MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycoplasma gallisepticum str. R(low) chromosome

Total Repeats: 1007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004829	ATCAT	2	10	1093	1102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004829	AAAGT	2	10	1582	1591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004829	ATATT	2	10	1858	1867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004829	TCATT	2	10	1897	1906	20 %	60 %	0 %	20 %	294660181
5	NC_004829	AAAAG	2	10	3459	3468	80 %	0 %	20 %	0 %	31544207
6	NC_004829	AGCTT	2	10	5484	5493	20 %	40 %	20 %	20 %	294660184
7	NC_004829	CTGAT	2	10	6272	6281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004829	GATGA	2	10	8280	8289	40 %	20 %	40 %	0 %	294660185
9	NC_004829	AAAAG	2	10	8994	9003	80 %	0 %	20 %	0 %	31544213
10	NC_004829	TTATC	2	10	10465	10474	20 %	60 %	0 %	20 %	294660187
11	NC_004829	CTTCA	2	10	14084	14093	20 %	40 %	0 %	40 %	294660189
12	NC_004829	TTGCA	2	10	14919	14928	20 %	40 %	20 %	20 %	294660190
13	NC_004829	CCACA	2	10	15038	15047	40 %	0 %	0 %	60 %	294660190
14	NC_004829	CCCAA	2	10	15062	15071	40 %	0 %	0 %	60 %	294660190
15	NC_004829	ATTTA	2	10	17722	17731	40 %	60 %	0 %	0 %	294660192
16	NC_004829	ATAGT	2	10	18540	18549	40 %	40 %	20 %	0 %	294660193
17	NC_004829	TTAAA	2	10	20567	20576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004829	ATCTG	2	10	21465	21474	20 %	40 %	20 %	20 %	31544223
19	NC_004829	GGTTT	2	10	21882	21891	0 %	60 %	40 %	0 %	31544223
20	NC_004829	TTTAG	2	10	22352	22361	20 %	60 %	20 %	0 %	294660194
21	NC_004829	TTTAA	2	10	24276	24285	40 %	60 %	0 %	0 %	31544225
22	NC_004829	CCAAC	2	10	26442	26451	40 %	0 %	0 %	60 %	31544225
23	NC_004829	TAAAT	2	10	27362	27371	60 %	40 %	0 %	0 %	31544225
24	NC_004829	AAGTT	2	10	27406	27415	40 %	40 %	20 %	0 %	31544225
25	NC_004829	ACAAG	2	10	27720	27729	60 %	0 %	20 %	20 %	31544225
26	NC_004829	TGAAC	2	10	27807	27816	40 %	20 %	20 %	20 %	31544225
27	NC_004829	GTAAT	2	10	28513	28522	40 %	40 %	20 %	0 %	31544226
28	NC_004829	AAAAG	2	10	28774	28783	80 %	0 %	20 %	0 %	31544226
29	NC_004829	GTTAA	2	10	29857	29866	40 %	40 %	20 %	0 %	31544226
30	NC_004829	TTCCA	2	10	30252	30261	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_004829	AACCA	2	10	30548	30557	60 %	0 %	0 %	40 %	294660195
32	NC_004829	GGATT	2	10	31641	31650	20 %	40 %	40 %	0 %	294660196
33	NC_004829	TTAAT	2	10	36629	36638	40 %	60 %	0 %	0 %	294660201
34	NC_004829	ATTTT	2	10	36650	36659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004829	TTAGT	2	10	38524	38533	20 %	60 %	20 %	0 %	294660202
36	NC_004829	AGATG	2	10	38769	38778	40 %	20 %	40 %	0 %	31544235
37	NC_004829	AACAA	2	10	38842	38851	80 %	0 %	0 %	20 %	31544235
38	NC_004829	CCTTA	2	10	39000	39009	20 %	40 %	0 %	40 %	31544235
39	NC_004829	AAAGT	2	10	41636	41645	60 %	20 %	20 %	0 %	294660203
40	NC_004829	TTCAA	2	10	46052	46061	40 %	40 %	0 %	20 %	294660204
41	NC_004829	AACTG	2	10	46175	46184	40 %	20 %	20 %	20 %	294660204
42	NC_004829	CTAAC	2	10	46303	46312	40 %	20 %	0 %	40 %	294660204
43	NC_004829	TAAAC	2	10	46463	46472	60 %	20 %	0 %	20 %	294660204
44	NC_004829	AAAGA	2	10	46588	46597	80 %	0 %	20 %	0 %	294660205
45	NC_004829	AATGA	2	10	48028	48037	60 %	20 %	20 %	0 %	31544240
46	NC_004829	ACAAA	2	10	49350	49359	80 %	0 %	0 %	20 %	294660206
