MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 1428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	GGGAT	2	10	142	151	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005791	TTAAA	2	10	190	199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005791	CATAC	2	10	2665	2674	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_005791	CCAAG	2	10	3165	3174	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_005791	GGGAT	2	10	5183	5192	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005791	TTAAA	2	10	5231	5240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005791	CATAC	2	10	7706	7715	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_005791	CCAAG	2	10	8206	8215	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_005791	TGGAA	2	10	10784	10793	40 %	20 %	40 %	0 %	45357565
10	NC_005791	CTGTT	2	10	13044	13053	0 %	60 %	20 %	20 %	45357567
11	NC_005791	ATTTT	2	10	13684	13693	20 %	80 %	0 %	0 %	45357568
12	NC_005791	ATATG	2	10	14799	14808	40 %	40 %	20 %	0 %	45357568
13	NC_005791	AAAAT	2	10	15083	15092	80 %	20 %	0 %	0 %	45357568
14	NC_005791	CATAA	2	10	15170	15179	60 %	20 %	0 %	20 %	45357568
15	NC_005791	AAAAC	2	10	16105	16114	80 %	0 %	0 %	20 %	45357569
16	NC_005791	TAAAA	6	30	17571	17600	80 %	20 %	0 %	0 %	45357570
17	NC_005791	TCAAT	2	10	18732	18741	40 %	40 %	0 %	20 %	45357571
18	NC_005791	TTTTA	2	10	19252	19261	20 %	80 %	0 %	0 %	45357571
19	NC_005791	CAATT	2	10	21952	21961	40 %	40 %	0 %	20 %	45357574
20	NC_005791	ATTCA	2	10	25168	25177	40 %	40 %	0 %	20 %	45357577
21	NC_005791	CTTTT	2	10	26316	26325	0 %	80 %	0 %	20 %	45357579
22	NC_005791	TAGAT	2	10	26564	26573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005791	CAGAA	2	10	27912	27921	60 %	0 %	20 %	20 %	45357581
24	NC_005791	AAAAC	2	10	28521	28530	80 %	0 %	0 %	20 %	45357581
25	NC_005791	CTAAA	2	10	28786	28795	60 %	20 %	0 %	20 %	45357582
26	NC_005791	TTAAA	2	10	28913	28922	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005791	TAAAA	2	10	28973	28982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005791	AGTGG	2	10	29208	29217	20 %	20 %	60 %	0 %	45357583
29	NC_005791	TATCC	2	10	29394	29403	20 %	40 %	0 %	40 %	45357583
30	NC_005791	AATTT	2	10	30418	30427	40 %	60 %	0 %	0 %	45357585
31	NC_005791	ATTTA	2	10	35845	35854	40 %	60 %	0 %	0 %	45357589
32	NC_005791	ACCGT	2	10	36097	36106	20 %	20 %	20 %	40 %	45357589
33	NC_005791	ATGAA	2	10	37098	37107	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005791	GGGAT	2	10	37193	37202	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005791	TTAAA	2	10	37241	37250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005791	CATAC	2	10	39716	39725	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_005791	CCAAG	2	10	40216	40225	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_005791	TAATG	2	10	42122	42131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005791	TTATA	2	10	44223	44232	40 %	60 %	0 %	0 %	45357591
40	NC_005791	TAAAT	2	10	44511	44520	60 %	40 %	0 %	0 %	45357591
41	NC_005791	TAAAT	2	10	44705	44714	60 %	40 %	0 %	0 %	45357591
42	NC_005791	ACTAA	2	10	44814	44823	60 %	20 %	0 %	20 %	45357592
43	NC_005791	TTTTA	2	10	44948	44957	20 %	80 %	0 %	0 %	45357592
44	NC_005791	GTTCA	2	10	47251	47260	20 %	40 %	20 %	20 %	45357593
