MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002682	TCGC	2	8	308	315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002682	ACAG	2	8	1490	1497	50 %	0 %	25 %	25 %	13488373
3	NC_002682	GATC	2	8	1572	1579	25 %	25 %	25 %	25 %	13488373
4	NC_002682	ATGG	2	8	1604	1611	25 %	25 %	50 %	0 %	13488373
5	NC_002682	CGAG	2	8	2490	2497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002682	TGCG	2	8	2600	2607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002682	CTTC	2	8	3061	3068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002682	CGGG	2	8	3094	3101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002682	CCGC	2	8	3587	3594	0 %	0 %	25 %	75 %	13488376
10	NC_002682	CACG	2	8	4505	4512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_002682	ACGG	2	8	6148	6155	25 %	0 %	50 %	25 %	13488378
12	NC_002682	CGGA	2	8	6279	6286	25 %	0 %	50 %	25 %	13488378
13	NC_002682	GAAC	2	8	6329	6336	50 %	0 %	25 %	25 %	13488378
14	NC_002682	GCCC	2	8	6419	6426	0 %	0 %	25 %	75 %	13488378
15	NC_002682	CCAT	2	8	7130	7137	25 %	25 %	0 %	50 %	13488379
16	NC_002682	CCGC	2	8	7325	7332	0 %	0 %	25 %	75 %	13488379
17	NC_002682	CGGC	2	8	7663	7670	0 %	0 %	50 %	50 %	13488379
18	NC_002682	GGCG	2	8	8007	8014	0 %	0 %	75 %	25 %	13488379
19	NC_002682	CAGC	2	8	8469	8476	25 %	0 %	25 %	50 %	13488379
20	NC_002682	GCCA	2	8	8623	8630	25 %	0 %	25 %	50 %	13488379
21	NC_002682	CTCG	2	8	8872	8879	0 %	25 %	25 %	50 %	13488379
22	NC_002682	GCAT	2	8	9063	9070	25 %	25 %	25 %	25 %	13488379
23	NC_002682	TGAA	2	8	9564	9571	50 %	25 %	25 %	0 %	13488380
24	NC_002682	ACCG	2	8	9603	9610	25 %	0 %	25 %	50 %	13488380
25	NC_002682	GCCA	2	8	9616	9623	25 %	0 %	25 %	50 %	13488380
26	NC_002682	GCCG	2	8	9937	9944	0 %	0 %	50 %	50 %	13488381
27	NC_002682	GCCT	2	8	10242	10249	0 %	25 %	25 %	50 %	13488381
28	NC_002682	GCTC	2	8	10291	10298	0 %	25 %	25 %	50 %	13488381
29	NC_002682	GACC	2	8	10450	10457	25 %	0 %	25 %	50 %	13488381
30	NC_002682	GGTT	2	8	11026	11033	0 %	50 %	50 %	0 %	13488381
31	NC_002682	TTGA	2	8	11685	11692	25 %	50 %	25 %	0 %	13488383
32	NC_002682	GCCT	2	8	12066	12073	0 %	25 %	25 %	50 %	13488383
33	NC_002682	TGAT	2	8	12148	12155	25 %	50 %	25 %	0 %	13488383
34	NC_002682	GCCG	2	8	12201	12208	0 %	0 %	50 %	50 %	13488383
35	NC_002682	TTGG	2	8	12906	12913	0 %	50 %	50 %	0 %	13488383
36	NC_002682	TCTG	2	8	13767	13774	0 %	50 %	25 %	25 %	13488385
37	NC_002682	GGCT	2	8	14133	14140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002682	CTGG	2	8	14313	14320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002682	CGAT	2	8	14732	14739	25 %	25 %	25 %	25 %	13488386
40	NC_002682	CGAT	2	8	14774	14781	25 %	25 %	25 %	25 %	13488386
41	NC_002682	AATC	2	8	15067	15074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002682	GCCA	2	8	15741	15748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_002682	GGTT	2	8	15883	15890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002682	TCTG	2	8	15967	15974	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_002682	CGCC	2	8	16601	16608	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_002682	AGGC	2	8	16806	16813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002682	CAGG	2	8	17158	17165	25 %	0 %	50 %	25 %	13488387
48	NC_002682	GGCG	2	8	17419	17426	0 %	0 %	75 %	25 %	13488387
49	NC_002682	GCCA	2	8	18221	18228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002682	AGTA	2	8	19214	19221	50 %	25 %	25 %	0 %	13488389
