MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 4322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002682	GAGG	2	8	26399	26406	25 %	0 %	75 %	0 %	13488399
502	NC_002682	CGC	2	6	26427	26432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488399
503	NC_002682	GGC	2	6	26458	26463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488399
504	NC_002682	CGA	2	6	26482	26487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488399
505	NC_002682	GCTG	2	8	26559	26566	0 %	25 %	50 %	25 %	13488399
506	NC_002682	CGAT	2	8	26609	26616	25 %	25 %	25 %	25 %	13488399
507	NC_002682	AGC	2	6	26619	26624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488399
508	NC_002682	GGA	2	6	26638	26643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488399
509	NC_002682	GC	4	8	26651	26658	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
510	NC_002682	TCG	2	6	26661	26666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488399
511	NC_002682	CGCGG	2	10	26839	26848	0 %	0 %	60 %	40 %	13488399
512	NC_002682	GC	3	6	26849	26854	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
513	NC_002682	CCA	2	6	26874	26879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488399
514	NC_002682	CTG	2	6	26894	26899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488399
515	NC_002682	CTGG	2	8	26962	26969	0 %	25 %	50 %	25 %	13488399
516	NC_002682	CG	4	8	26991	26998	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
517	NC_002682	CAT	2	6	27073	27078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488399
518	NC_002682	GCG	2	6	27083	27088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488399
519	NC_002682	CGGC	2	8	27103	27110	0 %	0 %	50 %	50 %	13488399
520	NC_002682	CCG	2	6	27129	27134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488399
521	NC_002682	CTG	2	6	27165	27170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_002682	ACA	2	6	27173	27178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_002682	GA	3	6	27205	27210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_002682	GTC	2	6	27219	27224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_002682	CAT	2	6	27342	27347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488400
526	NC_002682	GAT	2	6	27375	27380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488400
527	NC_002682	GC	3	6	27438	27443	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
528	NC_002682	GTC	3	9	27468	27476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488400
529	NC_002682	GCG	2	6	27498	27503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488400
530	NC_002682	CG	3	6	27509	27514	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
531	NC_002682	GC	3	6	27550	27555	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
532	NC_002682	ACGGCT	2	12	27586	27597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488400
533	NC_002682	CGC	2	6	27635	27640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488400
534	NC_002682	CG	3	6	27674	27679	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
535	NC_002682	GC	3	6	27698	27703	0 %	0 %	50 %	50 %	13488400
536	NC_002682	GAT	2	6	27723	27728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488400
537	NC_002682	GCC	2	6	27788	27793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488400
538	NC_002682	GCT	2	6	27794	27799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488400
539	NC_002682	GCC	2	6	27851	27856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488400
540	NC_002682	TGG	2	6	27907	27912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488400
541	NC_002682	GCC	2	6	27954	27959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488400
542	NC_002682	TCAG	2	8	27976	27983	25 %	25 %	25 %	25 %	13488400
543	NC_002682	CGA	2	6	28007	28012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488400
544	NC_002682	GCG	2	6	28115	28120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488400
545	NC_002682	TGG	2	6	28129	28134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488400
546	NC_002682	CAG	2	6	28137	28142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488400
547	NC_002682	GCT	2	6	28280	28285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488401
548	NC_002682	TGA	2	6	28293	28298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488401
549	NC_002682	GAC	2	6	28375	28380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488401
550	NC_002682	GCT	2	6	28408	28413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488401
551	NC_002682	GGC	3	9	28414	28422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488401
552	NC_002682	CAAC	2	8	28540	28547	50 %	0 %	0 %	50 %	13488401
553	NC_002682	GGC	2	6	28712	28717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488401
554	NC_002682	GCA	2	6	28791	28796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488401
555	NC_002682	TGC	2	6	28827	28832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488401
556	NC_002682	CGA	2	6	28882	28887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488401
557	NC_002682	AT	3	6	28915	28920	50 %	50 %	0 %	0 %	13488401
558	NC_002682	CTG	2	6	28934	28939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488401
559	NC_002682	GCG	2	6	28971	28976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488401
560	NC_002682	CCG	2	6	28977	28982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488401
561	NC_002682	TGG	2	6	28986	28991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488401
562	NC_002682	TCA	2	6	29034	29039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488401
563	NC_002682	CTGG	2	8	29103	29110	0 %	25 %	50 %	25 %	13488401
564	NC_002682	CCGAG	2	10	29127	29136	20 %	0 %	40 %	40 %	13488401
565	NC_002682	ACC	2	6	29144	29149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488401
566	NC_002682	CTTT	2	8	29182	29189	0 %	75 %	0 %	25 %	13488401
567	NC_002682	GCAG	2	8	29224	29231	25 %	0 %	50 %	25 %	13488401
568	NC_002682	CGT	2	6	29314	29319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488402
569	NC_002682	CGT	2	6	29321	29326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488402
