MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 109576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002755	GCA	2	6	127254	127259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3002	NC_002755	CGG	2	6	127263	127268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839487
3003	NC_002755	GGT	2	6	127279	127284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839487
3004	NC_002755	TGC	2	6	127314	127319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3005	NC_002755	GC	3	6	127326	127331	0 %	0 %	50 %	50 %	15839487
3006	NC_002755	ACC	2	6	127334	127339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
3007	NC_002755	GCGAG	2	10	127414	127423	20 %	0 %	60 %	20 %	15839487
3008	NC_002755	GCG	2	6	127457	127462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839487
3009	NC_002755	CCA	2	6	127482	127487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
3010	NC_002755	GCA	2	6	127563	127568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3011	NC_002755	GCC	2	6	127591	127596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3012	NC_002755	GCA	2	6	127611	127616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3013	NC_002755	GCC	2	6	127655	127660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3014	NC_002755	CCG	2	6	127677	127682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3015	NC_002755	CG	3	6	127687	127692	0 %	0 %	50 %	50 %	15839487
3016	NC_002755	GCG	2	6	127697	127702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839487
3017	NC_002755	CG	3	6	127729	127734	0 %	0 %	50 %	50 %	15839487
3018	NC_002755	CGA	2	6	127746	127751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3019	NC_002755	TGC	2	6	127755	127760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3020	NC_002755	TCG	2	6	127853	127858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3021	NC_002755	CCA	2	6	127875	127880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
3022	NC_002755	GC	3	6	127885	127890	0 %	0 %	50 %	50 %	15839487
3023	NC_002755	CCG	2	6	127893	127898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3024	NC_002755	ACC	2	6	127901	127906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
3025	NC_002755	GCC	2	6	127985	127990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3026	NC_002755	CCG	2	6	128016	128021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3027	NC_002755	CAC	3	9	128023	128031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
3028	NC_002755	CGG	2	6	128067	128072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839487
3029	NC_002755	CCG	2	6	128073	128078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3030	NC_002755	TCA	2	6	128124	128129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839487
3031	NC_002755	TGC	2	6	128157	128162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3032	NC_002755	TGC	2	6	128176	128181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3033	NC_002755	GCG	2	6	128274	128279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839487
3034	NC_002755	GTC	2	6	128302	128307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3035	NC_002755	GCC	2	6	128316	128321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3036	NC_002755	GCC	2	6	128359	128364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3037	NC_002755	GGGGT	2	10	128423	128432	0 %	20 %	80 %	0 %	15839487
3038	NC_002755	GCA	2	6	128442	128447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3039	NC_002755	GGC	2	6	128452	128457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839487
3040	NC_002755	GCGGCA	2	12	128486	128497	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15839487
3041	NC_002755	GCTG	2	8	128524	128531	0 %	25 %	50 %	25 %	15839487
3042	NC_002755	TGG	2	6	128535	128540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839487
3043	NC_002755	CAA	2	6	128563	128568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839487
3044	NC_002755	GGT	2	6	128581	128586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839487
3045	NC_002755	CCG	2	6	128658	128663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3046	NC_002755	TCG	2	6	128720	128725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3047	NC_002755	CG	3	6	128824	128829	0 %	0 %	50 %	50 %	15839487
3048	NC_002755	ACC	2	6	128924	128929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
3049	NC_002755	GCA	2	6	128955	128960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839487
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3051	NC_002755	ACC	2	6	129023	129028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
3052	NC_002755	TCGGGT	2	12	129125	129136	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15839487
3053	NC_002755	GTC	3	9	129181	129189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3054	NC_002755	TGCA	2	8	129211	129218	25 %	25 %	25 %	25 %	15839487
3055	NC_002755	ACC	2	6	129263	129268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
3056	NC_002755	GGC	2	6	129282	129287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839487
3057	NC_002755	CCG	2	6	129345	129350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3058	NC_002755	GCCG	2	8	129403	129410	0 %	0 %	50 %	50 %	15839487
3059	NC_002755	ACC	2	6	129421	129426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
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3062	NC_002755	CCG	2	6	129545	129550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
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3065	NC_002755	GCC	2	6	129584	129589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
3066	NC_002755	CGA	2	6	129625	129630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839487
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3070	NC_002755	AGC	2	6	129752	129757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839487
3071	NC_002755	GCC	3	9	129788	129796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839487
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3073	NC_002755	TGG	2	6	129897	129902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839487
3074	NC_002755	TGCGG	2	10	129905	129914	0 %	20 %	60 %	20 %	15839487
3075	NC_002755	CGA	2	6	130039	130044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839487
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3084	NC_002755	CTGT	2	8	130470	130477	0 %	50 %	25 %	25 %	15839487
