MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 2473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007295	TAAA	2	8	106	113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007295	CAAA	2	8	210	217	75 %	0 %	0 %	25 %	71893360
3	NC_007295	AAAG	2	8	483	490	75 %	0 %	25 %	0 %	71893360
4	NC_007295	AACA	2	8	873	880	75 %	0 %	0 %	25 %	71893360
5	NC_007295	CAAA	2	8	1200	1207	75 %	0 %	0 %	25 %	71893360
6	NC_007295	AAAT	2	8	1211	1218	75 %	25 %	0 %	0 %	71893360
7	NC_007295	ATTT	2	8	1230	1237	25 %	75 %	0 %	0 %	71893360
8	NC_007295	AACA	2	8	1285	1292	75 %	0 %	0 %	25 %	71893360
9	NC_007295	ATTA	2	8	1409	1416	50 %	50 %	0 %	0 %	71893360
10	NC_007295	TAAA	2	8	1697	1704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007295	AATA	2	8	2309	2316	75 %	25 %	0 %	0 %	71893361
12	NC_007295	TGAT	2	8	2536	2543	25 %	50 %	25 %	0 %	71893361
13	NC_007295	ATTA	2	8	3351	3358	50 %	50 %	0 %	0 %	71893362
14	NC_007295	TTTC	2	8	3677	3684	0 %	75 %	0 %	25 %	71893362
15	NC_007295	AATT	2	8	4508	4515	50 %	50 %	0 %	0 %	71893362
16	NC_007295	AATT	2	8	5152	5159	50 %	50 %	0 %	0 %	71893363
17	NC_007295	AAAT	2	8	6012	6019	75 %	25 %	0 %	0 %	71893364
18	NC_007295	TTGA	2	8	6094	6101	25 %	50 %	25 %	0 %	71893364
19	NC_007295	CATT	2	8	6750	6757	25 %	50 %	0 %	25 %	71893365
20	NC_007295	TAAA	2	8	6990	6997	75 %	25 %	0 %	0 %	71893365
21	NC_007295	ATTA	2	8	7207	7214	50 %	50 %	0 %	0 %	71893365
22	NC_007295	ATAA	2	8	7258	7265	75 %	25 %	0 %	0 %	71893365
23	NC_007295	GGAA	2	8	7366	7373	50 %	0 %	50 %	0 %	71893366
24	NC_007295	CTTT	2	8	8122	8129	0 %	75 %	0 %	25 %	71893367
25	NC_007295	CAAA	2	8	8133	8140	75 %	0 %	0 %	25 %	71893367
26	NC_007295	TAAA	2	8	8714	8721	75 %	25 %	0 %	0 %	71893367
27	NC_007295	GCAG	2	8	8802	8809	25 %	0 %	50 %	25 %	71893367
28	NC_007295	ATGG	2	8	8857	8864	25 %	25 %	50 %	0 %	71893367
29	NC_007295	GATG	2	8	8943	8950	25 %	25 %	50 %	0 %	71893367
30	NC_007295	TAAA	2	8	9132	9139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007295	ATTT	2	8	9157	9164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007295	TAAT	2	8	9281	9288	50 %	50 %	0 %	0 %	71893368
33	NC_007295	AATA	2	8	9801	9808	75 %	25 %	0 %	0 %	71893368
34	NC_007295	AAAG	2	8	10567	10574	75 %	0 %	25 %	0 %	71893368
35	NC_007295	ATTA	2	8	11037	11044	50 %	50 %	0 %	0 %	71893368
36	NC_007295	AGGA	2	8	11456	11463	50 %	0 %	50 %	0 %	71893369
37	NC_007295	CAAA	2	8	11564	11571	75 %	0 %	0 %	25 %	71893369
38	NC_007295	AATT	2	8	11633	11640	50 %	50 %	0 %	0 %	71893369
39	NC_007295	ATTT	2	8	12156	12163	25 %	75 %	0 %	0 %	71893369
40	NC_007295	CAAA	2	8	12278	12285	75 %	0 %	0 %	25 %	71893369
41	NC_007295	AAAT	2	8	13656	13663	75 %	25 %	0 %	0 %	71893371
42	NC_007295	AAAG	2	8	14629	14636	75 %	0 %	25 %	0 %	71893371
43	NC_007295	CAAA	2	8	15342	15349	75 %	0 %	0 %	25 %	71893373
44	NC_007295	GGAG	2	8	15587	15594	25 %	0 %	75 %	0 %	71893373
45	NC_007295	TTAA	2	8	15887	15894	50 %	50 %	0 %	0 %	71893374
46	NC_007295	TTTA	2	8	16584	16591	25 %	75 %	0 %	0 %	71893374
47	NC_007295	ATTT	2	8	16654	16661	25 %	75 %	0 %	0 %	71893374
48	NC_007295	TAAA	2	8	16716	16723	75 %	25 %	0 %	0 %	71893375
