MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia succiniciproducens MBEL55E chromosome

Total Repeats: 47348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006300	CGG	2	6	246187	246192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424326
5002	NC_006300	GCC	2	6	246209	246214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424326
5003	NC_006300	ATT	2	6	246220	246225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424326
5004	NC_006300	ATT	2	6	246275	246280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424326
5005	NC_006300	TGATAT	2	12	246286	246297	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	52424326
5006	NC_006300	TAATCA	2	12	246304	246315	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	52424326
5007	NC_006300	GAA	2	6	246323	246328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424326
5008	NC_006300	GTTT	2	8	246369	246376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_006300	T	6	6	246380	246385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_006300	TTA	2	6	246663	246668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424327
5011	NC_006300	AAG	2	6	246711	246716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424327
5012	NC_006300	CAG	2	6	246767	246772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424327
5013	NC_006300	A	7	7	246780	246786	100 %	0 %	0 %	0 %	52424327
5014	NC_006300	GCG	2	6	246806	246811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424327
5015	NC_006300	TGC	2	6	246834	246839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424327
5016	NC_006300	A	6	6	246908	246913	100 %	0 %	0 %	0 %	52424327
5017	NC_006300	CGC	2	6	246987	246992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424327
5018	NC_006300	GAA	2	6	247106	247111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424327
5019	NC_006300	GAA	2	6	247133	247138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424327
5020	NC_006300	AGC	2	6	247167	247172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424327
5021	NC_006300	GATA	2	8	247195	247202	50 %	25 %	25 %	0 %	52424327
5022	NC_006300	A	6	6	247211	247216	100 %	0 %	0 %	0 %	52424327
5023	NC_006300	GCG	2	6	247227	247232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424327
5024	NC_006300	ATT	2	6	247274	247279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424327
5025	NC_006300	CGTC	2	8	247364	247371	0 %	25 %	25 %	50 %	52424327
5026	NC_006300	AGA	2	6	247435	247440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424327
5027	NC_006300	TGA	2	6	247497	247502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424327
5028	NC_006300	CGT	2	6	247601	247606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424327
5029	NC_006300	GTG	2	6	247676	247681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424327
5030	NC_006300	ATG	2	6	247713	247718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424327
5031	NC_006300	TTTTA	2	10	247744	247753	20 %	80 %	0 %	0 %	52424327
5032	NC_006300	AAT	3	9	247821	247829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_006300	ATT	2	6	247846	247851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_006300	CTTT	2	8	247897	247904	0 %	75 %	0 %	25 %	52424328
5035	NC_006300	CTT	2	6	247949	247954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424328
5036	NC_006300	CTT	2	6	247994	247999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424328
5037	NC_006300	GCC	2	6	248050	248055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424328
5038	NC_006300	TTG	2	6	248122	248127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424328
5039	NC_006300	ATAA	2	8	248147	248154	75 %	25 %	0 %	0 %	52424328
5040	NC_006300	TGA	2	6	248196	248201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424328
5041	NC_006300	TTGC	2	8	248243	248250	0 %	50 %	25 %	25 %	52424328
5042	NC_006300	TCA	2	6	248296	248301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424328
5043	NC_006300	T	6	6	248304	248309	0 %	100 %	0 %	0 %	52424328
5044	NC_006300	ACG	2	6	248400	248405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424328
5045	NC_006300	GCAA	2	8	248431	248438	50 %	0 %	25 %	25 %	52424328
5046	NC_006300	CTT	2	6	248450	248455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424328
5047	NC_006300	TCA	2	6	248467	248472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424328
5048	NC_006300	TTCT	2	8	248511	248518	0 %	75 %	0 %	25 %	52424328
5049	NC_006300	TA	3	6	248522	248527	50 %	50 %	0 %	0 %	52424328
5050	NC_006300	AAAT	2	8	248587	248594	75 %	25 %	0 %	0 %	52424328
5051	NC_006300	GCG	2	6	248627	248632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424328
5052	NC_006300	GCC	2	6	248665	248670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424328
5053	NC_006300	TGT	2	6	248683	248688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424328
5054	NC_006300	CCA	2	6	248714	248719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424328
5055	NC_006300	GTT	2	6	248789	248794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424328
5056	NC_006300	CCG	2	6	248804	248809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424328
