MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 137095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002944	TCG	2	6	132960	132965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406223
3502	NC_002944	ACC	2	6	132984	132989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406223
3503	NC_002944	CGGC	2	8	133030	133037	0 %	0 %	50 %	50 %	41406223
3504	NC_002944	ACG	2	6	133069	133074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406223
3505	NC_002944	CGGCG	2	10	133079	133088	0 %	0 %	60 %	40 %	41406223
3506	NC_002944	CGAT	2	8	133096	133103	25 %	25 %	25 %	25 %	41406223
3507	NC_002944	CGT	2	6	133177	133182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406223
3508	NC_002944	GGC	2	6	133241	133246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406223
3509	NC_002944	GTG	2	6	133296	133301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406223
3510	NC_002944	GTTG	2	8	133494	133501	0 %	50 %	50 %	0 %	41406223
3511	NC_002944	AT	3	6	133532	133537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_002944	AT	3	6	133551	133556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_002944	CGA	2	6	133660	133665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406224
3514	NC_002944	CGAC	2	8	133728	133735	25 %	0 %	25 %	50 %	41406224
3515	NC_002944	CGT	2	6	133759	133764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406224
3516	NC_002944	ACG	2	6	133830	133835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406224
3517	NC_002944	CGT	2	6	133846	133851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406224
3518	NC_002944	GCG	2	6	133863	133868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406224
3519	NC_002944	GTG	2	6	133987	133992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406224
3520	NC_002944	CG	3	6	133997	134002	0 %	0 %	50 %	50 %	41406224
3521	NC_002944	TCC	2	6	134014	134019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406224
3522	NC_002944	CCGGT	2	10	134110	134119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3523	NC_002944	CCAC	2	8	134138	134145	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3524	NC_002944	ACG	2	6	134183	134188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_002944	GT	3	6	134332	134337	0 %	50 %	50 %	0 %	41406225
3526	NC_002944	TGG	2	6	134395	134400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3527	NC_002944	TGG	2	6	134407	134412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3528	NC_002944	GATCGC	2	12	134432	134443	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3529	NC_002944	TCG	2	6	134482	134487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3530	NC_002944	TCG	2	6	134494	134499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3531	NC_002944	CGC	2	6	134518	134523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406225
3532	NC_002944	CGC	2	6	134540	134545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406225
3533	NC_002944	CGT	2	6	134555	134560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3534	NC_002944	TCA	2	6	134605	134610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406225
3535	NC_002944	CGT	2	6	134612	134617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3536	NC_002944	TTG	2	6	134637	134642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406225
3537	NC_002944	CAG	2	6	134648	134653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3538	NC_002944	CGC	2	6	134663	134668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406225
3539	NC_002944	CGT	2	6	134684	134689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3540	NC_002944	GCA	2	6	134732	134737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3541	NC_002944	CTG	2	6	134844	134849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3542	NC_002944	TGG	2	6	134863	134868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3543	NC_002944	CCCGG	2	10	134882	134891	0 %	0 %	40 %	60 %	41406225
3544	NC_002944	GTG	2	6	134925	134930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3545	NC_002944	ATC	2	6	134937	134942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406225
3546	NC_002944	TGC	2	6	134950	134955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3547	NC_002944	G	6	6	135034	135039	0 %	0 %	100 %	0 %	41406225
3548	NC_002944	TCGA	2	8	135105	135112	25 %	25 %	25 %	25 %	41406225
3549	NC_002944	GC	3	6	135187	135192	0 %	0 %	50 %	50 %	41406225
3550	NC_002944	TGGG	2	8	135193	135200	0 %	25 %	75 %	0 %	41406225
3551	NC_002944	CAT	2	6	135272	135277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406225
3552	NC_002944	CCG	2	6	135340	135345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406225
3553	NC_002944	CTG	2	6	135357	135362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3554	NC_002944	ATCT	2	8	135432	135439	25 %	50 %	0 %	25 %	41406225
3555	NC_002944	GGTCAC	2	12	135440	135451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3556	NC_002944	CTG	2	6	135471	135476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3557	NC_002944	CTG	2	6	135495	135500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3558	NC_002944	GTG	3	9	135507	135515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3559	NC_002944	GTG	2	6	135528	135533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3560	NC_002944	CGT	2	6	135575	135580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3561	NC_002944	CGC	2	6	135692	135697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406225
3562	NC_002944	ACG	2	6	135722	135727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3563	NC_002944	CGG	2	6	135775	135780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406225
3564	NC_002944	GC	4	8	135869	135876	0 %	0 %	50 %	50 %	41406226
3565	NC_002944	CGG	2	6	135887	135892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406226
3566	NC_002944	GCG	2	6	135907	135912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406226
3567	NC_002944	GGT	2	6	135914	135919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406226
3568	NC_002944	GTC	2	6	136017	136022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406226