49	NC_007295	AAAT	2	8	16918	16925	75 %	25 %	0 %	0 %	71893375
50	NC_007295	TGTT	2	8	16935	16942	0 %	75 %	25 %	0 %	71893375
51	NC_007295	TTTA	2	8	17018	17025	25 %	75 %	0 %	0 %	71893375
52	NC_007295	ATTT	2	8	17030	17037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007295	TAAT	2	8	17102	17109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007295	AGAT	2	8	17425	17432	50 %	25 %	25 %	0 %	71893376
55	NC_007295	ATTA	2	8	17593	17600	50 %	50 %	0 %	0 %	71893376
56	NC_007295	ATTA	2	8	17654	17661	50 %	50 %	0 %	0 %	71893376
57	NC_007295	ACCA	2	8	17674	17681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007295	AAAT	2	8	17856	17863	75 %	25 %	0 %	0 %	71893377
59	NC_007295	AGAA	2	8	17867	17874	75 %	0 %	25 %	0 %	71893377
60	NC_007295	TGAG	2	8	18195	18202	25 %	25 %	50 %	0 %	71893377
61	NC_007295	TATT	2	8	19126	19133	25 %	75 %	0 %	0 %	71893377
62	NC_007295	GGTT	2	8	19607	19614	0 %	50 %	50 %	0 %	71893377
63	NC_007295	AGTT	2	8	19762	19769	25 %	50 %	25 %	0 %	71893377
64	NC_007295	TGAT	2	8	20606	20613	25 %	50 %	25 %	0 %	71893378
65	NC_007295	ATCC	2	8	21285	21292	25 %	25 %	0 %	50 %	71893378
66	NC_007295	TAAG	2	8	21731	21738	50 %	25 %	25 %	0 %	71893378
67	NC_007295	AACT	2	8	21809	21816	50 %	25 %	0 %	25 %	71893378
68	NC_007295	GGTT	2	8	22041	22048	0 %	50 %	50 %	0 %	71893378
69	NC_007295	GTTT	2	8	22421	22428	0 %	75 %	25 %	0 %	71893378
70	NC_007295	AATA	2	8	22918	22925	75 %	25 %	0 %	0 %	71893379
71	NC_007295	ATTA	2	8	22990	22997	50 %	50 %	0 %	0 %	71893379
72	NC_007295	TTCT	2	8	23010	23017	0 %	75 %	0 %	25 %	71893379
73	NC_007295	TTGG	2	8	23239	23246	0 %	50 %	50 %	0 %	71893379
74	NC_007295	TGGT	2	8	23386	23393	0 %	50 %	50 %	0 %	71893379
75	NC_007295	GGTT	2	8	24442	24449	0 %	50 %	50 %	0 %	71893379
76	NC_007295	AGTT	2	8	24817	24824	25 %	50 %	25 %	0 %	71893379
77	NC_007295	AAGG	2	8	25242	25249	50 %	0 %	50 %	0 %	71893380
78	NC_007295	ACTT	2	8	25322	25329	25 %	50 %	0 %	25 %	71893380
79	NC_007295	ATTA	2	8	25929	25936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007295	AAAT	2	8	26015	26022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007295	TTAA	2	8	26284	26291	50 %	50 %	0 %	0 %	71893381
82	NC_007295	TTAT	2	8	26675	26682	25 %	75 %	0 %	0 %	71893382
83	NC_007295	AAAT	2	8	27115	27122	75 %	25 %	0 %	0 %	71893383
84	NC_007295	ATTA	2	8	27229	27236	50 %	50 %	0 %	0 %	71893383
85	NC_007295	AAAT	2	8	28245	28252	75 %	25 %	0 %	0 %	71893383
86	NC_007295	TTGA	2	8	28746	28753	25 %	50 %	25 %	0 %	71893384
87	NC_007295	CAAG	2	8	29027	29034	50 %	0 %	25 %	25 %	71893384
88	NC_007295	ACCT	2	8	29268	29275	25 %	25 %	0 %	50 %	71893384
89	NC_007295	ACAA	4	16	29462	29477	75 %	0 %	0 %	25 %	71893384
90	NC_007295	TCAA	2	8	29674	29681	50 %	25 %	0 %	25 %	71893384
91	NC_007295	TAAG	2	8	29719	29726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007295	ATTT	2	8	29792	29799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007295	ATTT	2	8	30184	30191	25 %	75 %	0 %	0 %	71893385
94	NC_007295	TAAA	2	8	30678	30685	75 %	25 %	0 %	0 %	71893386
95	NC_007295	AGTG	2	8	30814	30821	25 %	25 %	50 %	0 %	71893386
