MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 3501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002755	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	15839373
2	NC_002755	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	15839374
3	NC_002755	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	15839374
4	NC_002755	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	15839376
5	NC_002755	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	15839378
6	NC_002755	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	15839378
7	NC_002755	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	15839378
8	NC_002755	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	15839379
9	NC_002755	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	15839379
10	NC_002755	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_002755	CGACC	2	10	13672	13681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_002755	GGCGT	2	10	14154	14163	0 %	20 %	60 %	20 %	15839386
13	NC_002755	GGGCC	2	10	14437	14446	0 %	0 %	60 %	40 %	15839386
14	NC_002755	GCGTT	2	10	15182	15191	0 %	40 %	40 %	20 %	15839387
15	NC_002755	CCAGC	2	10	15722	15731	20 %	0 %	20 %	60 %	15839388
16	NC_002755	ACCGA	2	10	16485	16494	40 %	0 %	20 %	40 %	15839388
17	NC_002755	ATCGG	2	10	16877	16886	20 %	20 %	40 %	20 %	15839388
18	NC_002755	CGGCC	2	10	17886	17895	0 %	0 %	40 %	60 %	15839389
19	NC_002755	TTAGC	2	10	19037	19046	20 %	40 %	20 %	20 %	15839390
20	NC_002755	GGTCC	2	10	19109	19118	0 %	20 %	40 %	40 %	15839390
21	NC_002755	GTCGT	2	10	21628	21637	0 %	40 %	40 %	20 %	15839391
22	NC_002755	ATCAC	2	10	23901	23910	40 %	20 %	0 %	40 %	15839394
23	NC_002755	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	15839394
24	NC_002755	CGAGC	2	10	26950	26959	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_002755	GGCAA	2	10	29283	29292	40 %	0 %	40 %	20 %	15839399
26	NC_002755	CGATC	2	10	30108	30117	20 %	20 %	20 %	40 %	15839400
27	NC_002755	CGACG	2	10	32291	32300	20 %	0 %	40 %	40 %	15839404
28	NC_002755	CCGCG	2	10	32325	32334	0 %	0 %	40 %	60 %	15839404
29	NC_002755	GACAC	2	10	32406	32415	40 %	0 %	20 %	40 %	15839404
30	NC_002755	CCGCC	2	10	33752	33761	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_002755	TCCTG	2	10	37411	37420	0 %	40 %	20 %	40 %	15839412
32	NC_002755	CTCGG	2	10	37504	37513	0 %	20 %	40 %	40 %	15839412
33	NC_002755	GGCGC	2	10	38047	38056	0 %	0 %	60 %	40 %	15839412
34	NC_002755	TGGCC	2	10	38195	38204	0 %	20 %	40 %	40 %	15839412
35	NC_002755	CGGCG	2	10	38727	38736	0 %	0 %	60 %	40 %	15839412
36	NC_002755	GTCCA	2	10	39339	39348	20 %	20 %	20 %	40 %	15839413
37	NC_002755	GCCAA	2	10	41473	41482	40 %	0 %	20 %	40 %	15839415
38	NC_002755	GCGTC	2	10	41888	41897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_002755	GCACA	2	10	42272	42281	40 %	0 %	20 %	40 %	15839416
40	NC_002755	GGTAC	2	10	44806	44815	20 %	20 %	40 %	20 %	15839418
41	NC_002755	TCGAA	2	10	45038	45047	40 %	20 %	20 %	20 %	15839418
42	NC_002755	GCACC	2	10	45968	45977	20 %	0 %	20 %	60 %	15839418
43	NC_002755	CGGTG	2	10	47002	47011	0 %	20 %	60 %	20 %	15839419
44	NC_002755	TCATG	2	10	47148	47157	20 %	40 %	20 %	20 %	15839419
45	NC_002755	ATCGG	2	10	47295	47304	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_002755	GCAGC	2	10	48542	48551	20 %	0 %	40 %	40 %	15839421
47	NC_002755	CCCGA	2	10	48625	48634	20 %	0 %	20 %	60 %	15839421
48	NC_002755	CAGCG	2	10	49750	49759	20 %	0 %	40 %	40 %	15839422
49	NC_002755	CTCCC	2	10	56184	56193	0 %	20 %	0 %	80 %	15839428
50	NC_002755	CGGCG	2	10	56633	56642	0 %	0 %	60 %	40 %	15839428
51	NC_002755	CGACC	2	10	58165	58174	20 %	0 %	20 %	60 %	15839430
52	NC_002755	CTTCG	2	10	58852	58861	0 %	40 %	20 %	40 %	15839431
53	NC_002755	CGGTG	2	10	59908	59917	0 %	20 %	60 %	20 %	15839434
