MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mesoplasma florum L1 chromosome

Total Repeats: 627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006055	AAAGAA	2	12	1273	1284	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364816
2	NC_006055	TAATTC	2	12	3020	3031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364818
3	NC_006055	TTTCTT	2	12	3163	3174	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50364818
4	NC_006055	GATGTT	2	12	3970	3981	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50364819
5	NC_006055	TGAAAT	2	12	5760	5771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364821
6	NC_006055	TTGAAG	2	12	6053	6064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50364821
7	NC_006055	AAATGC	2	12	6426	6437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50364821
8	NC_006055	TAAAAA	2	12	10216	10227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364823
9	NC_006055	TTCAGT	2	12	11429	11440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50364823
10	NC_006055	AAGCTA	2	12	15443	15454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50364826
11	NC_006055	CTAATT	2	12	19963	19974	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364829
12	NC_006055	ACACCA	2	12	21138	21149	50 %	0 %	0 %	50 %	50364830
13	NC_006055	TAACAC	2	12	21508	21519	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364830
14	NC_006055	TTCAAT	2	12	21828	21839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364831
15	NC_006055	AACTTT	2	12	22101	22112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364831
16	NC_006055	GTTTTA	2	12	23344	23355	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50364831
17	NC_006055	TAATTT	2	12	24274	24285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50364832
18	NC_006055	CATTAT	2	12	24354	24365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364832
19	NC_006055	TAAAAA	2	12	25380	25391	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364833
20	NC_006055	CACAAA	2	12	25881	25892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50364834
21	NC_006055	CAAACT	2	12	26698	26709	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364834
22	NC_006055	AATAAA	2	12	27301	27312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364834
23	NC_006055	TCTAAA	2	12	28832	28843	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50364835
24	NC_006055	AACTTC	2	12	31427	31438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364837
25	NC_006055	ATGCAG	2	12	32411	32422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50364838
26	NC_006055	CAACTT	2	12	33506	33517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364838
27	NC_006055	GAGAAA	2	12	33601	33612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50364838
28	NC_006055	CTACAC	2	12	33980	33991	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50364838
29	NC_006055	GAAATA	2	12	35348	35359	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364839
30	NC_006055	TTGAAA	2	12	35862	35873	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364839
31	NC_006055	ATACAA	2	12	36546	36557	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50364839
32	NC_006055	GCTTTT	2	12	36966	36977	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	50364840
33	NC_006055	CAACTT	2	12	45448	45459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364848
34	NC_006055	CAGTTG	2	12	46567	46578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50364848
35	NC_006055	TAAAAA	2	12	48676	48687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364849
36	NC_006055	ATTACC	2	12	57921	57932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364857
37	NC_006055	CCACAT	2	12	63299	63310	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50364862
38	NC_006055	TGCAAT	2	12	64327	64338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_006055	TGGAAC	2	12	66178	66189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50364867
40	NC_006055	AAAATA	2	12	67978	67989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006055	TATTGA	2	12	71337	71348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364872
42	NC_006055	AGTGGT	2	12	75609	75620	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	50364874
43	NC_006055	CTGAAA	2	12	76231	76242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50364874
44	NC_006055	ACTCAT	2	12	76267	76278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364874
45	NC_006055	AACTCA	2	12	76871	76882	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364874
46	NC_006055	ATTTAG	2	12	76957	76968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364874
47	NC_006055	AGTGGT	2	12	77445	77456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	50364874
48	NC_006055	TTATTT	2	12	77572	77583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50364874
49	NC_006055	GAAAAA	2	12	78985	78996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364875
50	NC_006055	TTTAAA	2	12	79071	79082	50 %	50 %	0 %	0 %	50364875
51	NC_006055	AAATAG	2	12	80779	80790	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364877
52	NC_006055	AGAAAA	2	12	82403	82414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364878
53	NC_006055	TTGAAA	2	12	83405	83416	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364879
54	NC_006055	CATTAT	2	12	84972	84983	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364880
55	NC_006055	AAATTA	2	12	85099	85110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50364880
56	NC_006055	TCAAAC	2	12	85348	85359	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364881
57	NC_006055	ATGAAA	2	12	86150	86161	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364882
58	NC_006055	TTCAAA	2	12	86597	86608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50364883
59	NC_006055	AAAATA	2	12	89992	90003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364884
60	NC_006055	ATTTTG	2	12	90511	90522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50364885
61	NC_006055	AAAGCA	3	18	91095	91112	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50364885
62	NC_006055	GTTGCT	2	12	91792	91803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	50364886
63	NC_006055	AAAGCA	3	18	92536	92553	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50364886
64	NC_006055	AATATT	2	12	93214	93225	50 %	50 %	0 %	0 %	50364887
65	NC_006055	AAGGTA	2	12	95479	95490	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50364889
66	NC_006055	ACAGGT	2	12	96180	96191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50364889
67	NC_006055	TAGAAA	2	12	96915	96926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364890
68	NC_006055	ATCAAC	2	12	98252	98263	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364891
69	NC_006055	GAATTG	2	12	99518	99529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50364892
70	NC_006055	AAAAAT	2	12	100467	100478	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364893