47	NC_004829	TTAAT	2	10	49841	49850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004829	TAGAT	2	10	53956	53965	40 %	40 %	20 %	0 %	294660208
49	NC_004829	TTTAG	2	10	55499	55508	20 %	60 %	20 %	0 %	294660208
50	NC_004829	AAAGA	2	10	55800	55809	80 %	0 %	20 %	0 %	294660209
51	NC_004829	TAATT	2	10	55925	55934	40 %	60 %	0 %	0 %	294660209
52	NC_004829	CATTG	2	10	59599	59608	20 %	40 %	20 %	20 %	31544247
53	NC_004829	AAAGG	2	10	62618	62627	60 %	0 %	40 %	0 %	31544250
54	NC_004829	TTAGC	2	10	63830	63839	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_004829	TTTAT	2	10	64381	64390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004829	CAGTT	2	10	66882	66891	20 %	40 %	20 %	20 %	31544255
57	NC_004829	TAAAA	2	10	67485	67494	80 %	20 %	0 %	0 %	161511519
58	NC_004829	GCAAA	2	10	68452	68461	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004829	TTTCA	2	10	70220	70229	20 %	60 %	0 %	20 %	161511517
60	NC_004829	ACGTT	2	10	73201	73210	20 %	40 %	20 %	20 %	294660216
61	NC_004829	CTAAA	2	10	73591	73600	60 %	20 %	0 %	20 %	31544269
62	NC_004829	TAAAT	2	10	75807	75816	60 %	40 %	0 %	0 %	161511515
63	NC_004829	ATTTA	2	10	76209	76218	40 %	60 %	0 %	0 %	31544274
64	NC_004829	AAGAT	2	10	77737	77746	60 %	20 %	20 %	0 %	294660219
65	NC_004829	AATTT	2	10	78230	78239	40 %	60 %	0 %	0 %	31544276
66	NC_004829	CTAAA	2	10	78928	78937	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_004829	ATTTA	2	10	80142	80151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004829	CAAAC	2	10	80244	80253	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_004829	ATCAA	2	10	80458	80467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004829	ATATA	2	10	80473	80482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004829	CTCAT	2	10	83034	83043	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_004829	CTTCC	2	10	83308	83317	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_004829	TTAAT	2	10	83671	83680	40 %	60 %	0 %	0 %	294660220
74	NC_004829	TTTGT	2	10	83952	83961	0 %	80 %	20 %	0 %	294660220
75	NC_004829	TCAGT	2	10	84025	84034	20 %	40 %	20 %	20 %	294660220
76	NC_004829	TTAAA	2	10	84133	84142	60 %	40 %	0 %	0 %	294660220
77	NC_004829	ATTTA	2	10	85031	85040	40 %	60 %	0 %	0 %	294660220
78	NC_004829	TCAGA	2	10	86185	86194	40 %	20 %	20 %	20 %	294660220
79	NC_004829	TTTCT	2	10	86219	86228	0 %	80 %	0 %	20 %	294660220
80	NC_004829	TAATA	2	10	87047	87056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004829	TAAAC	2	10	87123	87132	60 %	20 %	0 %	20 %	294660221
82	NC_004829	AAAAC	2	10	90799	90808	80 %	0 %	0 %	20 %	31544282
83	NC_004829	TGGTT	2	10	91561	91570	0 %	60 %	40 %	0 %	31544282
84	NC_004829	GTTGC	2	10	93028	93037	0 %	40 %	40 %	20 %	294660222
85	NC_004829	AAATT	2	10	93619	93628	60 %	40 %	0 %	0 %	294660222
86	NC_004829	ATGAT	2	10	93956	93965	40 %	40 %	20 %	0 %	294660222
87	NC_004829	TAAAA	2	10	94966	94975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004829	AAAAC	2	10	95599	95608	80 %	0 %	0 %	20 %	31544286
89	NC_004829	CTGTT	2	10	95797	95806	0 %	60 %	20 %	20 %	294660224
90	NC_004829	TTCAG	2	10	96275	96284	20 %	40 %	20 %	20 %	294660224
91	NC_004829	TGTGA	2	10	96806	96815	20 %	40 %	40 %	0 %	294660224
92	NC_004829	TTAAA	2	10	97245	97254	60 %	40 %	0 %	0 %	294660224
93	NC_004829	ATCGA	2	10	97323	97332	40 %	20 %	20 %	20 %	294660224
