MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 3002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002682	TTA	2	6	72	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002682	GTT	2	6	96	101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002682	TCC	2	6	197	202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_002682	GGC	3	9	289	297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002682	TGC	2	6	345	350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002682	GCG	2	6	351	356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002682	GCA	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47060339
8	NC_002682	CCG	2	6	477	482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47060339
9	NC_002682	GAA	2	6	501	506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47060339
10	NC_002682	CAT	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47060339
11	NC_002682	AGC	2	6	652	657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47060339
12	NC_002682	TGG	2	6	776	781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002682	GCC	2	6	786	791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47060340
14	NC_002682	AAT	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	47060340
15	NC_002682	ATC	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47060340
16	NC_002682	GGT	2	6	968	973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	47060340
17	NC_002682	GCA	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47060340
18	NC_002682	AGA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47060340
19	NC_002682	CCG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47060340
20	NC_002682	CTC	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	47060340
21	NC_002682	TTG	2	6	1083	1088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	47060340
22	NC_002682	ACG	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002682	CAT	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_002682	ACG	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488373
25	NC_002682	CGC	2	6	1464	1469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488373
26	NC_002682	GGC	2	6	1509	1514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488373
27	NC_002682	GCG	2	6	1696	1701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488373
28	NC_002682	TGT	2	6	1734	1739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488373
29	NC_002682	CGA	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488373
30	NC_002682	GGC	2	6	1783	1788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488373
31	NC_002682	GCA	2	6	1891	1896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488373
32	NC_002682	TGC	2	6	1917	1922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488373
33	NC_002682	CAA	2	6	2212	2217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_002682	ACG	4	12	2256	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002682	TGT	2	6	2305	2310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002682	CGT	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002682	GCT	2	6	2379	2384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002682	CGT	2	6	2395	2400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002682	TCG	2	6	2617	2622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002682	TCC	2	6	2818	2823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488374
41	NC_002682	GGT	2	6	3020	3025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002682	ATC	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002682	GCC	3	9	3186	3194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488375
44	NC_002682	TCC	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488375
45	NC_002682	CGC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488375
46	NC_002682	TGG	2	6	3362	3367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488375
47	NC_002682	AGC	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488376
48	NC_002682	GCT	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488376
49	NC_002682	CGT	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488376
50	NC_002682	TCG	2	6	3778	3783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488376
51	NC_002682	GTG	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488376
52	NC_002682	AGA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488376
53	NC_002682	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488376
54	NC_002682	CTG	2	6	3896	3901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488376
55	NC_002682	GTG	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002682	TCC	2	6	4042	4047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_002682	TGT	2	6	4058	4063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002682	GTC	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002682	AAT	2	6	4155	4160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002682	CAA	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_002682	CGC	2	6	4198	4203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_002682	AGG	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002682	GGA	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002682	AGA	2	6	4471	4476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002682	GCC	2	6	4549	4554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_002682	CAA	2	6	4681	4686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002682	CAA	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_002682	CGC	2	6	4813	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_002682	CGG	2	6	4939	4944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488377
70	NC_002682	GTT	2	6	4986	4991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488377
71	NC_002682	TTC	2	6	5084	5089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488377
72	NC_002682	TCG	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488377
73	NC_002682	ATC	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488377
74	NC_002682	GCC	2	6	5310	5315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488377
75	NC_002682	TCA	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488377
76	NC_002682	TGG	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488377
77	NC_002682	ATA	2	6	5914	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488377
78	NC_002682	GAA	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488378
79	NC_002682	CGG	3	9	5969	5977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488378
80	NC_002682	CCA	2	6	6114	6119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488378
81	NC_002682	GAT	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488378
82	NC_002682	CAA	2	6	6317	6322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488378
83	NC_002682	CGC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488378
84	NC_002682	GCC	2	6	6938	6943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488379
85	NC_002682	ACG	2	6	6959	6964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
86	NC_002682	ATA	2	6	7006	7011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488379
87	NC_002682	TCT	2	6	7043	7048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488379
88	NC_002682	ATG	2	6	7073	7078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488379
89	NC_002682	GAC	2	6	7159	7164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
90	NC_002682	CGA	2	6	7360	7365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
91	NC_002682	TCG	2	6	7394	7399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
92	NC_002682	GCT	2	6	7439	7444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
93	NC_002682	ACG	3	9	7559	7567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
94	NC_002682	AGC	2	6	7763	7768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
95	NC_002682	GAG	2	6	7832	7837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488379
96	NC_002682	CCT	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488379
97	NC_002682	CGT	2	6	8055	8060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
98	NC_002682	GCA	2	6	8076	8081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
99	NC_002682	CTC	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488379
