 %	83588900
22	NC_007644	GACCT	2	10	28782	28791	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_007644	GGCCG	2	10	30481	30490	0 %	0 %	60 %	40 %	83588901
24	NC_007644	ACAGG	2	10	32722	32731	40 %	0 %	40 %	20 %	83588906
25	NC_007644	ACCTG	2	10	33746	33755	20 %	20 %	20 %	40 %	83588907
26	NC_007644	AAACC	2	10	34500	34509	60 %	0 %	0 %	40 %	83588908
27	NC_007644	CGCCC	2	10	34966	34975	0 %	0 %	20 %	80 %	83588908
28	NC_007644	AGTCC	2	10	35279	35288	20 %	20 %	20 %	40 %	83588909
29	NC_007644	CGGCG	2	10	35492	35501	0 %	0 %	60 %	40 %	83588909
30	NC_007644	AAAAT	2	10	36231	36240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007644	TTCCT	2	10	38584	38593	0 %	60 %	0 %	40 %	83588911
32	NC_007644	CAGCG	2	10	39694	39703	20 %	0 %	40 %	40 %	83588912
33	NC_007644	TAAAG	2	10	40164	40173	60 %	20 %	20 %	0 %	83588912
34	NC_007644	CCTGG	2	10	41822	41831	0 %	20 %	40 %	40 %	83588914
35	NC_007644	GCGCC	2	10	42682	42691	0 %	0 %	40 %	60 %	83588914
36	NC_007644	AGCGG	2	10	43402	43411	20 %	0 %	60 %	20 %	83588915
37	NC_007644	CTTAT	2	10	44330	44339	20 %	60 %	0 %	20 %	83588916
38	NC_007644	CCGGG	2	10	46358	46367	0 %	0 %	60 %	40 %	83588919
39	NC_007644	TAATA	2	10	47322	47331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007644	GCCGG	2	10	49847	49856	0 %	0 %	60 %	40 %	83588922
41	NC_007644	CAACG	2	10	49967	49976	40 %	0 %	20 %	40 %	83588922
42	NC_007644	CAGGC	2	10	50467	50476	20 %	0 %	40 %	40 %	83588923
43	NC_007644	CCAGC	2	10	50970	50979	20 %	0 %	20 %	60 %	83588923
44	NC_007644	CCGGG	2	10	51027	51036	0 %	0 %	60 %	40 %	83588923
45	NC_007644	GATCA	2	10	55995	56004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007644	CGGCC	2	10	56616	56625	0 %	0 %	40 %	60 %	83588929
47	NC_007644	CCGCC	2	10	57387	57396	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_007644	GGGGT	2	10	57411	57420	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007644	CCGGG	2	10	57503	57512	0 %	0 %	60 %	40 %	83588931
50	NC_007644	CCGGC	2	10	58134	58143	0 %	0 %	40 %	60 %	83588931
51	NC_007644	CCGGG	2	10	59399	59408	0 %	0 %	60 %	40 %	83588933
52	NC_007644	GCCCG	2	10	60744	60753	0 %	0 %	40 %	60 %	83588934
53	NC_007644	TGTGG	2	10	62422	62431	0 %	40 %	60 %	0 %	83588936
54	NC_007644	CTGGC	2	10	63380	63389	0 %	20 %	40 %	40 %	83588937
55	NC_007644	CGGCC	2	10	66950	66959	0 %	0 %	40 %	60 %	83588938
56	NC_007644	GGCGG	2	10	68092	68101	0 %	0 %	80 %	20 %	83588939
57	NC_007644	CCTCC	2	10	72979	72988	0 %	20 %	0 %	80 %	83588945
58	NC_007644	GCCTG	2	10	75643	75652	0 %	20 %	40 %	40 %	83588948
59	NC_007644	CCAGC	2	10	78793	78802	20 %	0 %	20 %	60 %	83588951
60	NC_007644	GGGCG	2	10	78907	78916	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007644	AATAT	2	10	80189	80198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007644	CTGGC	2	10	81306	81315	0 %	20 %	40 %	40 %	83588954
63	NC_007644	TTCGG	2	10	83189	83198	0 %	40 %	40 %	20 %	83588954
64	NC_007644	TTCCT	2	10	85542	85551	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_007644	CCCGG	2	10	86027	86036	0 %	0 %	40 %	60 %	83588957
66	NC_007644	AAACC	2	10	87918	87927	60 %	0 %	0 %	40 %	83588960
67	NC_007644	CGGGC	2	10	88457	88466	0 %	0 %	60 %	40 %	83588960
