MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 chromosome

Total Repeats: 1072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005364	AACAGC	2	12	921	932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	42560561
2	NC_005364	TAGAAA	3	18	1509	1526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005364	TAGTAA	2	12	1527	1538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005364	TTTAAA	2	12	2084	2095	50 %	50 %	0 %	0 %	42560562
5	NC_005364	AACTAA	2	12	2632	2643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42560562
6	NC_005364	ATTTTT	2	12	2742	2753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005364	ATTTAA	2	12	3339	3350	50 %	50 %	0 %	0 %	42560564
8	NC_005364	AGAAAA	2	12	5227	5238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42560565
9	NC_005364	CTTTAT	2	12	5977	5988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560566
10	NC_005364	GTTGAA	2	12	5991	6002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560566
11	NC_005364	AAACTA	2	12	6610	6621	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42560566
12	NC_005364	TGATGG	2	12	7904	7915	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	42560567
13	NC_005364	TGAAGA	2	12	9050	9061	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42560567
14	NC_005364	TCCTAA	2	12	10721	10732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560568
15	NC_005364	GTTCTT	2	12	11265	11276	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42560569
16	NC_005364	CTTGTT	2	12	11691	11702	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42560569
17	NC_005364	CATTAA	2	12	12204	12215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560569
18	NC_005364	CTTTTT	2	12	13843	13854	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560570
19	NC_005364	ATACCA	2	12	14961	14972	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42560570
20	NC_005364	TTAAAT	2	12	16909	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005364	TTTTCT	2	12	17301	17312	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560572
22	NC_005364	TCTAAT	2	12	19015	19026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560573
23	NC_005364	TTTACT	2	12	19483	19494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560573
24	NC_005364	AAAATA	2	12	19529	19540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	42560573
25	NC_005364	TCTTTA	2	12	22883	22894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560575
26	NC_005364	TTTTAG	2	12	23346	23357	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560576
27	NC_005364	CAATAT	2	12	24506	24517	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560577
28	NC_005364	ACCAGG	2	12	27382	27393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42560581
29	NC_005364	TTTGAA	2	12	27447	27458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560581
30	NC_005364	ACTATT	2	12	28679	28690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560582
31	NC_005364	AGTTGT	2	12	29651	29662	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	42560584
32	NC_005364	AAAACC	2	12	31655	31666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42560588
33	NC_005364	TTAACT	2	12	32678	32689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560590
34	NC_005364	AAAACA	2	12	33038	33049	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42560590
35	NC_005364	TCCAGA	2	12	33103	33114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	42560590
36	NC_005364	GTTTTT	2	12	33327	33338	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	42560590
37	NC_005364	TAGTTT	2	12	33438	33449	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560590
38	NC_005364	TTTCAT	2	12	34833	34844	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560592
39	NC_005364	TAGTTT	2	12	35301	35312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560592
40	NC_005364	CAATTC	2	12	35373	35384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560592
41	NC_005364	TTTCAT	2	12	36615	36626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560592
42	NC_005364	GATTTT	2	12	38451	38462	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560593
43	NC_005364	TCAAAT	2	12	39141	39152	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560593
44	NC_005364	CAGCAA	2	12	39730	39741	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	42560593
45	NC_005364	GAAAAA	2	12	42436	42447	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42560593
46	NC_005364	GTTGAT	2	12	42909	42920	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	42560593
47	NC_005364	ATATTT	2	12	43039	43050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560593
48	NC_005364	AAATTT	2	12	43623	43634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005364	AGCTGG	2	12	44566	44577	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	42560594
50	NC_005364	GGATAT	2	12	47903	47914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560598
51	NC_005364	TCTTGT	2	12	49656	49667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	42560599
52	NC_005364	TTTTTC	2	12	49673	49684	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560599
53	NC_005364	TAAAAT	2	12	51140	51151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560599
54	NC_005364	CAAAAC	2	12	51492	51503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42560599
55	NC_005364	TGTAAT	2	12	53415	53426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560602
56	NC_005364	TATTAA	2	12	53773	53784	50 %	50 %	0 %	0 %	42560602
57	NC_005364	TTAATC	2	12	54825	54836	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560604
58	NC_005364	TGATTT	2	12	59035	59046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560608
59	NC_005364	TTTTTC	2	12	61459	61470	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560611
60	NC_005364	TGTTAT	2	12	61716	61727	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560611
61	NC_005364	AAAATC	2	12	63888	63899	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42560612
62	NC_005364	TGATTT	2	12	64279	64290	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560612
63	NC_005364	ATTTTG	2	12	64299	64310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560612
64	NC_005364	ATTGTT	2	12	64323	64334	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560612
65	NC_005364	TCTTTA	2	12	67663	67674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560615
66	NC_005364	TTTTAG	2	12	68126	68137	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560616
67	NC_005364	TTTAAT	2	12	69064	69075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560619
68	NC_005364	GGATAT	2	12	69717	69728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560620
69	NC_005364	TCACAA	2	12	72403	72414	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42560622
70	NC_005364	ATTAAA	2	12	72477	72488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42560622
71	NC_005364	GATATT	2	12	73183	73194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560623
72	NC_005364	GTTAAA	2	12	73534	73545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42560624
73	NC_005364	ATTGCT	2	12	73651	73662	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	42560624
