MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7448 chromosome

Total Repeats: 628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007332	AAAATA	2	12	1592	1603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080343
2	NC_007332	ATTTTG	2	12	5879	5890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080347
3	NC_007332	TAAAAA	2	12	6427	6438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080348
4	NC_007332	TCATTT	2	12	6467	6478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72080348
5	NC_007332	AATTTA	2	12	6591	6602	50 %	50 %	0 %	0 %	72080348
6	NC_007332	TAATTT	2	12	7974	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007332	GAAAAT	2	12	11551	11562	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	72080352
8	NC_007332	AATCAA	2	12	14545	14556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	72080354
9	NC_007332	ATTAAC	2	12	15031	15042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72080356
10	NC_007332	TAATTT	2	12	16007	16018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080357
11	NC_007332	CTTTTT	2	12	17450	17461	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	72080359
12	NC_007332	CAAAAA	2	12	19057	19068	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080361
13	NC_007332	ATTGAA	2	12	22688	22699	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72080362
14	NC_007332	ATTTCA	2	12	22955	22966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72080362
15	NC_007332	AATAAG	2	12	24640	24651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	72080363
16	NC_007332	TTTCAT	2	12	24835	24846	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72080363
17	NC_007332	TTTTCA	2	12	25620	25631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	72080363
18	NC_007332	TTAGTT	2	12	30137	30148	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080366
19	NC_007332	TTTTAA	2	12	30500	30511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080366
20	NC_007332	AATAAA	2	12	30873	30884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080366
21	NC_007332	AAGAAA	2	12	32614	32625	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007332	TTGGGT	2	12	33994	34005	0 %	50 %	50 %	0 %	72080370
23	NC_007332	TGGTTT	2	12	34638	34649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080370
24	NC_007332	TTGAAA	2	12	35367	35378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72080371
25	NC_007332	ATTAAA	2	12	37558	37569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080373
26	NC_007332	TGCAAT	2	12	38290	38301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080374
27	NC_007332	ATCAAT	2	12	40554	40565	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72080375
28	NC_007332	TTTTTG	2	12	41406	41417	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72080375
29	NC_007332	GTTCGA	2	12	42140	42151	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	72080375
30	NC_007332	TTATTT	2	12	42332	42343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080375
31	NC_007332	TTAAAA	2	12	43449	43460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080376
32	NC_007332	TGAAGT	2	12	45360	45371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080377
33	NC_007332	ATAAAA	2	12	47260	47271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080378
34	NC_007332	TTTTAA	2	12	49227	49238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080379
35	NC_007332	AATAAA	2	12	51817	51828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	72080380
36	NC_007332	TTTTGT	2	12	52952	52963	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72080381
37	NC_007332	AATTTT	2	12	53713	53724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080382
38	NC_007332	TGAATT	2	12	55558	55569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72080383
39	NC_007332	ATATTG	2	12	57741	57752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72080387
40	NC_007332	ATGATT	2	12	58665	58676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72080387
41	NC_007332	TATAAA	2	12	59273	59284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080388
42	NC_007332	CAAAAA	2	12	59292	59303	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080388
43	NC_007332	TAATTT	2	12	59860	59871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080389
44	NC_007332	TAATTT	2	12	60354	60365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080390
45	NC_007332	AAAATT	2	12	60386	60397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007332	TAAATC	2	12	60434	60445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	72080391
47	NC_007332	ATGTTT	2	12	60482	60493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080391
48	NC_007332	CAGTGA	2	12	65444	65455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007332	GGTATT	2	12	65820	65831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	72080396
50	NC_007332	AGCAAC	2	12	67816	67827	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	72080398
51	NC_007332	GTCGAA	2	12	69612	69623	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	72080399
52	NC_007332	AATTTT	2	12	70604	70615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080400
53	NC_007332	TGTTTT	2	12	70793	70804	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72080400
54	NC_007332	GAACAA	2	12	78305	78316	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	72080406
55	NC_007332	TTAATT	2	12	79482	79493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080406
56	NC_007332	TAAAAT	2	12	80121	80132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080406
57	NC_007332	AACAAA	2	12	81628	81639	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080406
58	NC_007332	AATCAC	2	12	82380	82391	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	72080406
59	NC_007332	CTAATT	2	12	86901	86912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72080408
60	NC_007332	TTGAAC	2	12	88641	88652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080409
61	NC_007332	AATTAA	2	12	89502	89513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080409
62	NC_007332	ATCTGA	2	12	89578	89589	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080409
63	NC_007332	TGGTTT	2	12	90169	90180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080410
64	NC_007332	CAAAAT	2	12	91278	91289	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	72080411
65	NC_007332	TTGGTT	2	12	94601	94612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080415
66	NC_007332	GCCCAC	2	12	97316	97327	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	72080417
67	NC_007332	TGCAAG	2	12	98178	98189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	72080417
68	NC_007332	GGAATT	2	12	98224	98235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080417
69	NC_007332	CAAAAA	2	12	100036	100047	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080420
70	NC_007332	TTTTGC	2	12	101730	101741	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	72080423
71	NC_007332	CATATG	2	12	101780	101791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080423
72	NC_007332	TTGGTT	2	12	102047	102058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080423
73	NC_007332	TTAGGA	2	12	102292	102303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080423
74	NC_007332	TTCAGG	2	12	104709	104720	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	72080425
75	NC_007332	AATTTT	2	12	105108	105119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080425
76	NC_007332	ATTTTA	2	12	105301	105312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080425
