MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007295	AAACA	2	10	151	160	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007295	CTTTT	2	10	841	850	0 %	80 %	0 %	20 %	71893360
3	NC_007295	ATTAA	2	10	1023	1032	60 %	40 %	0 %	0 %	71893360
4	NC_007295	ATTCG	2	10	1150	1159	20 %	40 %	20 %	20 %	71893360
5	NC_007295	ATATA	2	10	1715	1724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007295	AATTA	2	10	2117	2126	60 %	40 %	0 %	0 %	71893361
7	NC_007295	TTCGA	2	10	2704	2713	20 %	40 %	20 %	20 %	71893361
8	NC_007295	TATAA	2	10	3664	3673	60 %	40 %	0 %	0 %	71893362
9	NC_007295	TTGAA	2	10	4046	4055	40 %	40 %	20 %	0 %	71893362
10	NC_007295	CAAAG	2	10	4392	4401	60 %	0 %	20 %	20 %	71893362
11	NC_007295	GAAAA	2	10	5316	5325	80 %	0 %	20 %	0 %	71893364
12	NC_007295	AAATT	2	10	5893	5902	60 %	40 %	0 %	0 %	71893364
13	NC_007295	AGAAC	2	10	5917	5926	60 %	0 %	20 %	20 %	71893364
14	NC_007295	CAGAC	2	10	6364	6373	40 %	0 %	20 %	40 %	71893365
15	NC_007295	AATTT	2	10	6407	6416	40 %	60 %	0 %	0 %	71893365
16	NC_007295	GTTGA	2	10	6660	6669	20 %	40 %	40 %	0 %	71893365
17	NC_007295	CAATA	2	10	7607	7616	60 %	20 %	0 %	20 %	71893366
18	NC_007295	TTGTT	2	10	7765	7774	0 %	80 %	20 %	0 %	71893366
19	NC_007295	AATAA	2	10	9094	9103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007295	ATTTT	2	10	11117	11126	20 %	80 %	0 %	0 %	71893368
21	NC_007295	CTTAA	2	10	11383	11392	40 %	40 %	0 %	20 %	71893369
22	NC_007295	CAAGA	2	10	11804	11813	60 %	0 %	20 %	20 %	71893369
23	NC_007295	AAGAT	2	10	12574	12583	60 %	20 %	20 %	0 %	71893370
24	NC_007295	TTATT	2	10	14217	14226	20 %	80 %	0 %	0 %	71893371
25	NC_007295	AGATC	2	10	14873	14882	40 %	20 %	20 %	20 %	71893372
26	NC_007295	AAAAG	2	10	15994	16003	80 %	0 %	20 %	0 %	71893374
27	NC_007295	TTGAG	2	10	19231	19240	20 %	40 %	40 %	0 %	71893377
28	NC_007295	AATTA	2	10	19931	19940	60 %	40 %	0 %	0 %	71893377
29	NC_007295	TTATT	2	10	19984	19993	20 %	80 %	0 %	0 %	71893377
30	NC_007295	AATTA	2	10	20153	20162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007295	TAAAA	2	10	22056	22065	80 %	20 %	0 %	0 %	71893378
32	NC_007295	AATTA	2	10	22365	22374	60 %	40 %	0 %	0 %	71893378
33	NC_007295	AATTA	2	10	22510	22519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007295	AATTA	2	10	23551	23560	60 %	40 %	0 %	0 %	71893379
35	NC_007295	AGTGA	2	10	24071	24080	40 %	20 %	40 %	0 %	71893379
36	NC_007295	GTTTT	2	10	24374	24383	0 %	80 %	20 %	0 %	71893379
37	NC_007295	TAAAA	2	10	24457	24466	80 %	20 %	0 %	0 %	71893379
38	NC_007295	AATTA	2	10	24766	24775	60 %	40 %	0 %	0 %	71893379
39	NC_007295	TCCCA	2	10	24790	24799	20 %	20 %	0 %	60 %	71893379
40	NC_007295	TATTT	2	10	25218	25227	20 %	80 %	0 %	0 %	71893380
41	NC_007295	CAGAG	2	10	25523	25532	40 %	0 %	40 %	20 %	71893380
42	NC_007295	ACAAA	2	10	27336	27345	80 %	0 %	0 %	20 %	71893383
43	NC_007295	CGATT	2	10	27421	27430	20 %	40 %	20 %	20 %	71893383
44	NC_007295	TTTAA	2	10	29478	29487	40 %	60 %	0 %	0 %	71893384
45	NC_007295	CTTTT	2	10	30583	30592	0 %	80 %	0 %	20 %	71893386
46	NC_007295	TTTTG	2	10	31126	31135	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007295	AATCA	2	10	32230	32239	60 %	20 %	0 %	20 %	71893387
48	NC_007295	AAATT	2	10	35246	35255	60 %	40 %	0 %	0 %	71893388
