MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 137095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_002944	CGG	2	6	288480	288485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406366
8002	NC_002944	CGA	2	6	288522	288527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406366
8003	NC_002944	GCG	2	6	288563	288568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406366
8004	NC_002944	TCG	2	6	288611	288616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406366
8005	NC_002944	GCC	2	6	288642	288647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406366
8006	NC_002944	GGC	2	6	288682	288687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406366
8007	NC_002944	CTC	2	6	288720	288725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_002944	CCA	2	6	288766	288771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_002944	ACG	2	6	288776	288781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_002944	GAA	2	6	288783	288788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_002944	CGCTGC	2	12	288816	288827	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	41406367
8012	NC_002944	GTG	2	6	288929	288934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406367
8013	NC_002944	GCGCC	2	10	288946	288955	0 %	0 %	40 %	60 %	41406367
8014	NC_002944	CGG	2	6	288963	288968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406367
8015	NC_002944	GGC	2	6	288976	288981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406367
8016	NC_002944	CGA	2	6	289006	289011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406367
8017	NC_002944	CGA	2	6	289069	289074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406367
8018	NC_002944	GGA	2	6	289081	289086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406367
8019	NC_002944	CGA	2	6	289126	289131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406367
8020	NC_002944	GC	3	6	289153	289158	0 %	0 %	50 %	50 %	41406367
8021	NC_002944	CGA	2	6	289165	289170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406367
8022	NC_002944	TCG	2	6	289173	289178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406367
8023	NC_002944	CGG	2	6	289179	289184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406367
8024	NC_002944	CGG	2	6	289219	289224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406367
8025	NC_002944	TGC	3	9	289236	289244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406367
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8028	NC_002944	CTG	2	6	289373	289378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406367
8029	NC_002944	GGT	2	6	289392	289397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406367
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8031	NC_002944	GC	3	6	289523	289528	0 %	0 %	50 %	50 %	41406368
8032	NC_002944	CGG	2	6	289541	289546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406368
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8040	NC_002944	GC	3	6	289735	289740	0 %	0 %	50 %	50 %	41406368
8041	NC_002944	TCG	2	6	289750	289755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406368
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8043	NC_002944	GCC	2	6	289780	289785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406368
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8047	NC_002944	CGT	2	6	290120	290125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406368
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8054	NC_002944	CAT	2	6	290345	290350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406368
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8061	NC_002944	CG	3	6	290538	290543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8062	NC_002944	ACC	2	6	290574	290579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8111	NC_002944	CGA	2	6	292467	292472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406371
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8122	NC_002944	CGA	2	6	292716	292721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406371
8123	NC_002944	GCTGG	2	10	292734	292743	0 %	20 %	60 %	20 %	41406371
8124	NC_002944	CGC	2	6	292854	292859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406371
8125	NC_002944	GTC	2	6	292863	292868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406371
8126	NC_002944	CGA	3	9	292893	292901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406371
8127	NC_002944	CGG	2	6	292914	292919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406371
8128	NC_002944	GCC	2	6	292927	292932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406371
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8130	NC_002944	CGT	2	6	293018	293023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406372
8131	NC_002944	GAC	2	6	293120	293125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406372
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8133	NC_002944	GTG	2	6	293172	293177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406372
8134	NC_002944	GAT	2	6	293183	293188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406372
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8139	NC_002944	GCC	2	6	293310	293315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406372
8140	NC_002944	GAT	2	6	293345	293350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406372
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8142	NC_002944	TCGG	2	8	293430	293437	0 %	25 %	50 %	25 %	41406372
8143	NC_002944	GATCGG	2	12	293444	293455	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	41406372
8144	NC_002944	CAT	2	6	293519	293524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406372
8145	NC_002944	CGGC	2	8	293573	293580	0 %	0 %	50 %	50 %	41406372
8146	NC_002944	GCG	3	9	293608	293616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406372
8147	NC_002944	CGC	2	6	293619	293624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406372
8148	NC_002944	GTC	2	6	293628	293633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406372
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8150	NC_002944	G	6	6	293645	293650	0 %	0 %	100 %	0 %	41406372
