MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 232 chromosome

Total Repeats: 2465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006360	CAAA	2	8	4	11	75 %	0 %	0 %	25 %	54019970
2	NC_006360	AAAG	2	8	277	284	75 %	0 %	25 %	0 %	54019970
3	NC_006360	AACA	2	8	667	674	75 %	0 %	0 %	25 %	54019970
4	NC_006360	CAAA	2	8	994	1001	75 %	0 %	0 %	25 %	54019970
5	NC_006360	AAAT	2	8	1005	1012	75 %	25 %	0 %	0 %	54019970
6	NC_006360	ATTT	2	8	1024	1031	25 %	75 %	0 %	0 %	54019970
7	NC_006360	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	54019970
8	NC_006360	ATTA	2	8	1203	1210	50 %	50 %	0 %	0 %	54019970
9	NC_006360	TAAA	2	8	1491	1498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006360	AATA	2	8	2103	2110	75 %	25 %	0 %	0 %	54019971
11	NC_006360	TGAT	2	8	2330	2337	25 %	50 %	25 %	0 %	54019971
12	NC_006360	ATTA	2	8	3143	3150	50 %	50 %	0 %	0 %	54019972
13	NC_006360	TTTC	2	8	3469	3476	0 %	75 %	0 %	25 %	54019972
14	NC_006360	AATT	2	8	4300	4307	50 %	50 %	0 %	0 %	54019972
15	NC_006360	AATT	2	8	4944	4951	50 %	50 %	0 %	0 %	54019973
16	NC_006360	AAAT	2	8	5804	5811	75 %	25 %	0 %	0 %	54019974
17	NC_006360	TTGA	2	8	5886	5893	25 %	50 %	25 %	0 %	54019974
18	NC_006360	CATT	2	8	6542	6549	25 %	50 %	0 %	25 %	54019975
19	NC_006360	TAAA	2	8	6782	6789	75 %	25 %	0 %	0 %	54019975
20	NC_006360	ATTA	2	8	6999	7006	50 %	50 %	0 %	0 %	54019975
21	NC_006360	ATAA	2	8	7050	7057	75 %	25 %	0 %	0 %	54019975
22	NC_006360	GGAA	2	8	7158	7165	50 %	0 %	50 %	0 %	54019976
23	NC_006360	CTTT	2	8	7914	7921	0 %	75 %	0 %	25 %	54019977
24	NC_006360	CAAA	2	8	7925	7932	75 %	0 %	0 %	25 %	54019977
25	NC_006360	TAAA	2	8	8506	8513	75 %	25 %	0 %	0 %	54019977
26	NC_006360	GCAG	2	8	8594	8601	25 %	0 %	50 %	25 %	54019977
27	NC_006360	ATGG	2	8	8649	8656	25 %	25 %	50 %	0 %	54019977
28	NC_006360	GATG	2	8	8735	8742	25 %	25 %	50 %	0 %	54019977
29	NC_006360	TAAA	2	8	8924	8931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006360	ATTT	2	8	8949	8956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006360	TAAT	2	8	9073	9080	50 %	50 %	0 %	0 %	54019978
32	NC_006360	AATA	2	8	9593	9600	75 %	25 %	0 %	0 %	54019978
33	NC_006360	CAAA	2	8	10201	10208	75 %	0 %	0 %	25 %	54019978
34	NC_006360	AAAG	2	8	10359	10366	75 %	0 %	25 %	0 %	54019978
35	NC_006360	ATTA	2	8	10829	10836	50 %	50 %	0 %	0 %	54019978
36	NC_006360	AGGA	2	8	11248	11255	50 %	0 %	50 %	0 %	54019979
37	NC_006360	CAAA	2	8	11356	11363	75 %	0 %	0 %	25 %	54019979
38	NC_006360	AATT	2	8	11425	11432	50 %	50 %	0 %	0 %	54019979
39	NC_006360	ATTT	2	8	11948	11955	25 %	75 %	0 %	0 %	54019979
40	NC_006360	CAAA	2	8	12070	12077	75 %	0 %	0 %	25 %	54019979
41	NC_006360	AAAT	2	8	13448	13455	75 %	25 %	0 %	0 %	54019981
42	NC_006360	AAAG	2	8	14421	14428	75 %	0 %	25 %	0 %	54019981
43	NC_006360	CAAA	2	8	15131	15138	75 %	0 %	0 %	25 %	54019983
44	NC_006360	GGAG	2	8	15376	15383	25 %	0 %	75 %	0 %	54019983
45	NC_006360	TTAA	2	8	15676	15683	50 %	50 %	0 %	0 %	54019984
46	NC_006360	TTTA	2	8	16373	16380	25 %	75 %	0 %	0 %	54019984
47	NC_006360	ATTT	2	8	16443	16450	25 %	75 %	0 %	0 %	54019984
48	NC_006360	TAAA	2	8	16505	16512	75 %	25 %	0 %	0 %	54020307