71	NC_006055	TAAAAA	2	12	101747	101758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364894
72	NC_006055	TAAAAA	2	12	101939	101950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364894
73	NC_006055	AAATAA	2	12	102331	102342	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006055	TGCTGT	2	12	102495	102506	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_006055	GTTGAA	2	12	103477	103488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50364895
76	NC_006055	TTTCAG	2	12	103999	104010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50364896
77	NC_006055	AATTCA	2	12	106982	106993	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50364900
78	NC_006055	ATTTAG	2	12	107727	107738	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364900
79	NC_006055	TTCAGT	2	12	108241	108252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50364901
80	NC_006055	TTGGTT	2	12	108447	108458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50364901
81	NC_006055	CATTTA	2	12	108477	108488	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364901
82	NC_006055	TAAAAT	2	12	112681	112692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50364907
83	NC_006055	AAAGTT	2	12	112769	112780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364907
84	NC_006055	ATTTCA	2	12	113654	113665	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364907
85	NC_006055	TTTCTA	2	12	114297	114308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50364908
86	NC_006055	TTAGAT	2	12	114788	114799	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364909
87	NC_006055	AGCGAA	2	12	116183	116194	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	50364910
88	NC_006055	GAACAA	2	12	116436	116447	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50364910
89	NC_006055	TATTGC	2	12	118089	118100	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50364911
90	NC_006055	CAAATG	2	12	119705	119716	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50364912
91	NC_006055	TCAACG	2	12	119995	120006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50364912
92	NC_006055	GCTGAT	2	12	120230	120241	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50364912
93	NC_006055	AGAAAA	2	12	120318	120329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364912
94	NC_006055	TTTATG	2	12	123419	123430	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50364913
95	NC_006055	TGATGT	2	12	128200	128211	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50364916
96	NC_006055	AATGAA	2	12	128549	128560	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364916
97	NC_006055	TAATGA	2	12	130549	130560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364918
98	NC_006055	CTTTTT	2	12	133914	133925	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50364923
99	NC_006055	AATTAG	2	12	137571	137582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364928
100	NC_006055	TAAAAA	2	12	140280	140291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364930
101	NC_006055	ATTTTA	2	12	141165	141176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006055	TTTTCA	2	12	142972	142983	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50364934
103	NC_006055	AGTTAA	2	12	143397	143408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364934
104	NC_006055	AAATCC	2	12	145158	145169	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364935
105	NC_006055	TAAAGT	2	12	145971	145982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364935
106	NC_006055	AATTAA	2	12	146000	146011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50364935
107	NC_006055	TACAAA	2	12	147232	147243	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_006055	AAAAGG	2	12	147625	147636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50364938
109	NC_006055	AGCATT	2	12	148336	148347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50364939
110	NC_006055	AAAATT	2	12	150658	150669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50364944
111	NC_006055	GATGCA	2	12	150835	150846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50364944
112	NC_006055	CAAAAA	2	12	152261	152272	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	50364947
113	NC_006055	GAGGTA	2	12	154228	154239	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006055	TAAAGG	2	12	154717	154728	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50364953
115	NC_006055	CAATTT	2	12	158109	158120	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364958
116	NC_006055	ATAATC	2	12	158437	158448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50364959
117	NC_006055	AAAGTT	2	12	158709	158720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364959
118	NC_006055	GTTTTG	2	12	159328	159339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50364960
119	NC_006055	AGGTCC	2	12	160755	160766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	50364964
120	NC_006055	ATTTAG	2	12	161328	161339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364965
121	NC_006055	TTTAAA	2	12	162459	162470	50 %	50 %	0 %	0 %	50364967
122	NC_006055	AGTTAT	2	12	163370	163381	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364967
123	NC_006055	AAAGAA	2	12	163428	163439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364967
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125	NC_006055	AATTTA	2	12	165358	165369	50 %	50 %	0 %	0 %	50364969
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127	NC_006055	TAAATT	2	12	168973	168984	50 %	50 %	0 %	0 %	50364971
128	NC_006055	GATAAA	2	12	169103	169114	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364971
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196	NC_006055	ATTTAA	2	12	256193	256204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_006055	AGAAAA	2	12	256839	256850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50365048
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220	NC_006055	TTAAAG	2	12	279192	279203	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50365064
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224	NC_006055	AGGAAC	2	12	285150	285161	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	50365072
225	NC_006055	TTTAAT	2	12	285249	285260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50365072
226	NC_006055	TCTTTG	2	12	285479	285490	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	50365072
227	NC_006055	ATTAAA	2	12	286011	286022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
228	NC_006055	TTTTAA	2	12	286314	286325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50365073
229	NC_006055	AACATC	2	12	286552	286563	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50365074
230	NC_006055	GGTGTT	2	12	287803	287814	0 %	50 %	50 %	0 %	50365075
231	NC_006055	ACTTTC	2	12	289267	289278	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	50365076
