MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium bovis AF2122/97 chromosome

Total Repeats: 11208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002945	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	31791178
2	NC_002945	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	31791178
3	NC_002945	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	31791178
4	NC_002945	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	31791178
5	NC_002945	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	31791178
6	NC_002945	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002945	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	31791179
8	NC_002945	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	31791179
9	NC_002945	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	31791179
10	NC_002945	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	31791179
11	NC_002945	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	31791179
12	NC_002945	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	31791179
13	NC_002945	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	31791180
14	NC_002945	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	31791180
15	NC_002945	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	31791180
16	NC_002945	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	31791180
17	NC_002945	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	31791182
18	NC_002945	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	31791182
19	NC_002945	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	31791182
20	NC_002945	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	31791182
21	NC_002945	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	31791182
22	NC_002945	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	31791183
23	NC_002945	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	31791183
24	NC_002945	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	31791183
25	NC_002945	CGTG	2	8	8735	8742	0 %	25 %	50 %	25 %	31791183
26	NC_002945	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	31791183
27	NC_002945	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	31791183
28	NC_002945	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	31791183
29	NC_002945	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	31791184
30	NC_002945	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002945	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	31791185
32	NC_002945	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	31791185
33	NC_002945	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_002945	AACC	2	8	13337	13344	50 %	0 %	0 %	50 %	31791187
35	NC_002945	CCCG	2	8	13446	13453	0 %	0 %	25 %	75 %	31791187
36	NC_002945	ATTC	2	8	13690	13697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_002945	ACCC	2	8	14097	14104	25 %	0 %	0 %	75 %	31791189
38	NC_002945	TGAT	2	8	14134	14141	25 %	50 %	25 %	0 %	31791189
39	NC_002945	TGCT	2	8	14181	14188	0 %	50 %	25 %	25 %	31791189
40	NC_002945	GCCC	2	8	14668	14675	0 %	0 %	25 %	75 %	31791189
41	NC_002945	GGGC	2	8	15449	15456	0 %	0 %	75 %	25 %	31791190
42	NC_002945	CTGA	2	8	15904	15911	25 %	25 %	25 %	25 %	31791191
43	NC_002945	TGGC	2	8	16047	16054	0 %	25 %	50 %	25 %	31791191
