MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 109576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002755	CA	3	6	228143	228148	50 %	0 %	0 %	50 %	15839573
5502	NC_002755	GGT	2	6	228165	228170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5503	NC_002755	GCC	2	6	228277	228282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5504	NC_002755	CGG	2	6	228310	228315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5505	NC_002755	GCG	2	6	228321	228326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5506	NC_002755	GAG	2	6	228333	228338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839573
5507	NC_002755	GC	3	6	228381	228386	0 %	0 %	50 %	50 %	15839573
5508	NC_002755	CGG	2	6	228401	228406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5509	NC_002755	CAACGC	2	12	228408	228419	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15839573
5510	NC_002755	GTT	2	6	228455	228460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839573
5511	NC_002755	GAC	2	6	228468	228473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5512	NC_002755	AGG	2	6	228514	228519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839573
5513	NC_002755	TGC	2	6	228520	228525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5514	NC_002755	CGC	2	6	228564	228569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5515	NC_002755	CGA	2	6	228641	228646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5516	NC_002755	GT	3	6	228735	228740	0 %	50 %	50 %	0 %	15839573
5517	NC_002755	GCA	2	6	228773	228778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5518	NC_002755	CACC	2	8	228810	228817	25 %	0 %	0 %	75 %	15839573
5519	NC_002755	CGC	2	6	228834	228839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5520	NC_002755	CTG	2	6	228840	228845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5521	NC_002755	CTG	2	6	228876	228881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5522	NC_002755	TGG	2	6	228883	228888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5523	NC_002755	CTG	2	6	228909	228914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5524	NC_002755	CGC	2	6	228954	228959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5525	NC_002755	TGG	2	6	228978	228983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5526	NC_002755	CGT	2	6	229091	229096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5527	NC_002755	GCCTGG	2	12	229114	229125	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15839573
5528	NC_002755	GAC	2	6	229137	229142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5529	NC_002755	CCG	2	6	229171	229176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5530	NC_002755	GTG	2	6	229233	229238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5531	NC_002755	TGG	2	6	229255	229260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5532	NC_002755	GCT	2	6	229262	229267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5533	NC_002755	CAC	2	6	229301	229306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839573
5534	NC_002755	CGG	2	6	229365	229370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5535	NC_002755	CGG	2	6	229417	229422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5536	NC_002755	GAC	2	6	229488	229493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5537	NC_002755	GCT	2	6	229523	229528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5538	NC_002755	TAC	2	6	229536	229541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839573
5539	NC_002755	ACC	2	6	229572	229577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839573
5540	NC_002755	TCGG	2	8	229623	229630	0 %	25 %	50 %	25 %	15839573
5541	NC_002755	TGT	2	6	229663	229668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839573
5542	NC_002755	CGA	2	6	229700	229705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5543	NC_002755	GCG	2	6	229716	229721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5544	NC_002755	GGC	2	6	229724	229729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5545	NC_002755	GCT	2	6	229745	229750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5546	NC_002755	CGT	2	6	229765	229770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5547	NC_002755	CGG	2	6	229774	229779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5548	NC_002755	GTG	2	6	229801	229806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5549	NC_002755	CCGG	2	8	229884	229891	0 %	0 %	50 %	50 %	15839573
5550	NC_002755	GGT	2	6	229898	229903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5551	NC_002755	TCG	2	6	229906	229911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5552	NC_002755	TGG	2	6	229948	229953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5553	NC_002755	ACGG	2	8	230101	230108	25 %	0 %	50 %	25 %	15839573
5554	NC_002755	GAT	2	6	230165	230170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839573
5555	NC_002755	CCG	2	6	230227	230232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839573
5556	NC_002755	CTG	3	9	230286	230294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5557	NC_002755	GTG	2	6	230334	230339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839573
5558	NC_002755	CACCCT	2	12	230348	230359	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15839573
5559	NC_002755	GAC	2	6	230372	230377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5560	NC_002755	GCT	2	6	230481	230486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839573
5561	NC_002755	GGC	2	6	230510	230515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839573
5562	NC_002755	AACT	2	8	230733	230740	50 %	25 %	0 %	25 %	15839574
5563	NC_002755	TGT	2	6	230873	230878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839575
5564	NC_002755	GGAA	2	8	230908	230915	50 %	0 %	50 %	0 %	15839575
5565	NC_002755	CAC	2	6	230916	230921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839575
5566	NC_002755	G	6	6	230923	230928	0 %	0 %	100 %	0 %	15839575
5567	NC_002755	GAG	2	6	230974	230979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839575
5568	NC_002755	TCC	2	6	230984	230989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15839575