5057	NC_006300	AAT	2	6	248879	248884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424328
5058	NC_006300	GAA	2	6	248982	248987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424328
5059	NC_006300	TA	3	6	249009	249014	50 %	50 %	0 %	0 %	52424328
5060	NC_006300	AAC	2	6	249015	249020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424328
5061	NC_006300	GGC	2	6	249027	249032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424328
5062	NC_006300	GGT	2	6	249051	249056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424328
5063	NC_006300	GA	3	6	249115	249120	50 %	0 %	50 %	0 %	52424328
5064	NC_006300	CTA	2	6	249131	249136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424328
5065	NC_006300	TAA	2	6	249144	249149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424328
5066	NC_006300	TTG	2	6	249194	249199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424329
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5069	NC_006300	AAG	2	6	249423	249428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424329
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5071	NC_006300	AAT	2	6	249594	249599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424329
5072	NC_006300	T	6	6	249602	249607	0 %	100 %	0 %	0 %	52424329
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5074	NC_006300	T	7	7	249661	249667	0 %	100 %	0 %	0 %	52424329
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5081	NC_006300	GA	3	6	249914	249919	50 %	0 %	50 %	0 %	52424329
5082	NC_006300	CAT	2	6	249934	249939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424329
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5088	NC_006300	TGC	2	6	250239	250244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424329
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5090	NC_006300	ATA	2	6	250262	250267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424329
5091	NC_006300	T	6	6	250328	250333	0 %	100 %	0 %	0 %	52424329
5092	NC_006300	ACG	2	6	250335	250340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424329
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5095	NC_006300	T	7	7	250371	250377	0 %	100 %	0 %	0 %	52424329
5096	NC_006300	CAA	2	6	250417	250422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424329
5097	NC_006300	TTTTA	2	10	250473	250482	20 %	80 %	0 %	0 %	52424330
5098	NC_006300	CAG	2	6	250660	250665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424330
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5106	NC_006300	A	6	6	251134	251139	100 %	0 %	0 %	0 %	52424330
5107	NC_006300	ATTT	2	8	251166	251173	25 %	75 %	0 %	0 %	52424330
5108	NC_006300	TGC	2	6	251273	251278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424331
5109	NC_006300	GC	3	6	251381	251386	0 %	0 %	50 %	50 %	52424331
5110	NC_006300	T	6	6	251402	251407	0 %	100 %	0 %	0 %	52424331
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5119	NC_006300	AGCCC	2	10	251880	251889	20 %	0 %	20 %	60 %	52424331
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5121	NC_006300	TAT	2	6	252156	252161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424331
5122	NC_006300	TTA	2	6	252175	252180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_006300	AGTC	2	8	252222	252229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_006300	GA	3	6	252235	252240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_006300	AT	3	6	252262	252267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_006300	TTG	2	6	252289	252294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_006300	AAT	2	6	258148	258153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424336
5254	NC_006300	ATA	2	6	258220	258225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424336
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5292	NC_006300	T	6	6	259676	259681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5293	NC_006300	GTA	2	6	259723	259728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511003
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5337	NC_006300	A	7	7	261709	261715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5366	NC_006300	GGTTAT	2	12	263275	263286	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	52424340
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5368	NC_006300	TGG	2	6	263383	263388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424340
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5370	NC_006300	TTACG	2	10	263443	263452	20 %	40 %	20 %	20 %	52424340
5371	NC_006300	CGTT	2	8	263466	263473	0 %	50 %	25 %	25 %	52424340
5372	NC_006300	ATT	2	6	263598	263603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_006300	AGATA	2	10	263611	263620	60 %	20 %	20 %	0 %	52424341
5374	NC_006300	A	6	6	263629	263634	100 %	0 %	0 %	0 %	52424341
5375	NC_006300	A	6	6	263679	263684	100 %	0 %	0 %	0 %	52424341
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5500	NC_006300	A	6	6	270944	270949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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