77	NC_007332	ATATTT	2	12	107450	107461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161611231
78	NC_007332	TAGTAA	2	12	111764	111775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72080429
79	NC_007332	AATTTC	2	12	112091	112102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72080429
80	NC_007332	AATTTA	2	12	112697	112708	50 %	50 %	0 %	0 %	72080430
81	NC_007332	TTTTAA	2	12	114848	114859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007332	CAAGAA	2	12	115308	115319	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007332	TAAATT	2	12	116510	116521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007332	TCCAGA	2	12	117626	117637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	72080433
85	NC_007332	ATTTTT	2	12	119946	119957	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080434
86	NC_007332	ACAAAA	2	12	120625	120636	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	72080434
87	NC_007332	AATTTT	2	12	121014	121025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080434
88	NC_007332	TCATAA	2	12	122152	122163	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007332	ATTTTT	2	12	122662	122673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007332	TAATTT	2	12	125188	125199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007332	AAGGAA	2	12	130413	130424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080441
92	NC_007332	ACCAGA	2	12	130802	130813	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	72080441
93	NC_007332	AGTTCA	2	12	134983	134994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080443
94	NC_007332	ATAATT	2	12	135157	135168	50 %	50 %	0 %	0 %	72080443
95	NC_007332	TATAAT	2	12	138243	138254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007332	TCTTTA	2	12	139073	139084	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007332	CTTGAT	2	12	139566	139577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007332	TGACTT	2	12	139928	139939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007332	GCAATT	2	12	142367	142378	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080446
100	NC_007332	AGGCAA	2	12	142519	142530	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007332	ATAATT	2	12	147081	147092	50 %	50 %	0 %	0 %	72080448
102	NC_007332	TTTTAA	2	12	147678	147689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080448
103	NC_007332	TTTTTC	2	12	149213	149224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	72080449
104	NC_007332	TTTAAA	2	12	150971	150982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007332	TTTTAT	2	12	151837	151848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	72080450
106	NC_007332	CATATT	2	12	152946	152957	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007332	TTTAAA	2	12	153161	153172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007332	TTTAAT	2	12	154563	154574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007332	ATTTAA	2	12	155937	155948	50 %	50 %	0 %	0 %	72080452
110	NC_007332	ATTGCA	2	12	156825	156836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080453
111	NC_007332	TATCGT	2	12	157505	157516	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72080453
112	NC_007332	AATGTT	2	12	158749	158760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	72080455
113	NC_007332	TGGAGT	2	12	159665	159676	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	72080456
114	NC_007332	TAAAAA	2	12	161211	161222	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007332	TATAAT	2	12	161252	161263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007332	AGATCA	2	12	161537	161548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72080457
117	NC_007332	AAAAAC	2	12	163468	163479	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007332	TAAAAA	2	12	163579	163590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007332	TATAAT	2	12	163619	163630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007332	AGATCA	2	12	163904	163915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	72080460
121	NC_007332	TAATTT	4	24	166930	166953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007332	GAATCT	2	12	168220	168231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72080466
123	NC_007332	TTTTTG	2	12	168375	168386	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	72080466
124	NC_007332	AAATTT	2	12	168875	168886	50 %	50 %	0 %	0 %	72080467
125	NC_007332	TTTTGA	2	12	176661	176672	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	72080476
126	NC_007332	AAAGAA	2	12	177400	177411	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	72080476
127	NC_007332	ATTTTT	2	12	177623	177634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007332	TTGACT	2	12	179151	179162	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72080477
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140	NC_007332	TTATTT	2	12	189332	189343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007332	ACTTTA	2	12	189903	189914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	72080488
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145	NC_007332	TATTTG	2	12	194922	194933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007332	AGTTCT	2	12	199106	199117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	72080499
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163	NC_007332	TTTAAT	2	12	231777	231788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080541
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170	NC_007332	ATTTTT	2	12	242953	242964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_007332	ATTTTT	2	12	243077	243088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_007332	TAAATA	2	12	243241	243252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_007332	AAATTT	2	12	262733	262744	50 %	50 %	0 %	0 %	72080560
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223	NC_007332	AAAATC	2	12	311431	311442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	72080595
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229	NC_007332	TTATAA	2	12	324333	324344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_007332	AACTTC	2	12	325045	325056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080609
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232	NC_007332	AATTGA	2	12	328048	328059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	72080610
233	NC_007332	TATTTT	2	12	328610	328621	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_007332	AAAATT	2	12	330105	330116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080611
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238	NC_007332	TTTATT	2	12	332044	332055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_007332	AGGAAT	2	12	332821	332832	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	72080612
240	NC_007332	ATGAAA	2	12	335112	335123	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
241	NC_007332	TCAACT	2	12	342854	342865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080622
242	NC_007332	AATTTT	2	12	346187	346198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_007332	AATTTA	2	12	347685	347696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_007332	AAATCT	2	12	531204	531215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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488	NC_007332	ATATTT	2	12	704150	704161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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