54	NC_002755	TCAGG	2	10	62394	62403	20 %	20 %	40 %	20 %	15839435
55	NC_002755	TGCCG	2	10	65425	65434	0 %	20 %	40 %	40 %	15839439
56	NC_002755	GGCGA	2	10	66357	66366	20 %	0 %	60 %	20 %	15839440
57	NC_002755	GGTGT	2	10	68933	68942	0 %	40 %	60 %	0 %	15839443
58	NC_002755	ATCGG	2	10	69570	69579	20 %	20 %	40 %	20 %	15839443
59	NC_002755	CCGCG	2	10	70107	70116	0 %	0 %	40 %	60 %	15839443
60	NC_002755	GGCAA	2	10	70458	70467	40 %	0 %	40 %	20 %	15839443
61	NC_002755	CGACC	2	10	70747	70756	20 %	0 %	20 %	60 %	15839443
62	NC_002755	CGGGT	2	10	71201	71210	0 %	20 %	60 %	20 %	15839443
63	NC_002755	GGTCG	2	10	71261	71270	0 %	20 %	60 %	20 %	15839443
64	NC_002755	TGCCT	2	10	72000	72009	0 %	40 %	20 %	40 %	15839444
65	NC_002755	GTCCA	2	10	72871	72880	20 %	20 %	20 %	40 %	15839445
66	NC_002755	TGACC	2	10	75495	75504	20 %	20 %	20 %	40 %	15839447
67	NC_002755	GCCAA	2	10	75809	75818	40 %	0 %	20 %	40 %	15839447
68	NC_002755	GTCGC	2	10	75886	75895	0 %	20 %	40 %	40 %	15839447
69	NC_002755	GCGCG	2	10	76974	76983	0 %	0 %	60 %	40 %	15839448
70	NC_002755	CACGA	2	10	79840	79849	40 %	0 %	20 %	40 %	15839450
71	NC_002755	GCACC	2	10	80280	80289	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_002755	CCACC	2	10	80473	80482	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_002755	GAGCA	2	10	82378	82387	40 %	0 %	40 %	20 %	15839452
74	NC_002755	GCCGG	2	10	82477	82486	0 %	0 %	60 %	40 %	15839452
75	NC_002755	GCGAC	2	10	82553	82562	20 %	0 %	40 %	40 %	15839452
76	NC_002755	ATCCG	2	10	83323	83332	20 %	20 %	20 %	40 %	15839453
77	NC_002755	CACCG	2	10	84103	84112	20 %	0 %	20 %	60 %	15839454
78	NC_002755	TGGTC	2	10	86238	86247	0 %	40 %	40 %	20 %	15839456
79	NC_002755	GCTGG	2	10	86875	86884	0 %	20 %	60 %	20 %	15839457
80	NC_002755	TGGGT	2	10	89913	89922	0 %	40 %	60 %	0 %	15839463
81	NC_002755	TCGCC	2	10	90120	90129	0 %	20 %	20 %	60 %	15839463
82	NC_002755	GGGCC	2	10	91093	91102	0 %	0 %	60 %	40 %	15839464
83	NC_002755	GGCCG	2	10	92412	92421	0 %	0 %	60 %	40 %	15839465
84	NC_002755	GCGCC	2	10	93064	93073	0 %	0 %	40 %	60 %	15839465
85	NC_002755	GCTTG	2	10	95096	95105	0 %	40 %	40 %	20 %	15839467
86	NC_002755	CGTGT	2	10	95528	95537	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_002755	AGATC	2	10	95607	95616	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_002755	CGGCG	2	10	99188	99197	0 %	0 %	60 %	40 %	15839470
89	NC_002755	CGGCG	2	10	99315	99324	0 %	0 %	60 %	40 %	15839471
90	NC_002755	GCGGT	2	10	100264	100273	0 %	20 %	60 %	20 %	15839472
91	NC_002755	GGTGA	2	10	100482	100491	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002755	GCGCC	2	10	103096	103105	0 %	0 %	40 %	60 %	15839474
93	NC_002755	GGTGG	2	10	103784	103793	0 %	20 %	80 %	0 %	15839475
94	NC_002755	GGCTT	2	10	104797	104806	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_002755	CTGGC	2	10	105519	105528	0 %	20 %	40 %	40 %	15839476
96	NC_002755	GCACA	2	10	106640	106649	40 %	0 %	20 %	40 %	15839476
97	NC_002755	CTGAA	2	10	108970	108979	40 %	20 %	20 %	20 %	15839479
98	NC_002755	ATCGC	2	10	109465	109474	20 %	20 %	20 %	40 %	15839479
99	NC_002755	TCTGA	2	10	110799	110808	20 %	40 %	20 %	20 %	15839481
100	NC_002755	CGGTC	2	10	111074	111083	0 %	20 %	40 %	40 %	15839481
101	NC_002755	GACCA	2	10	112212	112221	40 %	0 %	20 %	40 %	15839481
102	NC_002755	GGCTG	2	10	114776	114785	0 %	20 %	60 %	20 %	15839481
103	NC_002755	CCGCG	2	10	118696	118705	0 %	0 %	40 %	60 %	15839482
104	NC_002755	TCGTG	2	10	122649	122658	0 %	40 %	40 %	20 %	15839484
105	NC_002755	GCACG	2	10	124304	124313	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_002755	CCGGA	2	10	124430	124439	20 %	0 %	40 %	40 %	15839486
107	NC_002755	TGCGC	2	10	126903	126912	0 %	20 %	40 %	40 %	15839487
108	NC_002755	GCGAG	2	10	127414	127423	20 %	0 %	60 %	20 %	15839487
109	NC_002755	GGGGT	2	10	128423	128432	0 %	20 %	80 %	0 %	15839487