45	NC_005791	ATTTT	2	10	49030	49039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005791	CAAAA	2	10	49272	49281	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_005791	AATAT	2	10	50005	50014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005791	ATATT	2	10	50360	50369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005791	ATGCA	2	10	51767	51776	40 %	20 %	20 %	20 %	45357597
50	NC_005791	AAATT	2	10	54184	54193	60 %	40 %	0 %	0 %	45357599
51	NC_005791	TTTTC	2	10	56923	56932	0 %	80 %	0 %	20 %	45357602
52	NC_005791	AATCA	2	10	57492	57501	60 %	20 %	0 %	20 %	45357603
53	NC_005791	TTTCT	2	10	58943	58952	0 %	80 %	0 %	20 %	45357604
54	NC_005791	GACAG	2	10	59490	59499	40 %	0 %	40 %	20 %	45357604
55	NC_005791	CAAAG	2	10	61547	61556	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_005791	TTTAA	2	10	62801	62810	40 %	60 %	0 %	0 %	45357607
57	NC_005791	TAATT	2	10	62907	62916	40 %	60 %	0 %	0 %	45357607
58	NC_005791	GTACA	2	10	66006	66015	40 %	20 %	20 %	20 %	45357612
59	NC_005791	AAATT	2	10	66789	66798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005791	AAGAA	2	10	67095	67104	80 %	0 %	20 %	0 %	45357614
61	NC_005791	ATTTA	2	10	68112	68121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005791	TATTT	2	10	70094	70103	20 %	80 %	0 %	0 %	45357619
63	NC_005791	AATTA	2	10	72766	72775	60 %	40 %	0 %	0 %	45357621
64	NC_005791	TTTTA	2	10	73608	73617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005791	TATTG	2	10	75231	75240	20 %	60 %	20 %	0 %	45357625
66	NC_005791	TTAAA	2	10	77086	77095	60 %	40 %	0 %	0 %	45357627
67	NC_005791	GGTCA	2	10	77260	77269	20 %	20 %	40 %	20 %	45357628
68	NC_005791	GAACA	2	10	79128	79137	60 %	0 %	20 %	20 %	45357630
69	NC_005791	ATTCC	2	10	79851	79860	20 %	40 %	0 %	40 %	45357631
70	NC_005791	GTGCC	2	10	80799	80808	0 %	20 %	40 %	40 %	45357632
71	NC_005791	TTTTA	2	10	82595	82604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005791	ATTTT	2	10	84838	84847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005791	ACTAT	2	10	85140	85149	40 %	40 %	0 %	20 %	45357636
74	NC_005791	GAAAA	2	10	87390	87399	80 %	0 %	20 %	0 %	45357638
75	NC_005791	AATAA	2	10	88237	88246	80 %	20 %	0 %	0 %	45357640
76	NC_005791	ATAAA	2	10	88574	88583	80 %	20 %	0 %	0 %	45357640
77	NC_005791	TTTTA	2	10	89323	89332	20 %	80 %	0 %	0 %	45357641
78	NC_005791	AATTA	2	10	91444	91453	60 %	40 %	0 %	0 %	45357643
79	NC_005791	TTTAA	2	10	91596	91605	40 %	60 %	0 %	0 %	45357643
80	NC_005791	CTGTT	2	10	94659	94668	0 %	60 %	20 %	20 %	45357646
81	NC_005791	TCTTT	2	10	95565	95574	0 %	80 %	0 %	20 %	45357647
82	NC_005791	CTATT	2	10	96131	96140	20 %	60 %	0 %	20 %	45357648
83	NC_005791	CATTG	2	10	96326	96335	20 %	40 %	20 %	20 %	45357648
84	NC_005791	TGAAG	2	10	97334	97343	40 %	20 %	40 %	0 %	45357649
85	NC_005791	TTAAT	2	10	102473	102482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005791	AATAA	2	10	105362	105371	80 %	20 %	0 %	0 %	45357658
87	NC_005791	GAAAT	2	10	105684	105693	60 %	20 %	20 %	0 %	45357658
88	NC_005791	ATCTA	2	10	107167	107176	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_005791	TTCAC	2	10	107393	107402	20 %	40 %	0 %	40 %	45357660
90	NC_005791	TTTAT	2	10	108380	108389	20 %	80 %	0 %	0 %	45357662
91	NC_005791	AATTT	2	10	112714	112723	40 %	60 %	0 %	0 %	45357666
92	NC_005791	TTTTA	2	10	112743	112752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005791	ATCCC	2	10	113318	113327	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_005791	ATTAA	2	10	115097	115106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005791	ATTTT	2	10	115831	115840	20 %	80 %	0 %	0 %	45357670