3085	NC_002755	CAC	2	6	130494	130499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839487
3086	NC_002755	GCGA	2	8	130656	130663	25 %	0 %	50 %	25 %	15839488
3087	NC_002755	CGGG	2	8	130699	130706	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_002755	ACG	2	6	130756	130761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_002755	G	6	6	130864	130869	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_002755	CGA	2	6	130871	130876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_002755	GGT	2	6	130895	130900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839489
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3093	NC_002755	TGG	2	6	130954	130959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839489
3094	NC_002755	CAC	2	6	130983	130988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839489
3095	NC_002755	CGG	2	6	131205	131210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_002755	GCTC	2	8	131211	131218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_002755	GGT	2	6	131222	131227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_002755	CCA	2	6	131334	131339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839490
3099	NC_002755	ATCAC	2	10	131384	131393	40 %	20 %	0 %	40 %	15839490
3100	NC_002755	GCG	2	6	131408	131413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3101	NC_002755	ATCGG	2	10	131432	131441	20 %	20 %	40 %	20 %	15839490
3102	NC_002755	CGA	2	6	131475	131480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839490
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3104	NC_002755	CCCA	2	8	131714	131721	25 %	0 %	0 %	75 %	15839490
3105	NC_002755	ATC	2	6	131741	131746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839490
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3109	NC_002755	GGT	2	6	131852	131857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839490
3110	NC_002755	CGG	2	6	131860	131865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
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3112	NC_002755	CGG	2	6	131896	131901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3113	NC_002755	CGG	2	6	131905	131910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3114	NC_002755	GCGG	2	8	131930	131937	0 %	0 %	75 %	25 %	15839490
3115	NC_002755	GGCG	2	8	131938	131945	0 %	0 %	75 %	25 %	15839490
3116	NC_002755	GCT	2	6	131956	131961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839490
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3119	NC_002755	CAC	2	6	132001	132006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839490
3120	NC_002755	CGG	2	6	132031	132036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3121	NC_002755	CGG	2	6	132070	132075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3122	NC_002755	GCG	2	6	132081	132086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3123	NC_002755	CGG	2	6	132088	132093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3124	NC_002755	CGG	2	6	132112	132117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3125	NC_002755	CGG	2	6	132130	132135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3126	NC_002755	CCG	2	6	132138	132143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839490
3127	NC_002755	CGG	2	6	132157	132162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3128	NC_002755	CGG	2	6	132166	132171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3129	NC_002755	CGG	2	6	132196	132201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3130	NC_002755	GGT	2	6	132206	132211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839490
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3132	NC_002755	CGG	2	6	132250	132255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3133	NC_002755	CGG	2	6	132259	132264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3134	NC_002755	CGG	2	6	132283	132288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
3135	NC_002755	CGG	2	6	132301	132306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
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3137	NC_002755	GGT	2	6	132338	132343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839490
3138	NC_002755	CGG	2	6	132346	132351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
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3140	NC_002755	TCG	2	6	132402	132407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839490
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3154	NC_002755	CGG	2	6	132652	132657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
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3157	NC_002755	GCT	2	6	132713	132718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839490
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3162	NC_002755	CGG	2	6	132799	132804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839490
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3165	NC_002755	CAA	2	6	132892	132897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3166	NC_002755	CCA	2	6	133030	133035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839491
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3187	NC_002755	CGGG	2	8	133923	133930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3188	NC_002755	GTCG	2	8	133991	133998	0 %	25 %	50 %	25 %	15839492
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3198	NC_002755	GCT	2	6	134242	134247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839492
3199	NC_002755	GCGAT	2	10	134328	134337	20 %	20 %	40 %	20 %	15839492
3200	NC_002755	CGC	2	6	134338	134343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839492
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3203	NC_002755	GTTCG	2	10	134549	134558	0 %	40 %	40 %	20 %	15839492
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3209	NC_002755	TCG	2	6	134790	134795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839492
3210	NC_002755	GGCT	2	8	134796	134803	0 %	25 %	50 %	25 %	15839492
3211	NC_002755	GAC	2	6	134815	134820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839492
3212	NC_002755	CTG	2	6	134861	134866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839492
3213	NC_002755	GTG	2	6	134870	134875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839492