49	NC_006360	AAAT	2	8	16707	16714	75 %	25 %	0 %	0 %	54020307
50	NC_006360	TGTT	2	8	16724	16731	0 %	75 %	25 %	0 %	54020307
51	NC_006360	TTTA	2	8	16807	16814	25 %	75 %	0 %	0 %	54020307
52	NC_006360	ATTT	2	8	16819	16826	25 %	75 %	0 %	0 %	54020307
53	NC_006360	AAAT	2	8	16885	16892	75 %	25 %	0 %	0 %	54020307
54	NC_006360	ATTT	2	8	16902	16909	25 %	75 %	0 %	0 %	54020307
55	NC_006360	TATT	2	8	17316	17323	25 %	75 %	0 %	0 %	54020307
56	NC_006360	ATTG	2	8	17899	17906	25 %	50 %	25 %	0 %	54019985
57	NC_006360	TTGG	2	8	18485	18492	0 %	50 %	50 %	0 %	54019985
58	NC_006360	ATTT	2	8	18563	18570	25 %	75 %	0 %	0 %	54019985
59	NC_006360	TATT	2	8	18721	18728	25 %	75 %	0 %	0 %	54019986
60	NC_006360	ATTA	2	8	19139	19146	50 %	50 %	0 %	0 %	54019986
61	NC_006360	TTTC	2	8	19242	19249	0 %	75 %	0 %	25 %	54019986
62	NC_006360	TAAT	2	8	19349	19356	50 %	50 %	0 %	0 %	54019986
63	NC_006360	ATTA	2	8	19841	19848	50 %	50 %	0 %	0 %	54020309
64	NC_006360	ATTA	2	8	19902	19909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006360	ACCA	2	8	19922	19929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006360	AAAT	2	8	20104	20111	75 %	25 %	0 %	0 %	54020310
67	NC_006360	AGAA	2	8	20115	20122	75 %	0 %	25 %	0 %	54020310
68	NC_006360	TGAG	2	8	20443	20450	25 %	25 %	50 %	0 %	54020310
69	NC_006360	CTTC	2	8	20860	20867	0 %	50 %	0 %	50 %	54020310
70	NC_006360	TATT	2	8	21383	21390	25 %	75 %	0 %	0 %	54020310
71	NC_006360	GGTT	2	8	21864	21871	0 %	50 %	50 %	0 %	54020310
72	NC_006360	AGTT	2	8	22019	22026	25 %	50 %	25 %	0 %	54020310
73	NC_006360	TGAT	2	8	22862	22869	25 %	50 %	25 %	0 %	54020311
74	NC_006360	TCCT	2	8	23545	23552	0 %	50 %	0 %	50 %	54020311
75	NC_006360	TAAG	2	8	23990	23997	50 %	25 %	25 %	0 %	54020311
76	NC_006360	AACT	2	8	24068	24075	50 %	25 %	0 %	25 %	54020311
77	NC_006360	GGTT	2	8	24300	24307	0 %	50 %	50 %	0 %	54020311
78	NC_006360	GTTT	2	8	24680	24687	0 %	75 %	25 %	0 %	54020311
79	NC_006360	AATA	2	8	25177	25184	75 %	25 %	0 %	0 %	54020312
80	NC_006360	ATTA	2	8	25249	25256	50 %	50 %	0 %	0 %	54020312
81	NC_006360	TTCT	2	8	25269	25276	0 %	75 %	0 %	25 %	54020312
82	NC_006360	TTGG	2	8	25498	25505	0 %	50 %	50 %	0 %	54020312
83	NC_006360	TGGT	2	8	25645	25652	0 %	50 %	50 %	0 %	54020312
84	NC_006360	GGTT	2	8	26701	26708	0 %	50 %	50 %	0 %	54020312
85	NC_006360	AGTT	2	8	27076	27083	25 %	50 %	25 %	0 %	54020312
86	NC_006360	AAGG	2	8	27501	27508	50 %	0 %	50 %	0 %	54020313
87	NC_006360	ACTT	2	8	27581	27588	25 %	50 %	0 %	25 %	54020313
88	NC_006360	CGAA	2	8	27754	27761	50 %	0 %	25 %	25 %	54020313
89	NC_006360	TAAA	2	8	28075	28082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006360	ATTT	2	8	28791	28798	25 %	75 %	0 %	0 %	54020314
91	NC_006360	CTTC	2	8	28969	28976	0 %	50 %	0 %	50 %	54020314
92	NC_006360	CTGG	2	8	29000	29007	0 %	25 %	50 %	25 %	54020314
93	NC_006360	TTAA	2	8	29122	29129	50 %	50 %	0 %	0 %	54020314
94	NC_006360	GGTT	2	8	29961	29968	0 %	50 %	50 %	0 %	54020314
95	NC_006360	CCTT	2	8	30235	30242	0 %	50 %	0 %	50 %	54020314
96	NC_006360	ATTA	2	8	30947	30954	50 %	50 %	0 %	0 %	54020315
97	NC_006360	TTCT	2	8	30967	30974	0 %	75 %	0 %	25 %	54020315
98	NC_006360	ATTT	2	8	31145	31152	25 %	75 %	0 %	0 %	54020315