68	NC_007644	CCTCA	2	10	88754	88763	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_007644	CGGGG	2	10	89099	89108	0 %	0 %	80 %	20 %	83588962
70	NC_007644	CCTGG	2	10	89447	89456	0 %	20 %	40 %	40 %	83588962
71	NC_007644	CGGCC	2	10	92395	92404	0 %	0 %	40 %	60 %	83588968
72	NC_007644	CCGGC	2	10	92510	92519	0 %	0 %	40 %	60 %	83588968
73	NC_007644	CCCGG	2	10	93025	93034	0 %	0 %	40 %	60 %	83588968
74	NC_007644	ACCTG	2	10	93144	93153	20 %	20 %	20 %	40 %	83588968
75	NC_007644	GGCCC	2	10	94957	94966	0 %	0 %	40 %	60 %	83588970
76	NC_007644	GCCTG	2	10	100040	100049	0 %	20 %	40 %	40 %	83588976
77	NC_007644	ATGAC	2	10	101759	101768	40 %	20 %	20 %	20 %	83588976
78	NC_007644	GGCCG	2	10	102812	102821	0 %	0 %	60 %	40 %	83588977
79	NC_007644	TGGCC	2	10	103203	103212	0 %	20 %	40 %	40 %	83588977
80	NC_007644	GGGGC	2	10	103346	103355	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007644	CTTTA	2	10	105701	105710	20 %	60 %	0 %	20 %	83588979
82	NC_007644	CTCTC	2	10	106167	106176	0 %	40 %	0 %	60 %	83588980
83	NC_007644	GGACG	2	10	106452	106461	20 %	0 %	60 %	20 %	83588981
84	NC_007644	ATGAC	2	10	108469	108478	40 %	20 %	20 %	20 %	83588982
85	NC_007644	GGTAA	2	10	110129	110138	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007644	TTAAA	2	10	115645	115654	60 %	40 %	0 %	0 %	83588990
87	NC_007644	CCGCC	2	10	115866	115875	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
88	NC_007644	TATCC	2	10	117826	117835	20 %	40 %	0 %	40 %	83588993
89	NC_007644	TCCTA	2	10	118703	118712	20 %	40 %	0 %	40 %	83588994
90	NC_007644	GCCGG	2	10	119059	119068	0 %	0 %	60 %	40 %	83588994
91	NC_007644	CTTTT	2	10	121555	121564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007644	GCCTG	2	10	121608	121617	0 %	20 %	40 %	40 %	83588997
93	NC_007644	GCCGG	2	10	122416	122425	0 %	0 %	60 %	40 %	83588998
94	NC_007644	GTCCA	2	10	127394	127403	20 %	20 %	20 %	40 %	83589006
95	NC_007644	GGTTC	2	10	127607	127616	0 %	40 %	40 %	20 %	83589006
96	NC_007644	TGGCT	2	10	130263	130272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007644	AATAA	2	10	130849	130858	80 %	20 %	0 %	0 %	83589008
98	NC_007644	GCCCT	2	10	131606	131615	0 %	20 %	20 %	60 %	83589009
99	NC_007644	CAGGA	2	10	132191	132200	40 %	0 %	40 %	20 %	83589010
100	NC_007644	TTAAA	2	10	134923	134932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007644	CTGCC	2	10	135959	135968	0 %	20 %	20 %	60 %	83589012
102	NC_007644	CCCGG	2	10	136133	136142	0 %	0 %	40 %	60 %	83589012
103	NC_007644	GGAAG	2	10	136630	136639	40 %	0 %	60 %	0 %	83589012
104	NC_007644	GATCT	2	10	137511	137520	20 %	40 %	20 %	20 %	83589013
105	NC_007644	GCCTG	2	10	137582	137591	0 %	20 %	40 %	40 %	83589013
106	NC_007644	CGGCC	2	10	137919	137928	0 %	0 %	40 %	60 %	83589014
107	NC_007644	AATAA	2	10	138070	138079	80 %	20 %	0 %	0 %	83589014
108	NC_007644	CAATA	2	10	139319	139328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007644	CTGGG	2	10	141942	141951	0 %	20 %	60 %	20 %	83589019
110	NC_007644	CGGCG	2	10	142001	142010	0 %	0 %	60 %	40 %	83589019
111	NC_007644	TCCGC	2	10	144401	144410	0 %	20 %	20 %	60 %	83589022
112	NC_007644	ATGGC	2	10	146505	146514	20 %	20 %	40 %	20 %	83589024
