MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 112404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	AT	3	6	15	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003552	AAT	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003552	TATGA	2	10	148	157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003552	TA	3	6	180	185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003552	AT	3	6	253	258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003552	TTG	2	6	279	284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088900
7	NC_003552	AAG	2	6	332	337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
8	NC_003552	ATG	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088900
9	NC_003552	TGGG	2	8	603	610	0 %	25 %	75 %	0 %	20088900
10	NC_003552	GC	3	6	660	665	0 %	0 %	50 %	50 %	20088900
11	NC_003552	TTC	2	6	674	679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
12	NC_003552	TC	4	8	699	706	0 %	50 %	0 %	50 %	20088900
13	NC_003552	AGG	2	6	729	734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088900
14	NC_003552	CGG	2	6	744	749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088900
15	NC_003552	CGT	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088900
16	NC_003552	CAT	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088900
17	NC_003552	TTC	3	9	890	898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
18	NC_003552	TA	3	6	1012	1017	50 %	50 %	0 %	0 %	20088900
19	NC_003552	CAT	2	6	1021	1026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088900
20	NC_003552	TCG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088900
21	NC_003552	ATG	2	6	1065	1070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088900
22	NC_003552	CTT	3	9	1147	1155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
23	NC_003552	AAG	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
24	NC_003552	ACA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088900
25	NC_003552	A	6	6	1231	1236	100 %	0 %	0 %	0 %	20088900
26	NC_003552	TTCCT	2	10	1265	1274	0 %	60 %	0 %	40 %	20088900
27	NC_003552	TC	3	6	1339	1344	0 %	50 %	0 %	50 %	20088900
28	NC_003552	TAA	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088900
29	NC_003552	AAG	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
30	NC_003552	GAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
31	NC_003552	ATGA	2	8	1509	1516	50 %	25 %	25 %	0 %	20088900
32	NC_003552	ACAG	2	8	1591	1598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003552	CAAAT	2	10	1617	1626	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_003552	T	7	7	1655	1661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003552	GTTTT	2	10	1690	1699	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003552	T	6	6	1747	1752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003552	T	7	7	1762	1768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003552	ATT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003552	A	7	7	1834	1840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003552	ATT	2	6	1845	1850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003552	T	6	6	1912	1917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003552	ATT	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003552	AT	3	6	2094	2099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003552	TAT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003552	TTA	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003552	GAAG	2	8	2220	2227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003552	AAT	3	9	2381	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003552	TA	3	6	2392	2397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003552	GAA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003552	ATC	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_003552	A	7	7	2544	2550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003552	GAA	2	6	2610	2615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003552	A	6	6	2656	2661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003552	ATA	2	6	2675	2680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003552	ATA	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003552	GA	4	8	2750	2757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003552	ACAAT	2	10	2767	2776	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_003552	A	7	7	2781	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003552	A	6	6	2857	2862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003552	T	8	8	2940	2947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003552	CTG	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_003552	TAC	2	6	3082	3087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_003552	CATC	2	8	3088	3095	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_003552	CTA	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_003552	TCA	2	6	3355	3360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088901
66	NC_003552	GAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088901
67	NC_003552	AT	3	6	3410	3415	50 %	50 %	0 %	0 %	20088901
68	NC_003552	AAT	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088901
69	NC_003552	ATAA	2	8	3506	3513	75 %	25 %	0 %	0 %	20088901
70	NC_003552	CT	3	6	3543	3548	0 %	50 %	0 %	50 %	20088901
71	NC_003552	AGT	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088901
72	NC_003552	AAC	2	6	3661	3666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088901
73	NC_003552	A	7	7	3719	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	20088901
74	NC_003552	ACA	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088901
75	NC_003552	A	6	6	3749	3754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003552	A	6	6	3768	3773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003552	A	7	7	3787	3793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003552	TAT	2	6	3825	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
79	NC_003552	TAT	2	6	3880	3885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
80	NC_003552	AGG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088902
81	NC_003552	TGGC	2	8	3978	3985	0 %	25 %	50 %	25 %	20088902
82	NC_003552	ATCT	2	8	4029	4036	25 %	50 %	0 %	25 %	20088902
83	NC_003552	TTG	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088902
84	NC_003552	CTT	2	6	4219	4224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
85	NC_003552	CAA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088902
86	NC_003552	CTT	2	6	4297	4302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
87	NC_003552	ATC	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
88	NC_003552	CTG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
89	NC_003552	GGT	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088902
90	NC_003552	A	6	6	4607	4612	100 %	0 %	0 %	0 %	20088902
91	NC_003552	ATT	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
92	NC_003552	TC	3	6	4652	4657	0 %	50 %	0 %	50 %	20088902
93	NC_003552	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	20088902
94	NC_003552	ATC	2	6	4681	4686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
95	NC_003552	ATGGTA	2	12	4744	4755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088902