99	NC_006360	TTTC	2	8	31759	31766	0 %	75 %	0 %	25 %	54020315
100	NC_006360	TCAA	2	8	32616	32623	50 %	25 %	0 %	25 %	54020315
101	NC_006360	CCTT	2	8	32673	32680	0 %	50 %	0 %	50 %	54020315
102	NC_006360	AGTT	2	8	32774	32781	25 %	50 %	25 %	0 %	54020315
103	NC_006360	AATT	2	8	32800	32807	50 %	50 %	0 %	0 %	54020315
104	NC_006360	ACCC	2	8	33045	33052	25 %	0 %	0 %	75 %	54020316
105	NC_006360	TAAA	2	8	33342	33349	75 %	25 %	0 %	0 %	54020316
106	NC_006360	TTTG	2	8	33667	33674	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006360	ATTA	2	8	33925	33932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006360	AAAT	2	8	34011	34018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006360	TTAA	2	8	34280	34287	50 %	50 %	0 %	0 %	54019987
110	NC_006360	TTGG	2	8	34292	34299	0 %	50 %	50 %	0 %	54019987
111	NC_006360	TTAT	2	8	34576	34583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006360	AAAT	2	8	35016	35023	75 %	25 %	0 %	0 %	54019988
113	NC_006360	ATTA	2	8	35130	35137	50 %	50 %	0 %	0 %	54019988
114	NC_006360	AAAT	2	8	36146	36153	75 %	25 %	0 %	0 %	54019988
115	NC_006360	ATTG	2	8	36646	36653	25 %	50 %	25 %	0 %	54019989
116	NC_006360	CAAG	2	8	36928	36935	50 %	0 %	25 %	25 %	54019989
117	NC_006360	ACAA	4	16	37363	37378	75 %	0 %	0 %	25 %	54019989
118	NC_006360	TCAA	2	8	37575	37582	50 %	25 %	0 %	25 %	54019989
119	NC_006360	ATTT	2	8	37693	37700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006360	ATTT	2	8	38084	38091	25 %	75 %	0 %	0 %	54019990
121	NC_006360	TAAA	2	8	38578	38585	75 %	25 %	0 %	0 %	54020317
122	NC_006360	AGTG	2	8	38714	38721	25 %	25 %	50 %	0 %	54020317
123	NC_006360	TCAA	2	8	38946	38953	50 %	25 %	0 %	25 %	54020317
124	NC_006360	GATT	2	8	39219	39226	25 %	50 %	25 %	0 %	54020318
125	NC_006360	AAAT	2	8	40006	40013	75 %	25 %	0 %	0 %	54020318
126	NC_006360	AAAT	2	8	40069	40076	75 %	25 %	0 %	0 %	54020318
127	NC_006360	TTCG	2	8	40364	40371	0 %	50 %	25 %	25 %	54020318
128	NC_006360	TAAA	2	8	41075	41082	75 %	25 %	0 %	0 %	54020318
129	NC_006360	GTTT	2	8	41238	41245	0 %	75 %	25 %	0 %	54020318
130	NC_006360	ACTT	2	8	41753	41760	25 %	50 %	0 %	25 %	54020319
131	NC_006360	CCTT	2	8	42318	42325	0 %	50 %	0 %	50 %	54020319
132	NC_006360	ATTC	2	8	42380	42387	25 %	50 %	0 %	25 %	54020319
133	NC_006360	TTAG	2	8	42573	42580	25 %	50 %	25 %	0 %	54020319
134	NC_006360	ACTA	2	8	43022	43029	50 %	25 %	0 %	25 %	54020319
135	NC_006360	TTGA	2	8	43206	43213	25 %	50 %	25 %	0 %	54020319
136	NC_006360	TAAT	2	8	43293	43300	50 %	50 %	0 %	0 %	54020319
137	NC_006360	AATT	2	8	43829	43836	50 %	50 %	0 %	0 %	54020319
138	NC_006360	AATT	2	8	44212	44219	50 %	50 %	0 %	0 %	54020319
139	NC_006360	CATT	2	8	44438	44445	25 %	50 %	0 %	25 %	54020320
140	NC_006360	GTCA	2	8	44670	44677	25 %	25 %	25 %	25 %	54020320
141	NC_006360	ATTA	2	8	45048	45055	50 %	50 %	0 %	0 %	54020320
142	NC_006360	ATTT	2	8	45149	45156	25 %	75 %	0 %	0 %	54020320
143	NC_006360	TTTG	2	8	45157	45164	0 %	75 %	25 %	0 %	54020320
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145	NC_006360	ATTT	2	8	46500	46507	25 %	75 %	0 %	0 %	54019991
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