MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 7448 chromosome

Total Repeats: 11559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007332	TTA	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007332	TGT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007332	TAC	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007332	AAT	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
5	NC_007332	CAA	2	6	255	260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080343
6	NC_007332	TTA	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080343
7	NC_007332	TGT	2	6	286	291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080343
8	NC_007332	AAC	2	6	294	299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080343
9	NC_007332	ATT	2	6	342	347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080343
10	NC_007332	AAT	2	6	462	467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
11	NC_007332	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080343
12	NC_007332	AGA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080343
13	NC_007332	TTC	2	6	770	775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080343
14	NC_007332	TGA	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080343
15	NC_007332	TTG	2	6	892	897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080343
16	NC_007332	ATA	2	6	942	947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
17	NC_007332	CTT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080343
18	NC_007332	TGG	2	6	974	979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72080343
19	NC_007332	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080343
20	NC_007332	GAA	2	6	1083	1088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080343
21	NC_007332	ATG	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080343
22	NC_007332	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080343
23	NC_007332	ATA	2	6	1438	1443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
24	NC_007332	AAC	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080343
25	NC_007332	AGA	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080343
26	NC_007332	AAT	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080343
27	NC_007332	CAA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080343
28	NC_007332	TTA	2	6	1675	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007332	TAT	2	6	1685	1690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007332	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007332	ATA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080344
32	NC_007332	AAG	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080344
33	NC_007332	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080344
34	NC_007332	CAA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080344
35	NC_007332	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080344
36	NC_007332	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080344
37	NC_007332	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080344
38	NC_007332	TTC	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080344
39	NC_007332	CAA	3	9	2176	2184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080344
40	NC_007332	CAA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080344
41	NC_007332	ACA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080344
42	NC_007332	TTA	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080344
43	NC_007332	TTG	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080345
44	NC_007332	GGC	2	6	3037	3042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72080345
45	NC_007332	ATT	2	6	3069	3074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080345
46	NC_007332	GTT	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080345
47	NC_007332	TAA	2	6	3098	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080345
48	NC_007332	TGG	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72080345
49	NC_007332	GGA	2	6	3196	3201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72080345
50	NC_007332	ATT	2	6	3451	3456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080345
51	NC_007332	ACA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080345
52	NC_007332	TTC	2	6	3485	3490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080345
53	NC_007332	CAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080345
54	NC_007332	AAT	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080345
55	NC_007332	CTT	2	6	3617	3622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080345
56	NC_007332	ACA	2	6	3733	3738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080345
57	NC_007332	CCA	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72080345
58	NC_007332	ATG	2	6	4028	4033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080345
59	NC_007332	GAA	2	6	4126	4131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080345
60	NC_007332	ATG	2	6	4211	4216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080345
61	NC_007332	TGA	2	6	4236	4241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080345
62	NC_007332	GAT	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080345
63	NC_007332	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080345
64	NC_007332	GTG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72080345
65	NC_007332	CTG	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72080345
66	NC_007332	AAT	2	6	4853	4858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080346
67	NC_007332	TAA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080346
68	NC_007332	TGA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080346
69	NC_007332	ACC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72080346
70	NC_007332	ATA	2	6	5363	5368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080347
71	NC_007332	TCA	2	6	5379	5384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080347
72	NC_007332	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080347
73	NC_007332	CTG	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72080347
74	NC_007332	GCT	2	6	5713	5718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72080347
75	NC_007332	GAT	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080347
76	NC_007332	CTA	2	6	5737	5742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080347
77	NC_007332	GAA	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080347
78	NC_007332	CAA	2	6	5831	5836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080347
79	NC_007332	TGC	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72080347
80	NC_007332	AAG	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080347
81	NC_007332	TAA	2	6	6150	6155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080347
82	NC_007332	GCA	2	6	6193	6198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72080347
83	NC_007332	TTG	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080348
84	NC_007332	ACC	2	6	6621	6626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72080348
85	NC_007332	GAT	2	6	6638	6643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080348
86	NC_007332	ATT	2	6	6835	6840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080348
87	NC_007332	ATT	2	6	7178	7183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080348
88	NC_007332	TGG	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72080349
89	NC_007332	ATT	2	6	7411	7416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080349
90	NC_007332	TTG	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080349
91	NC_007332	AGA	2	6	7679	7684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080349
92	NC_007332	TGA	2	6	7724	7729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080349
93	NC_007332	GAT	2	6	7759	7764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080349
94	NC_007332	TAA	2	6	7816	7821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080349
95	NC_007332	TGA	3	9	7901	7909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080349
96	NC_007332	ATT	2	6	7944	7949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007332	TAA	2	6	7992	7997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007332	TGA	2	6	8173	8178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080350
99	NC_007332	GAA	2	6	8189	8194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080350
100	NC_007332	AGA	2	6	8197	8202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080350
101	NC_007332	TAA	2	6	8208	8213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080350
102	NC_007332	AAT	2	6	8245	8250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080350
103	NC_007332	AAT	2	6	8288	8293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080350
104	NC_007332	AAT	2	6	8311	8316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080350
105	NC_007332	ACT	2	6	8432	8437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080350
106	NC_007332	GCT	2	6	8495	8500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72080350
107	NC_007332	AAT	2	6	8681	8686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080350
108	NC_007332	CAA	2	6	8778	8783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080350
109	NC_007332	AGG	2	6	8875	8880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72080350
110	NC_007332	AAG	2	6	8997	9002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080350
111	NC_007332	TGG	2	6	9221	9226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72080351
112	NC_007332	ATA	2	6	9271	9276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080351
113	NC_007332	ATT	2	6	9336	9341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080351
114	NC_007332	TCA	2	6	9391	9396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080351
115	NC_007332	ATT	2	6	9492	9497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080351
116	NC_007332	GAA	2	6	9891	9896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080351
117	NC_007332	ATT	2	6	9915	9920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080351
118	NC_007332	AAC	2	6	10010	10015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080351
119	NC_007332	TAA	2	6	10016	10021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080351
120	NC_007332	GAT	2	6	10143	10148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080351
121	NC_007332	CAA	3	9	10252	10260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080351
122	NC_007332	TTG	2	6	10264	10269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080351
123	NC_007332	AGA	2	6	10310	10315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080351
124	NC_007332	GAT	2	6	10325	10330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72080351
125	NC_007332	TTC	2	6	10354	10359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72080351
126	NC_007332	GAA	2	6	10515	10520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080351
127	NC_007332	ATT	2	6	10602	10607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080351
128	NC_007332	ATT	2	6	10710	10715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080351
129	NC_007332	ATT	2	6	10722	10727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080351
130	NC_007332	TAA	2	6	10730	10735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080351
131	NC_007332	CAA	2	6	10782	10787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72080351
132	NC_007332	ATA	2	6	10861	10866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080351
133	NC_007332	TGC	2	6	10952	10957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72080351
134	NC_007332	GAA	2	6	10998	11003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72080351
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264	NC_007332	ATC	2	6	22375	22380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080362
265	NC_007332	TTA	2	6	22428	22433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080362
266	NC_007332	ATA	2	6	22445	22450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	72080362
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268	NC_007332	TCA	2	6	22529	22534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72080362
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272	NC_007332	TTG	2	6	22872	22877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72080362
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274	NC_007332	ATT	2	6	22988	22993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72080362
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