570	NC_002682	GTTC	2	8	29344	29351	0 %	50 %	25 %	25 %	13488402
571	NC_002682	CGG	2	6	29356	29361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488402
572	NC_002682	GCTG	2	8	29384	29391	0 %	25 %	50 %	25 %	13488402
573	NC_002682	ACG	2	6	29394	29399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488402
574	NC_002682	GAT	2	6	29423	29428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488402
575	NC_002682	GCG	2	6	29461	29466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488402
576	NC_002682	CCG	2	6	29559	29564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488402
577	NC_002682	TGC	2	6	29596	29601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488402
578	NC_002682	GCG	2	6	29602	29607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488402
579	NC_002682	CGAT	2	8	29611	29618	25 %	25 %	25 %	25 %	13488402
580	NC_002682	TCAC	2	8	29649	29656	25 %	25 %	0 %	50 %	13488402
581	NC_002682	CCG	2	6	29704	29709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488402
582	NC_002682	CGA	2	6	29710	29715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488402
583	NC_002682	AGGC	2	8	29720	29727	25 %	0 %	50 %	25 %	13488402
584	NC_002682	CGA	2	6	29842	29847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488402
585	NC_002682	CGA	2	6	29896	29901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488402
586	NC_002682	GCGAT	2	10	29917	29926	20 %	20 %	40 %	20 %	13488402
587	NC_002682	GCC	3	9	29943	29951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488402
588	NC_002682	GTG	2	6	30054	30059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488402
589	NC_002682	ACG	2	6	30060	30065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488402
590	NC_002682	GCG	2	6	30084	30089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488402
591	NC_002682	CGC	2	6	30092	30097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488402
592	NC_002682	GAG	2	6	30120	30125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488402
593	NC_002682	CGA	2	6	30133	30138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488402
594	NC_002682	GC	4	8	30153	30160	0 %	0 %	50 %	50 %	13488402
595	NC_002682	TCG	2	6	30175	30180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488402
596	NC_002682	GCAA	2	8	30273	30280	50 %	0 %	25 %	25 %	13488402
597	NC_002682	GCA	2	6	30328	30333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488402
598	NC_002682	AGCG	2	8	30351	30358	25 %	0 %	50 %	25 %	13488402
599	NC_002682	TGG	2	6	30364	30369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488402
600	NC_002682	GC	4	8	30440	30447	0 %	0 %	50 %	50 %	13488402
601	NC_002682	CGGC	2	8	30593	30600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_002682	TTG	2	6	30641	30646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_002682	GCA	2	6	30659	30664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_002682	GT	3	6	30693	30698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_002682	CGT	2	6	30713	30718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_002682	TGA	2	6	30732	30737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_002682	GA	3	6	30778	30783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_002682	CT	3	6	30791	30796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_002682	TTTCG	2	10	30811	30820	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
610	NC_002682	CG	3	6	30828	30833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_002682	CAG	2	6	30841	30846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488403
612	NC_002682	GCG	2	6	30859	30864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488403
613	NC_002682	TGT	2	6	31049	31054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_002682	GTT	2	6	31126	31131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_002682	TGT	2	6	31183	31188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488404
616	NC_002682	GCG	2	6	31199	31204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488404
617	NC_002682	CAT	2	6	31370	31375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488404
618	NC_002682	T	6	6	31396	31401	0 %	100 %	0 %	0 %	13488404
619	NC_002682	CG	3	6	31484	31489	0 %	0 %	50 %	50 %	13488404
620	NC_002682	GGC	2	6	31507	31512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488404
621	NC_002682	AAG	2	6	31527	31532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488404
622	NC_002682	CGT	2	6	31573	31578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488404
623	NC_002682	CT	3	6	31661	31666	0 %	50 %	0 %	50 %	13488404
624	NC_002682	GC	3	6	31712	31717	0 %	0 %	50 %	50 %	13488404
625	NC_002682	TGGAG	2	10	31731	31740	20 %	20 %	60 %	0 %	13488404
626	NC_002682	TACG	2	8	31917	31924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
627	NC_002682	ACA	2	6	31992	31997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488405
628	NC_002682	GC	3	6	32071	32076	0 %	0 %	50 %	50 %	13488405
629	NC_002682	GGC	2	6	32168	32173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488405
630	NC_002682	CGG	2	6	32233	32238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488405
631	NC_002682	GCG	2	6	32252	32257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488405
632	NC_002682	TCG	2	6	32283	32288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488405
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639	NC_002682	GCG	2	6	32615	32620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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641	NC_002682	TCG	2	6	32730	32735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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885	NC_002682	GC	3	6	45587	45592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
886	NC_002682	A	6	6	45600	45605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
887	NC_002682	GCA	2	6	45667	45672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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892	NC_002682	GGT	2	6	45790	45795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488424
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