8151	NC_002944	CTG	2	6	293687	293692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406373
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8153	NC_002944	CTG	2	6	293834	293839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406373
8154	NC_002944	GTG	2	6	293840	293845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406373
8155	NC_002944	GC	4	8	293863	293870	0 %	0 %	50 %	50 %	41406373
8156	NC_002944	TGC	2	6	293886	293891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406373
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8159	NC_002944	TGC	2	6	293946	293951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406373
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8167	NC_002944	CTG	2	6	294269	294274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406373
8168	NC_002944	CCGG	2	8	294306	294313	0 %	0 %	50 %	50 %	41406373
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8171	NC_002944	TCG	2	6	294507	294512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406374
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8180	NC_002944	TCGACG	2	12	294711	294722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41406374
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8183	NC_002944	GCGG	2	8	294778	294785	0 %	0 %	75 %	25 %	41406374
8184	NC_002944	CGT	2	6	294802	294807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406374
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8191	NC_002944	GGC	3	9	294993	295001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406375
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8194	NC_002944	TGG	2	6	295120	295125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406375
8195	NC_002944	GC	3	6	295141	295146	0 %	0 %	50 %	50 %	41406375
8196	NC_002944	GCC	2	6	295234	295239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406375
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8199	NC_002944	CGT	2	6	295361	295366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406375
8200	NC_002944	ATCGG	2	10	295371	295380	20 %	20 %	40 %	20 %	41406375
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8205	NC_002944	GTC	2	6	295452	295457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406375
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8208	NC_002944	CGA	2	6	295547	295552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406375
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8212	NC_002944	CTT	2	6	295596	295601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406375
8213	NC_002944	CGG	2	6	295712	295717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406375
8214	NC_002944	CGG	2	6	295763	295768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406375
8215	NC_002944	GGC	2	6	295770	295775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406375
8216	NC_002944	TCGA	2	8	295786	295793	25 %	25 %	25 %	25 %	41406375
8217	NC_002944	CGGC	2	8	295816	295823	0 %	0 %	50 %	50 %	41406375
8218	NC_002944	GGC	2	6	295830	295835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406375
8219	NC_002944	GC	3	6	295834	295839	0 %	0 %	50 %	50 %	41406375
8220	NC_002944	GCC	2	6	295848	295853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406375
8221	NC_002944	GCAC	2	8	295871	295878	25 %	0 %	25 %	50 %	41406375
8222	NC_002944	GC	3	6	295941	295946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8223	NC_002944	CGC	2	6	295949	295954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8224	NC_002944	GGT	2	6	296088	296093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406376
8225	NC_002944	GCC	2	6	296155	296160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406376
8226	NC_002944	GCT	2	6	296205	296210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406376
8227	NC_002944	GAC	2	6	296218	296223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406376
8228	NC_002944	TTC	2	6	296227	296232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406376
8229	NC_002944	TGC	2	6	296267	296272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406376
8230	NC_002944	CCG	2	6	296285	296290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406376
8231	NC_002944	CGC	2	6	296307	296312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406376
8232	NC_002944	GGA	2	6	296349	296354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406376
8233	NC_002944	GAG	2	6	296377	296382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406376
8234	NC_002944	GCT	2	6	296394	296399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406376
8235	NC_002944	CGA	2	6	296442	296447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406376
8236	NC_002944	CGA	2	6	296463	296468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406376
8237	NC_002944	CGG	2	6	296516	296521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406376
8238	NC_002944	TCGG	2	8	296534	296541	0 %	25 %	50 %	25 %	41406376
8239	NC_002944	CGG	2	6	296590	296595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406377
8240	NC_002944	GGT	3	9	296621	296629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406377
8241	NC_002944	CG	4	8	296666	296673	0 %	0 %	50 %	50 %	41406377
8242	NC_002944	GCC	2	6	296727	296732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406377
8243	NC_002944	GGC	2	6	296749	296754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406377
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8245	NC_002944	CG	3	6	296819	296824	0 %	0 %	50 %	50 %	41406377
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8494	NC_002944	CGA	2	6	308291	308296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406389
8495	NC_002944	GC	3	6	308358	308363	0 %	0 %	50 %	50 %	41406389
8496	NC_002944	TCG	2	6	308472	308477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406389
8497	NC_002944	GTG	2	6	308582	308587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406389
8498	NC_002944	TGG	2	6	308592	308597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406389
8499	NC_002944	CGC	2	6	308612	308617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406389
8500	NC_002944	GCC	2	6	308739	308744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406390

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