100	NC_002682	GCC	2	6	8245	8250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488379
101	NC_002682	TCG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
102	NC_002682	CCA	2	6	8481	8486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488379
103	NC_002682	CCG	2	6	8487	8492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488379
104	NC_002682	CGG	2	6	8506	8511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488379
105	NC_002682	GCA	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
106	NC_002682	GCC	2	6	8598	8603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488379
107	NC_002682	GAG	2	6	8719	8724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488379
108	NC_002682	GTC	2	6	8738	8743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
109	NC_002682	GCT	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
110	NC_002682	GGA	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488379
111	NC_002682	GCG	2	6	8969	8974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488379
112	NC_002682	GAT	2	6	9025	9030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488379
113	NC_002682	CGG	2	6	9084	9089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488379
114	NC_002682	TCG	2	6	9194	9199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
115	NC_002682	GCA	2	6	9275	9280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488380
116	NC_002682	TCA	2	6	9370	9375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488380
117	NC_002682	CAC	2	6	9408	9413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488380
118	NC_002682	GGC	2	6	9419	9424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488380
119	NC_002682	CAC	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488380
120	NC_002682	CGA	2	6	9574	9579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488380
121	NC_002682	TCC	2	6	9625	9630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488380
122	NC_002682	TCG	2	6	9664	9669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
123	NC_002682	CGC	2	6	9713	9718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488380
124	NC_002682	TGC	2	6	9732	9737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
125	NC_002682	AGG	2	6	9745	9750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488380
126	NC_002682	CGT	2	6	9751	9756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
127	NC_002682	TCT	2	6	9761	9766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488380
128	NC_002682	TGC	2	6	9796	9801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
129	NC_002682	TAG	2	6	9804	9809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488380
130	NC_002682	GCC	2	6	9842	9847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488380
131	NC_002682	GTC	2	6	9852	9857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
132	NC_002682	TCC	2	6	9868	9873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488380
133	NC_002682	GCC	2	6	9898	9903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488380
134	NC_002682	AGC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488381
135	NC_002682	GAT	2	6	10015	10020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488381
136	NC_002682	GCA	2	6	10068	10073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488381
137	NC_002682	CAG	2	6	10097	10102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488381
138	NC_002682	AGA	2	6	10105	10110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488381
139	NC_002682	CTG	2	6	10154	10159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488381
140	NC_002682	CCT	2	6	10162	10167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488381
141	NC_002682	GAA	2	6	10282	10287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488381
142	NC_002682	TTG	2	6	10299	10304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488381
143	NC_002682	GGC	2	6	10334	10339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488381
144	NC_002682	CGG	2	6	10405	10410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488381
145	NC_002682	CCG	2	6	10444	10449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488381
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147	NC_002682	CAG	2	6	10478	10483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488381
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152	NC_002682	CAG	2	6	11350	11355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488382
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156	NC_002682	GCA	2	6	11538	11543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488382
157	NC_002682	TGG	2	6	11555	11560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488382
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159	NC_002682	GCC	2	6	11673	11678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488383
160	NC_002682	TCG	2	6	11695	11700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
161	NC_002682	CTG	2	6	11850	11855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
162	NC_002682	CTG	2	6	11883	11888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
163	NC_002682	CGG	2	6	11905	11910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488383
164	NC_002682	CCA	2	6	12038	12043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488383
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166	NC_002682	GTC	2	6	12136	12141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
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247	NC_002682	TAT	2	6	18512	18517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_002682	GGC	2	6	18530	18535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_002682	GCC	2	6	18570	18575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_002682	TTG	2	6	18738	18743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488389
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259	NC_002682	CGA	2	6	19608	19613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488390
260	NC_002682	GGC	2	6	19668	19673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488390
261	NC_002682	GAA	2	6	19708	19713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488390
262	NC_002682	ACC	2	6	19755	19760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488390
263	NC_002682	CAA	2	6	19835	19840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488391
264	NC_002682	GCG	2	6	20060	20065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_002682	TGG	2	6	20144	20149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_002682	CGG	2	6	20150	20155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_002682	CCT	2	6	20313	20318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_002682	GCG	2	6	20319	20324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_002682	GGA	2	6	20381	20386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_002682	TTC	2	6	20564	20569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_002682	CCG	2	6	20601	20606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_002682	GGA	2	6	20903	20908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_002682	GCG	2	6	21089	21094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_002682	CGA	2	6	21159	21164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_002682	CTG	2	6	21253	21258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_002682	GCC	2	6	21340	21345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
277	NC_002682	TGA	2	6	21386	21391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_002682	GCC	2	6	21435	21440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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286	NC_002682	CTG	2	6	22123	22128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_002682	CTA	2	6	22347	22352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488394
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298	NC_002682	AGA	2	6	23288	23293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_002682	CCG	2	6	23337	23342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_002682	ATC	2	6	23377	23382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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