49	NC_007295	ATCGC	2	10	35979	35988	20 %	20 %	20 %	40 %	71893388
50	NC_007295	CTTTT	2	10	37064	37073	0 %	80 %	0 %	20 %	71893389
51	NC_007295	TAAAT	2	10	38305	38314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007295	CCTTG	2	10	38732	38741	0 %	40 %	20 %	40 %	71893390
53	NC_007295	AAATC	2	10	39229	39238	60 %	20 %	0 %	20 %	71893390
54	NC_007295	ATGAT	2	10	39414	39423	40 %	40 %	20 %	0 %	71893390
55	NC_007295	AGTTC	2	10	39678	39687	20 %	40 %	20 %	20 %	71893391
56	NC_007295	AATTC	2	10	39714	39723	40 %	40 %	0 %	20 %	71893391
57	NC_007295	TAAAT	2	10	40592	40601	60 %	40 %	0 %	0 %	71893391
58	NC_007295	TTCAG	2	10	40671	40680	20 %	40 %	20 %	20 %	71893391
59	NC_007295	CCAAA	2	10	42153	42162	60 %	0 %	0 %	40 %	71893392
60	NC_007295	TGGAT	2	10	43499	43508	20 %	40 %	40 %	0 %	71893392
61	NC_007295	TTAGA	2	10	44605	44614	40 %	40 %	20 %	0 %	71893393
62	NC_007295	ATTCA	2	10	45465	45474	40 %	40 %	0 %	20 %	71893393
63	NC_007295	TTTTA	2	10	46810	46819	20 %	80 %	0 %	0 %	71893395
64	NC_007295	TTATT	2	10	47353	47362	20 %	80 %	0 %	0 %	71893395
65	NC_007295	AAACA	2	10	47493	47502	80 %	0 %	0 %	20 %	71893395
66	NC_007295	TTTCA	2	10	47946	47955	20 %	60 %	0 %	20 %	71893396
67	NC_007295	CAAAA	2	10	48499	48508	80 %	0 %	0 %	20 %	71893396
68	NC_007295	GTTTG	2	10	48536	48545	0 %	60 %	40 %	0 %	71893396
69	NC_007295	TACCC	2	10	50349	50358	20 %	20 %	0 %	60 %	71893398
70	NC_007295	AATTT	2	10	53025	53034	40 %	60 %	0 %	0 %	71893402
71	NC_007295	TAATT	2	10	56752	56761	40 %	60 %	0 %	0 %	71893407
72	NC_007295	TGAAA	2	10	57816	57825	60 %	20 %	20 %	0 %	71893408
73	NC_007295	AAAAC	2	10	58706	58715	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007295	TAATT	2	10	59587	59596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007295	CAAAA	2	10	59817	59826	80 %	0 %	0 %	20 %	71893410
76	NC_007295	CAAAA	2	10	60210	60219	80 %	0 %	0 %	20 %	71893410
77	NC_007295	AAAAT	2	10	63312	63321	80 %	20 %	0 %	0 %	71893413
78	NC_007295	GAAAT	2	10	63639	63648	60 %	20 %	20 %	0 %	71893413
79	NC_007295	GGGTG	2	10	63881	63890	0 %	20 %	80 %	0 %	71893413
80	NC_007295	TGATA	2	10	67438	67447	40 %	40 %	20 %	0 %	71893415
81	NC_007295	TTGGA	2	10	67462	67471	20 %	40 %	40 %	0 %	71893415
82	NC_007295	TTATA	2	10	69282	69291	40 %	60 %	0 %	0 %	71893417
83	NC_007295	CATTT	2	10	70649	70658	20 %	60 %	0 %	20 %	71893418
84	NC_007295	TATTT	2	10	71359	71368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007295	ATTTT	2	10	72231	72240	20 %	80 %	0 %	0 %	71893419
86	NC_007295	GAAAA	2	10	73580	73589	80 %	0 %	20 %	0 %	71893419
87	NC_007295	AATTA	2	10	75451	75460	60 %	40 %	0 %	0 %	71893419
88	NC_007295	ACAAA	2	10	75835	75844	80 %	0 %	0 %	20 %	71893419
89	NC_007295	TTGTT	2	10	75938	75947	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007295	ATTTT	2	10	76968	76977	20 %	80 %	0 %	0 %	71893420
91	NC_007295	AATTT	2	10	77032	77041	40 %	60 %	0 %	0 %	71893420
92	NC_007295	TTTAT	2	10	77655	77664	20 %	80 %	0 %	0 %	71893420
93	NC_007295	AATAT	2	10	78752	78761	60 %	40 %	0 %	0 %	71893420
94	NC_007295	AAATT	2	10	78876	78885	60 %	40 %	0 %	0 %	71893420
95	NC_007295	AATTA	2	10	79159	79168	60 %	40 %	0 %	0 %	71893421
96	NC_007295	AAATC	2	10	79194	79203	60 %	20 %	0 %	20 %	71893421