113	NC_007644	ATAAA	2	10	147840	147849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007644	AGGAG	2	10	148667	148676	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007644	TCGTG	2	10	149080	149089	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007644	GGGAG	2	10	150531	150540	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007644	AGGCC	2	10	154480	154489	20 %	0 %	40 %	40 %	83589026
118	NC_007644	CAGGT	2	10	155883	155892	20 %	20 %	40 %	20 %	83589026
119	NC_007644	GGAGA	2	10	156351	156360	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007644	CCGGG	2	10	158159	158168	0 %	0 %	60 %	40 %	83589029
121	NC_007644	CCCGG	2	10	158852	158861	0 %	0 %	40 %	60 %	83589029
122	NC_007644	AGGCC	2	10	159334	159343	20 %	0 %	40 %	40 %	83589030
123	NC_007644	GTTTC	2	10	159380	159389	0 %	60 %	20 %	20 %	83589030
124	NC_007644	GGGCG	2	10	159646	159655	0 %	0 %	80 %	20 %	83589030
125	NC_007644	TGCCC	2	10	160599	160608	0 %	20 %	20 %	60 %	83589031
126	NC_007644	GCCGG	2	10	161065	161074	0 %	0 %	60 %	40 %	83589032
127	NC_007644	GAAGA	2	10	163741	163750	60 %	0 %	40 %	0 %	83589034
128	NC_007644	GCGCC	2	10	163980	163989	0 %	0 %	40 %	60 %	83589034
129	NC_007644	GCGCC	2	10	164709	164718	0 %	0 %	40 %	60 %	83589034
130	NC_007644	GCTGG	2	10	165467	165476	0 %	20 %	60 %	20 %	83589035
131	NC_007644	TAATT	2	10	168315	168324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007644	ATAAA	2	10	168376	168385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007644	TAAAA	2	10	171494	171503	80 %	20 %	0 %	0 %	83589041
134	NC_007644	ATTCC	2	10	172797	172806	20 %	40 %	0 %	40 %	83589043
135	NC_007644	AATTA	2	10	173672	173681	60 %	40 %	0 %	0 %	83589043
136	NC_007644	TAAAA	2	10	174496	174505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007644	TGCTT	2	10	177959	177968	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007644	TAATT	2	10	178128	178137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007644	TAAAA	2	10	178190	178199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007644	ATCCG	2	10	183159	183168	20 %	20 %	20 %	40 %	83589057
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142	NC_007644	AAGGG	2	10	184590	184599	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_007644	GGGTA	2	10	354510	354519	20 %	20 %	60 %	0 %	83589216
255	NC_007644	GGGAA	2	10	355117	355126	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_007644	CGAGC	2	10	368789	368798	20 %	0 %	40 %	40 %	83589233
262	NC_007644	GAAAA	2	10	369287	369296	80 %	0 %	20 %	0 %	83589233
263	NC_007644	GGAAA	2	10	369358	369367	60 %	0 %	40 %	0 %	83589233
264	NC_007644	AAACA	2	10	370131	370140	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_007644	CTGCG	2	10	373437	373446	0 %	20 %	40 %	40 %	83589236
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269	NC_007644	CCTGG	2	10	374256	374265	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
270	NC_007644	CCGGG	2	10	374915	374924	0 %	0 %	60 %	40 %	83589238
271	NC_007644	AAATG	2	10	378732	378741	60 %	20 %	20 %	0 %	83589242
272	NC_007644	AGGAC	2	10	378984	378993	40 %	0 %	40 %	20 %	83589242
273	NC_007644	AAAGC	2	10	379406	379415	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
274	NC_007644	AAATA	2	10	379586	379595	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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