232	NC_006055	ATTTAA	2	12	291508	291519	50 %	50 %	0 %	0 %	50365077
233	NC_006055	TACGAA	5	30	292618	292647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50365077
234	NC_006055	ATAAAT	2	12	295830	295841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50365077
235	NC_006055	TTTAAT	2	12	296470	296481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50365077
236	NC_006055	TGCTTT	2	12	297419	297430	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	50365078
237	NC_006055	TGAAAA	2	12	297467	297478	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50365078
238	NC_006055	CTAATA	2	12	298396	298407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50365078
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240	NC_006055	TGAAAA	2	12	300437	300448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50365078
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359	NC_006055	CAATTT	2	12	439330	439341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50365197
360	NC_006055	TTTTTG	2	12	439813	439824	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	50365197
361	NC_006055	ACTTTT	2	12	444968	444979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50365204
362	NC_006055	ATCAAA	2	12	448243	448254	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50365207
363	NC_006055	ATGGTA	2	12	448587	448598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50365207
364	NC_006055	TCTTTT	2	12	448664	448675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50365207
365	NC_006055	ATTTTA	2	12	449052	449063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50365207
366	NC_006055	TCAGTA	2	12	449549	449560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50365207
367	NC_006055	GTTTTT	2	12	450099	450110	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	50365207
368	NC_006055	TAAAAA	2	12	450246	450257	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
369	NC_006055	ATTTTC	2	12	451951	451962	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50365209
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379	NC_006055	TAATAT	2	12	471593	471604	50 %	50 %	0 %	0 %	50365221
380	NC_006055	CAAAAG	2	12	471635	471646	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50365221
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382	NC_006055	TAAAAA	2	12	474592	474603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_006055	ACCTTG	2	12	475873	475884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50365223
384	NC_006055	CAGCTT	2	12	476411	476422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50365225
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387	NC_006055	AGCATC	2	12	480300	480311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50365228
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389	NC_006055	TTCTTT	2	12	481067	481078	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50365229
390	NC_006055	CCAATA	3	18	483388	483405	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50365231
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393	NC_006055	TATTTT	2	12	488782	488793	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_006055	TAAGAA	2	12	489595	489606	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50365236
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398	NC_006055	AATTAA	2	12	494806	494817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50365240
399	NC_006055	CAGCTA	2	12	496252	496263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50365241
400	NC_006055	TCAATT	2	12	496911	496922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50365241
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408	NC_006055	AATTAA	2	12	507560	507571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_006055	CCAGCT	2	12	508459	508470	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	50365248
410	NC_006055	TTTAAA	2	12	509074	509085	50 %	50 %	0 %	0 %	50365249
411	NC_006055	ATCAAG	2	12	509998	510009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50365249
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420	NC_006055	AGCTTC	2	12	525421	525432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50365263
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430	NC_006055	ATTTTC	2	12	537227	537238	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50365273
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450	NC_006055	CTCCTT	2	12	563793	563804	0 %	50 %	0 %	50 %	50365296
451	NC_006055	TTAATT	2	12	563901	563912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50365296
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456	NC_006055	TATTTC	2	12	570836	570847	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50365304
457	NC_006055	TCTTAA	2	12	570932	570943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50365304
458	NC_006055	CACTTG	2	12	571870	571881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50365305
459	NC_006055	TATTAA	2	12	572346	572357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_006055	CCAGCT	2	12	573687	573698	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	50365306
461	NC_006055	TCTTTA	2	12	574179	574190	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50365307
462	NC_006055	ACATTG	2	12	580811	580822	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50365313
463	NC_006055	CTTTTT	2	12	582487	582498	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50365313
464	NC_006055	TTAGTT	2	12	583497	583508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
465	NC_006055	TTTTCT	2	12	585181	585192	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50365316
466	NC_006055	ATATTC	2	12	586322	586333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50365316
467	NC_006055	AGTCTT	2	12	587935	587946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50365317
468	NC_006055	CATACA	2	12	588313	588324	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50365318
469	NC_006055	AAAATT	2	12	591132	591143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50365320
470	NC_006055	CTAAAA	2	12	591569	591580	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50365320
471	NC_006055	ATTGAA	2	12	592111	592122	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50365321
472	NC_006055	TAATCC	2	12	592224	592235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50365321
473	NC_006055	TATTTT	2	12	592447	592458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50365322
474	NC_006055	AATTAT	2	12	593249	593260	50 %	50 %	0 %	0 %	50365322
475	NC_006055	AAATTT	2	12	596710	596721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_006055	AAACTA	2	12	597529	597540	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50365324
477	NC_006055	ATTAAT	2	12	598528	598539	50 %	50 %	0 %	0 %	50365325
478	NC_006055	TAAATT	2	12	598662	598673	50 %	50 %	0 %	0 %	50365325
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