94	NC_004829	TTTGG	2	10	97815	97824	0 %	60 %	40 %	0 %	294660225
95	NC_004829	TTAAA	2	10	98098	98107	60 %	40 %	0 %	0 %	294660225
96	NC_004829	TGATG	2	10	98654	98663	20 %	40 %	40 %	0 %	294660225
97	NC_004829	TTGTT	2	10	99386	99395	0 %	80 %	20 %	0 %	294660225
98	NC_004829	TAAAT	2	10	99749	99758	60 %	40 %	0 %	0 %	31544289
99	NC_004829	AAATT	2	10	101066	101075	60 %	40 %	0 %	0 %	31544290
100	NC_004829	AACTT	2	10	101130	101139	40 %	40 %	0 %	20 %	31544290
101	NC_004829	AAACC	2	10	101488	101497	60 %	0 %	0 %	40 %	31544290
102	NC_004829	ATTCA	2	10	101734	101743	40 %	40 %	0 %	20 %	31544290
103	NC_004829	CTAAA	2	10	102006	102015	60 %	20 %	0 %	20 %	31544290
104	NC_004829	GAATC	2	10	103359	103368	40 %	20 %	20 %	20 %	294660226
105	NC_004829	ATTAG	2	10	103918	103927	40 %	40 %	20 %	0 %	294660226
106	NC_004829	ATATA	2	10	105290	105299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004829	TTAAT	2	10	107945	107954	40 %	60 %	0 %	0 %	294660230
108	NC_004829	TGTTT	2	10	108550	108559	0 %	80 %	20 %	0 %	294660230
109	NC_004829	TAAAA	2	10	109243	109252	80 %	20 %	0 %	0 %	31544296
110	NC_004829	ACTGA	2	10	109589	109598	40 %	20 %	20 %	20 %	31544296
111	NC_004829	CTAAC	2	10	109739	109748	40 %	20 %	0 %	40 %	294660231
112	NC_004829	AGATC	2	10	112435	112444	40 %	20 %	20 %	20 %	294660232
113	NC_004829	TTCAG	2	10	112844	112853	20 %	40 %	20 %	20 %	294660232
114	NC_004829	TGAGA	2	10	113509	113518	40 %	20 %	40 %	0 %	294660232
115	NC_004829	ATTTA	2	10	114061	114070	40 %	60 %	0 %	0 %	294660232
116	NC_004829	ATCTT	2	10	115217	115226	20 %	60 %	0 %	20 %	294660233
117	NC_004829	CTGAT	2	10	117690	117699	20 %	40 %	20 %	20 %	294660233
118	NC_004829	ACGTA	2	10	118180	118189	40 %	20 %	20 %	20 %	294660233
119	NC_004829	GAGAT	2	10	118530	118539	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004829	ATCTC	2	10	118556	118565	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_004829	GTTTT	2	10	118721	118730	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004829	TTAAA	2	10	119199	119208	60 %	40 %	0 %	0 %	31544300
123	NC_004829	TTAAT	2	10	119879	119888	40 %	60 %	0 %	0 %	31544300
124	NC_004829	CTTTG	2	10	120034	120043	0 %	60 %	20 %	20 %	31544300
125	NC_004829	ATTTT	2	10	120679	120688	20 %	80 %	0 %	0 %	31544300
126	NC_004829	AAATC	2	10	120868	120877	60 %	20 %	0 %	20 %	31544301
127	NC_004829	ACATA	2	10	122804	122813	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004829	TTTGC	2	10	122970	122979	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_004829	TTAAT	2	10	123648	123657	40 %	60 %	0 %	0 %	294660234
130	NC_004829	CATTA	2	10	128414	128423	40 %	40 %	0 %	20 %	294660237
131	NC_004829	TGAAC	2	10	129481	129490	40 %	20 %	20 %	20 %	294660237
132	NC_004829	TAATT	2	10	129551	129560	40 %	60 %	0 %	0 %	294660237
133	NC_004829	AAATG	2	10	130973	130982	60 %	20 %	20 %	0 %	31544308
134	NC_004829	ATTTT	2	10	131520	131529	20 %	80 %	0 %	0 %	31544308
135	NC_004829	TTAAT	2	10	132002	132011	40 %	60 %	0 %	0 %	294660239
136	NC_004829	TTAAC	2	10	132943	132952	40 %	40 %	0 %	20 %	294660240
137	NC_004829	TAATT	2	10	133124	133133	40 %	60 %	0 %	0 %	294660240
138	NC_004829	TTTAA	2	10	133572	133581	40 %	60 %	0 %	0 %	294660240
139	NC_004829	ATTTT	2	10	134715	134724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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