51	NC_002682	CGAA	2	8	20649	20656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002682	GGCC	2	8	21010	21017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002682	GCGA	2	8	21133	21140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002682	CCGA	2	8	21178	21185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002682	CCTC	2	8	21206	21213	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_002682	TGTT	2	8	21634	21641	0 %	75 %	25 %	0 %	13488392
57	NC_002682	TTGA	2	8	22042	22049	25 %	50 %	25 %	0 %	13488393
58	NC_002682	GTAG	2	8	22057	22064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002682	TGGT	2	8	22621	22628	0 %	50 %	50 %	0 %	13488394
60	NC_002682	CGGG	2	8	22752	22759	0 %	0 %	75 %	25 %	13488394
61	NC_002682	CTTC	2	8	22810	22817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002682	TCGC	2	8	22834	22841	0 %	25 %	25 %	50 %	13488395
63	NC_002682	CGGC	2	8	22894	22901	0 %	0 %	50 %	50 %	13488395
64	NC_002682	GCCG	2	8	23739	23746	0 %	0 %	50 %	50 %	13488397
65	NC_002682	CGGC	2	8	23831	23838	0 %	0 %	50 %	50 %	13488397
66	NC_002682	CGGT	2	8	24161	24168	0 %	25 %	50 %	25 %	13488397
67	NC_002682	AGGC	2	8	24170	24177	25 %	0 %	50 %	25 %	13488397
68	NC_002682	TCGA	2	8	24220	24227	25 %	25 %	25 %	25 %	13488398
69	NC_002682	TTGG	2	8	24796	24803	0 %	50 %	50 %	0 %	13488399
70	NC_002682	ATGC	2	8	25467	25474	25 %	25 %	25 %	25 %	13488399
71	NC_002682	GCAG	2	8	25891	25898	25 %	0 %	50 %	25 %	13488399
72	NC_002682	TGCT	2	8	26335	26342	0 %	50 %	25 %	25 %	13488399
73	NC_002682	GAGG	2	8	26399	26406	25 %	0 %	75 %	0 %	13488399
74	NC_002682	GCTG	2	8	26559	26566	0 %	25 %	50 %	25 %	13488399
75	NC_002682	CGAT	2	8	26609	26616	25 %	25 %	25 %	25 %	13488399
76	NC_002682	CTGG	2	8	26962	26969	0 %	25 %	50 %	25 %	13488399
77	NC_002682	CGGC	2	8	27103	27110	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
78	NC_002682	TCAG	2	8	27976	27983	25 %	25 %	25 %	25 %	13488400
79	NC_002682	CAAC	2	8	28540	28547	50 %	0 %	0 %	50 %	13488401
80	NC_002682	CTGG	2	8	29103	29110	0 %	25 %	50 %	25 %	13488401
81	NC_002682	CTTT	2	8	29182	29189	0 %	75 %	0 %	25 %	13488401
82	NC_002682	GCAG	2	8	29224	29231	25 %	0 %	50 %	25 %	13488401
83	NC_002682	GTTC	2	8	29344	29351	0 %	50 %	25 %	25 %	13488402
84	NC_002682	GCTG	2	8	29384	29391	0 %	25 %	50 %	25 %	13488402
85	NC_002682	CGAT	2	8	29611	29618	25 %	25 %	25 %	25 %	13488402
86	NC_002682	TCAC	2	8	29649	29656	25 %	25 %	0 %	50 %	13488402
87	NC_002682	AGGC	2	8	29720	29727	25 %	0 %	50 %	25 %	13488402
88	NC_002682	GCAA	2	8	30273	30280	50 %	0 %	25 %	25 %	13488402
89	NC_002682	AGCG	2	8	30351	30358	25 %	0 %	50 %	25 %	13488402
90	NC_002682	CGGC	2	8	30593	30600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002682	TACG	2	8	31917	31924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002682	CGCA	2	8	32300	32307	25 %	0 %	25 %	50 %	13488405
93	NC_002682	GATC	2	8	32940	32947	25 %	25 %	25 %	25 %	13488406
94	NC_002682	TTGA	2	8	33660	33667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002682	GAGC	2	8	33891	33898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002682	AGCG	2	8	34605	34612	25 %	0 %	50 %	25 %	13488408
97	NC_002682	CGGC	2	8	34726	34733	0 %	0 %	50 %	50 %	13488408
98	NC_002682	TTGG	2	8	35224	35231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002682	TCTT	2	8	35725	35732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002682	GGCG	2	8	36080	36087	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002682	CGAA	2	8	36290	36297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_002682	TTTG	2	8	36490	36497	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002682	TCGG	2	8	37245	37252	0 %	25 %	50 %	25 %	13488410
104	NC_002682	CATG	2	8	37619	37626	25 %	25 %	25 %	25 %	13488410
105	NC_002682	ACAT	2	8	37960	37967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_002682	GGCG	2	8	39441	39448	0 %	0 %	75 %	25 %	13488414