96	NC_005791	CAGTG	2	10	115925	115934	20 %	20 %	40 %	20 %	45357670
97	NC_005791	TTTTA	2	10	116279	116288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005791	TGGAT	2	10	120361	120370	20 %	40 %	40 %	0 %	45357674
99	NC_005791	TTGTT	2	10	120619	120628	0 %	80 %	20 %	0 %	45357675
100	NC_005791	AATTC	2	10	120960	120969	40 %	40 %	0 %	20 %	45357675
101	NC_005791	AAAAT	2	10	122337	122346	80 %	20 %	0 %	0 %	45357676
102	NC_005791	TTATT	2	10	122670	122679	20 %	80 %	0 %	0 %	45357677
103	NC_005791	GTATT	2	10	123078	123087	20 %	60 %	20 %	0 %	45357677
104	NC_005791	ACACT	2	10	123532	123541	40 %	20 %	0 %	40 %	45357678
105	NC_005791	CTTAA	2	10	125181	125190	40 %	40 %	0 %	20 %	45357679
106	NC_005791	TATTT	2	10	127160	127169	20 %	80 %	0 %	0 %	45357682
107	NC_005791	ATTTT	2	10	127922	127931	20 %	80 %	0 %	0 %	45357684
108	NC_005791	TCCAA	2	10	128099	128108	40 %	20 %	0 %	40 %	45357685
109	NC_005791	ACAGA	2	10	133345	133354	60 %	0 %	20 %	20 %	45357689
110	NC_005791	AGCAA	2	10	134486	134495	60 %	0 %	20 %	20 %	45357690
111	NC_005791	TCATA	2	10	134686	134695	40 %	40 %	0 %	20 %	45357690
112	NC_005791	GTTTT	2	10	135072	135081	0 %	80 %	20 %	0 %	45357691
113	NC_005791	GAAAA	2	10	137139	137148	80 %	0 %	20 %	0 %	45357693
114	NC_005791	CTTTT	2	10	137655	137664	0 %	80 %	0 %	20 %	45357694
115	NC_005791	TAAAA	2	10	139081	139090	80 %	20 %	0 %	0 %	45357695
116	NC_005791	AAAAT	2	10	143906	143915	80 %	20 %	0 %	0 %	45357700
117	NC_005791	GTTTT	2	10	143931	143940	0 %	80 %	20 %	0 %	45357700
118	NC_005791	AAAGA	2	10	144467	144476	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005791	TTGAT	2	10	145687	145696	20 %	60 %	20 %	0 %	45357701
120	NC_005791	TTCAC	2	10	147292	147301	20 %	40 %	0 %	40 %	45357702
121	NC_005791	ATTTT	2	10	150626	150635	20 %	80 %	0 %	0 %	45357704
122	NC_005791	CCTGA	2	10	150961	150970	20 %	20 %	20 %	40 %	45357704
123	NC_005791	ATAAC	2	10	155461	155470	60 %	20 %	0 %	20 %	45357709
124	NC_005791	AAAAG	2	10	155696	155705	80 %	0 %	20 %	0 %	45357709
125	NC_005791	ACTGG	2	10	158152	158161	20 %	20 %	40 %	20 %	45357711
126	NC_005791	AAATG	2	10	158854	158863	60 %	20 %	20 %	0 %	45357711
127	NC_005791	GAAAA	2	10	159177	159186	80 %	0 %	20 %	0 %	45357711
128	NC_005791	CTTTT	2	10	161758	161767	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_005791	TTTTC	2	10	164105	164114	0 %	80 %	0 %	20 %	45357716
130	NC_005791	TTGAT	2	10	164866	164875	20 %	60 %	20 %	0 %	45357716
131	NC_005791	TGAAC	2	10	167459	167468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_005791	AAAAC	2	10	168967	168976	80 %	0 %	0 %	20 %	45357722
133	NC_005791	TAATT	2	10	169140	169149	40 %	60 %	0 %	0 %	45357723
134	NC_005791	TTTCT	2	10	170406	170415	0 %	80 %	0 %	20 %	45357723
135	NC_005791	AAATC	2	10	171108	171117	60 %	20 %	0 %	20 %	45357724
136	NC_005791	CAAGT	2	10	171212	171221	40 %	20 %	20 %	20 %	45357724
137	NC_005791	ATTAA	2	10	173146	173155	60 %	40 %	0 %	0 %	45357727
138	NC_005791	GCTTC	2	10	174128	174137	0 %	40 %	20 %	40 %	45357728
139	NC_005791	TCCCG	2	10	175898	175907	0 %	20 %	20 %	60 %	45357730
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141	NC_005791	CACTG	2	10	176617	176626	20 %	20 %	20 %	40 %	45357730
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