96	NC_003552	AAC	2	6	4756	4761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088902
97	NC_003552	TAT	2	6	4812	4817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
98	NC_003552	CTG	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
99	NC_003552	CTT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
100	NC_003552	GCT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
101	NC_003552	A	6	6	4887	4892	100 %	0 %	0 %	0 %	20088902
102	NC_003552	TC	3	6	5054	5059	0 %	50 %	0 %	50 %	20088902
103	NC_003552	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088902
104	NC_003552	ATC	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
105	NC_003552	AGC	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088902
106	NC_003552	AAG	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
107	NC_003552	AGA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
108	NC_003552	AGA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
109	NC_003552	ATA	2	6	5356	5361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003552	CTT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_003552	AT	3	6	5418	5423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003552	CTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_003552	A	9	9	5567	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003552	ATG	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003552	AT	3	6	5699	5704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003552	AT	3	6	5748	5753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003552	AAT	2	6	5774	5779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003552	AAT	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003552	A	7	7	5838	5844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003552	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003552	AGTA	2	8	5960	5967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003552	A	7	7	6010	6016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003552	AAG	2	6	6060	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003552	TTA	2	6	6091	6096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003552	TTA	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003552	TTC	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_003552	AAT	2	6	6280	6285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003552	TTGGA	2	10	6287	6296	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003552	TA	3	6	6342	6347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003552	T	6	6	6379	6384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003552	A	6	6	6404	6409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003552	TGT	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003552	TA	4	8	6465	6472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003552	CAATT	2	10	6513	6522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_003552	AAAT	2	8	6536	6543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003552	T	6	6	6549	6554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003552	TTA	2	6	6564	6569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003552	A	7	7	6578	6584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003552	TC	4	8	6632	6639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_003552	AAT	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003552	AATC	2	8	6714	6721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_003552	A	6	6	6733	6738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003552	A	7	7	6748	6754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003552	CTA	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_003552	AATT	2	8	6898	6905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003552	CTAA	2	8	6925	6932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_003552	TAT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003552	CTG	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_003552	TAA	2	6	7079	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003552	TTC	2	6	7131	7136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_003552	TCTTT	2	10	7158	7167	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_003552	T	6	6	7176	7181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003552	ATT	2	6	7216	7221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_003552	TAA	2	6	12924	12929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_003552	CATT	2	8	12933	12940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
263	NC_003552	AG	3	6	13018	13023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_003552	T	7	7	14139	14145	0 %	100 %	0 %	0 %	20088907
282	NC_003552	TGG	2	6	14198	14203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088907
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423	NC_003552	TCT	2	6	20295	20300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
424	NC_003552	TGC	2	6	20322	20327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088913
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426	NC_003552	T	7	7	20503	20509	0 %	100 %	0 %	0 %	20088913
427	NC_003552	CTT	2	6	20593	20598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
428	NC_003552	TCA	2	6	20719	20724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088913
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430	NC_003552	TTC	2	6	20864	20869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
431	NC_003552	TCT	2	6	20892	20897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
432	NC_003552	GCT	2	6	20908	20913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088913
433	NC_003552	TCT	2	6	20916	20921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
434	NC_003552	CTT	2	6	20929	20934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
435	NC_003552	CTT	2	6	20941	20946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088913
436	NC_003552	CTTTT	2	10	20953	20962	0 %	80 %	0 %	20 %	20088913
437	NC_003552	T	6	6	20959	20964	0 %	100 %	0 %	0 %	20088913
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445	NC_003552	CT	3	6	21044	21049	0 %	50 %	0 %	50 %	20088913
446	NC_003552	T	7	7	21049	21055	0 %	100 %	0 %	0 %	20088913
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449	NC_003552	T	6	6	21183	21188	0 %	100 %	0 %	0 %	20088913
450	NC_003552	CT	3	6	21189	21194	0 %	50 %	0 %	50 %	20088913
451	NC_003552	CAA	2	6	21229	21234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088913
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453	NC_003552	GCC	2	6	21295	21300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20088913
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456	NC_003552	GTAA	2	8	21654	21661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
457	NC_003552	TTA	2	6	21666	21671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_003552	ATT	2	6	21673	21678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_003552	TTTA	2	8	22837	22844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_003552	TAAT	2	8	23124	23131	50 %	50 %	0 %	0 %	20088915
483	NC_003552	T	7	7	23144	23150	0 %	100 %	0 %	0 %	20088915
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