44	NC_002945	GCTT	2	8	16106	16113	0 %	50 %	25 %	25 %	31791191
45	NC_002945	CAGT	2	8	16134	16141	25 %	25 %	25 %	25 %	31791191
46	NC_002945	CGGT	2	8	16505	16512	0 %	25 %	50 %	25 %	31791191
47	NC_002945	GCCG	2	8	16564	16571	0 %	0 %	50 %	50 %	31791191
48	NC_002945	CGGG	2	8	17799	17806	0 %	0 %	75 %	25 %	31791192
49	NC_002945	CTGG	2	8	17907	17914	0 %	25 %	50 %	25 %	31791192
50	NC_002945	GTGC	2	8	18407	18414	0 %	25 %	50 %	25 %	31791192
51	NC_002945	GCCG	2	8	18425	18432	0 %	0 %	50 %	50 %	31791192
52	NC_002945	CCGC	2	8	18790	18797	0 %	0 %	25 %	75 %	31791193
53	NC_002945	GCCG	2	8	20254	20261	0 %	0 %	50 %	50 %	31791194
54	NC_002945	CCAG	2	8	20742	20749	25 %	0 %	25 %	50 %	31791194
55	NC_002945	CACC	2	8	20925	20932	25 %	0 %	0 %	75 %	31791194
56	NC_002945	CGGG	2	8	21881	21888	0 %	0 %	75 %	25 %	31791195
57	NC_002945	GCCG	2	8	21972	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	31791195
58	NC_002945	GCTG	2	8	22352	22359	0 %	25 %	50 %	25 %	31791195
59	NC_002945	CGGC	2	8	22372	22379	0 %	0 %	50 %	50 %	31791195
60	NC_002945	GCCG	2	8	23043	23050	0 %	0 %	50 %	50 %	31791195
61	NC_002945	CCCA	2	8	23055	23062	25 %	0 %	0 %	75 %	31791195
62	NC_002945	GCTG	2	8	24194	24201	0 %	25 %	50 %	25 %	31791197
63	NC_002945	CGGC	2	8	24242	24249	0 %	0 %	50 %	50 %	31791197
64	NC_002945	GCCG	2	8	24342	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	31791197
65	NC_002945	CGGG	2	8	24417	24424	0 %	0 %	75 %	25 %	31791197
66	NC_002945	TCAA	2	8	25495	25502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002945	GAGC	2	8	25523	25530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002945	GGCC	2	8	25537	25544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002945	GCTC	2	8	26486	26493	0 %	25 %	25 %	50 %	31791198
70	NC_002945	CCAA	2	8	26703	26710	50 %	0 %	0 %	50 %	31791198
71	NC_002945	CAGC	2	8	26769	26776	25 %	0 %	25 %	50 %	31791198
72	NC_002945	CGGC	2	8	27589	27596	0 %	0 %	50 %	50 %	31791200
73	NC_002945	CCGG	2	8	28075	28082	0 %	0 %	50 %	50 %	31791200
74	NC_002945	GCTC	2	8	28631	28638	0 %	25 %	25 %	50 %	31791201
75	NC_002945	TGCG	2	8	28770	28777	0 %	25 %	50 %	25 %	31791201
76	NC_002945	CCGG	2	8	29034	29041	0 %	0 %	50 %	50 %	31791201
77	NC_002945	CGTC	2	8	29365	29372	0 %	25 %	25 %	50 %	31791202
78	NC_002945	CACG	2	8	29725	29732	25 %	0 %	25 %	50 %	31791203
79	NC_002945	ACCG	2	8	29806	29813	25 %	0 %	25 %	50 %	31791203
80	NC_002945	CCGG	2	8	30125	30132	0 %	0 %	50 %	50 %	31791203
81	NC_002945	GTCG	2	8	30301	30308	0 %	25 %	50 %	25 %	31791203
82	NC_002945	CCCG	2	8	30923	30930	0 %	0 %	25 %	75 %	31791203
83	NC_002945	ACCA	2	8	31108	31115	50 %	0 %	0 %	50 %	31791203
84	NC_002945	CGAG	2	8	31439	31446	25 %	0 %	50 %	25 %	31791204
85	NC_002945	CGAC	2	8	31736	31743	25 %	0 %	25 %	50 %	31791205
86	NC_002945	GCCG	2	8	32463	32470	0 %	0 %	50 %	50 %	31791206
87	NC_002945	CCGA	2	8	33452	33459	25 %	0 %	25 %	50 %	31791207
88	NC_002945	GCTA	2	8	33839	33846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002945	GGCC	2	8	34587	34594	0 %	0 %	50 %	50 %	31791209
90	NC_002945	ATCG	2	8	35080	35087	25 %	25 %	25 %	25 %	31791209
91	NC_002945	GATC	2	8	35418	35425	25 %	25 %	25 %	25 %	31791209
92	NC_002945	CCAC	2	8	36239	36246	25 %	0 %	0 %	75 %	31791209
93	NC_002945	ACCG	2	8	36633	36640	25 %	0 %	25 %	50 %	31791210
94	NC_002945	CTGG	2	8	36977	36984	0 %	25 %	50 %	25 %	31791211