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3216	NC_002755	GGCCC	2	10	135047	135056	0 %	0 %	40 %	60 %	15839492
3217	NC_002755	GGT	2	6	135082	135087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839492
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3224	NC_002755	TCGCCG	2	12	135284	135295	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15839492
3225	NC_002755	GCC	2	6	135397	135402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839492
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3227	NC_002755	CGTTG	2	10	135559	135568	0 %	40 %	40 %	20 %	15839492
3228	NC_002755	TCG	2	6	135573	135578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839492
3229	NC_002755	CGACC	2	10	135631	135640	20 %	0 %	20 %	60 %	15839492
3230	NC_002755	AGCG	2	8	135669	135676	25 %	0 %	50 %	25 %	15839492
3231	NC_002755	CAC	2	6	135715	135720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839492
3232	NC_002755	CGG	2	6	135736	135741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839492
3233	NC_002755	GGA	2	6	135769	135774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839492
3234	NC_002755	CAA	2	6	135856	135861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839492
3235	NC_002755	CCG	2	6	135999	136004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839492
3236	NC_002755	TG	3	6	136045	136050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_002755	TGA	2	6	136066	136071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_002755	GTG	2	6	136082	136087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_002755	GC	4	8	136180	136187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3240	NC_002755	ATG	2	6	136309	136314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839493
3241	NC_002755	GCC	2	6	136342	136347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839493
3242	NC_002755	CTAC	2	8	136364	136371	25 %	25 %	0 %	50 %	15839493
3243	NC_002755	CGG	2	6	136508	136513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839493
3244	NC_002755	CCGG	2	8	136524	136531	0 %	0 %	50 %	50 %	15839493
3245	NC_002755	ACC	2	6	136543	136548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839493
3246	NC_002755	CGCA	2	8	136598	136605	25 %	0 %	25 %	50 %	15839493
3247	NC_002755	ATT	2	6	136609	136614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15839493
3248	NC_002755	TCG	2	6	136624	136629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839493
3249	NC_002755	TTG	2	6	136643	136648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839493
3250	NC_002755	GCG	2	6	136674	136679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839493
3251	NC_002755	GGC	2	6	136716	136721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839493
3252	NC_002755	CGT	2	6	136770	136775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839493
3253	NC_002755	CCG	2	6	136836	136841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839493
3254	NC_002755	TGATGC	2	12	136943	136954	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15839493
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3263	NC_002755	CTG	2	6	137325	137330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839494
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3265	NC_002755	GGT	2	6	137468	137473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839494
3266	NC_002755	TCG	2	6	137567	137572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839494
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3269	NC_002755	TCA	2	6	137985	137990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839494
3270	NC_002755	TACG	2	8	138011	138018	25 %	25 %	25 %	25 %	15839494
3271	NC_002755	GGC	2	6	138024	138029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839494
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3275	NC_002755	TGA	2	6	138132	138137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839494
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3279	NC_002755	CGC	2	6	138370	138375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839494
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3286	NC_002755	TC	3	6	138718	138723	0 %	50 %	0 %	50 %	15839495
3287	NC_002755	GAA	2	6	138724	138729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15839495
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3315	NC_002755	GAG	2	6	139763	139768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3319	NC_002755	GAT	2	6	139953	139958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839496
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3339	NC_002755	CTGA	2	8	140941	140948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3340	NC_002755	GATA	2	8	140986	140993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3341	NC_002755	AC	3	6	141042	141047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3342	NC_002755	AGCA	2	8	141082	141089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3343	NC_002755	CGC	2	6	141105	141110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3344	NC_002755	CG	3	6	141134	141139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3345	NC_002755	GAG	2	6	141177	141182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3356	NC_002755	CGC	2	6	141806	141811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839498
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3359	NC_002755	GC	3	6	142066	142071	0 %	0 %	50 %	50 %	15839498
3360	NC_002755	GGCGCT	2	12	142073	142084	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15839498
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3370	NC_002755	GAT	2	6	142630	142635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839499
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3495	NC_002755	GGT	2	6	147647	147652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839501
3496	NC_002755	GCC	2	6	147656	147661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839501
3497	NC_002755	C	6	6	147660	147665	0 %	0 %	0 %	100 %	15839501
3498	NC_002755	CCA	2	6	147673	147678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839501
3499	NC_002755	CGC	2	6	147694	147699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839501
3500	NC_002755	GCG	2	6	147720	147725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839501

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