110	NC_002755	CCCAC	2	10	128985	128994	20 %	0 %	0 %	80 %	15839487
111	NC_002755	CCGGC	2	10	129495	129504	0 %	0 %	40 %	60 %	15839487
112	NC_002755	TGCGG	2	10	129905	129914	0 %	20 %	60 %	20 %	15839487
113	NC_002755	ATCAC	2	10	131384	131393	40 %	20 %	0 %	40 %	15839490
114	NC_002755	ATCGG	2	10	131432	131441	20 %	20 %	40 %	20 %	15839490
115	NC_002755	CGGGC	2	10	132523	132532	0 %	0 %	60 %	40 %	15839490
116	NC_002755	GCGAT	2	10	134328	134337	20 %	20 %	40 %	20 %	15839492
117	NC_002755	GTTCG	2	10	134549	134558	0 %	40 %	40 %	20 %	15839492
118	NC_002755	CCTGG	2	10	134941	134950	0 %	20 %	40 %	40 %	15839492
119	NC_002755	GGCCC	2	10	135047	135056	0 %	0 %	40 %	60 %	15839492
120	NC_002755	CGTTG	2	10	135559	135568	0 %	40 %	40 %	20 %	15839492
121	NC_002755	CGACC	2	10	135631	135640	20 %	0 %	20 %	60 %	15839492
122	NC_002755	GAGAT	2	10	138650	138659	40 %	20 %	40 %	0 %	15839495
123	NC_002755	CGGCG	2	10	140804	140813	0 %	0 %	60 %	40 %	15839497
124	NC_002755	TGCGG	2	10	141437	141446	0 %	20 %	60 %	20 %	15839498
125	NC_002755	CGCTG	2	10	142144	142153	0 %	20 %	40 %	40 %	15839499
126	NC_002755	GTTGC	2	10	142690	142699	0 %	40 %	40 %	20 %	15839499
127	NC_002755	CCGAT	2	10	143438	143447	20 %	20 %	20 %	40 %	15839499
128	NC_002755	ATCGC	2	10	144129	144138	20 %	20 %	20 %	40 %	15839500
129	NC_002755	AACCG	2	10	144868	144877	40 %	0 %	20 %	40 %	15839500
130	NC_002755	CCGCC	2	10	145455	145464	0 %	0 %	20 %	80 %	15839500
131	NC_002755	CCGCC	2	10	146098	146107	0 %	0 %	20 %	80 %	15839501
132	NC_002755	GGGTC	2	10	147852	147861	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_002755	ATCGG	2	10	149582	149591	20 %	20 %	40 %	20 %	15839505
134	NC_002755	ATTGG	2	10	152416	152425	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002755	AGCGA	2	10	154319	154328	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_002755	AGCGA	2	10	154372	154381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_002755	TCGTC	2	10	154719	154728	0 %	40 %	20 %	40 %	15839508
138	NC_002755	CACGC	2	10	155183	155192	20 %	0 %	20 %	60 %	15839508
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165	NC_002755	GCCGA	2	10	179293	179302	20 %	0 %	40 %	40 %	15839533
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172	NC_002755	ACGGT	2	10	191273	191282	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_002755	TGCGC	2	10	302300	302309	0 %	20 %	40 %	40 %	15839632
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254	NC_002755	TGCCA	2	10	310913	310922	20 %	20 %	20 %	40 %	15839641
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258	NC_002755	CAGAT	2	10	314184	314193	40 %	20 %	20 %	20 %	15839643
259	NC_002755	AGCGG	2	10	314408	314417	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
260	NC_002755	CGCAG	2	10	314730	314739	20 %	0 %	40 %	40 %	15839644
261	NC_002755	GGCCG	2	10	315045	315054	0 %	0 %	60 %	40 %	15839645
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263	NC_002755	TCGGC	2	10	316571	316580	0 %	20 %	40 %	40 %	15839646
264	NC_002755	CCTGG	2	10	317119	317128	0 %	20 %	40 %	40 %	15839647
265	NC_002755	GGCCG	2	10	320223	320232	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
266	NC_002755	TGCGC	2	10	320720	320729	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
267	NC_002755	GTTGG	2	10	322318	322327	0 %	40 %	60 %	0 %	15839648
268	NC_002755	AGCGC	2	10	330239	330248	20 %	0 %	40 %	40 %	15839654
269	NC_002755	GGGAC	2	10	331144	331153	20 %	0 %	60 %	20 %	15839656
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405	NC_002755	GCGCG	2	10	512596	512605	0 %	0 %	60 %	40 %	15839812
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444	NC_002755	CCGAC	2	10	567071	567080	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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