5569	NC_002755	GGT	2	6	231036	231041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839575
5570	NC_002755	GCGA	2	8	231043	231050	25 %	0 %	50 %	25 %	15839575
5571	NC_002755	GC	3	6	231108	231113	0 %	0 %	50 %	50 %	15839575
5572	NC_002755	CCA	2	6	231155	231160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839575
5573	NC_002755	GTC	3	9	231232	231240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839575
5574	NC_002755	CGA	2	6	231243	231248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839575
5575	NC_002755	GAT	2	6	231273	231278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839575
5576	NC_002755	GTT	2	6	231297	231302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15839575
5577	NC_002755	TCG	2	6	231332	231337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839575
5578	NC_002755	CCG	2	6	231353	231358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839575
5579	NC_002755	GCC	2	6	231362	231367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839575
5580	NC_002755	CCG	2	6	231425	231430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839575
5581	NC_002755	AC	3	6	231437	231442	50 %	0 %	0 %	50 %	15839575
5582	NC_002755	GCC	2	6	231448	231453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839575
5583	NC_002755	TGC	2	6	231479	231484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839575
5584	NC_002755	GCAC	2	8	231506	231513	25 %	0 %	25 %	50 %	15839575
5585	NC_002755	CGCA	2	8	231598	231605	25 %	0 %	25 %	50 %	15839575
5586	NC_002755	TGCGC	2	10	231618	231627	0 %	20 %	40 %	40 %	15839575
5587	NC_002755	TGAT	2	8	231640	231647	25 %	50 %	25 %	0 %	15839575
5588	NC_002755	ACGT	2	8	231660	231667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_002755	GGCCG	2	10	231670	231679	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5590	NC_002755	GTG	2	6	231691	231696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_002755	ACAT	2	8	231727	231734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5592	NC_002755	GCG	2	6	231749	231754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_002755	TGG	2	6	231777	231782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15839576
5594	NC_002755	TGC	2	6	231840	231845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839576
5595	NC_002755	GCG	2	6	231852	231857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839576
5596	NC_002755	ACT	2	6	231879	231884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839576
5597	NC_002755	CGC	2	6	231943	231948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839576
5598	NC_002755	G	6	6	231967	231972	0 %	0 %	100 %	0 %	15839576
5599	NC_002755	GCT	2	6	231979	231984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839576
5600	NC_002755	CAG	2	6	232010	232015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839576
5601	NC_002755	CGC	2	6	232051	232056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839576
5602	NC_002755	GGCG	2	8	232069	232076	0 %	0 %	75 %	25 %	15839576
5603	NC_002755	CG	3	6	232111	232116	0 %	0 %	50 %	50 %	15839576
5604	NC_002755	GCG	2	6	232121	232126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839576
5605	NC_002755	CCG	2	6	232181	232186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839576
5606	NC_002755	GCG	2	6	232255	232260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839576
5607	NC_002755	CGC	2	6	232269	232274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839576
5608	NC_002755	CTG	3	9	232304	232312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839576
5609	NC_002755	GAT	2	6	232335	232340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15839576
5610	NC_002755	TCG	2	6	232397	232402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839577
5611	NC_002755	CGA	2	6	232410	232415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839577
5612	NC_002755	CAA	2	6	232476	232481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839577
5613	NC_002755	AAC	2	6	232507	232512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839577
5614	NC_002755	GCC	2	6	232538	232543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15839577
5615	NC_002755	GAG	2	6	232561	232566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15839577
5616	NC_002755	CGG	2	6	232629	232634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839577
5617	NC_002755	TCT	2	6	232643	232648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15839577
5618	NC_002755	CGG	4	12	232653	232664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839577
5619	NC_002755	TCG	2	6	232679	232684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839577
5620	NC_002755	GCG	2	6	232694	232699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839577
5621	NC_002755	CGG	2	6	232788	232793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839577
5622	NC_002755	CG	3	6	232799	232804	0 %	0 %	50 %	50 %	15839577
5623	NC_002755	TCG	2	6	232835	232840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839577
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5627	NC_002755	CGT	2	6	232938	232943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839577
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5991	NC_002755	CCA	3	9	247750	247758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839587
5992	NC_002755	GCG	2	6	247761	247766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15839587
5993	NC_002755	TCG	2	6	247785	247790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15839587
5994	NC_002755	CCAC	2	8	247879	247886	25 %	0 %	0 %	75 %	15839587
5995	NC_002755	ACC	2	6	247893	247898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15839587
5996	NC_002755	CGGC	2	8	247962	247969	0 %	0 %	50 %	50 %	15839587
5997	NC_002755	CAG	2	6	247991	247996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15839587
5998	NC_002755	CGGC	2	8	248039	248046	0 %	0 %	50 %	50 %	15839587
5999	NC_002755	TCA	3	9	248218	248226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15839587
6000	NC_002755	AAC	2	6	248270	248275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15839588

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