96	NC_007295	CAAC	2	8	31047	31054	50 %	0 %	0 %	50 %	71893386
97	NC_007295	GATT	2	8	31319	31326	25 %	50 %	25 %	0 %	71893387
98	NC_007295	AAAT	2	8	32106	32113	75 %	25 %	0 %	0 %	71893387
99	NC_007295	AAAT	2	8	32169	32176	75 %	25 %	0 %	0 %	71893387
100	NC_007295	TTCG	2	8	32464	32471	0 %	50 %	25 %	25 %	71893387
101	NC_007295	TAAA	2	8	33175	33182	75 %	25 %	0 %	0 %	71893387
102	NC_007295	GTTT	2	8	33338	33345	0 %	75 %	25 %	0 %	71893387
103	NC_007295	ACTT	2	8	33853	33860	25 %	50 %	0 %	25 %	71893388
104	NC_007295	CCTT	2	8	34418	34425	0 %	50 %	0 %	50 %	71893388
105	NC_007295	ATTC	2	8	34480	34487	25 %	50 %	0 %	25 %	71893388
106	NC_007295	TTAG	2	8	34673	34680	25 %	50 %	25 %	0 %	71893388
107	NC_007295	TTAA	2	8	35111	35118	50 %	50 %	0 %	0 %	71893388
108	NC_007295	TTGA	2	8	35306	35313	25 %	50 %	25 %	0 %	71893388
109	NC_007295	TAAT	2	8	35393	35400	50 %	50 %	0 %	0 %	71893388
110	NC_007295	AATT	2	8	35929	35936	50 %	50 %	0 %	0 %	71893388
111	NC_007295	AATT	2	8	36312	36319	50 %	50 %	0 %	0 %	71893388
112	NC_007295	CATT	2	8	36541	36548	25 %	50 %	0 %	25 %	71893389
113	NC_007295	GTCA	2	8	36773	36780	25 %	25 %	25 %	25 %	71893389
114	NC_007295	ATTT	2	8	37252	37259	25 %	75 %	0 %	0 %	71893389
115	NC_007295	TTTG	2	8	37260	37267	0 %	75 %	25 %	0 %	71893389
116	NC_007295	ATTA	2	8	38081	38088	50 %	50 %	0 %	0 %	71893389
117	NC_007295	ATTT	2	8	38603	38610	25 %	75 %	0 %	0 %	71893390
118	NC_007295	TTCC	2	8	39143	39150	0 %	50 %	0 %	50 %	71893390
119	NC_007295	TGGA	2	8	39164	39171	25 %	25 %	50 %	0 %	71893390
120	NC_007295	GACA	2	8	39334	39341	50 %	0 %	25 %	25 %	71893390
121	NC_007295	ATTC	2	8	39431	39438	25 %	50 %	0 %	25 %	71893390
122	NC_007295	AGTA	2	8	39489	39496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007295	AACC	2	8	40191	40198	50 %	0 %	0 %	50 %	71893391
124	NC_007295	AATC	2	8	40201	40208	50 %	25 %	0 %	25 %	71893391
125	NC_007295	TTAG	2	8	40239	40246	25 %	50 %	25 %	0 %	71893391
126	NC_007295	TTCC	2	8	40828	40835	0 %	50 %	0 %	50 %	71893391
127	NC_007295	TTTC	2	8	41969	41976	0 %	75 %	0 %	25 %	71893392
128	NC_007295	TTGA	2	8	42331	42338	25 %	50 %	25 %	0 %	71893392
129	NC_007295	AATT	2	8	42451	42458	50 %	50 %	0 %	0 %	71893392
130	NC_007295	AGTC	2	8	42676	42683	25 %	25 %	25 %	25 %	71893392
131	NC_007295	ATTA	2	8	42742	42749	50 %	50 %	0 %	0 %	71893392
132	NC_007295	GGTC	2	8	43035	43042	0 %	25 %	50 %	25 %	71893392
133	NC_007295	TACA	2	8	43147	43154	50 %	25 %	0 %	25 %	71893392
134	NC_007295	ATTA	2	8	43249	43256	50 %	50 %	0 %	0 %	71893392
135	NC_007295	TTAG	2	8	43649	43656	25 %	50 %	25 %	0 %	71893392
136	NC_007295	CGAT	2	8	44225	44232	25 %	25 %	25 %	25 %	71893393
137	NC_007295	AGCA	2	8	44423	44430	50 %	0 %	25 %	25 %	71893393
138	NC_007295	TAAA	2	8	45409	45416	75 %	25 %	0 %	0 %	71893393
139	NC_007295	TAAA	2	8	45500	45507	75 %	25 %	0 %	0 %	71893393
140	NC_007295	TTTA	2	8	46059	46066	25 %	75 %	0 %	0 %	71893394
141	NC_007295	GAAT	2	8	46929	46936	50 %	25 %	25 %	0 %	71893395
142	NC_007295	AATT	2	8	46983	46990	50 %	50 %	0 %	0 %	71893395
143	NC_007295	TAAT	2	8	47418	47425	50 %	50 %	0 %	0 %	71893395
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