74	NC_005364	GATATT	2	12	74744	74755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005364	ATTCTT	2	12	75586	75597	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	42560625
76	NC_005364	CTAGAA	2	12	77943	77954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42560628
77	NC_005364	TTAAAT	2	12	78571	78582	50 %	50 %	0 %	0 %	42560629
78	NC_005364	ATATCC	2	12	81568	81579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560630
79	NC_005364	ATATCC	2	12	81977	81988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_005364	ACATCT	2	12	82445	82456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560631
81	NC_005364	ATATCT	2	12	88556	88567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_005364	GGATAT	2	12	88881	88892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560633
83	NC_005364	ATATCT	2	12	90570	90581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_005364	ATTTAA	2	12	91711	91722	50 %	50 %	0 %	0 %	42560634
85	NC_005364	ATTAAT	2	12	92286	92297	50 %	50 %	0 %	0 %	42560634
86	NC_005364	ATGTTA	2	12	92311	92322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560634
87	NC_005364	TGGTAA	2	12	92478	92489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560635
88	NC_005364	TTTGAG	2	12	94010	94021	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	42560636
89	NC_005364	AGCTAA	2	12	94149	94160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	42560636
90	NC_005364	CAAAAA	2	12	94190	94201	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42560636
91	NC_005364	TGAAAA	2	12	95394	95405	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42560636
92	NC_005364	ATCAAT	2	12	98469	98480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560639
93	NC_005364	GTTTTT	2	12	99298	99309	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	42560639
94	NC_005364	AGTTAA	2	12	101082	101093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42560641
95	NC_005364	CTTTTT	2	12	106729	106740	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42560648
96	NC_005364	CAATAT	2	12	106899	106910	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560648
97	NC_005364	TTTTGA	2	12	110454	110465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560650
98	NC_005364	AGAGGA	2	12	112869	112880	50 %	0 %	50 %	0 %	42560652
99	NC_005364	TTTTAG	2	12	114306	114317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	42560654
100	NC_005364	CTAATA	2	12	114458	114469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560654
101	NC_005364	GTTAAA	2	12	114929	114940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42560655
102	NC_005364	GGATAT	2	12	115399	115410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560656
103	NC_005364	ATATCC	2	12	119201	119212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42560657
104	NC_005364	TTTTAT	2	12	120074	120085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42560659
105	NC_005364	ATATTT	2	12	121686	121697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560661
106	NC_005364	ATTTTT	2	12	122321	122332	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42560662
107	NC_005364	GTTGAT	2	12	122747	122758	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	42560662
108	NC_005364	CATAAC	2	12	123187	123198	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42560664
109	NC_005364	ATTAGT	2	12	123758	123769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560664
110	NC_005364	ATTTTT	2	12	125100	125111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	42560666
111	NC_005364	AACATC	2	12	125475	125486	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42560666
112	NC_005364	ATAAAA	2	12	127222	127233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005364	TAAAAA	2	12	127370	127381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	42560667
114	NC_005364	ATGGTG	2	12	134090	134101	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005364	TAAAGT	2	12	134862	134873	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005364	AAAAGA	2	12	135346	135357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	42560673
117	NC_005364	ATATTG	2	12	135864	135875	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42560673
118	NC_005364	ACAAAA	2	12	136388	136399	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	42560674
119	NC_005364	TAATAT	2	12	136661	136672	50 %	50 %	0 %	0 %	42560674
120	NC_005364	TTGGAA	2	12	137521	137532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560674
121	NC_005364	TTTTAA	2	12	140523	140534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560677
122	NC_005364	AAAAGT	2	12	140818	140829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42560677
123	NC_005364	AACTTT	2	12	141130	141141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	42560677
124	NC_005364	ATATCC	2	12	144690	144701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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242	NC_005364	AAATTC	2	12	275184	275195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	42560789
243	NC_005364	ATTTTA	2	12	275704	275715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42560790
244	NC_005364	GGATAT	2	12	278553	278564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560793
245	NC_005364	CTAAAA	2	12	280240	280251	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
246	NC_005364	AGATAA	2	12	280700	280711	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42560794
247	NC_005364	ATATTA	2	12	281815	281826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_005364	TTAATT	2	12	282310	282321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_005364	GGATAT	2	12	284297	284308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560797
250	NC_005364	ATTTTC	2	12	288303	288314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_005364	AGTTGA	2	12	288452	288463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42560801
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352	NC_005364	TTTAGT	2	12	395188	395199	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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354	NC_005364	ATATGT	2	12	395343	395354	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_005364	TATTAA	2	12	487610	487621	50 %	50 %	0 %	0 %	42560968
449	NC_005364	TCTTTT	2	12	487927	487938	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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475	NC_005364	ATTTTA	2	12	522741	522752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_005364	AAAATG	2	12	524331	524342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42560997
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479	NC_005364	AAGATT	2	12	532436	532447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	42561004
480	NC_005364	TAAAAA	2	12	532805	532816	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	42561004
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483	NC_005364	ACTAAA	2	12	536754	536765	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	42561008
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