3569	NC_002944	CGGC	2	8	136066	136073	0 %	0 %	50 %	50 %	41406226
3570	NC_002944	CG	3	6	136083	136088	0 %	0 %	50 %	50 %	41406226
3571	NC_002944	GGC	2	6	136157	136162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406226
3572	NC_002944	GGC	2	6	136188	136193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406226
3573	NC_002944	CGC	2	6	136242	136247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406226
3574	NC_002944	CTC	2	6	136320	136325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406226
3575	NC_002944	CCA	2	6	136414	136419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406226
3576	NC_002944	CGG	2	6	136436	136441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406226
3577	NC_002944	CCA	2	6	136451	136456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406226
3578	NC_002944	GAT	2	6	136479	136484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406226
3579	NC_002944	CGC	2	6	136515	136520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406226
3580	NC_002944	AAC	2	6	136531	136536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406226
3581	NC_002944	GTCGA	2	10	136555	136564	20 %	20 %	40 %	20 %	41406226
3582	NC_002944	CGA	2	6	136610	136615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406226
3583	NC_002944	CTC	2	6	136650	136655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406226
3584	NC_002944	GCA	2	6	136676	136681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406226
3585	NC_002944	TCCGA	2	10	136690	136699	20 %	20 %	20 %	40 %	41406226
3586	NC_002944	GAC	2	6	136716	136721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406226
3587	NC_002944	TTCC	2	8	136761	136768	0 %	50 %	0 %	50 %	41406227
3588	NC_002944	CGC	2	6	136774	136779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
3589	NC_002944	GAT	2	6	136786	136791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406227
3590	NC_002944	GCG	2	6	136817	136822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406227
3591	NC_002944	AGA	2	6	136857	136862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406227
3592	NC_002944	CG	3	6	136869	136874	0 %	0 %	50 %	50 %	41406227
3593	NC_002944	ACG	2	6	136877	136882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406227
3594	NC_002944	CG	4	8	136905	136912	0 %	0 %	50 %	50 %	41406227
3595	NC_002944	CGC	2	6	136932	136937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
3596	NC_002944	GCT	2	6	136950	136955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406227
3597	NC_002944	CGC	2	6	136980	136985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
3598	NC_002944	CAA	2	6	137022	137027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406227
3599	NC_002944	GCC	2	6	137059	137064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
3600	NC_002944	CCG	2	6	137067	137072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
3601	NC_002944	GCC	2	6	137167	137172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
3602	NC_002944	CGGGC	2	10	137185	137194	0 %	0 %	60 %	40 %	41406227
3603	NC_002944	GC	3	6	137200	137205	0 %	0 %	50 %	50 %	41406227
3604	NC_002944	CCTGGG	2	12	137256	137267	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	41406227
3605	NC_002944	TCGGC	2	10	137273	137282	0 %	20 %	40 %	40 %	41406227
3606	NC_002944	CCG	3	9	137331	137339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
3607	NC_002944	GCC	2	6	137365	137370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
3608	NC_002944	CCG	2	6	137372	137377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
3609	NC_002944	TGG	2	6	137405	137410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406227
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3611	NC_002944	ACC	2	6	137426	137431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406227
3612	NC_002944	TCG	2	6	137444	137449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406227
3613	NC_002944	TGC	2	6	137459	137464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406227
3614	NC_002944	GC	3	6	137463	137468	0 %	0 %	50 %	50 %	41406227
3615	NC_002944	CGT	2	6	137511	137516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406227
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3617	NC_002944	TGG	2	6	137531	137536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406227
3618	NC_002944	CGG	2	6	137547	137552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406227
3619	NC_002944	GCTGG	2	10	137566	137575	0 %	20 %	60 %	20 %	41406227
3620	NC_002944	CGA	2	6	137586	137591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406227
3621	NC_002944	CCG	2	6	137603	137608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406227
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3747	NC_002944	CG	4	8	142179	142186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3748	NC_002944	GCG	3	9	142191	142199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3749	NC_002944	GGC	2	6	142287	142292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406232
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3765	NC_002944	CCCGG	2	10	142861	142870	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3766	NC_002944	GCCG	2	8	142922	142929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3767	NC_002944	GCC	2	6	142933	142938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3993	NC_002944	TGC	2	6	150244	150249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3994	NC_002944	GCG	2	6	150274	150279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3995	NC_002944	AGG	2	6	150280	150285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406242
3996	NC_002944	GCG	2	6	150286	150291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3997	NC_002944	ACG	2	6	150301	150306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3998	NC_002944	CG	3	6	150322	150327	0 %	0 %	50 %	50 %	41406242
3999	NC_002944	CGC	2	6	150347	150352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406242
4000	NC_002944	GTT	2	6	150365	150370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406242

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