95	NC_002945	GCAT	2	8	37372	37379	25 %	25 %	25 %	25 %	31791212
96	NC_002945	GCTG	2	8	37886	37893	0 %	25 %	50 %	25 %	31791212
97	NC_002945	AACG	2	8	38641	38648	50 %	0 %	25 %	25 %	31791212
98	NC_002945	CCGA	2	8	38702	38709	25 %	0 %	25 %	50 %	31791212
99	NC_002945	CCAC	2	8	38858	38865	25 %	0 %	0 %	75 %	31791212
100	NC_002945	CAGC	2	8	39085	39092	25 %	0 %	25 %	50 %	31791213
101	NC_002945	CCGG	2	8	39581	39588	0 %	0 %	50 %	50 %	31791213
102	NC_002945	GGCC	2	8	40112	40119	0 %	0 %	50 %	50 %	31791214
103	NC_002945	CGAT	2	8	40562	40569	25 %	25 %	25 %	25 %	31791214
104	NC_002945	GCCG	2	8	40862	40869	0 %	0 %	50 %	50 %	31791214
105	NC_002945	CACC	2	8	40887	40894	25 %	0 %	0 %	75 %	31791214
106	NC_002945	ACCG	2	8	41110	41117	25 %	0 %	25 %	50 %	31791214
107	NC_002945	GCGT	2	8	41136	41143	0 %	25 %	50 %	25 %	31791214
108	NC_002945	CCAC	2	8	41865	41872	25 %	0 %	0 %	75 %	31791215
109	NC_002945	CGAT	2	8	41874	41881	25 %	25 %	25 %	25 %	31791215
110	NC_002945	GGCC	2	8	42570	42577	0 %	0 %	50 %	50 %	31791217
111	NC_002945	CCCG	2	8	43161	43168	0 %	0 %	25 %	75 %	31791217
112	NC_002945	CGGG	2	8	43190	43197	0 %	0 %	75 %	25 %	31791217
113	NC_002945	CGAC	2	8	43829	43836	25 %	0 %	25 %	50 %	31791218
114	NC_002945	GAGC	2	8	44209	44216	25 %	0 %	50 %	25 %	31791218
115	NC_002945	GGGC	2	8	45368	45375	0 %	0 %	75 %	25 %	31791218
116	NC_002945	CGGC	2	8	45463	45470	0 %	0 %	50 %	50 %	31791218
117	NC_002945	GCCG	2	8	46426	46433	0 %	0 %	50 %	50 %	31791218
118	NC_002945	TTGC	2	8	46590	46597	0 %	50 %	25 %	25 %	31791219
119	NC_002945	CCGC	2	8	46738	46745	0 %	0 %	25 %	75 %	31791219
120	NC_002945	CCGC	2	8	46771	46778	0 %	0 %	25 %	75 %	31791219
121	NC_002945	GGTC	2	8	46879	46886	0 %	25 %	50 %	25 %	31791219
122	NC_002945	CTAC	2	8	47203	47210	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002945	CGGG	2	8	47430	47437	0 %	0 %	75 %	25 %	31791220
124	NC_002945	GCAG	2	8	47503	47510	25 %	0 %	50 %	25 %	31791220
125	NC_002945	GTGC	2	8	48403	48410	0 %	25 %	50 %	25 %	31791221
126	NC_002945	GCCG	2	8	48687	48694	0 %	0 %	50 %	50 %	31791221
127	NC_002945	CAGC	2	8	49872	49879	25 %	0 %	25 %	50 %	31791222
128	NC_002945	CGGG	2	8	50061	50068	0 %	0 %	75 %	25 %	31791223
129	NC_002945	GCCG	2	8	50161	50168	0 %	0 %	50 %	50 %	31791223
130	NC_002945	GGTG	2	8	50484	50491	0 %	25 %	75 %	0 %	31791223
131	NC_002945	CTCA	2	8	51100	51107	25 %	25 %	0 %	50 %	31791223
132	NC_002945	CGCT	2	8	51239	51246	0 %	25 %	25 %	50 %	31791224
133	NC_002945	GGTA	2	8	52105	52112	25 %	25 %	50 %	0 %	31791225
134	NC_002945	CTGG	2	8	52700	52707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_002945	GCCG	2	8	53554	53561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_002945	ACCA	2	8	53725	53732	50 %	0 %	0 %	50 %	31791227
137	NC_002945	GTGC	2	8	54610	54617	0 %	25 %	50 %	25 %	31791227
138	NC_002945	ACCG	2	8	55488	55495	25 %	0 %	25 %	50 %	31791227
139	NC_002945	CCCG	2	8	55656	55663	0 %	0 %	25 %	75 %	31791227
140	NC_002945	GGCC	2	8	56330	56337	0 %	0 %	50 %	50 %	31791228
141	NC_002945	CGCT	2	8	57057	57064	0 %	25 %	25 %	50 %	31791228
142	NC_002945	GCGG	2	8	58814	58821	0 %	0 %	75 %	25 %	31791231
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144	NC_002945	AGCG	2	8	59238	59245	25 %	0 %	50 %	25 %	31791232
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