107	NC_002682	CGCA	2	8	39550	39557	25 %	0 %	25 %	50 %	13488414
108	NC_002682	CGCC	2	8	39664	39671	0 %	0 %	25 %	75 %	13488414
109	NC_002682	ATCG	2	8	40215	40222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_002682	GTGC	2	8	40460	40467	0 %	25 %	50 %	25 %	13488417
111	NC_002682	TCGA	2	8	40508	40515	25 %	25 %	25 %	25 %	13488417
112	NC_002682	CAGC	2	8	42686	42693	25 %	0 %	25 %	50 %	13488418
113	NC_002682	TAGG	2	8	42802	42809	25 %	25 %	50 %	0 %	13488418
114	NC_002682	GCAG	2	8	42822	42829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002682	CGCT	2	8	43237	43244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_002682	CATC	2	8	43421	43428	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002682	GTTC	2	8	43444	43451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002682	GCTG	2	8	44122	44129	0 %	25 %	50 %	25 %	13488421
119	NC_002682	TGAC	2	8	44680	44687	25 %	25 %	25 %	25 %	13488423
120	NC_002682	TCCC	2	8	45104	45111	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_002682	TTGT	2	8	45154	45161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002682	GTTT	2	8	45458	45465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002682	CCAG	2	8	45566	45573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002682	ATCG	2	8	45777	45784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_002682	GAAG	2	8	46091	46098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002682	AACC	2	8	46324	46331	50 %	0 %	0 %	50 %	13488425
127	NC_002682	GAGC	2	8	46902	46909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_002682	CGTC	2	8	47927	47934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002682	TTGA	2	8	48220	48227	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002682	TGCT	2	8	48652	48659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002682	CCGC	2	8	49102	49109	0 %	0 %	25 %	75 %	13488426
132	NC_002682	GCCG	2	8	49650	49657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002682	CTGG	2	8	49724	49731	0 %	25 %	50 %	25 %	13488427
134	NC_002682	TCGG	2	8	49768	49775	0 %	25 %	50 %	25 %	13488427
135	NC_002682	GGCT	2	8	49789	49796	0 %	25 %	50 %	25 %	13488427
136	NC_002682	TCGC	2	8	49934	49941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002682	GCTG	2	8	50247	50254	0 %	25 %	50 %	25 %	13488428
138	NC_002682	GCAG	2	8	50400	50407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002682	TGCG	2	8	50672	50679	0 %	25 %	50 %	25 %	13488429
140	NC_002682	GCTG	2	8	50783	50790	0 %	25 %	50 %	25 %	13488429
141	NC_002682	TCGG	2	8	50864	50871	0 %	25 %	50 %	25 %	13488429
142	NC_002682	GCAG	2	8	50987	50994	25 %	0 %	50 %	25 %	13488430
143	NC_002682	TGAA	2	8	51123	51130	50 %	25 %	25 %	0 %	13488430
144	NC_002682	AGCA	2	8	51305	51312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002682	GCCT	2	8	51645	51652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002682	GGCT	2	8	51827	51834	0 %	25 %	50 %	25 %	13488431
147	NC_002682	TGGT	2	8	52668	52675	0 %	50 %	50 %	0 %	13488431
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184	NC_002682	AGCG	2	8	64913	64920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_002682	GAAA	2	8	94851	94858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_002682	GACC	2	8	95145	95152	25 %	0 %	25 %	50 %	13488472
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286	NC_002682	TAGC	2	8	96326	96333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
287	NC_002682	AGCG	2	8	96481	96488	25 %	0 %	50 %	25 %	13488474
288	NC_002682	CCAG	2	8	97212	97219	25 %	0 %	25 %	50 %	13488474
289	NC_002682	GGCC	2	8	97296	97303	0 %	0 %	50 %	50 %	13488474
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