97	NC_007295	ACTTG	2	10	80782	80791	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007295	TCAAA	2	10	81839	81848	60 %	20 %	0 %	20 %	71893422
99	NC_007295	CAAAA	2	10	82695	82704	80 %	0 %	0 %	20 %	71893422
100	NC_007295	GATTT	2	10	83391	83400	20 %	60 %	20 %	0 %	71893423
101	NC_007295	CAAAA	2	10	83687	83696	80 %	0 %	0 %	20 %	71893423
102	NC_007295	AAAAC	2	10	84770	84779	80 %	0 %	0 %	20 %	71893424
103	NC_007295	GCTTT	2	10	87148	87157	0 %	60 %	20 %	20 %	71893428
104	NC_007295	GGATT	2	10	87875	87884	20 %	40 %	40 %	0 %	71893428
105	NC_007295	TATTT	2	10	89185	89194	20 %	80 %	0 %	0 %	71893429
106	NC_007295	AATTA	2	10	89796	89805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007295	TTGAT	2	10	90468	90477	20 %	60 %	20 %	0 %	71893430
108	NC_007295	TAACT	2	10	92203	92212	40 %	40 %	0 %	20 %	71893431
109	NC_007295	TTTAT	2	10	93041	93050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007295	CTTTT	2	10	93235	93244	0 %	80 %	0 %	20 %	71893433
111	NC_007295	TAATT	2	10	93362	93371	40 %	60 %	0 %	0 %	71893433
112	NC_007295	TTAAT	2	10	93493	93502	40 %	60 %	0 %	0 %	71893433
113	NC_007295	AAATA	2	10	93677	93686	80 %	20 %	0 %	0 %	71893434
114	NC_007295	CAAAA	2	10	93794	93803	80 %	0 %	0 %	20 %	71893434
115	NC_007295	CAAAA	2	10	93957	93966	80 %	0 %	0 %	20 %	71893434
116	NC_007295	TATAT	2	10	94165	94174	40 %	60 %	0 %	0 %	71893435
117	NC_007295	TTTAA	2	10	94559	94568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007295	TTATT	2	10	95523	95532	20 %	80 %	0 %	0 %	71893436
119	NC_007295	ATATT	2	10	95537	95546	40 %	60 %	0 %	0 %	71893436
120	NC_007295	AGTTT	2	10	95812	95821	20 %	60 %	20 %	0 %	71893436
121	NC_007295	TTTTA	2	10	96224	96233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007295	TAAAA	2	10	96269	96278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007295	TAAAA	2	10	99056	99065	80 %	20 %	0 %	0 %	71893438
124	NC_007295	TATAA	2	10	99966	99975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007295	AATTA	2	10	100130	100139	60 %	40 %	0 %	0 %	71893440
126	NC_007295	AAAAT	2	10	100182	100191	80 %	20 %	0 %	0 %	71893440
127	NC_007295	TAAAT	2	10	101787	101796	60 %	40 %	0 %	0 %	161611224
128	NC_007295	GTTTT	2	10	102218	102227	0 %	80 %	20 %	0 %	161611224
129	NC_007295	ATTTA	2	10	102824	102833	40 %	60 %	0 %	0 %	161611224
130	NC_007295	TTTCA	2	10	103304	103313	20 %	60 %	0 %	20 %	161611224
131	NC_007295	TTTAA	2	10	103784	103793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007295	AATTT	2	10	104369	104378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007295	TTTTA	2	10	104944	104953	20 %	80 %	0 %	0 %	71893442
134	NC_007295	CAAAA	2	10	105009	105018	80 %	0 %	0 %	20 %	71893442
135	NC_007295	TAAAA	2	10	105073	105082	80 %	20 %	0 %	0 %	71893442
136	NC_007295	TAAAA	2	10	105178	105187	80 %	20 %	0 %	0 %	71893442
137	NC_007295	TATAA	2	10	106875	106884	60 %	40 %	0 %	0 %	71893443
138	NC_007295	TCAAT	2	10	107609	107618	40 %	40 %	0 %	20 %	71893444
139	NC_007295	CTTTT	2	10	108083	108092	0 %	80 %	0 %	20 %	71893444
140	NC_007295	AATTA	2	10	111662	111671	60 %	40 %	0 %	0 %	71893447
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142	NC_007295	GTTTT	2	10	113827	113836	0 %	80 %	20 %	0 %	71893447
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